首页 > 最新文献

Freshwater Biology最新文献

英文 中文
Environmental DNA metabarcoding in the Cape Fold aquatic ecoregion: Opportunities and challenges for eDNA uptake in an endemism hotspot 褶皱角水生生态区的环境 DNA 代谢编码:在一个地方性热点地区吸收 eDNA 的机遇与挑战
IF 2.8 2区 生物学 Q2 ECOLOGY Pub Date : 2024-09-18 DOI: 10.1111/fwb.14331
Alexander Van Nynatten, Rowshyra A. Castañeda, Albert Chakona, Nathan R. Lovejoy, Olaf L. F. Weyl, Nicholas E. Mandrak

环境 DNA(eDNA)元编码有可能极大地改善淡水系统生物多样性的调查。然而,这种方法在全球特有物种热点地区仍很少使用,部分原因是 eDNA 代谢标码的成功有两大障碍:(1)公共参考序列数据库中的区域分类代表性不足;(2)与传统调查相比,物种发生率和丰度估计不一致。我们在南非开普福德水生生态区的两条河流的上游采集了 eDNA 样本并进行了目测调查。我们为鱼类的区域多样性建立了参考序列数据库,以改进特有物种的分类。我们还比较了每个采样点的 eDNA 代谢编码序列结果和目测调查(浮潜和水下摄像机)得出的鱼类发生率数据和相对丰度估计值的一致性。在没有补充当地特有物种参考序列数据库的情况下,仅有 1%的 eDNA 元条码读数可归类为鱼类物种。在补充了区域参考序列后,共检测到 9 个物种,99% 的读数被分类。使用 eDNA 和目测方法检测到的物种之间存在很强的正相关关系(Φ = 0.75)。然而,eDNA 代谢标码比目测方法检测到更多的物种。此外,在所调查的大多数小水池中,目测调查所观察到的相对读数频率与丰度存在显著相关性(R2 = 0.85-0.88, p <0.001)。不完整的公共参考序列数据库阻碍了 eDNA 代谢标码在高流行区的应用。本地参考序列库可以克服这些挑战。如果实施得当,eDNA 代谢标码将大有可为,其结果将与更常用且劳动密集型的目测调查一致或更好。目前迫切需要像 eDNA 代谢标定这样高效的调查方法来改善全球的水生生物监测工作。了解 eDNA 代谢标定测序结果与传统调查方法之间的关系是在高地方性生态区域实施该方法的关键一步。
{"title":"Environmental DNA metabarcoding in the Cape Fold aquatic ecoregion: Opportunities and challenges for eDNA uptake in an endemism hotspot","authors":"Alexander Van Nynatten,&nbsp;Rowshyra A. Castañeda,&nbsp;Albert Chakona,&nbsp;Nathan R. Lovejoy,&nbsp;Olaf L. F. Weyl,&nbsp;Nicholas E. Mandrak","doi":"10.1111/fwb.14331","DOIUrl":"10.1111/fwb.14331","url":null,"abstract":"<p>\u0000 \u0000 </p>","PeriodicalId":12365,"journal":{"name":"Freshwater Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":2.8,"publicationDate":"2024-09-18","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/fwb.14331","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"142247292","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Issue Information - Cover and Ed Board 发行信息 - 封面和 Ed Board
IF 2.8 2区 生物学 Q2 ECOLOGY Pub Date : 2024-09-17 DOI: 10.1111/fwb.14132
{"title":"Issue Information - Cover and Ed Board","authors":"","doi":"10.1111/fwb.14132","DOIUrl":"https://doi.org/10.1111/fwb.14132","url":null,"abstract":"","PeriodicalId":12365,"journal":{"name":"Freshwater Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":2.8,"publicationDate":"2024-09-17","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/fwb.14132","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"142244393","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Anuran occupancy varies with stream characteristics and flow across Arizona wilderness areas 在亚利桑那州的荒野地区,有尾类动物的栖息地随溪流特征和流量的变化而变化
IF 2.8 2区 生物学 Q2 ECOLOGY Pub Date : 2024-09-17 DOI: 10.1111/fwb.14334
Margaret A. Huck, Heather L. Bateman, Fábio Suzart de Albuquerque, Jesse S. Lewis

在美国西部干旱地区,河岸生态系统只占不到 2% 的面积,但却为一半以上的干旱地区野生动物提供了栖息地和资源,其中包括种类繁多的无尾类动物(青蛙和蟾蜍)。尽管如此,描述西南部河岸底栖动物群落的研究相对较少,偏远荒野地区的调查尤其不足。我们采用了被动声学监测技术来捕捉美国亚利桑那州佛得河荒野地区支流中的无尾类广告叫声。在 2021 年和 2022 年的春季和夏季,我们沿常年、间歇和短暂的支流河段部署了 13-29 个自主记录单元(ARUs)。我们根据每个自动记录单元 100 米范围内的水池、涟漪、流水和边沟栖息地的百分比来确定地点的特征,并对基质、湿润河道宽度和树冠覆盖率进行量化。为了将无尾类动物的栖息地与环境和水文变量联系起来,我们使用单物种、单季节栖息地模型对声学探测数据进行了评估。本研究检测到了四种物种:峡谷树蛙(Hyla arenicolor)、红点蟾蜍(Anaxyrus punctatus)、伍德豪斯蟾蜍(Anaxyrus woodhousii)和非本地美洲牛蛙(Lithobates catesbeianus),其中峡谷树蛙是观察到的最普遍的物种。峡谷树蛙在多年生和间歇性水域的发声活动比在短暂水域的发声活动要高,水池的存在与峡谷树蛙的栖息地关系最为密切。持续、缓慢流动的水最能预示峡谷树蛙繁殖的存在。值得注意的是,本研究未在佛得河中游流域发现几个有历史记录的物种,包括亚利桑那蟾蜍(Anaxyrus microscaphus)和北方豹蛙(Lithobates pipiens)。鉴于气候变化导致的流量减少以及全球干旱地区对水的需求不断增加,保持溪流流量,为无尾类动物的繁殖和幼体发育提供稳定、适宜的水文条件变得越来越重要。确定支持无尾类种群所需的栖息地使用情况和水流机制有助于确定与水管理相关的保护行动的优先次序,并预测水供应的变化可能会如何影响溪流繁殖的无尾类。
{"title":"Anuran occupancy varies with stream characteristics and flow across Arizona wilderness areas","authors":"Margaret A. Huck,&nbsp;Heather L. Bateman,&nbsp;Fábio Suzart de Albuquerque,&nbsp;Jesse S. Lewis","doi":"10.1111/fwb.14334","DOIUrl":"10.1111/fwb.14334","url":null,"abstract":"<p>\u0000 \u0000 </p>","PeriodicalId":12365,"journal":{"name":"Freshwater Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":2.8,"publicationDate":"2024-09-17","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"142247291","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Temperature and light timing effects on diapause progression in Daphnia magna 温度和光照时间对大型蚤休眠期进展的影响
IF 2.8 2区 生物学 Q2 ECOLOGY Pub Date : 2024-09-13 DOI: 10.1111/fwb.14329
Luxi Chen, Rocío Gómez, Martin Horstmann, Linda C. Weiss

休眠是水蚤属淡水甲壳类动物的一种生存策略,包括通过基因编码抑制生物体的生长、发育和繁殖。虽然水蚤产生停顿期胚胎的环境诱因和诱导孵化的环境诱因已被充分记录,但在不同的停顿期子阶段,环境挑战的影响仍有待探索。在这项研究中,我们在指定的休眠亚阶段将大型水蚤的休眠胚胎暴露在不同的温度和光照条件下。我们的研究结果强调了母体环境对准备进入休眠期的胚胎的重要性。此外,我们还展示了一个强制性发育停滞期,在此期间无法触发发育重启。此外,我们还展示了胚胎在孵化过程中根据环境变化调整孵化的能力。这项研究揭示了水蚤胚胎在休眠期的固有发育模式及其对环境变化的适应能力。
{"title":"Temperature and light timing effects on diapause progression in Daphnia magna","authors":"Luxi Chen,&nbsp;Rocío Gómez,&nbsp;Martin Horstmann,&nbsp;Linda C. Weiss","doi":"10.1111/fwb.14329","DOIUrl":"10.1111/fwb.14329","url":null,"abstract":"<p>\u0000 \u0000 </p>","PeriodicalId":12365,"journal":{"name":"Freshwater Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":2.8,"publicationDate":"2024-09-13","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/fwb.14329","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"142247293","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Metacommunity structures of dormant and active zooplankton in two distant mediterranean regions 两个遥远的地中海地区休眠和活跃浮游动物的元群落结构
IF 2.8 2区 生物学 Q2 ECOLOGY Pub Date : 2024-09-10 DOI: 10.1111/fwb.14322
Camila López-Allendes, Ángel Gálvez, Xavier Armengol, Bárbara Alvado, Andreu Castillo-Escrivà, Francesc Mesquita-Joanes, Stéphanie Gascón, Rodrigo Ramos-Jiliberto, Carla Olmo

临时池塘是定期干涸的小型湖泊系统。潮湿期的长短决定了水文条件,也决定了暂养池塘中的群落组合。浮游动物物种通过采取一些休眠策略(如形成休眠阶段)来适应干燥。休眠期的孵化是干旱事件后重新定居的一个来源,孵化类群的组成也受水文条件的影响。我们比较了智利中部和西班牙东部两个地中海气候区半永久性和季节性临时池塘中休眠亚群落(休眠阶段)、先驱活跃亚群落(池塘淹没后立即出现的动物)和累积活跃亚群落(水文周期初期、中期和末期出现的动物)的元群落结构和组成。我们的目的是确定水文条件的影响,并确定地中海气候地区之间的元群落模式是否一致。我们在每个地区选择了五个半永久性池塘和五个季节性池塘,对沉积物和活跃的浮游动物亚群落进行取样。通过将沉积物中的孵化实验与野外样本中活性浮游动物的直接计数相结合,我们收集了休眠亚群落和活性亚群落的数据,从而建立了每个池塘中物种出现的非加权双方格网络。我们对获得的网络进行了分析,以确定元群落结构特征(多样性、嵌套性和模块性)的季节性趋势及其与水文条件(半永久性和季节性)和地理位置(智利和西班牙)的关系。在比较不同演替阶段(休眠期、先驱活跃期和累积活跃期)和不同水文条件(半永久性和季节性)下的亚群落时,我们观察到群落结构存在一致的差异。α-和γ-多样性呈现出一致的趋势,即累积活跃亚群落的多样性最高,而休眠亚群落的多样性最低,而且无论在哪个地区,季节性池塘的α-和γ-多样性都更高。此外,在两个地区,先驱活跃亚群落的 β-多样性都较高,不同水文制度之间没有显著差异。与先锋亚群落和休眠亚群落相比,累积活跃亚群落的物种组成异质性较低。不同亚群落和不同水文条件下的模块化和嵌套度值没有发现一致的模式。与我们的假设一致的是,我们观察到在这两个区域,随着时间的推移,分类群逐渐积累,群落也逐渐同质化。与我们的预期相反,水文过程并没有影响这些模式,而且令人惊讶的是,较短的水文周期表现出更高的区域多样性。我们的研究结果表明,作为单一变量的水文过程对暂养池塘的元群落组合没有很强的解释力。因此,需要一个更全面的理论来预测即将到来的水文周期缩短的影响。
{"title":"Metacommunity structures of dormant and active zooplankton in two distant mediterranean regions","authors":"Camila López-Allendes,&nbsp;Ángel Gálvez,&nbsp;Xavier Armengol,&nbsp;Bárbara Alvado,&nbsp;Andreu Castillo-Escrivà,&nbsp;Francesc Mesquita-Joanes,&nbsp;Stéphanie Gascón,&nbsp;Rodrigo Ramos-Jiliberto,&nbsp;Carla Olmo","doi":"10.1111/fwb.14322","DOIUrl":"10.1111/fwb.14322","url":null,"abstract":"<p>\u0000 \u0000 </p>","PeriodicalId":12365,"journal":{"name":"Freshwater Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":2.8,"publicationDate":"2024-09-10","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"142206881","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Homogenization of fish assemblages in an endemic biodiversity hot spot: Evidence from 70-year data from the Yun-Gui Plateau, China 特有生物多样性热点地区鱼类组合的同质化:来自中国云贵高原 70 年数据的证据
IF 2.8 2区 生物学 Q2 ECOLOGY Pub Date : 2024-09-10 DOI: 10.1111/fwb.14325
Lei Shi, Tao Xiang, Xianghong Dong, Chi Xu, Haijun Wang, Erik Jeppesen, Ping Xie

人类活动和全球气候变化的综合影响威胁着本地鱼类群落。这些威胁在拥有众多特有物种的生物多样性热点地区尤为严重,中国与世隔绝的云贵高原就是一例。在这些地区,生物同质化的风险预计也会很高,但对这种风险及其潜在驱动因素的研究仍然很少。在此,我们建立了一个鱼类分布数据库,并使用环境筛选法对云贵高原流域的鱼类进行空间聚类(n = 3759)。该数据库基于公共数据来源,并对 1950 年至 2021 年期间的相关文献(n = 481)进行了全面回顾。我们将云贵高原分为九个子流域进行空间比较,并将其分为两个时期进行时间比较--1978 年经济开始快速增长发展之前和之后。我们发现:(a)替换(不同子流域的物种交换)和相似性指数略有增加,但物种丰富度差异指数有所下降,这表明整个高原的物种同质化和自然屏障的丧失;(b)物种丰富度增加的同时,系统发育多样性明显下降,这也表明高原物种同质化;(c)通过物种损失-增益分析,物种丰富度的增加与所有子流域的气候变量(温度和降水)、海拔高度和人类活动有关。时空比较表明,气候和人为压力加剧了云贵高原鱼类种群的同质化。观察到的鱼类物种同质化现象令人担忧,我们呼吁进行系统评估并采取预防性缓解行动,以保持云贵高原地区生物多样性的独特性。
{"title":"Homogenization of fish assemblages in an endemic biodiversity hot spot: Evidence from 70-year data from the Yun-Gui Plateau, China","authors":"Lei Shi,&nbsp;Tao Xiang,&nbsp;Xianghong Dong,&nbsp;Chi Xu,&nbsp;Haijun Wang,&nbsp;Erik Jeppesen,&nbsp;Ping Xie","doi":"10.1111/fwb.14325","DOIUrl":"10.1111/fwb.14325","url":null,"abstract":"<p>\u0000 \u0000 </p>","PeriodicalId":12365,"journal":{"name":"Freshwater Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":2.8,"publicationDate":"2024-09-10","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"142206876","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Reciprocal transplant experiments demonstrate a dynamic coevolutionary relationship between parasitic mussel larvae and bitterling fishes 互惠移植实验证明了寄生贻贝幼虫与苦味鱼之间的动态共同进化关系
IF 2.8 2区 生物学 Q2 ECOLOGY Pub Date : 2024-09-09 DOI: 10.1111/fwb.14324
Abhishek Nair Anil, Imane Mehdi, Karel Douda, Carl Smith, Martin Reichard

宿主与寄生虫之间的共同进化动态从严格的局部适应到扩散的行会共同进化各不相同。先天和后天免疫反应如何调节宿主对寄生虫的抵抗力,宿主的特异性和地理尺度如何影响宿主反应的效力,这些都会对范围动态和生物入侵产生影响。通过相互移植实验,我们测试了在欧洲和东亚的苦丁鱼与淡水贻贝幼体(球藻)之间的寄主-寄生虫关系中,局部或扩散的共同进化是否会影响寄主对寄生虫的反应。我们发现,钩毛蚴最初会不加区分地附着在所有研究宿主物种上,但在感染后24小时内,宿主的免疫反应会出现显著差异,这种差异在钩毛蚴发育过程中会加剧。欧洲苦木对欧洲钩毛虫的抗性较强,亚洲苦木对亚洲钩毛虫的抗性较强,其中亚洲苦木寄主的抗性地域偏差最大。这一发现表明当地适应性的影响很大,但也表明共同进化热点的作用不容忽视。因此,苦丁属物种上的低自然钩毛虫负载量总体上是由合格的免疫反应而非钩毛虫回避行为引起的。苦树的免疫反应主要是先天性的,而不是后天获得的。总之,我们的数据证明了寄生虫压力对宿主抗性进化的复杂影响,以及地理结构上的共同进化在形成宿主反应中的重要作用。
{"title":"Reciprocal transplant experiments demonstrate a dynamic coevolutionary relationship between parasitic mussel larvae and bitterling fishes","authors":"Abhishek Nair Anil,&nbsp;Imane Mehdi,&nbsp;Karel Douda,&nbsp;Carl Smith,&nbsp;Martin Reichard","doi":"10.1111/fwb.14324","DOIUrl":"10.1111/fwb.14324","url":null,"abstract":"<p>\u0000 \u0000 </p>","PeriodicalId":12365,"journal":{"name":"Freshwater Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":2.8,"publicationDate":"2024-09-09","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/fwb.14324","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"142206877","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Anthropogenic and environmental risk factors of salmonid predation in a tidal freshwater delta 潮汐淡水三角洲鲑鱼捕食的人为和环境风险因素
IF 2.8 2区 生物学 Q2 ECOLOGY Pub Date : 2024-09-09 DOI: 10.1111/fwb.14321
T. Reid Nelson, Brendan M. Lehman, Nicholas J. Demetras, Lance Takata, Matthew J. Young, Frederick Feyrer, Cyril J. Michel

支持农业和市政用水的引水工程会通过夹带和撞击造成鱼类死亡。此外,这些基础设施可能会吸引捕食者和猎物鱼类,从而增加这些人为接触点附近的捕食率和猎物死亡率。位于加利福尼亚中央河谷的萨克拉门托-圣华金三角洲(三角洲)是一个潮汐淡水生态系统,它输出大量的水用于市政和农业,同时也为濒危鱼类提供了宝贵的洄游和繁殖栖息地。迁徙的幼年鲑鱼在三角洲的死亡率很高,非本地鱼类的捕食是主要原因。因此,这项研究有三个主要目标。首先,我们确定小型引水是否会像淡水生态系统中的其他类似结构一样聚集食鱼鱼类。第二,结合其他已知的捕食风险因素(如捕食者数量、温度和水深),确定小型引水工程如何影响幼年鲑鱼的捕食风险。第三,我们评估了捕食者的组合、丰度和分布,以确定目标一和目标二中可能的捕食者组成。在整个 2021 年春季,我们使用 ARIS(自适应分辨率成像声纳;Sound Metrics)声纳来比较北三角洲 30 个分水口与不包含这些结构的分水口附近海岸线的食鱼动物丰度。我们使用捕食事件记录器 (PER) 评估幼年鲑鱼所面临的捕食风险、与引水渠的线性距离(米)以及北三角洲的其他捕食风险因素。最后,我们使用船上电鱼调查来确定食鱼动物群落,并比较这些水道中黑鲈鱼(Micropterus spp.)CPUE 和相对丰度的空间趋势。与邻近的海岸线相比,小型引水道附近的鱼类丰度更高,幼年鲑鱼的捕食风险随着引水道的靠近而增加。此外,捕食风险随着鱼类丰度的增加和水深的降低而增加。北三角洲捕食者组合以黑鲈(Micropterus spp.)为主,考虑到这些物种对栖息地的要求,这可能导致捕食风险与水深呈负相关。此外,考虑到小口鲈鱼(Micropterus dolomieu)和斑点鲈鱼(Micropterus punctulatus)对新陈代谢的要求,北部研究地点小口鲈鱼(Micropterus dolomieu)和斑点鲈鱼(Micropterus punctulatus)数量的增加可能会削弱温度对捕食的影响。我们的工作表明,小规模引水可能会增加濒危鲑科鱼类的死亡率,而且北三角洲捕食者组合与该系统以前的工作记录不同,从而改变了捕食风险因素。虽然还需要做更多的工作来确定引水对种群的影响,但由于这些结构无处不在,因此有必要采取管理办法来降低这一来源造成的死亡率。这些结果表明,除了夹带和撞击外,引水还可能通过吸引捕食者和提高捕食风险来增加小体型鱼类的死亡率。鉴于人类对淡水的持续需求,在评估取水口基础设施缓解措施时,应将捕食者与猎物之间的相互作用与夹带和撞击一并考虑,尤其是当引水同时出现在洄游路线和濒危鱼类的重要栖息地时。
{"title":"Anthropogenic and environmental risk factors of salmonid predation in a tidal freshwater delta","authors":"T. Reid Nelson,&nbsp;Brendan M. Lehman,&nbsp;Nicholas J. Demetras,&nbsp;Lance Takata,&nbsp;Matthew J. Young,&nbsp;Frederick Feyrer,&nbsp;Cyril J. Michel","doi":"10.1111/fwb.14321","DOIUrl":"10.1111/fwb.14321","url":null,"abstract":"<p>\u0000 \u0000 </p>","PeriodicalId":12365,"journal":{"name":"Freshwater Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":2.8,"publicationDate":"2024-09-09","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/fwb.14321","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"142206883","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
A sedimentary DNA perspective about the influence of environmental and food-web changes on the microbial eukaryotic community of Lake Biwa 从沉积 DNA 的角度看环境和食物网变化对琵琶湖微生物真核生物群落的影响
IF 2.8 2区 生物学 Q2 ECOLOGY Pub Date : 2024-09-06 DOI: 10.1111/fwb.14326
Eric Capo, Maïlys Picard, Kai Nakane, Michinobu Kuwae, Stefan Bertilsson, Maiko Kagami, Xin Liu, Yoichiro Sakai, Narumi Tsugeki

几十年来,人们一直在探索环境变化对琵琶湖的影响,水体监测和古生物学研究揭示了环境胁迫(包括气候变暖、富营养化、水位调节和人类对鱼类种群的操纵)是如何影响琵琶湖食物网的。然而,这些研究很少考虑微生物食物网的组成部分。造成这一知识空白的主要原因是缺乏时间跨度超过几十年的时间序列,再加上识别属于非常多样化群体的生物需要很高的分类学专业知识。使用沉积 DNA 方法可以重建水生系统微生物真核生物群落的多样性、组成和结构在过去的变化。18S 代谢条形码的应用已被证明可以成功地描述湖泊生态系统中单细胞真核生物(原生生物)和水生真菌的反应,包括大量的分类和功能多样性,如光养生物、异养生物和混养生物。我们对琵琶湖过去 100 年间的 31 个沉积物核心样本应用了 18S 代谢编码,并探讨了 1973-2010 年间微生物真核生物群落对多种环境压力变化的响应,包括营养水平、湖水水位、气候以及鱼类和浮游动物生物量的变化。我们发现,水位的调节和鱼类群落组成的变化是(间接)影响湖泊微生物真核生物群落结构的主要因素,气候变暖和磷含量的影响较小,但也很显著。共现网络分析强调了食物网对微生物真核生物群落的潜在影响,表明该区块的生物同时受到自下而上和自上而下过程的影响。
{"title":"A sedimentary DNA perspective about the influence of environmental and food-web changes on the microbial eukaryotic community of Lake Biwa","authors":"Eric Capo,&nbsp;Maïlys Picard,&nbsp;Kai Nakane,&nbsp;Michinobu Kuwae,&nbsp;Stefan Bertilsson,&nbsp;Maiko Kagami,&nbsp;Xin Liu,&nbsp;Yoichiro Sakai,&nbsp;Narumi Tsugeki","doi":"10.1111/fwb.14326","DOIUrl":"10.1111/fwb.14326","url":null,"abstract":"<p>\u0000 \u0000 </p>","PeriodicalId":12365,"journal":{"name":"Freshwater Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":2.8,"publicationDate":"2024-09-06","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/fwb.14326","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"142206878","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Relationship between fish traits and the methane-derived carbon contribution to fish in a shallow lake 浅水湖中鱼类特征与甲烷衍生碳对鱼类贡献之间的关系
IF 2.8 2区 生物学 Q2 ECOLOGY Pub Date : 2024-08-20 DOI: 10.1111/fwb.14319
Kenji Tsuchiya, Shin-ichiro S. Matsuzaki, Ayato Kohzu

尽管甲烷衍生碳(MDC)向摇蚊幼虫和寡毛类等底栖大型无脊椎动物转移的情况已被充分记录,但有关 MDC 向鱼类转移的知识却很有限。我们调查了日本霞浦湖中 28 种鱼类在各个生长阶段对 MDC 的贡献,并研究了鱼类特征(包括体型)与鱼类物种内 MDC 贡献之间的关系。我们使用碳稳定同位素比和双源混合模型(甲烷氧化细菌 [MOB] 和颗粒有机物)来估算 MDC 对鱼类的贡献。单条鱼的 MDC 贡献率从 0% 到 21.5% 不等。鳗鲡的甲烷氧化菌贡献率最高(平均为 3.8%)。根据两个标准将鱼类物种分为四组:(a) MDC 贡献率与鱼体大小(物种内)之间的相关性是否为显著负相关(负相关与不显著相关;ns);以及 (b) MDC 贡献率的第 90 百分位数是否为 0%。(a)ns/(b)>0%组的平均 MDC 贡献率最高(2.18% ± 2.93%,12 个物种),包括 Abbottina rivularis(平均 5.5%)和 Biwia zezera(平均 9.8%)等高贡献率物种。这组物种(12 种)包括数量相对较多的底栖栖息地利用物种(8 种)和杂食物种(9 种)。(a)ns/(b)=0%组(7 个物种)的平均 MDC 贡献率几乎为零,该组仅包括 2 个使用底栖栖息地的物种和 1 个杂食物种。其他组的平均 MDC 贡献率介于(a)负/(b)>0%(1.30% ± 1.17%,7 个物种)和(a)负/(b)=0%(0.10%,2 个物种)之间。在(a)负/(b)>0%和(a)负/(b)=0%的群体中,种内鱼体大小与MDC贡献率之间呈负相关,这表明本体栖息地和食性的改变引起了MDC转移的变化。我们的研究结果表明,28种鱼类中有21种参与了浅水湖泊中的MDC转移,但MDC转移的变化可以用鱼类的性状(营养行会和生境利用)来解释。虽然所有鱼类物种的平均 MDC 贡献率较低(0.61% ± 1.97%),但粗略估计的鱼类对 MOB 的年消耗率约相当于沉积物中 MOB 产量的 10%,这表明从生物地球化学循环的角度来看,鱼类对甲烷动态有贡献。
{"title":"Relationship between fish traits and the methane-derived carbon contribution to fish in a shallow lake","authors":"Kenji Tsuchiya,&nbsp;Shin-ichiro S. Matsuzaki,&nbsp;Ayato Kohzu","doi":"10.1111/fwb.14319","DOIUrl":"10.1111/fwb.14319","url":null,"abstract":"<p>\u0000 \u0000 </p>","PeriodicalId":12365,"journal":{"name":"Freshwater Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":2.8,"publicationDate":"2024-08-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"142206905","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":2,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
期刊
Freshwater Biology
全部 Acc. Chem. Res. ACS Applied Bio Materials ACS Appl. Electron. Mater. ACS Appl. Energy Mater. ACS Appl. Mater. Interfaces ACS Appl. Nano Mater. ACS Appl. Polym. Mater. ACS BIOMATER-SCI ENG ACS Catal. ACS Cent. Sci. ACS Chem. Biol. ACS Chemical Health & Safety ACS Chem. Neurosci. ACS Comb. Sci. ACS Earth Space Chem. ACS Energy Lett. ACS Infect. Dis. ACS Macro Lett. ACS Mater. Lett. ACS Med. Chem. Lett. ACS Nano ACS Omega ACS Photonics ACS Sens. ACS Sustainable Chem. Eng. ACS Synth. Biol. Anal. Chem. BIOCHEMISTRY-US Bioconjugate Chem. BIOMACROMOLECULES Chem. Res. Toxicol. Chem. Rev. Chem. Mater. CRYST GROWTH DES ENERG FUEL Environ. Sci. Technol. Environ. Sci. Technol. Lett. Eur. J. Inorg. Chem. IND ENG CHEM RES Inorg. Chem. J. Agric. Food. Chem. J. Chem. Eng. Data J. Chem. Educ. J. Chem. Inf. Model. J. Chem. Theory Comput. J. Med. Chem. J. Nat. Prod. J PROTEOME RES J. Am. Chem. Soc. LANGMUIR MACROMOLECULES Mol. Pharmaceutics Nano Lett. Org. Lett. ORG PROCESS RES DEV ORGANOMETALLICS J. Org. Chem. J. Phys. Chem. J. Phys. Chem. A J. Phys. Chem. B J. Phys. Chem. C J. Phys. Chem. Lett. Analyst Anal. Methods Biomater. Sci. Catal. Sci. Technol. Chem. Commun. Chem. Soc. Rev. CHEM EDUC RES PRACT CRYSTENGCOMM Dalton Trans. Energy Environ. Sci. ENVIRON SCI-NANO ENVIRON SCI-PROC IMP ENVIRON SCI-WAT RES Faraday Discuss. Food Funct. Green Chem. Inorg. Chem. Front. Integr. Biol. J. Anal. At. Spectrom. J. Mater. Chem. A J. Mater. Chem. B J. Mater. Chem. C Lab Chip Mater. Chem. Front. Mater. Horiz. MEDCHEMCOMM Metallomics Mol. Biosyst. Mol. Syst. Des. Eng. Nanoscale Nanoscale Horiz. Nat. Prod. Rep. New J. Chem. Org. Biomol. Chem. Org. Chem. Front. PHOTOCH PHOTOBIO SCI PCCP Polym. Chem.
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
0
微信
客服QQ
Book学术公众号 扫码关注我们
反馈
×
意见反馈
请填写您的意见或建议
请填写您的手机或邮箱
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
现在去查看 取消
×
提示
确定
Book学术官方微信
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术
文献互助 智能选刊 最新文献 互助须知 联系我们:info@booksci.cn
Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。
Copyright © 2023 Book学术 All rights reserved.
ghs 京公网安备 11010802042870号 京ICP备2023020795号-1