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Methods in Ecology and Evolution最新文献

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How to count bird calls? Vocal activity indices may provide different insights into bird abundance and behaviour depending on species traits 如何计算鸟类的叫声?声音活动指数可根据物种特征提供有关鸟类丰度和行为的不同见解
IF 6.6 2区 环境科学与生态学 Q1 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2024-05-10 DOI: 10.1111/2041-210X.14333
Anja Hutschenreiter, Ellen Andresen, Margarita Briseño-Jaramillo, Alejandra Torres-Araneda, Eduardo Pinel-Ramos, Jacqueline Baier, Filippo Aureli

被动声学监测(PAM)已成为调查鸟类的重要工具,对从 PAM 记录中获取鸟类数量和行为信息的方法的需求也在不断增长。鸟类种群的变化是通过计算记录的鸟叫声和发声活动率(VAR,即每次记录时间内的鸟叫声数量)来评估的。然而,鸟类鸣叫的计数方式多种多样,而且根据不同的物种特征,这些鸣叫计数可以让我们对鸟类的数量、发声行为和/或栖息地使用情况有不同的了解。我们的研究有两个目标(1)提出并评估两个基于鸣叫计数的新指数,即检测率(DR,即检测到目标发声存在的 1 分钟记录数)和每分钟最大计数(MAX,即 1 分钟记录中发现的最大鸣叫数);以及(2)提出一个概念框架,说明对 VAR、DR 和 MAX 的解释如何取决于指数和物种特征。对于具有不同特征的三种新热带鸟类,我们根据尤卡坦半岛(墨西哥)25 个地点的 PAM 数据计算了 VAR、DR 和 MAX,这些地点的人为生境干扰程度各不相同。我们发现这些指数之间存在中度到高度的相关性,与 DR 和 MAX 相比,VAR 的时间变异性更高。我们还发现,生境干扰对三种物种和指数的影响大小不同。我们认为,对于鸣叫行为具有高提示率的物种来说,DR可能是比VAR更可靠的相对丰度指数,而MAX可能适用于估计群居鸟类的家族或鸟群规模。我们的研究结果表明,基于叫声计数开发新的指数对于提出生态假设和评估鸟类丰度与行为的变化具有潜在的实用性。
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Systematic review and best practices for drone remote sensing of invasive plants 入侵植物无人机遥感的系统审查和最佳做法
IF 6.6 2区 环境科学与生态学 Q1 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2024-05-06 DOI: 10.1111/2041-210X.14330
Kunwar K. Singh, Thilina D. Surasinghe, Amy E. Frazier

无人机已成为探测和绘制植物入侵地图的一种具有成本效益的解决方案,为研究人员和土地管理者提供了飞行设计、传感器和数据收集时间表方面的灵活性。需要对基于无人机的图像收集、数据处理和分析方法的发展趋势进行系统回顾,以推动入侵物种监测和管理科学的发展,提高可扩展性和可复制性。我们系统地回顾了使用无人机进行植物入侵研究的各项研究,以确定知识差距、最佳实践以及推进入侵植物监测和管理科学的路径。我们设计了一个包含 33 个标准化报告参数的数据库,根据这些参数对每项研究进行编码,计算描述性统计数字,并综合这些技术的实施和使用情况。趋势显示,自 2009 年以来,研究数量普遍增加,且偏向于北美和欧洲的温带地区。大多数研究侧重于测试机器学习或深度学习图像分类技术的有效性,而侧重于监测或模拟传播的研究较少。很少有研究使用无人机评估生态系统动态和影响,如确定环境驱动因素或跟踪干扰后的重新出现。总体而言,我们注意到在实地调查设计、飞行设计、无人机系统、图像处理和分析方面缺乏标准化报告,这阻碍了方法的可复制性和可扩展性。基于这些发现,我们为入侵物种监测中的无人机应用制定了一个标准框架,以促进跨研究的可比性和可重复性。我们建议在以下几个方面推进无人机在入侵植物研究中的应用,包括:(1)利用标准化报告框架促进科学研究实践;(2)将无人机数据与卫星图像整合,以扩展更大范围内的关系;(3)使用无人机替代亲临现场的地面调查;以及(4)利用无人机评估与植物适应性和繁殖相关的群落性状变化。
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Harnessing large language models for coding, teaching and inclusion to empower research in ecology and evolution 利用大型语言模型进行编码、教学和包容,增强生态学和进化论研究的能力
IF 6.6 2区 环境科学与生态学 Q1 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2024-05-02 DOI: 10.1111/2041-210x.14325
Natalie Cooper, Adam T. Clark, Nicolas Lecomte, Huijie Qiao, Aaron M. Ellison
Large language models (LLMs) are a type of artificial intelligence (AI) that can perform various natural language processing tasks. The adoption of LLMs has become increasingly prominent in scientific writing and analyses because of the availability of free applications such as ChatGPT. This increased use of LLMs not only raises concerns about academic integrity but also presents opportunities for the research community. Here we focus on the opportunities for using LLMs for coding in ecology and evolution. We discuss how LLMs can be used to generate, explain, comment, translate, debug, optimise and test code. We also highlight the importance of writing effective prompts and carefully evaluating the outputs of LLMs. In addition, we draft a possible road map for using such models inclusively and with integrity. LLMs can accelerate the coding process, especially for unfamiliar tasks, and free up time for higher level tasks and creative thinking while increasing efficiency and creative output. LLMs also enhance inclusion by accommodating individuals without coding skills, with limited access to education in coding, or for whom English is not their primary written or spoken language. However, code generated by LLMs is of variable quality and has issues related to mathematics, logic, non‐reproducibility and intellectual property; it can also include mistakes and approximations, especially in novel methods. We highlight the benefits of using LLMs to teach and learn coding, and advocate for guiding students in the appropriate use of AI tools for coding. Despite the ability to assign many coding tasks to LLMs, we also reaffirm the continued importance of teaching coding skills for interpreting LLM‐generated code and to develop critical thinking skills. As editors of MEE, we support—to a limited extent—the transparent, accountable and acknowledged use of LLMs and other AI tools in publications. If LLMs or comparable AI tools (excluding commonly used aids like spell‐checkers, Grammarly and Writefull) are used to produce the work described in a manuscript, there must be a clear statement to that effect in its Methods section, and the corresponding or senior author must take responsibility for any code (or text) generated by the AI platform.
大型语言模型(LLM)是一种人工智能(AI),可以执行各种自然语言处理任务。由于可以使用 ChatGPT 等免费应用程序,大型语言模型在科学写作和分析中的应用日益突出。越来越多地使用 LLM 不仅引起了人们对学术诚信的关注,同时也为研究界带来了机遇。在此,我们将重点讨论在生态学和进化论中使用 LLMs 进行编码的机会。我们讨论了如何使用 LLM 生成、解释、注释、翻译、调试、优化和测试代码。我们还强调了编写有效提示和仔细评估 LLMs 输出的重要性。此外,我们还草拟了一份可能的路线图,以全面、完整地使用此类模型。LLM 可以加快编码过程,尤其是对于不熟悉的任务,并在提高效率和创造性产出的同时,为更高层次的任务和创造性思维腾出时间。本地化学习工具还能帮助没有编码技能、接受编码教育机会有限或英语不是主要书面或口语的个人,从而增强包容性。不过,本地语言学习工具生成的代码质量参差不齐,存在数学、逻辑、不可复制性和知识产权等问题;其中还可能包括错误和近似值,尤其是在新方法方面。我们强调了使用 LLMs 进行编码教学和学习的益处,并提倡指导学生适当使用人工智能工具进行编码。尽管可以将许多编码任务分配给 LLM,但我们也重申,教授编码技能对于解释 LLM 生成的代码和培养批判性思维能力仍然非常重要。作为 MEE 的编辑,我们在一定程度上支持在出版物中以透明、负责和公认的方式使用 LLM 和其他人工智能工具。如果稿件中描述的工作使用了LLM或类似的人工智能工具(不包括拼写检查器、Grammarly和Writefull等常用辅助工具),则必须在 "方法 "部分明确说明,并且通讯作者或资深作者必须对人工智能平台生成的任何代码(或文本)负责。
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Telling mutualistic and antagonistic ecological networks apart by learning their multiscale structure 通过学习生态网络的多尺度结构来区分互利和拮抗生态网络
IF 6.6 2区 环境科学与生态学 Q1 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2024-04-25 DOI: 10.1111/2041-210X.14328
Benoît Pichon, Rémy Le Goff, Hélène Morlon, Benoît Perez-Lamarque

生态网络代表了一个群落中谁与谁之间的相互作用,描述和理解生态网络结构的形成过程对生态学、进化生物学和自然保护有很多意义。一个备受争议的问题是,在拮抗型(如食草动物)和互惠型(如授粉)相互作用类型之间,双向生态网络的结构是否不同以及如何不同。在这里,我们利用网络结构的多尺度特征、机器学习工具以及一个大型的经验和模拟双向网络数据库来解决这个问题。以往的研究侧重于全局结构指标,如嵌套度和模块化,得出的结论是仅从结构上无法区分拮抗网络和互惠网络,与此相反,我们发现结合中尺度的结构表征和监督机器学习可以区分它们。在拮抗型网络中,连接密集的主题词比例过高,而在互助型网络中,具有非对称特化的主题词比例过高。这些结构特性可用来预测相互作用的类型,可信度相对较高。除了这种经典的互利/拮抗二分法之外,我们还发现了与特定生态(如授粉、寄生)相关的显著结构独特性。我们的研究结果澄清了拮抗网络和互利网络之间的结构差异,并建议对特定生态的结构独特性进行研究,以此作为超越粗略的拮抗/互利二分法描述相互作用特征的一种有前途的方法。
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Filtering heart rates using data densities: The boxfilter R package 利用数据密度过滤心率boxfilter R软件包
IF 6.6 2区 环境科学与生态学 Q1 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2024-04-24 DOI: 10.1111/2041-210X.14301
Thomas Ruf, Claudio Signer, Walter Arnold, Sebastian G. Vetter, Claudia Bieber

过去几十年来,人们对长期心率记录,尤其是自由生活动物的心率记录越来越感兴趣。这主要是因为组织的大部分新陈代谢活动都是基于心脏的氧气输送。然而,使用记录仪记录的人类和动物的心率或其他生理变量往往含有噪声。有时会通过人工或滤波器剔除虚假测量值,滤波器会根据信号的形状或频率剔除变量。我们介绍了一个 R 软件包 boxfilter,它能让用户通过计算滑动窗口内近邻的数量来消除噪声。根据所选的截止值,邻域比例较低的焦点将作为噪声被剔除。所有三个参数,即窗口宽度和高度以及截止值,都可以自动计算。窗口宽度和高度以及截断值这三个参数都可以自动计算。截断值的选择至关重要,超过这个值的数据点将被丢弃。当然,软件包方框滤波器无法解决完全错误的测量所造成的问题。与人眼一样,该滤波器也会偏好那些属于某种模式(如密集带)的点,而剔除孤立的值。除心率外,方框过滤器还可用于其他非瞬时变化的测量值,如体温、血压或睡眠参数。
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A FAIR and modular image-based workflow for knowledge discovery in the emerging field of imageomics 基于图像的 FAIR 模块化工作流程,用于新兴图像组学领域的知识发现
IF 6.6 2区 环境科学与生态学 Q1 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2024-04-22 DOI: 10.1111/2041-210X.14327
Meghan A. Balk, John Bradley, M. Maruf, Bahadir Altintaş, Yasin Bakiş, Henry L. Bart Jr, David Breen, Christopher R. Florian, Jane Greenberg, Anuj Karpatne, Kevin Karnani, Paula Mabee, Joel Pepper, Dom Jebbia, Thibault Tabarin, Xiaojun Wang, Hilmar Lapp

基于图像的机器学习工具是一个新兴的 "大数据 "研究领域。iNaturalist 等公民科学平台和博物馆主导的计划为研究人员提供了大量的数据和知识。其中包括元数据提取、物种识别和表型数据。生态和进化生物学家越来越多地使用复杂的多步骤数据处理方法。这些过程通常包括机器学习技术,而这些技术通常是由他人建立的,很难被合作中的其他成员重用。我们提出了一个机器学习应用的概念工作流模型,该模型使用图像数据提取新兴图像组学领域的生物知识。我们概述了创建自动化、可重用和模块化工作流的技术和最佳实践,并展示了这些技术和实践如何促进机器学习模型的重用和适应新的研究问题。我们鼓励研究人员--包括计算机科学家和生物学家--在这一概念性工作流程的基础上,结合图像数据上的机器学习工具,回答各自领域的新科学问题。
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A method for sampling the living wood microbiome 活木微生物群采样方法
IF 6.6 2区 环境科学与生态学 Q1 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2024-04-22 DOI: 10.1111/2041-210X.14311
Wyatt Arnold, Jonathan Gewirtzman, Peter A. Raymond, Mark A. Bradford, Claire Butler, Jordan Peccia

描述不同环境中微生物生命特征的工作取得了巨大进展,但地球上最大的生物质库--活树木的木材--的微生物群组在很大程度上尚未得到探索。目前对树木微生物群的了解主要局限于根和叶,很少关注木材的内生微生物群,尽管新出现的研究表明这一区域是独特类群的生存环境,对生态系统健康和全球生物地球化学循环具有重要影响。缺乏调查的部分原因是木材的物理不稳定性,这给取样、均质化和提取核酸带来了挑战。针对这些问题,我们提出了一种用于微生物分析的木材处理优化方法,从取样到下游分析。我们使用甲烷循环类群作为模式内生菌,评估了我们的方法在回收过程中的损失,并确定了每 100 毫克(干)木材中约 500 个细胞的检测极限。对于所有六个被评估的物种--代表了硬木和软木的多个不同类群--PCR 抑制作用被证明是最小的,我们预计这种方法适用于大多数树种。本文介绍的方法有助于今后对木材微生物组和甲烷循环的全球微生物生态学进行研究。
{"title":"A method for sampling the living wood microbiome","authors":"Wyatt Arnold,&nbsp;Jonathan Gewirtzman,&nbsp;Peter A. Raymond,&nbsp;Mark A. Bradford,&nbsp;Claire Butler,&nbsp;Jordan Peccia","doi":"10.1111/2041-210X.14311","DOIUrl":"10.1111/2041-210X.14311","url":null,"abstract":"<p>\u0000 \u0000 </p>","PeriodicalId":208,"journal":{"name":"Methods in Ecology and Evolution","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":6.6,"publicationDate":"2024-04-22","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/2041-210X.14311","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"140799754","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"环境科学与生态学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Ghostbusting—Reducing bias due to identification errors in spatial capture-recapture histories 捉鬼--减少空间捕获-再捕获历史记录中识别误差造成的偏差
IF 6.6 2区 环境科学与生态学 Q1 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2024-04-21 DOI: 10.1111/2041-210X.14326
Abinand Reddy Kodi, Jasmin Howard, David Louis Borchers, Hannah Worthington, Justine Shanti Alexander, Purevjav Lkhagvajav, Gantulga Bayandonoi, Munkhtogtokh Ochirjav, Sergelen Erdenebaatar, Choidogjamts Byambasuren, Nyamzav Battulga, Örjan Johansson, Koustubh Sharma

识别个体是通过空间捕获-重捕法估算种群数量的关键,但有时也会出现识别错误。最常见的识别错误是无法识别先前检测到的个体,从而产生 "幽灵 "约翰逊。幽灵通常表现为捕获历史中的单个检测个体("单体")。为了解决幽灵问题,我们开发了一种以至少发现为条件的空间捕获-重捕方法。标准的空间捕获-再捕获(SCR)模型是(SCR-2)的特例。 我们通过模拟研究了 "单体 "幽灵对模型参数估计的影响。随着幽灵个体比例的增加,SCR 方法对丰度的估计越来越高,即使只有 10%的检测个体是幽灵个体,也会出现正偏差,而当 30%的个体是幽灵个体时,偏差在 43%到 71%之间。SCR-2 方法的估计值在有幽灵存在的情况下偏差较小,但精确度有所下降。SCR-2方法估计丰度的均方误差在高相遇率下有幽灵的所有情况下都较低,在低相遇率下有30%或更多幽灵的情况下也较低。我们还将我们的方法应用于蒙古两个地点的雪豹相机陷阱调查捕获历史记录,发现 SCR 方法在这两个地点都得出了更高的丰度估计值。SCR-2 方法可以消除幽灵捕获历史记录中的偏差,但会损失一些精度。我们建议在幽灵捕获量可能超过 10%的情况下或有大量单次探测捕获历史记录的调查中使用 SCR-2 方法,除非样本数量非常少。
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Modelling individual variability in habitat selection and movement using integrated step-selection analysis 利用综合阶跃选择分析法模拟栖息地选择和移动中的个体差异性
IF 6.6 2区 环境科学与生态学 Q1 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2024-04-15 DOI: 10.1111/2041-210X.14321
Nilanjan Chatterjee, David Wolfson, Dongmin Kim, Juliana Velez, Smith Freeman, Nathan M. Bacheler, Kyle Shertzer, J. Christopher Taylor, John Fieberg

综合阶跃选择分析(ISSA)经常用于利用动物运动数据研究栖息地选择。目前已开发出将随机效应纳入 ISSA 的方法,从而可以量化动物空间利用模式的变异性。尽管可以对生境选择和运动参数的变异性进行建模,但迄今为止的应用主要集中在前者,尽管运动在决定从个体到生态系统水平的生态过程中发挥着广泛认可的重要作用。造成这种遗漏的一个潜在原因是缺乏现成的软件或实例来演示在具有随机效应的 ISSA 中估计运动参数的方法。我们利用模拟数据集,并通过对包含 35 条红鲷鱼(Lutjanus campechanus)位置的声学遥测数据集进行两个模型拟合,展示了描述个体间运动和生境选择参数变异性的方法。运动核被假定为取决于鱼类所在的底栖珊瑚礁生境类型(模型 1)或鱼类当前位置与最近的边缘生境之间的距离(模型 2)。在这两个模型中,我们还量化了不同底栖生境类别的生境选择和与边缘生境的距离,并利用随机效应考虑了运动和生境选择参数的个体差异性。模拟示例强调了混合效应规格的优点,即我们可以通过借用同类个体的信息来提高估计个体运动参数的精度。在我们的应用实例中,我们发现个体间的栖息地选择和移动参数都存在很大的差异。尽管如此,大多数红鲷鱼还是选择了硬底栖息地和靠近边缘栖息地的地点。它们在硬底栖息地的移动也较少。转弯角度经常接近 ± π,但在远离边缘栖息地时则较为分散。我们提供了代码模板和函数,以便在实施具有随机效应的 ISSA 时量化运动和生境选择参数的变异性。我们希望通过这种方法鼓励生态学家在进行 ISSA 时充分利用其能力,为栖息地选择和运动模式的个体间变异性建模。
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Performance of five statistical methods to infer interactions among moving individuals in a predator–prey system 推断捕食者-猎物系统中移动个体间相互作用的五种统计方法的性能
IF 6.6 2区 环境科学与生态学 Q1 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2024-04-15 DOI: 10.1111/2041-210X.14323
Thibault Fronville, Niels Blaum, Stephanie Kramer-Schadt, Ulrike Schlägel, Viktoriia Radchuk

1 引言 动物移动是指个体空间位置随时间的变化,几乎是所有动物的一个关键行为过程。它不仅能满足生存和繁殖的基本要求,还能影响物种的地理分布,从而影响种群、群落和生态系统的结构、动态和遗传组成(Jeltsch 等人,2013 年;Nathan 等人,2008 年)。虽然直到最近,大多数研究都忽视了动物在移动生态学中可能存在的相互作用,但动物的移动往往不是相互独立的(Nathan 等人,2022 年;Vicsek &amp; Zafeiris,2012 年)。到目前为止,对这种相互作用的研究相对较少,但由于最近追踪技术的改进,可以收集到多个同时移动个体的高分辨率数据,这为此类研究提供了机会(Farley 等人,2018 年;Urbano 等人,2010 年)。然而,分析这些数据需要合适的方法来评估移动个体之间的相互作用。虽然最近开发出了几种推断此类互动的方法(Long 等人,2014 年;Niu 等人,2016 年;Schlaegel 等人,2019 年),但我们仍然不知道这些方法在特定条件下与其他方法相比表现如何。例如,被跟踪个体的比例、感知范围和跟踪持续时间如何影响这些方法推断交互作用的能力。我们通过关注捕食者和猎物的移动个体,并使用模拟来评估三种常用统计方法和两种新型统计方法的性能,填补了这一研究空白。移动个体之间的相互作用可简化为三大类型:回避、吸引和中立(Schlaegel 等人,2019 年)。例如,组成群体的社会性动物会一起向同一目的地移动,群体中的个体通常会表现出对其他群体成员的吸引,或在交配季节进行求偶。相反,猎物通常会逃离捕食者,表现出回避;竞争者相互回避也是如此。我们将捕食者-猎物系统作为研究系统,研究移动个体之间的这种相互作用,因为捕食者-猎物动力学已被广泛研究(Banks 等人,2004 年;Peterson,1999 年;Volterra,1931 年)。以前的研究主要集中在捕食者与猎物之间的相互作用如何影响种群和群落动态(Angerbjorn 等人,1999 年;Drossel 等人,2001 年;Schneider 等人,2012 年),但对捕食者和猎物在移动过程中如何进行行为互动却知之甚少。虽然我们选择研究捕食者-猎物系统中移动个体之间的相互作用,但我们的研究结果更普遍地适用于其他系统,在这些系统中,移动个体可能表现出吸引、回避或彼此独立移动。由于缺乏关于何时使用哪种方法的指导原则,而且有些方法对于没有很强编程能力的研究人员来说并不那么容易实现,这些都阻碍了实证主义者对这些方法的广泛使用。因此,本研究旨在比较现有统计方法的基本假设、数据要求以及在各种条件下的性能。我们这里所说的性能是指该方法检测真实交互作用的能力。为此,我们重点研究了五种统计方法(图 1c):三种常用的动态交互作用指数(Cs-社会性系数、Cr-相关系数和 DI-动态交互作用指数),它们在 "野生动物 DI "R 软件包(Long et al、Schlaegel等人,2019;以下简称SSF-OD),另一种方法则使用与其他移动个体的距离(Roeleke等人,2022;以下简称SSF-DIST)。这五种方法都是通过个体的运动轨迹来估计相互作用的。为了测试这些方法,我们用基于代理的模型(ABM,Grimm 等人,2006 年;Tang &amp; Bennett,2010 年)模拟了运动数据,因为它允许我们用已知的相互作用类型建立数据模型,并能轻松地改变多种因素,而这是观测数据无法做到的。运动的个体可能处于两种行为状态之一:持续运动和非持续运动,后者与相关随机行走非常相似。 (b) 我们通过改变与野外生态学家相关的四个因素来研究统计方法的性能:捕食者感知范围的四个等级;被追踪猎物比例的五个等级;时间分辨率的两个等级;追踪期持续时间的四个等级。(c) 对生成的运动轨迹采用了五种不同的统计方法。上面的三个(Cs、Cr、DI)是交互指数,下面的两个是基于 SSF 的方法。我们通过在基于代理的模型模拟中操纵四个因素来研究这五种方法的性能(表 1)。其中一个因素反映了所研究物种的生物学特性,代表了捕食者的感知范围。其他三个因素可能会受到野外研究人员的影响,因此,如果以评估相互作用为目的,这三个因素将有助于优化数据收集。第一个因素是被追踪个体的比例。了解其对方法性能的影响至关重要,因为标记所有个体的成本很高,而且在后勤上也很困难。例如,Liu 等人(2015 年)发现,建议分析群体中的大量个体子集,以获得更准确的群体运动特征。接下来,我们研究了时间分辨率和追踪时间对方法的影响。鉴于快速发展的技术(Farley 等人,2018 年)能够以越来越高的时间分辨率追踪个体,因此了解时间分辨率对推断运动互动的影响至关重要。事实上,某些运动行为和模式可能只有在高时间分辨率下才能检测到(Nathan等人,2022年),而低时间分辨率可能会掩盖或削弱重要的生物信息(Mannocci等人,2017年;Postlethwaite &amp; Dennis,2013年)。然而,高分辨率数据也可能是一种负担,因为它往往需要更多的存储和处理能力(McCrea 等人,2023 年),而且必须拟合复杂的模型,解释这些模型具有挑战性。对动物进行追踪的时间也很重要,因为这可能会受到追踪设备寿命甚至动物福利法规的限制(Teague O'Mara 等人,2014 年)。本研究中用于评估运动数据交互作用的五种方法概述。方法参考文献描述解释社会性系数(Cs)Kenward et al.(1993)Differences between mean distance of all simultaneous fixes and mean expected distance obtained with permutations of all fixesCs ~ + 1 AttractionCs ~ - 1 AvoidanceCs ~ 0 NeutralCorrelation index (Cr)Shirabe (2006)Correlation of movement segments of two animals with respect to the overall path means.正相关Cr ~ - 1 负相关Cr ~ 0 中性动态交互指数 (DI)Long 和 Nelson (2013)两只动物运动片段的凝聚力、与距离和方向有关DI ~ + 1 凝聚运动DI ~ - 1 排斥运动DI ~ 0 中性基于出现率分布的阶跃选择函数方法(SSF-OD)Schlaegel 等人(2019)将阶跃选择函数应用于 "湍流 "和 "漩涡 "的研究,发现 "湍流 "和 "漩涡 "在湍流和漩涡的出现率分布上存在显著差异。(2019)Step-selection functions applied to occurrence distributions of individuals obtained through kriging of their movement pathSSF ~ + 1 AttractionSSF ~ - 1 Avoi
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Methods in Ecology and Evolution
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