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Extracción y análisis de metabolitos fenólicos apoplásticos en raíz y tallo de clavel (Dianthus caryophyllus L) 香石竹根和茎中无融合生殖酚类代谢物的提取与分析
IF 0.8 Pub Date : 2022-09-06 DOI: 10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.99258
Ana Patricia Martínez González, Ericsson Coy-Barrera, Harold Duban Ardila Barrantes
En el presente estudio se describe el acondicionamiento de algunos parámetros con fines de obtención eficiente de extractos apoplásticos enriquecidos en compuestos polares, principalmente fenólicos. Este flujo de trabajo descrito, incluso, puede ser aplicado a diferentes especies vegetales para ser empleado en el análisis particular o global de metabolitos en este espacio extracelular periférico. Para ello, usando raíces y tallos de clavel (Dianthus cariophyllus L), se evaluaron diferentes soluciones de infiltración para la extracción de los metabolitos apoplásticos. El mejor resultado se logró con la disolución amortiguadora NaH2PO4-Na2HPO4 0,1 M pH 6,5/NaCl 50 mM, porque se obtiene la mayor cantidad de metabolitos fenólicos apoplásticos, con la menor contaminación de compuestos intracelulares. Los metabolitos se separaron mediante HPLC-DAD-ESI-MS, obteniendo perfiles cromatográficos con parámetros de calidad razonables basados en resolución, selectividad y número de platos teóricos. Con estas condiciones, fue posible identificar ocho compuestos diferenciales (una flavona y siete flavonoles), cuyas estructuras básicas comprendían flavonoides del tipo (iso)pratol, kaempférido, (dihidro)kaempferol, quercetina y miricetina, según el órgano de prueba y la variedad. Los flavonoides identificados están relacionados con metabolitos de tipo fitoanticipina en el clavel, como hidroxi-metoxiflavona, di-o-benzoilquercetina y kaempférido disaliciloilrhamnósido, abundantemente presentes en la variedad resistente. Las condiciones descritas en este trabajo son fundamentales para profundizar en el papel de los metabolitos fenólicos apoplásticos relacionados con los mecanismos de defensa de esta planta ornamental. 
在这一过程中,我们发现了一种新的抗氧化活性,这是一种非常有效的抗氧化活性。所描述的工作流程甚至可以应用于不同的植物物种,用于该外周细胞外空间的特定或整体代谢物分析。在本研究中,我们评估了不同浸润溶液对凋亡代谢产物提取的影响。采用NaH2PO4-Na2HPO4缓冲溶液0.1 M pH 6.5 /NaCl 50 mM,获得最多的凋亡酚代谢物,细胞内化合物污染最少。采用HPLC-DAD-ESI-MS分离代谢物,得到基于分辨率、选择性和理论板数的合理质量参数的色谱图。在此条件下,根据检测器官和品种的不同,鉴定出8种不同的化合物(1种黄酮和7种黄酮醇),其基本结构包括黄酮类型(iso)pratol、山奈酚、(二氢)山奈酚、槲皮素和杨梅素。这些化合物与康乃馨中的植物预期代谢物有关,如羟基甲氧基黄酮、二-o-苯甲酰槲皮素和山奈菲德二烯丙基鼠李糖苷,这些化合物在抗性品种中大量存在。在本研究中,我们分析了不同的抗氧化活性和抗氧化活性,以确定抗氧化活性和抗氧化活性之间的关系。
{"title":"Extracción y análisis de metabolitos fenólicos apoplásticos en raíz y tallo de clavel (Dianthus caryophyllus L)","authors":"Ana Patricia Martínez González, Ericsson Coy-Barrera, Harold Duban Ardila Barrantes","doi":"10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.99258","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.99258","url":null,"abstract":"En el presente estudio se describe el acondicionamiento de algunos parámetros con fines de obtención eficiente de extractos apoplásticos enriquecidos en compuestos polares, principalmente fenólicos. Este flujo de trabajo descrito, incluso, puede ser aplicado a diferentes especies vegetales para ser empleado en el análisis particular o global de metabolitos en este espacio extracelular periférico. Para ello, usando raíces y tallos de clavel (Dianthus cariophyllus L), se evaluaron diferentes soluciones de infiltración para la extracción de los metabolitos apoplásticos. El mejor resultado se logró con la disolución amortiguadora NaH2PO4-Na2HPO4 0,1 M pH 6,5/NaCl 50 mM, porque se obtiene la mayor cantidad de metabolitos fenólicos apoplásticos, con la menor contaminación de compuestos intracelulares. Los metabolitos se separaron mediante HPLC-DAD-ESI-MS, obteniendo perfiles cromatográficos con parámetros de calidad razonables basados en resolución, selectividad y número de platos teóricos. Con estas condiciones, fue posible identificar ocho compuestos diferenciales (una flavona y siete flavonoles), cuyas estructuras básicas comprendían flavonoides del tipo (iso)pratol, kaempférido, (dihidro)kaempferol, quercetina y miricetina, según el órgano de prueba y la variedad. Los flavonoides identificados están relacionados con metabolitos de tipo fitoanticipina en el clavel, como hidroxi-metoxiflavona, di-o-benzoilquercetina y kaempférido disaliciloilrhamnósido, abundantemente presentes en la variedad resistente. Las condiciones descritas en este trabajo son fundamentales para profundizar en el papel de los metabolitos fenólicos apoplásticos relacionados con los mecanismos de defensa de esta planta ornamental.\u0000 ","PeriodicalId":43662,"journal":{"name":"Revista Colombiana de Quimica","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.8,"publicationDate":"2022-09-06","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"48964017","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Syntheses and magnetic properties of substituted bis-indacenyl bi-metallic complexes & application 取代双茚二烯基双金属配合物的合成、磁性及应用
IF 0.8 Pub Date : 2022-09-06 DOI: 10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.101889
Amshumali K. Mungalimane, K.M. Sateesha, K. Mussuvir Pasha, Yuvaraja Dibdalli, Mallikarjun V. Patil, V. Siruguri, R. Reddy
Organometallic compounds, Bis (2,4,6,8 teramethyl-indacenyl) di Iron (1), Bis (2,4,6,8 teramethyl s-indacenyl) mono iron, mono cobalt (2), and Bis (2,6 diethyl-4,8-dimethyl-s-indacenyl) di cobalt (3) were synthesised by means of salt elimination strategy, using Fe(II) and Co(II) salts. The compounds were characterised through spectroscopic and electrochemical methods. Magnetic measurements were carried out by Physical Property Measurement System (PPMS). Mossbauer spectroscopic data reveals that in all compounds, surprisingly, Iron is in +3 oxidation state. DFT calculations have been carried out to understand the change in the oxidation state of a metal. DFT study confirms the electron transfer nature of ligand to metal. Cyclic voltametric study on these compounds shows a large separation (ΔE>800mV) between two oxidation peaks confirming the strong interaction between the metal centres.  Magnetic measurements on these organometallic compounds reveals that they exhibit a ferrimagnetic behaviour at temperatures below 40 K.
使用Fe(II)和Co(II)盐,通过盐消除策略合成了有机金属化合物,双(2,4,6,8-四甲基-茚三烯基)二铁(1)、双(2、4,6,8-四甲基-s-茚二烯基)单铁、单钴(2)和双(2。6二乙基-4,8-二甲基-s-吲三烯酰基)二钴(3)。通过光谱和电化学方法对化合物进行了表征。通过物理性能测量系统(PPMS)进行磁性测量。穆斯堡尔谱数据显示,令人惊讶的是,在所有化合物中,铁都处于+3氧化态。已经进行DFT计算以了解金属氧化态的变化。DFT研究证实了配体向金属的电子转移性质。对这些化合物的循环伏安法研究表明,两个氧化峰之间有很大的分离(ΔE>800mV),证实了金属中心之间的强烈相互作用。对这些有机金属化合物的磁性测量表明,它们在低于40 K的温度下表现出铁磁性行为。
{"title":"Syntheses and magnetic properties of substituted bis-indacenyl bi-metallic complexes & application","authors":"Amshumali K. Mungalimane, K.M. Sateesha, K. Mussuvir Pasha, Yuvaraja Dibdalli, Mallikarjun V. Patil, V. Siruguri, R. Reddy","doi":"10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.101889","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.101889","url":null,"abstract":"Organometallic compounds, Bis (2,4,6,8 teramethyl-indacenyl) di Iron (1), Bis (2,4,6,8 teramethyl s-indacenyl) mono iron, mono cobalt (2), and Bis (2,6 diethyl-4,8-dimethyl-s-indacenyl) di cobalt (3) were synthesised by means of salt elimination strategy, using Fe(II) and Co(II) salts. The compounds were characterised through spectroscopic and electrochemical methods. Magnetic measurements were carried out by Physical Property Measurement System (PPMS). Mossbauer spectroscopic data reveals that in all compounds, surprisingly, Iron is in +3 oxidation state. DFT calculations have been carried out to understand the change in the oxidation state of a metal. DFT study confirms the electron transfer nature of ligand to metal. Cyclic voltametric study on these compounds shows a large separation (ΔE>800mV) between two oxidation peaks confirming the strong interaction between the metal centres.  Magnetic measurements on these organometallic compounds reveals that they exhibit a ferrimagnetic behaviour at temperatures below 40 K.","PeriodicalId":43662,"journal":{"name":"Revista Colombiana de Quimica","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.8,"publicationDate":"2022-09-06","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"48939856","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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The state of the art of marine natural products in Colombia 哥伦比亚最先进的海洋天然产品
IF 0.8 Pub Date : 2022-09-06 DOI: 10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.100644
Claudia Andrea Bautista, C. Puentes, C. M. Vargas-Peláez, Marison Santos-Acevedo, Freddy A Ramos, J. Gómez-León, Leonardo Castellanos Hernández
Marine Natural Products (MNPs) isolated from samples collected in Colombia have been an object of study since the early 1980's; however, this information is neither integrated nor compiled. This systematic review describes the articles published in scientific journals up to December 2019. 173 papers met the inclusion criteria of focusing on MNPs obtained from specimens collected from Colombian seas; all original papers written in English, Portuguese or Spanish. The selected papers were mostly authored by researchers from Colombian groups, with low interaction amongst themselves. 99.4% of the papers studied samples collected from the Caribbean Sea; 183 species were studied, mainly sponges and octocorals. In this study, 1,690 compounds (238 new ones) were reviewed, mainly diterpenes and sterol derivatives. Of the selected papers, 76.8% measured various biological activities, including antibiotic (34%) and anticancer (30%). These papers were published in 51 journals (74.6% were international). In conclusion, scientific work on natural marine products of Colombian origin has incremented over time. The most relevant opportunities to address and fill existing gaps comprise: exploring Pacific Ocean organisms and several of the misrepresented taxa; promoting strong interactions amongst the MNPs research groups, and accordingly with other areas of knowledge; and having the productive sector participate in MNPs research.
自20世纪80年代初以来,从哥伦比亚收集的样品中分离出的海洋天然产物(MNPs)一直是研究对象;但是,这些资料既没有综合也没有汇编。本系统综述描述了截至2019年12月在科学期刊上发表的文章。173篇论文符合重点关注哥伦比亚海域标本中获得的MNPs的纳入标准;所有论文用英语、葡萄牙语或西班牙语写成。被选中的论文大多是由哥伦比亚研究小组的研究人员撰写的,他们之间的互动很少。99.4%的论文研究了从加勒比海采集的样本;研究了183种,主要是海绵和八栖珊瑚。本研究综述了1690种化合物(新发现238种),主要是二萜和甾醇衍生物。在所选论文中,76.8%的论文测量了各种生物活性,包括抗生素(34%)和抗癌(30%)。发表于51种期刊,其中国际期刊占74.6%。总之,关于哥伦比亚天然海产品的科学工作随着时间的推移而增加。解决和填补现有空白的最相关机会包括:探索太平洋生物和一些被误传的分类群;促进MNPs研究小组之间的密切互动,并相应地与其他知识领域进行互动;让生产部门参与跨国企业的研究。
{"title":"The state of the art of marine natural products in Colombia","authors":"Claudia Andrea Bautista, C. Puentes, C. M. Vargas-Peláez, Marison Santos-Acevedo, Freddy A Ramos, J. Gómez-León, Leonardo Castellanos Hernández","doi":"10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.100644","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.100644","url":null,"abstract":"Marine Natural Products (MNPs) isolated from samples collected in Colombia have been an object of study since the early 1980's; however, this information is neither integrated nor compiled. This systematic review describes the articles published in scientific journals up to December 2019. 173 papers met the inclusion criteria of focusing on MNPs obtained from specimens collected from Colombian seas; all original papers written in English, Portuguese or Spanish. The selected papers were mostly authored by researchers from Colombian groups, with low interaction amongst themselves. 99.4% of the papers studied samples collected from the Caribbean Sea; 183 species were studied, mainly sponges and octocorals. In this study, 1,690 compounds (238 new ones) were reviewed, mainly diterpenes and sterol derivatives. Of the selected papers, 76.8% measured various biological activities, including antibiotic (34%) and anticancer (30%). These papers were published in 51 journals (74.6% were international). In conclusion, scientific work on natural marine products of Colombian origin has incremented over time. The most relevant opportunities to address and fill existing gaps comprise: exploring Pacific Ocean organisms and several of the misrepresented taxa; promoting strong interactions amongst the MNPs research groups, and accordingly with other areas of knowledge; and having the productive sector participate in MNPs research.","PeriodicalId":43662,"journal":{"name":"Revista Colombiana de Quimica","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.8,"publicationDate":"2022-09-06","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"49050635","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Estudio teórico de la oxidación de CO con O2 usando catalizadores de Au-Pd y Au-Pt
IF 0.8 Pub Date : 2022-09-06 DOI: 10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.101015
Andrés Felipe Forero Garzón, Sergio Joya Rodríguez, Kevin Nicolás Sebastián Cachón Osorio, Andrés Fernando Bernal Escobar, Badhin Gómez, Julián E. Sánchez-Velandia, Sol Milena Mejía Chica
En el presente estudio se realizaron cálculos con base en la Teoría del Funcional de la Densidad Electrónica (DFT) con la aproximación B3PW91/LANL2DZ para optimizar los sistemas monometálicos y bimetálicos Au9, Au8Pd, Au8Pt, AuPd8, AuPt8, Pd9 y Pt9. Los materiales fueron teóricamente evaluados como catalizadores para la oxidación de monóxido de carbono (CO) y se determinó el sistema más favorable para la adsorción de esta molécula. La sustitución de átomos de Pt y Pd por átomos de Au en los nonámeros generó un cambio en la estructura tridimensional del sistema. El análisis de reactividad global mostró que el clúster más reactivo es 𝑃𝑡9, seguido por 𝐴𝑢𝑃𝑡8. Los índices de Fukui identificaron los sitios más susceptibles para un ataque nucleofílico de ambos clústeres. La adsorción de CO generó una cascada de oxidación que liberó ~4,5 eV, indicando que la reacción es altamente exotérmica y exergónica. Los clústeres 𝐴𝑢𝑃𝑡8 y 𝑃𝑡9 mostraron los valores más bajos de energía de activación de la etapa determinante del mecanismo. En general, la sustitución de un átomo de platino (o paladio) por un átomo de oro no afecta la reactividad de los nonámeros y, por tanto, se infiere que el clúster 𝐴𝑢𝑃𝑡8 podría ser un catalizador promisorio en la oxidación de CO.
本研究以电子密度泛函理论(DFT)为基础,采用B3PW91/LANL2DZ方法对Au9、Au8Pd、Au8Pt、AuPd8、AuPt8、Pd9和Pt9单金属和双金属体系进行了优化。摘要本研究的目的是评价在氧化过程中吸附一氧化碳(CO)的最佳方法。非单体中Au原子取代Pt原子和Pd原子,引起了系统三维结构的变化。全球反应分析表明该集群内能是𝑃𝑡9,其次是𝐴𝑢𝑃𝑡8。福井指数确定了两个簇中最容易发生亲核攻击的位点。CO吸附产生的氧化级联释放~ 4.5 eV,表明该反应是高度放热和火能的。的集群𝐴𝑢𝑃𝑡8和𝑃𝑡9显示值最低的能量激活机制的决定性阶段。总的来说,更换为铂原子(或钯)的黄金原子不会影响反应nonámeros,因此来看集群𝐴𝑢𝑃𝑡8前途可能推动CO氧化。
{"title":"Estudio teórico de la oxidación de CO con O2 usando catalizadores de Au-Pd y Au-Pt","authors":"Andrés Felipe Forero Garzón, Sergio Joya Rodríguez, Kevin Nicolás Sebastián Cachón Osorio, Andrés Fernando Bernal Escobar, Badhin Gómez, Julián E. Sánchez-Velandia, Sol Milena Mejía Chica","doi":"10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.101015","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.101015","url":null,"abstract":"En el presente estudio se realizaron cálculos con base en la Teoría del Funcional de la Densidad Electrónica (DFT) con la aproximación B3PW91/LANL2DZ para optimizar los sistemas monometálicos y bimetálicos Au9, Au8Pd, Au8Pt, AuPd8, AuPt8, Pd9 y Pt9. Los materiales fueron teóricamente evaluados como catalizadores para la oxidación de monóxido de carbono (CO) y se determinó el sistema más favorable para la adsorción de esta molécula. La sustitución de átomos de Pt y Pd por átomos de Au en los nonámeros generó un cambio en la estructura tridimensional del sistema. El análisis de reactividad global mostró que el clúster más reactivo es 𝑃𝑡9, seguido por 𝐴𝑢𝑃𝑡8. Los índices de Fukui identificaron los sitios más susceptibles para un ataque nucleofílico de ambos clústeres. La adsorción de CO generó una cascada de oxidación que liberó ~4,5 eV, indicando que la reacción es altamente exotérmica y exergónica. Los clústeres 𝐴𝑢𝑃𝑡8 y 𝑃𝑡9 mostraron los valores más bajos de energía de activación de la etapa determinante del mecanismo. En general, la sustitución de un átomo de platino (o paladio) por un átomo de oro no afecta la reactividad de los nonámeros y, por tanto, se infiere que el clúster 𝐴𝑢𝑃𝑡8 podría ser un catalizador promisorio en la oxidación de CO.","PeriodicalId":43662,"journal":{"name":"Revista Colombiana de Quimica","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.8,"publicationDate":"2022-09-06","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"43526752","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Modelamiento in silico de la liasa organomercurial (MerB) de Pseudomonas fluorescens 荧光假单胞菌有机汞裂解酶(MerB)的硅模拟
IF 0.8 Pub Date : 2022-09-06 DOI: 10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.98381
Kerynd Barona Duque, Duverney Gaviria
El modelamiento in silico ha sido de gran contribución en los procesos proteómicos, desarrollando estructuras de las secuencias proteicas ya existentes, que por motivos de altos costos y las diferentes tecnologías necesarias para el desarrollo de estas metodologías, se encuentran deficientes en el número de modelamientos de proteínas disponibles. Entre aquellas secuencias con carencia de estructura proteica se encuentra la proteína liasa organomercurial (MerB) de Pseudomonas fluorescens, importante en la resistencia al mercurio. En el presente artículo se analizó tanto estructural como funcionalmente la proteína MerB en Pseudomonas fluorescens, utilizando la herramienta de la química estructural “modelamiento por homología” mediante plataformas bioinformáticas, con el fin de obtener un modelo que represente la estructura 3D más precisa y que capturen las mejores variantes estructurales entre todas las posibles conformaciones de las proteínas en la familia. En este trabajo, se desarrolló un método comparativo de la secuencia estudiada con las reportadas en las bases de datos para las proteínas MerB del género Pseudomonas. Se propone un modelo tridimensional para la enzima (MerB) en P. fluorescens, mediante el modelamiento por homología, se muestra la caracterización en la estructura secundaria, terciaria, la caracterización del dominio catalítico y los motivos estructurales presentes.
非硅建模在蛋白质组学过程中做出了巨大贡献,开发了现有蛋白质序列的结构,由于成本高和开发这些方法所需的不同技术,现有的蛋白质建模数量不足。在这些缺乏蛋白质结构的序列中,有荧光假单胞菌的有机汞裂解酶(MERB)蛋白,这在汞抗性中很重要。本文利用生物信息学平台上的结构化学工具“同源建模”,对荧光假单胞菌中的MERB蛋白进行了结构和功能分析,以获得一个代表最精确3D结构的模型,并捕获该家族蛋白质所有可能构象中最好的结构变体。在这项工作中,开发了一种将所研究的序列与假单胞菌属Merb蛋白数据库中报告的序列进行比较的方法。提出了P中酶的三维模型。通过同源建模,荧光显示了二级、三级结构的表征、催化域的表征和存在的结构基序。
{"title":"Modelamiento in silico de la liasa organomercurial (MerB) de Pseudomonas fluorescens","authors":"Kerynd Barona Duque, Duverney Gaviria","doi":"10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.98381","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.98381","url":null,"abstract":"El modelamiento in silico ha sido de gran contribución en los procesos proteómicos, desarrollando estructuras de las secuencias proteicas ya existentes, que por motivos de altos costos y las diferentes tecnologías necesarias para el desarrollo de estas metodologías, se encuentran deficientes en el número de modelamientos de proteínas disponibles. Entre aquellas secuencias con carencia de estructura proteica se encuentra la proteína liasa organomercurial (MerB) de Pseudomonas fluorescens, importante en la resistencia al mercurio. En el presente artículo se analizó tanto estructural como funcionalmente la proteína MerB en Pseudomonas fluorescens, utilizando la herramienta de la química estructural “modelamiento por homología” mediante plataformas bioinformáticas, con el fin de obtener un modelo que represente la estructura 3D más precisa y que capturen las mejores variantes estructurales entre todas las posibles conformaciones de las proteínas en la familia. En este trabajo, se desarrolló un método comparativo de la secuencia estudiada con las reportadas en las bases de datos para las proteínas MerB del género Pseudomonas. Se propone un modelo tridimensional para la enzima (MerB) en P. fluorescens, mediante el modelamiento por homología, se muestra la caracterización en la estructura secundaria, terciaria, la caracterización del dominio catalítico y los motivos estructurales presentes.","PeriodicalId":43662,"journal":{"name":"Revista Colombiana de Quimica","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.8,"publicationDate":"2022-09-06","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"46168644","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Evaluación del desempeño de una celda de combustible microbiana con electrodo de grafito modificado para el tratamiento de agua residual del procesamiento del café 用改性石墨电极处理咖啡加工废水的微生物燃料电池的性能评价
IF 0.8 Pub Date : 2022-09-06 DOI: 10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.101185
Paola Fuentes Schweizer, Dyanne Cárdenas, Lidieth Uribe Lorío, Jean Sanabria Chinchilla, José Ricardo Cabrejo Villegas, Carlos Solís Chacón
La actividad cafetalera en Costa Rica procesa aproximadamente 69.000 toneladas de café mediante la técnica de beneficiado húmedo. Esta actividad conlleva un alto impacto ambiental debido a la generación de 8 L de agua residual/kg de café oro producido. El presente trabajo tiene como objetivo utilizar el agua residual del procesamiento de café como sustrato en celdas combustibles microbianas (CCM), con el propósito de generar energía eléctrica a través de su uso y, a la vez, disminuir la carga orgánica del residuo. La CCM empleó un cátodo modificado con ftalocianinas de hierro (FePc), generó una eficiencia coulómbica de 0,7% y una densidad de potencia de 89 μW/cm2 en un ciclo de operación de cinco días. Además, se determinó que la CCM disminuye la demanda química de oxígeno (DQO) del residuo hasta en 27% bajo las condiciones de operación nativas del sustrato, a temperatura ambiente, sin mediadores químicos para la reacción anódica y con el uso de electrodos de platino para el cátodo. El estudio confirma la oportunidad de emplear el sustrato con una flora microbiana nativa apta para la operación de la tecnología de la CCM, y así perfilar el dispositivo como una opción novedosa para el tratamiento de este residuo en Costa Rica.
哥斯达黎加的咖啡生产活动使用湿法加工技术加工了大约6.9万吨咖啡。这种活动对环境的影响很大,因为每公斤奥罗咖啡产生8升废水。本研究旨在利用咖啡加工过程中的废水作为微生物燃料电池(mcc)的底物,通过其使用产生电能,同时减少废物的有机负荷。CCM采用酞菁铁修饰阴极(FePc),在5天的操作周期内,库仑效率为0.7%,功率密度为89 μW/cm2。此外,在环境温度下,不使用化学介质进行阳极反应,使用铂电极进行阴极反应,CCM可使废物的化学需氧量(cod)降低27%。这项研究证实了使用适合CCM技术操作的本地微生物群的基质的机会,从而将该设备描述为在哥斯达黎加处理这一废物的新选择。
{"title":"Evaluación del desempeño de una celda de combustible microbiana con electrodo de grafito modificado para el tratamiento de agua residual del procesamiento del café","authors":"Paola Fuentes Schweizer, Dyanne Cárdenas, Lidieth Uribe Lorío, Jean Sanabria Chinchilla, José Ricardo Cabrejo Villegas, Carlos Solís Chacón","doi":"10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.101185","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/rev.colomb.quim.v51n1.101185","url":null,"abstract":"La actividad cafetalera en Costa Rica procesa aproximadamente 69.000 toneladas de café mediante la técnica de beneficiado húmedo. Esta actividad conlleva un alto impacto ambiental debido a la generación de 8 L de agua residual/kg de café oro producido. El presente trabajo tiene como objetivo utilizar el agua residual del procesamiento de café como sustrato en celdas combustibles microbianas (CCM), con el propósito de generar energía eléctrica a través de su uso y, a la vez, disminuir la carga orgánica del residuo. La CCM empleó un cátodo modificado con ftalocianinas de hierro (FePc), generó una eficiencia coulómbica de 0,7% y una densidad de potencia de 89 μW/cm2 en un ciclo de operación de cinco días. Además, se determinó que la CCM disminuye la demanda química de oxígeno (DQO) del residuo hasta en 27% bajo las condiciones de operación nativas del sustrato, a temperatura ambiente, sin mediadores químicos para la reacción anódica y con el uso de electrodos de platino para el cátodo. El estudio confirma la oportunidad de emplear el sustrato con una flora microbiana nativa apta para la operación de la tecnología de la CCM, y así perfilar el dispositivo como una opción novedosa para el tratamiento de este residuo en Costa Rica.","PeriodicalId":43662,"journal":{"name":"Revista Colombiana de Quimica","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.8,"publicationDate":"2022-09-06","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"47485465","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Pyrazinamide–isoniazid hybrid: synthesis optimisation, characterisation, and antituberculous activity 吡嗪酰胺-异烟肼杂合物:合成优化、表征和抗结核活性
IF 0.8 Pub Date : 2022-06-29 DOI: 10.15446/rev.colomb.quim.v50n3.96424
A.C. Valderrama – Negrón, Rocio I. Ramirez Panti, Christian M. Aliaga Paucar, Fernando Grandez Arias, Patricia Sheen Cortovaria, Mirko Juan Zimic Peralta, Yudith Cauna Orocollo
Over time, the effective resistance mechanisms to various first- and second-line drugs against the disease of tuberculosis make its treatment extremely difficult. This work presents a new approach to synthesizing a hybrid of antituberculosis medications: isoniazid (INH) and pyrazinamide (PZA). The synthesis was performed using ultrasound-assisted synthesis to obtain an overall yield of 70%, minimizing the reaction time from 7 to 1 h. The evaluation of the biological activity of the hybrid (compound 2) was tested using the tetrazolium microplate assay (TEMA), showing inhibition in the growth of Mycobacterium tuberculosis H37Rv at a concentration of 0.025 mM at pH 6.0 and 6.7.
随着时间的推移,对各种针对结核病的一线和二线药物的有效耐药性机制使其治疗变得极其困难。这项工作提出了一种合成抗结核药物混合物的新方法:异烟肼(INH)和吡嗪酰胺(PZA)。使用超声辅助合成进行合成,以获得70%的总产率,使反应时间从7至1小时最小化。使用四氮唑微板测定法(TEMA)测试杂交体(化合物2)的生物活性的评估,显示在pH 6.0和6.7的0.025mM浓度下抑制结核分枝杆菌H37Rv的生长。
{"title":"Pyrazinamide–isoniazid hybrid: synthesis optimisation, characterisation, and antituberculous activity","authors":"A.C. Valderrama – Negrón, Rocio I. Ramirez Panti, Christian M. Aliaga Paucar, Fernando Grandez Arias, Patricia Sheen Cortovaria, Mirko Juan Zimic Peralta, Yudith Cauna Orocollo","doi":"10.15446/rev.colomb.quim.v50n3.96424","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/rev.colomb.quim.v50n3.96424","url":null,"abstract":"Over time, the effective resistance mechanisms to various first- and second-line drugs against the disease of tuberculosis make its treatment extremely difficult. This work presents a new approach to synthesizing a hybrid of antituberculosis medications: isoniazid (INH) and pyrazinamide (PZA). The synthesis was performed using ultrasound-assisted synthesis to obtain an overall yield of 70%, minimizing the reaction time from 7 to 1 h. The evaluation of the biological activity of the hybrid (compound 2) was tested using the tetrazolium microplate assay (TEMA), showing inhibition in the growth of Mycobacterium tuberculosis H37Rv at a concentration of 0.025 mM at pH 6.0 and 6.7.","PeriodicalId":43662,"journal":{"name":"Revista Colombiana de Quimica","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.8,"publicationDate":"2022-06-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"48183045","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Functional and chemical qualities of Vitis labrusca grape seed oil extracted by supercritical CO2 超临界CO2法提取葡萄籽油的功能及化学性质研究
IF 0.8 Pub Date : 2022-06-29 DOI: 10.15446/rev.colomb.quim.v50n3.95469
Maritza Elizabeth Barriga Sanchez, Carlos Francisco Castro Rumiche, Gloria Cesia Sanchez Gonzales, Maria Rosales-Hartshorn3
Grape seed oil, which is extracted with highly toxic organic solvents that are harmful to human health, is produced from tons of grape pomace waste, generated during winemaking. Sometimes, this waste is used to make compost or is burnt, which causes environmental contamination. The functional qualities, antioxidant capacity (AC), α-tocopherol and total phenolic compounds content (TPC) of Black Borgoña (Vitis labrusca) grape seed oil, extracted by supercritical CO2, were evaluated. The high content of linoleic acid (w-6) and monounsaturated fatty acids contributed to the beneficial effect on ​​the functional quality indices, which were 0.20, 0.23, 11.80 for IA, IT and H:H, respectively. In addition, a POV of 6.23 ± 0.08 milliequivalents of peroxide/kg oil and an anisidine index of 2.70 ± 0.05 indicated a good quality oil. Also, a high concentration of α-tocopherol (9.82 ± 0.02 mg/100 g oil) and a high TPC (114.14 ± 3.24 mg GAE/kg oil) were obtained. This study demonstrated that supercritical CO2 extraction is a suitable method for the delivery of a high-quality grape seed oil. 
葡萄籽油是用对人体有害的剧毒有机溶剂提取出来的,它是从酿酒过程中产生的成吨的葡萄渣中提取出来的。有时,这些废物被用来制造堆肥或被焚烧,这会造成环境污染。对超临界CO2萃取的黑Borgoña (Vitis labrusca)葡萄籽油的功能品质、抗氧化能力(AC)、α-生育酚和总酚类化合物含量(TPC)进行了评价。亚油酸(w-6)和单不饱和脂肪酸的高含量对功能品质指标有良好的影响,IA、IT和H:H分别为0.20、0.23、11.80。过氧化氢POV为6.23±0.08毫当量/kg油,茴香胺指数为2.70±0.05为优质油。α-生育酚含量高(9.82±0.02 mg/100 g油),TPC含量高(114.14±3.24 mg GAE/kg油)。本研究表明,超临界CO2萃取是一种适用于高品质葡萄籽油提取的方法。
{"title":"Functional and chemical qualities of Vitis labrusca grape seed oil extracted by supercritical CO2","authors":"Maritza Elizabeth Barriga Sanchez, Carlos Francisco Castro Rumiche, Gloria Cesia Sanchez Gonzales, Maria Rosales-Hartshorn3","doi":"10.15446/rev.colomb.quim.v50n3.95469","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/rev.colomb.quim.v50n3.95469","url":null,"abstract":"Grape seed oil, which is extracted with highly toxic organic solvents that are harmful to human health, is produced from tons of grape pomace waste, generated during winemaking. Sometimes, this waste is used to make compost or is burnt, which causes environmental contamination. The functional qualities, antioxidant capacity (AC), α-tocopherol and total phenolic compounds content (TPC) of Black Borgoña (Vitis labrusca) grape seed oil, extracted by supercritical CO2, were evaluated. The high content of linoleic acid (w-6) and monounsaturated fatty acids contributed to the beneficial effect on ​​the functional quality indices, which were 0.20, 0.23, 11.80 for IA, IT and H:H, respectively. In addition, a POV of 6.23 ± 0.08 milliequivalents of peroxide/kg oil and an anisidine index of 2.70 ± 0.05 indicated a good quality oil. Also, a high concentration of α-tocopherol (9.82 ± 0.02 mg/100 g oil) and a high TPC (114.14 ± 3.24 mg GAE/kg oil) were obtained. This study demonstrated that supercritical CO2 extraction is a suitable method for the delivery of a high-quality grape seed oil.\u0000 ","PeriodicalId":43662,"journal":{"name":"Revista Colombiana de Quimica","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.8,"publicationDate":"2022-06-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"67057119","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Biological homochirality and stoichiometric network analysis: Variations on Frank’s model 生物手性和化学计量网络分析:弗兰克模型的变化
IF 0.8 Pub Date : 2022-06-29 DOI: 10.15446/rev.colomb.quim.v50n3.96921
J. A. Ágreda Bastidas, Juan Andrés Montoya Arguello, Carolina Mejía
Biological homochirality is modelled using chemical reaction mechanisms that include autocatalytic and inhibition reactions as well as input and output flows. From the mathematical point of view, the differential equations associated with those mechanisms have to exhibit bistability.  The search for those bifurcations can be carried out using stoichiometric network analysis. This algorithm simplifies the mathematical analysis and can be implemented in a computer programme, which can help us to analyse chemical networks. However, regardless of the reduction to linear polynomials, which is made possible by this algorithm, in some cases, the complexity and length of the polynomials involved make the analysis unfeasible. This problem has been partially solved by extending the stoichiometric matrix with rows that code the duality relations between the different reactions occurring in the network given as input. All these facts allow us to analyse 28 different network models, highlighting the basic requirements needed by a chemical mechanism to have spontaneous mirror symmetry breaking.
生物同手性是用化学反应机制建模的,包括自催化和抑制反应以及输入和输出流。从数学的角度来看,与这些机制相关的微分方程必须表现出双稳定性。这些分支的搜索可以使用化学计量网络分析进行。该算法简化了数学分析,并可在计算机程序中实现,有助于我们分析化学网络。然而,尽管该算法可以简化为线性多项式,但在某些情况下,所涉及的多项式的复杂性和长度使得分析不可行。这个问题通过扩展化学计量矩阵得到了部分解决,这些矩阵的行编码了作为输入的网络中发生的不同反应之间的对偶关系。所有这些事实使我们能够分析28种不同的网络模型,强调化学机制产生自发镜像对称性破缺所需的基本要求。
{"title":"Biological homochirality and stoichiometric network analysis: Variations on Frank’s model","authors":"J. A. Ágreda Bastidas, Juan Andrés Montoya Arguello, Carolina Mejía","doi":"10.15446/rev.colomb.quim.v50n3.96921","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/rev.colomb.quim.v50n3.96921","url":null,"abstract":"Biological homochirality is modelled using chemical reaction mechanisms that include autocatalytic and inhibition reactions as well as input and output flows. From the mathematical point of view, the differential equations associated with those mechanisms have to exhibit bistability.  The search for those bifurcations can be carried out using stoichiometric network analysis. This algorithm simplifies the mathematical analysis and can be implemented in a computer programme, which can help us to analyse chemical networks. However, regardless of the reduction to linear polynomials, which is made possible by this algorithm, in some cases, the complexity and length of the polynomials involved make the analysis unfeasible. This problem has been partially solved by extending the stoichiometric matrix with rows that code the duality relations between the different reactions occurring in the network given as input. All these facts allow us to analyse 28 different network models, highlighting the basic requirements needed by a chemical mechanism to have spontaneous mirror symmetry breaking.","PeriodicalId":43662,"journal":{"name":"Revista Colombiana de Quimica","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.8,"publicationDate":"2022-06-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"42822721","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Evaluation of emeralds by their origin: Multivariate analysis - Infrared spectra 祖母绿来源评价:多元分析-红外光谱
IF 0.8 Pub Date : 2022-06-29 DOI: 10.15446/rev.colomb.quim.v50n3.98674
Elianna Castillo Serna, J. A. Ágreda Bastidas, Valentina Gonzalez Ruiz, Javier García Toloza
Colombian emeralds, 26 from Palo Arañado (eastern emerald zone, Chivor district, Boyacá, Colombia), and 28 from Santo Domingo - La Pava mine (western emerald zone, Muzo district, Boyacá, Colombia), together with 30 from Kafubu - Zambia, were studied by reflectance Fourier transform infrared spectroscopy, principal component analysis, clustering, and partial least squares – discriminant analysis, in order to differentiate them by geographical origin. The spectra were smoothed and a baseline correction was made. The principal component analysis showed that the wavenumbers 2,474; 2,640; 2,686; 2,818; 5,448, and 6,815 cm-1 are the most significant in the first principal component and the most valuable in separating the emeralds by their geographical origin. This allowed us to completely discriminate emeralds from Santo Domingo and Zambia, while only five emeralds from Palo Arañado were 100 % differentiable from the other two groups of emeralds.
利用反射傅里叶变换红外光谱、主成分分析、聚类和偏最小二乘鉴别分析等方法,对26颗哥伦比亚祖母绿(产自帕罗Arañado东部祖母绿区,哥伦比亚博雅ac Chivor区)、28颗产自圣多明各-拉帕瓦矿(产自哥伦比亚博雅ac Muzo区西部祖母绿区)和30颗产自卡富布-赞比亚的祖母绿进行了研究。对光谱进行了平滑处理,并进行了基线校正。主成分分析表明,波数为2474;2640;2686;2818;5,448 cm-1和6,815 cm-1是第一主成分中最重要的,也是按地理来源区分祖母绿最有价值的。这使我们能够完全区分来自圣多明各和赞比亚的祖母绿,而来自帕罗Arañado的祖母绿只有5颗与其他两组祖母绿100%区分。
{"title":"Evaluation of emeralds by their origin: Multivariate analysis - Infrared spectra","authors":"Elianna Castillo Serna, J. A. Ágreda Bastidas, Valentina Gonzalez Ruiz, Javier García Toloza","doi":"10.15446/rev.colomb.quim.v50n3.98674","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/rev.colomb.quim.v50n3.98674","url":null,"abstract":"Colombian emeralds, 26 from Palo Arañado (eastern emerald zone, Chivor district, Boyacá, Colombia), and 28 from Santo Domingo - La Pava mine (western emerald zone, Muzo district, Boyacá, Colombia), together with 30 from Kafubu - Zambia, were studied by reflectance Fourier transform infrared spectroscopy, principal component analysis, clustering, and partial least squares – discriminant analysis, in order to differentiate them by geographical origin. The spectra were smoothed and a baseline correction was made. The principal component analysis showed that the wavenumbers 2,474; 2,640; 2,686; 2,818; 5,448, and 6,815 cm-1 are the most significant in the first principal component and the most valuable in separating the emeralds by their geographical origin. This allowed us to completely discriminate emeralds from Santo Domingo and Zambia, while only five emeralds from Palo Arañado were 100 % differentiable from the other two groups of emeralds.","PeriodicalId":43662,"journal":{"name":"Revista Colombiana de Quimica","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.8,"publicationDate":"2022-06-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"44841749","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Revista Colombiana de Quimica
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