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Molecular-Assisted Taxonomic Study on the Sargassum C.Agardh (Fucales, Phaeophyceae) in Northwestern Luzon, Philippines 菲律宾吕宋岛西北部马尾藻的分子辅助分类研究
4区 生物学 Q3 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2023-10-18 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a7
Wilfred John E. Santiañez, John Michael L. Lastimoso, Masakazu Hoshino, Brix Nester Q. Villafuerte, Kazuhiro Kogame, Gavino C. Trono
Étude des Sargassum (Fucales, Phaeophyceae) dans le nord-ouest de Luzon, Philippines au moyen des outils de la taxonomie moléculaire. La diversité du genre d'algues brunes Sargassum C.Agardh aux Philippines est la plus élevée de l'océan Pacifique tropical occidental. Cependant, la plupart des études sur les Sargassum des Philippines sont basées sur de la morpho-anatomie, et l'hypothèse selon laquelle le genre est très diversifié dans le pays n'a jamais été vérifiée sur la base d'informations moléculaires. Étant donné que de nombreuses espèces de Sargassum sont hautement polymorphiques et que les études phylogénétiques moléculaires ont récemment permis de faire progresser la systématique, nous pensons que les espèces de Sargassum des Philippines devraient maintenant être réévaluées au moyen d'outils de la taxonomie moléculaire. Nous présentons ici les résultats de nos études taxonomiques moléculaires sur les sargasses du nord des Philippines, en particulier le long des côtes de quatre provinces côtières du nord-ouest de Luzon (Ilocos Norte, Ilocos Sur, La Union et Pangasinan). Nous avons reconnu trois lignées d'espèces distinctes, à savoir Sargassum aquifolium (Turner) C.Agardh, Sargassum ilicifolium (Turner) C.Agardh, et Sargassum polycystum C.Agardh, sur la base d'analyses moléculaires de 74 spécimens provenant de nos zones d'étude. Nos observations morphologiques sur la gamme de caractères de ces espèces suggèrent également que plusieurs taxons communs de Sargassum aux Philippines ont été mal identifiés. En particulier, les spécimens précédemment attribués à S. kushimotense Yendo devraient être appelés S. aquifolium, tandis que S. ilicifolium, largement répandue et très plastique, est souvent confondue et identifiée aux Philippines sous plusieurs noms, dont S. crassifolium J.Agardh, S. cristaefolium C.Agardh et S. turbinarioides Grunow. Nos résultats suggèrent que la biodiversité des sargasses aux Philippines pourrait avoir été gonflée par des erreurs d'identification et que la diversité des espèces est en fait beaucoup plus faible qu'on ne le pensait initialement.
利用分子分类学工具对菲律宾吕松西北部马尾藻(Fucales, Phaeophyceae)进行研究。菲律宾褐藻马尾藻属的多样性是西热带太平洋中最高的。然而,大多数关于菲律宾马尾藻的研究都是基于形态解剖学,而该属在该国非常多样化的假设从未在分子信息的基础上得到证实。由于许多马尾藻种具有高度的多态性,分子系统发育研究最近使分类学的进展成为可能,我们认为菲律宾马尾藻种现在应该使用分子分类学工具重新评估。在这里,我们展示了我们对菲律宾北部马尾藻的分子分类学研究结果,特别是吕宋岛西北部四个沿海省份(北伊洛科斯、南伊洛科斯、拉Union和Pangasinan)的沿海地区。通过对74个研究区域标本的分子分析,我们确定了3个不同的物种系,即马尾藻aquifolium (Turner) c.a agardh、马尾藻ilicifolium (Turner) c.a agardh和马尾藻polycystum c.a agardh。我们对这些物种特征范围的形态学观察也表明,菲律宾马尾藻的几个常见分类单元被错误地识别。特别是,以前被认为是S. kushimotense Yendo的标本应该被称为S. aquifolium,而S. ilicifolium,广泛分布和高度可塑性,在菲律宾经常被混淆和鉴定为几个名字,包括S. crassifolium J.Agardh, S. cristaefolium C.Agardh和S. turbinarioides Grunow。我们的结果表明,菲律宾马尾藻的生物多样性可能因识别错误而膨胀,物种多样性实际上比最初认为的要弱得多。
{"title":"Molecular-Assisted Taxonomic Study on the Sargassum C.Agardh (Fucales, Phaeophyceae) in Northwestern Luzon, Philippines","authors":"Wilfred John E. Santiañez, John Michael L. Lastimoso, Masakazu Hoshino, Brix Nester Q. Villafuerte, Kazuhiro Kogame, Gavino C. Trono","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a7","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a7","url":null,"abstract":"Étude des Sargassum (Fucales, Phaeophyceae) dans le nord-ouest de Luzon, Philippines au moyen des outils de la taxonomie moléculaire. La diversité du genre d'algues brunes Sargassum C.Agardh aux Philippines est la plus élevée de l'océan Pacifique tropical occidental. Cependant, la plupart des études sur les Sargassum des Philippines sont basées sur de la morpho-anatomie, et l'hypothèse selon laquelle le genre est très diversifié dans le pays n'a jamais été vérifiée sur la base d'informations moléculaires. Étant donné que de nombreuses espèces de Sargassum sont hautement polymorphiques et que les études phylogénétiques moléculaires ont récemment permis de faire progresser la systématique, nous pensons que les espèces de Sargassum des Philippines devraient maintenant être réévaluées au moyen d'outils de la taxonomie moléculaire. Nous présentons ici les résultats de nos études taxonomiques moléculaires sur les sargasses du nord des Philippines, en particulier le long des côtes de quatre provinces côtières du nord-ouest de Luzon (Ilocos Norte, Ilocos Sur, La Union et Pangasinan). Nous avons reconnu trois lignées d'espèces distinctes, à savoir Sargassum aquifolium (Turner) C.Agardh, Sargassum ilicifolium (Turner) C.Agardh, et Sargassum polycystum C.Agardh, sur la base d'analyses moléculaires de 74 spécimens provenant de nos zones d'étude. Nos observations morphologiques sur la gamme de caractères de ces espèces suggèrent également que plusieurs taxons communs de Sargassum aux Philippines ont été mal identifiés. En particulier, les spécimens précédemment attribués à S. kushimotense Yendo devraient être appelés S. aquifolium, tandis que S. ilicifolium, largement répandue et très plastique, est souvent confondue et identifiée aux Philippines sous plusieurs noms, dont S. crassifolium J.Agardh, S. cristaefolium C.Agardh et S. turbinarioides Grunow. Nos résultats suggèrent que la biodiversité des sargasses aux Philippines pourrait avoir été gonflée par des erreurs d'identification et que la diversité des espèces est en fait beaucoup plus faible qu'on ne le pensait initialement.","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-10-18","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135943291","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Two New Species of Achnanthidium Kützing (Achnanthidiaceae) from the Quaternary Sediments of the Colônia Basin, Southeast Brazil 巴西东南部Colônia盆地第四纪沉积物中蜘蛛属k<e:1> tzing两新种
4区 生物学 Q3 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2023-09-27 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a6
Marquardt, Gisele C., Bicudo, Denise C., de M. Bicudo, Carlos E., Ledru, Marie-Pierre, Wetzel, Carlos E.
Deux nouvelles espèces d'Achnanthidium Kützing (Achnanthidiaceae) provenant des sédiments quaternaires du bassin de Colônia, sud-est du Brésil. Cette recherche utilise des techniques de microscopie optique et de microscopie électronique à balayage pour observer deux espèces d'Achnanthidium Kützing appartenant au complexe A. minutissimum ‘sensu lato’, prélevées dans des sédiments pléistocènes du bassin de Colônia, dans le sud-est du Brésil. Nous avons comparé Achnanthidium ectorianum Marquardt & C.E.Wetzel, sp. nov. et A. craterianum Marquardt & C.E.Wetzel, sp. nov. avec leurs espèces morphologiquement les plus proches, révélant des contours de valves, des formes d’apex de valves, des zones centrales et des structures de raphé différents. Nos résultats permettent d’élargir les connaissances taxonomiques du genre en Amérique du Sud, ce qui est fondamental pour mieux comprendre les schémas de distribution et de diversité des diatomées dans les régions peu étudiées. Nos recherches améliorent également les connaissances actuelles sur l’évolution du paléolac dans le bassin de Colônia (São Paulo) depuis le début du Pléistocène.
来自巴西东南部科隆盆地第四纪沉积物的两新种achnanthidium kutzing (Achnanthidiaceae)。本研究使用光学显微镜和扫描电子显微镜技术观察了巴西东南部科隆盆地更新世沉积物中属于A. minutissimum ' sensu lato '复合体的两种achnanthidium kutzing。我们比较了Achnanthidium ectorianum Marquardt & C.E.Wetzel, sp. nov.和A. craterianum Marquardt & C.E.Wetzel, sp. nov.及其形态最接近的种,揭示了不同的阀门轮廓、阀门顶端形状、中心区域和raphe结构。我们的研究结果有助于扩大南美洲硅藻属的分类学知识,这对更好地了解硅藻在研究较少的地区的分布和多样性模式至关重要。我们的研究也提高了我们对科隆盆地(sao Paulo)自更新世开始以来旧石器时代进化的现有知识。
{"title":"Two New Species of Achnanthidium Kützing (Achnanthidiaceae) from the Quaternary Sediments of the Colônia Basin, Southeast Brazil","authors":"Marquardt, Gisele C., Bicudo, Denise C., de M. Bicudo, Carlos E., Ledru, Marie-Pierre, Wetzel, Carlos E.","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a6","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a6","url":null,"abstract":"Deux nouvelles espèces d'Achnanthidium Kützing (Achnanthidiaceae) provenant des sédiments quaternaires du bassin de Colônia, sud-est du Brésil. Cette recherche utilise des techniques de microscopie optique et de microscopie électronique à balayage pour observer deux espèces d'Achnanthidium Kützing appartenant au complexe A. minutissimum ‘sensu lato’, prélevées dans des sédiments pléistocènes du bassin de Colônia, dans le sud-est du Brésil. Nous avons comparé Achnanthidium ectorianum Marquardt & C.E.Wetzel, sp. nov. et A. craterianum Marquardt & C.E.Wetzel, sp. nov. avec leurs espèces morphologiquement les plus proches, révélant des contours de valves, des formes d’apex de valves, des zones centrales et des structures de raphé différents. Nos résultats permettent d’élargir les connaissances taxonomiques du genre en Amérique du Sud, ce qui est fondamental pour mieux comprendre les schémas de distribution et de diversité des diatomées dans les régions peu étudiées. Nos recherches améliorent également les connaissances actuelles sur l’évolution du paléolac dans le bassin de Colônia (São Paulo) depuis le début du Pléistocène.","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-09-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135586091","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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A Taxonomic Assessment of Pyropia hiemalis (Kylin) Varela-Álvarez, Guiry & Serrão, comb. nov. (Bangiaceae, Bangiophyceae) 这首歌在美国公告牌百强单曲榜上排名第二,在英国单曲榜上排名第三,在英国单曲榜上排名第四。11月(Bangiaceae, Bangiophyceae)
IF 1.3 4区 生物学 Q3 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2023-08-30 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a5
E. Varela-Álvarez, M. Guiry, Ester A. Serrão
ABSTRACT Until recently, all the bladed members of the Bangiaceae Duby were assigned to the genus Porphyra C.Agardh, nom. cons.; however, in the last twenty years, major molecular taxonomic revisions of this family have resulted in several new and reinstated genera. Porphyra linearis Greville is one of the species retained in Porphyra and its growth and reproduction is confined to the upper intertidal in the colder months of the year. Porphyra hiemalis Kylin was described for specimens collected from the south-west coast of Sweden but was later referred to the synonymy of P. linearis based upon its winter seasonality and linear form. We here compare the morphology and reproduction of isolates of both taxa from various locations in the NE Atlantic, and we sequence the intergenetic RUBISCO spacer and adjacent coding regions in these isolates to verify their phylogenetic relationships with other members of bladed Bangiaceae. Results show that both entities are not only distinct species despite almost identical external morphology, but they belong to different genera. A lectotype and epitype (of sequenced material) is designated for P. hiemalis and a transfer to the reinstated genus Pyropia J.Agardh is proposed as Pyropia hiemalis (Klyin) Varela-Álvarez, Guiry & Serrão, comb. nov. RÉSUMÉ Évaluation taxonomique de Pyropia hiemalis (Kylin) Varela-Álvarez, Guiry & Serrão, comb. nov. (Bangiaceae, Bangiophyceae). Jusqu'à récemment, tous les membres à lames des Bangiaceae Duby étaient assignés au genre Porphyra C.Agardh, nom. cons.; cependant, au cours des vingt dernières années, d'importantes révisions taxonomiques moléculaires de cette famille ont donné lieu à plusieurs genres nouveaux ou rétablis. Porphyra linearis Greville est l'une des espèces retenues dans Porphyra; sa croissance et sa reproduction sont confinées à la zone intertidale supérieure pendant les mois les plus froids de l'année. Porphyra hiemalis Kylin a été décrit selon des spécimens collectés sur la côte sud-ouest de la Suède, mais il a ensuite été mis en synonymie de P. linearis sur la base de sa saisonnalité hivernale et de sa forme linéaire. Nous comparons ici la morphologie et la reproduction d'isolats des deux taxons provenant de divers endroits de l'Atlantique Nord-Est, et nous séquençons l'espaceur intergénétique RUBISCO et les régions codantes adjacentes dans ces isolats afin de vérifier leurs relations phylogénétiques avec d'autres membres des Bangiaceae à feuilles. Les résultats montrent que les deux entités ne sont pas seulement des espèces distinctes malgré une morphologie externe presque identique, mais qu'elles appartiennent à des genres différents. Un lectotype et un épitype (du matériel séquencé) sont désignés pour P. hiemalis et un transfert au genre rétabli Pyropia J.Agardh est proposé sous le nom de Pyropia hiemalis (Klyin) Varela-Álvarez, Guiry & Serrão, comb. nov.
摘要:直到最近,所有带叶片的蕨科植物都被归为Porphyra C.Agardh属。然而,在过去的二十年中,该科的主要分子分类学修订产生了几个新的和恢复的属。线性紫菜(Porphyra linearis Greville)是保留在紫菜中的一种,它的生长和繁殖仅限于一年中较冷月份的潮间带上游。麒麟卟啉(Porphyra hiemalis Kylin)是在瑞典西南海岸采集的标本中被描述的,但后来根据其冬季季节性和线性形态被称为线性卟啉(P. linearis)的同义词。在此,我们比较了这两个分类群在东北大西洋不同地点的分离株的形态和繁殖,并对这些分离株的RUBISCO间隔区和邻近编码区进行了测序,以验证它们与其他叶片Bangiaceae成员的系统发育关系。结果表明,尽管两种植物的外部形态几乎相同,但它们不仅是不同的种,而且属于不同的属。(测序材料)指定了P. hiemalis的一个选型和表型,并将其转移到恢复的Pyropia j.a agardh属,命名为Pyropia hiemalis (Klyin) Varela-Álvarez, Guiry & serr o, comb。11月RÉSUMÉ Évaluation taxonomique de Pyropia hiemalis (Kylin) Varela-Álvarez, Guiry & serr o,梳子。11 . (Bangiaceae, bangihyaceae)。Jusqu' s recamement, tous les members lames des Bangiaceae Duby,;在此之前,我们有两个课程,分别是:一是课程,课程,课程,课程,课程,课程,课程,课程,课程,课程,课程,课程,课程,课程,课程,课程,课程,课程,课程,课程。卟啉线性是Greville est l'une des espires retenues dans Porphyra;sanci.911cha.com sanci.911cha.com sanci.9cha.com sanci.9cha.com sanci.9cha.com sanci.9cha.com sanci.9cha.com sanci.9cha.com sanci.9cha.com sanci.9cha.com sanci.9cha.comPorphyra hiemalis麒麟疾病decrit根据des标本收集关于la cote西南部de la仿麂皮,但是il一个套间mis en synonymie·德·p·linearis苏尔那儿基地de sa saisonnalite hivernale et de sa印版线性。在两个分类群中,从形态上比较,从繁殖上比较,从物种上比较,从物种上比较,从物种上比较,从物种上比较,从物种上比较,从物种上比较,从物种上比较,从物种上比较,从物种上比较,从物种上比较。不同类型的不同类型的不同,不同的不同类型的不同,不同的不同类型的不同,不同类型的不同。unlectotype et Un sampietype (du matacriel ssamquencest) sont dsamsignacimys pour P. hiemalis et Un transfer au genre rcameti Pyropia J.Agardh est建议sous le nom de Pyropia hiemalis (Klyin) Varela-Álvarez, Guiry & serr,梳子。11月。
{"title":"A Taxonomic Assessment of Pyropia hiemalis (Kylin) Varela-Álvarez, Guiry & Serrão, comb. nov. (Bangiaceae, Bangiophyceae)","authors":"E. Varela-Álvarez, M. Guiry, Ester A. Serrão","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a5","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a5","url":null,"abstract":"ABSTRACT Until recently, all the bladed members of the Bangiaceae Duby were assigned to the genus Porphyra C.Agardh, nom. cons.; however, in the last twenty years, major molecular taxonomic revisions of this family have resulted in several new and reinstated genera. Porphyra linearis Greville is one of the species retained in Porphyra and its growth and reproduction is confined to the upper intertidal in the colder months of the year. Porphyra hiemalis Kylin was described for specimens collected from the south-west coast of Sweden but was later referred to the synonymy of P. linearis based upon its winter seasonality and linear form. We here compare the morphology and reproduction of isolates of both taxa from various locations in the NE Atlantic, and we sequence the intergenetic RUBISCO spacer and adjacent coding regions in these isolates to verify their phylogenetic relationships with other members of bladed Bangiaceae. Results show that both entities are not only distinct species despite almost identical external morphology, but they belong to different genera. A lectotype and epitype (of sequenced material) is designated for P. hiemalis and a transfer to the reinstated genus Pyropia J.Agardh is proposed as Pyropia hiemalis (Klyin) Varela-Álvarez, Guiry & Serrão, comb. nov. RÉSUMÉ Évaluation taxonomique de Pyropia hiemalis (Kylin) Varela-Álvarez, Guiry & Serrão, comb. nov. (Bangiaceae, Bangiophyceae). Jusqu'à récemment, tous les membres à lames des Bangiaceae Duby étaient assignés au genre Porphyra C.Agardh, nom. cons.; cependant, au cours des vingt dernières années, d'importantes révisions taxonomiques moléculaires de cette famille ont donné lieu à plusieurs genres nouveaux ou rétablis. Porphyra linearis Greville est l'une des espèces retenues dans Porphyra; sa croissance et sa reproduction sont confinées à la zone intertidale supérieure pendant les mois les plus froids de l'année. Porphyra hiemalis Kylin a été décrit selon des spécimens collectés sur la côte sud-ouest de la Suède, mais il a ensuite été mis en synonymie de P. linearis sur la base de sa saisonnalité hivernale et de sa forme linéaire. Nous comparons ici la morphologie et la reproduction d'isolats des deux taxons provenant de divers endroits de l'Atlantique Nord-Est, et nous séquençons l'espaceur intergénétique RUBISCO et les régions codantes adjacentes dans ces isolats afin de vérifier leurs relations phylogénétiques avec d'autres membres des Bangiaceae à feuilles. Les résultats montrent que les deux entités ne sont pas seulement des espèces distinctes malgré une morphologie externe presque identique, mais qu'elles appartiennent à des genres différents. Un lectotype et un épitype (du matériel séquencé) sont désignés pour P. hiemalis et un transfert au genre rétabli Pyropia J.Agardh est proposé sous le nom de Pyropia hiemalis (Klyin) Varela-Álvarez, Guiry & Serrão, comb. nov.","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.3,"publicationDate":"2023-08-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"88943456","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Phylogeography of Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae) in Hawai‘i: A Single Species with High Divergence 夏威夷Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae)的系统地理学:一个高分化的单一物种
IF 1.3 4区 生物学 Q3 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2023-07-19 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a4
James T. Fumo, A. Sherwood
ABSTRACT Algal biogeography in Hawai‘i has not been studied in detail for many species. The islands are home to swift-current deep-water channels separating suitable habitats. The ability of these channels to act as barriers to dispersal has been studied in several animal lineages and is assessed here using the widespread red alga Amansia glomerata C.Agardh. A variety of analytical techniques based on 129 mitochondrial COI barcoding sequences collected across c. 2500 km were used to assess the genetic diversity of A. glomerata in Hawai‘i. Haplotype network analyses demonstrated that the species is split into four main lineages which overlap in large parts of their range, yet there is insufficient support to recognize the lineages as separate species. Measures of haplotype diversity, nucleotide diversity, and neutrality tests suggest that at least three of these lineages have undergone recent population expansion. Biogeographic barriers were found to largely match those of marine animal groups in the archipelago. No evidence was found for distinct haplotypes or lineages between shallow and mesophotic reefs. A number of potential collection locations are suggested for the 1822 lectotype of the species, which was included in the molecular analyses. Potential scenarios leading to observed diversity patterns in the archipelago are presented. Amansia glomerata exhibits a high degree of haplotypic variation in Hawai‘i, suggesting it may exhibit vast molecular divergences across its broader range, which extends from Hawai‘i to southeastern Africa. RÉSUMÉ Phylogéographie d'Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae) à Hawai‘i: une seule espèce à forte divergence. La biogéographie des algues à Hawai‘i n'a pas été étudiée en détail pour de nombreuses espèces. Les îles abritent des chenaux rapides d'eau profonde séparant les habitats appropriés. La capacité de ces chenaux à agir comme des barrières à la dispersion a été étudiée dans plusieurs lignées animales et est évaluée ici à l'aide de l’algue très répandue Amansia glomerata C.Agardh. Une variété de techniques analytiques basées sur 129 séquences de code-barres COI mitochondriales collectées sur environ 2500 km ont été utilisées pour évaluer la diversité génétique d'A. glomerata à Hawai‘i. Les analyses du réseau d'haplotypes ont démontré que l'espèce est divisée en quatre lignées principales qui se chevauchent dans de grandes parties de leur aire de répartition, mais il n'y a pas suffisamment de soutien pour reconnaître les lignées comme plusieurs espèces. Les mesures de la diversité des haplotypes, de la diversité des nucléotides et des tests de neutralité suggèrent qu'au moins trois de ces lignées ont subi des expansions démographiques récentes. Les barrières biogéographiques correspondent largement à celles des groupes d'animaux marins de l'archipel. Aucune preuve n'a été trouvée pour des haplotypes ou des lignées distincts entre les récifs peu profonds et mésophotiques. Un certain nombre d
夏威夷许多种类的藻类生物地理尚未得到详细研究。这些岛屿上有水流湍急的深水通道,分隔着适宜的栖息地。这些通道作为扩散障碍的能力已经在几个动物谱系中进行了研究,并在这里使用广泛分布的红藻Amansia glomerata C.Agardh进行评估。利用收集的129条线粒体COI条形码序列,利用多种分析技术对夏威夷A. glomerata的遗传多样性进行了评估。单倍型网络分析表明,该物种分为四个主要谱系,这些谱系在其活动范围的大部分重叠,但没有足够的证据支持将这些谱系视为单独的物种。单倍型多样性、核苷酸多样性和中性测试的测量表明,这些谱系中至少有三个经历了最近的种群扩张。研究发现,生物地理屏障与群岛上的海洋动物群体基本吻合。没有证据表明浅层和中孔珊瑚礁之间存在明显的单倍型或谱系。在分子分析中,提出了该物种1822选型的一些潜在收集点。提出了导致观察到的群岛多样性模式的潜在情景。在夏威夷,amarsia glomerata表现出高度的单倍型变异,这表明它可能在从夏威夷延伸到非洲东南部的更广泛的范围内表现出巨大的分子差异。RÉSUMÉ phyloggraphie d'Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae) 夏威夷:一个seule espce forte divergence。La biogsamographie des algues Hawai 'a pas samoest . samoest . samoest . en . samoest . de nombreuses esp。Les abrient des chenaux rapides d'eau proprode samsament Les。我的职业生涯有三个方面:1 .我的职业生涯有三个方面:1 .我的职业生涯有几个方面:1 .我的职业生涯有几个方面:1 .我的职业生涯有几个方面:1 .我的职业生涯有几个方面:1 .我的职业生涯有几个方面:1 .我的职业生涯有几个方面:1 .我的职业生涯有几个方面。Une variacest de techniques analytiques, basemes sur 129, basemques de code-barres COI线粒体,收集了2500 km范围内的basemes sur environment;glomerata,夏威夷。所有的分析都是基于单体型的,所有的数据都是基于单体型的,所有的数据都是基于单体型的,所有的数据都是基于单体型的,所有的数据都是基于单体型的,所有的数据都基于单体型的,所有的数据都是基于单体型的。单倍型多样性测量法、核型多样性测量法和中性型测试法都表明,单倍型的多样性测量法、核型的多样性测量法和中性型的测试法都表明,单倍型的多样性测量法和扩展型的扩展测量法都表明,单倍型的多样性测量法和中性型的测试法都表明,单倍型的多样性测量法和中性型的测试法都表明。《生物障碍学》对应于《海洋动物类群》的大型细胞。三种不同的单倍型,三种不同的单倍型,三种不同的单倍型,三种不同的单倍型,三种不同的单倍型,三种不同的单倍型。在某些情况下,收集潜力的人认为,在1822年的一项调查中,有一些人认为, - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -根据不同的模数,观察到不同的模数和不同的模数,所有的模数都是相同的。Amansia glomerata pracente undegre度的变异单倍型的夏威夷,ce qui建议,qui ' il pet pracente de vases的差异,moacimculaires sur sonaire de的变异,加上大的,qui ' s的samtend d '夏威夷和西南非洲。
{"title":"Phylogeography of Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae) in Hawai‘i: A Single Species with High Divergence","authors":"James T. Fumo, A. Sherwood","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a4","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a4","url":null,"abstract":"ABSTRACT Algal biogeography in Hawai‘i has not been studied in detail for many species. The islands are home to swift-current deep-water channels separating suitable habitats. The ability of these channels to act as barriers to dispersal has been studied in several animal lineages and is assessed here using the widespread red alga Amansia glomerata C.Agardh. A variety of analytical techniques based on 129 mitochondrial COI barcoding sequences collected across c. 2500 km were used to assess the genetic diversity of A. glomerata in Hawai‘i. Haplotype network analyses demonstrated that the species is split into four main lineages which overlap in large parts of their range, yet there is insufficient support to recognize the lineages as separate species. Measures of haplotype diversity, nucleotide diversity, and neutrality tests suggest that at least three of these lineages have undergone recent population expansion. Biogeographic barriers were found to largely match those of marine animal groups in the archipelago. No evidence was found for distinct haplotypes or lineages between shallow and mesophotic reefs. A number of potential collection locations are suggested for the 1822 lectotype of the species, which was included in the molecular analyses. Potential scenarios leading to observed diversity patterns in the archipelago are presented. Amansia glomerata exhibits a high degree of haplotypic variation in Hawai‘i, suggesting it may exhibit vast molecular divergences across its broader range, which extends from Hawai‘i to southeastern Africa. RÉSUMÉ Phylogéographie d'Amansia glomerata C.Agardh (Ceramiales, Rhodomelaceae) à Hawai‘i: une seule espèce à forte divergence. La biogéographie des algues à Hawai‘i n'a pas été étudiée en détail pour de nombreuses espèces. Les îles abritent des chenaux rapides d'eau profonde séparant les habitats appropriés. La capacité de ces chenaux à agir comme des barrières à la dispersion a été étudiée dans plusieurs lignées animales et est évaluée ici à l'aide de l’algue très répandue Amansia glomerata C.Agardh. Une variété de techniques analytiques basées sur 129 séquences de code-barres COI mitochondriales collectées sur environ 2500 km ont été utilisées pour évaluer la diversité génétique d'A. glomerata à Hawai‘i. Les analyses du réseau d'haplotypes ont démontré que l'espèce est divisée en quatre lignées principales qui se chevauchent dans de grandes parties de leur aire de répartition, mais il n'y a pas suffisamment de soutien pour reconnaître les lignées comme plusieurs espèces. Les mesures de la diversité des haplotypes, de la diversité des nucléotides et des tests de neutralité suggèrent qu'au moins trois de ces lignées ont subi des expansions démographiques récentes. Les barrières biogéographiques correspondent largement à celles des groupes d'animaux marins de l'archipel. Aucune preuve n'a été trouvée pour des haplotypes ou des lignées distincts entre les récifs peu profonds et mésophotiques. Un certain nombre d","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.3,"publicationDate":"2023-07-19","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"88059448","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Structural and Functional Genes, and Highly Repetitive Sequences Commonly Used in the Phylogeny and Species Concept of the Phylum Cyanobacteria 蓝藻门系统发育和物种概念中常用的结构和功能基因以及高度重复序列
IF 1.3 4区 生物学 Q3 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2023-06-28 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a3
B. Nowruzi, Lenka Hutárová
ABSTRACT Cyanobacteria are a lineage of Eubacteria that have long captured the attention of scientists. Approximately 5310 species of cyanobacteria have been hitherto described and new species are continually being found, named and described according to established rules. The correct determination of cyanobacteria strains concerns new biotechnological applications as well as ecological studies. There are many situations where it is crucial to recognise distinct algae species, however methods for doing so vary greatly. The aim of this review is to summarize the state of the art of the main and most recent molecular studies focusing on the phylum Cyanobacteria, with particular attention to the most frequently used gene markers. For a long time, the classification method used for cyanobacteria as well as traditionally described species was mainly based on morphology. Over time, integrative taxonomy, which involves the inclusion of many characters and comprehensive taxa sampling, has become the rule as it provides a better resolution of species relationships. For a better resolution of the phylogenies of the phylum Cyanobacteria, it is usually necessary to focus on different genetic markers: from the most common, like the 16S and 23S rRNA, ITS, rbcLXS and rpoC genes, to genes not so widely used, such as hetR, psbA, tufA, gyp and cpcBA. Also, the highly repetitive sequences often used for the symbiotic cyanobacteria represent an important factor in the inference of the phylogenetic relationships. RÉSUMÉ Gènes structurels, fonctionnels, et séquences hautement répétitives couramment utilisés pour la phylogénie et concept d'espèces dans le phylum des cyanobactéries. Les cyanobactéries sont une lignée d'eubactéries qui attirent depuis longtemps l'attention des scientifiques. Environ 5 310 espèces de cyanobactéries ont été décrites jusqu'à présent et de nouvelles espèces sont continuellement découvertes, généralement nommées et décrites d'après des règles précises. La détermination correcte des souches de cyanobactéries a des répercussions sur de nouvelles applications biotechnologiques ainsi que sur des études écologiques. Dans de nombreuses situations, il est crucial de reconnaître des espèces d'algues distinctes, mais les méthodes pour y parvenir varient considérablement. L'objectif de cette revue est de faire le point sur les principales et les plus récentes études moléculaires portant sur le phylum des cyanobactéries, en accordant une attention particulière aux marqueurs génétiques les plus fréquemment utilisés. Pendant longtemps, la méthode de classification utilisée pour les cyanobactéries et les espèces traditionnellement décrites était principalement basée sur la morphologie. Au fil du temps, la taxonomie intégrative, qui implique l'inclusion de nombreux caractères et un échantillonnage complet des taxons, est devenue la règle car elle permet une meilleure résolution des relations entre espèces. Pour une meilleure résolution des phylogénies du ph
蓝藻是真细菌的一个谱系,长期以来一直引起科学家的注意。迄今为止,已经描述了大约5310种蓝藻,并且不断发现新物种,根据既定规则命名和描述。蓝藻菌株的正确测定涉及新的生物技术应用以及生态研究。在许多情况下,识别不同的藻类物种是至关重要的,然而,这样做的方法差别很大。本综述的目的是总结目前的主要和最新的分子研究集中在门蓝藻,特别注意最常用的基因标记的艺术状态。长期以来,蓝藻以及传统上描述的物种的分类方法主要基于形态学。随着时间的推移,包括许多特征和综合分类群抽样的综合分类学已经成为一种规则,因为它提供了更好的物种关系解决方案。为了更好地解决蓝藻门的系统发育问题,通常有必要关注不同的遗传标记:从最常见的16S和23S rRNA、ITS、rbcLXS和rpoC基因,到不那么广泛使用的基因,如hetR、psbA、tufA、gyp和cpcBA。此外,共生蓝藻经常使用的高度重复序列是推断系统发育关系的重要因素。RÉSUMÉ 结构、功能、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金、薪金和薪金。蓝藻变异体引起了科学家们的长期关注,而蓝藻变异体引起了科学家的长期关注。环境5 310电子表格中有蓝色的电子表格,有蓝色的电子表格,有蓝色的电子表格,有蓝色的电子表格,有蓝色的电子表格,有蓝色的电子表格,有蓝色的电子表格,有蓝色的电子表格。在生物技术的新应用中,利用生物技术的方法,利用生物技术的方法,利用生物技术的方法,利用生物技术的方法,利用生物技术的方法,利用生物技术的方法,利用生物技术的方法,利用生物技术的方法,利用生物技术的方法,使生物技术的方法得到改进。在不同的情况下,最重要的是要重新确定《公约》所规定的不同的、不同的、不相同的、不相同的、不一致的、不一致的、不一致的、不一致的、不一致的、不一致的、不一致的、不一致的、不一致的和不一致的。根据特别注意事项,我们的目标是确定这些原则点,并将这些原则点与其他原则点结合起来,将这些原则点与其他原则点结合起来,将这些原则点与其他原则点结合起来,将这些原则点与其他原则点结合起来,将这些原则点与其他原则点结合起来,将这些原则点与其他原则点结合起来。在长时间的分类中,分类利用的是:蓝藻- - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -简单地说,在所有的分类中都包含了所有的分类,在所有的分类中都包含了所有的分类,在所有的分类中都包含了所有的分类,在所有的分类中都包含了所有的分类。1 .将不同种类的蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌-蓝细菌另外,在系统关系的构建中,有重要的因素,如系统关系的构建、系统关系的构建、系统关系的构建、系统关系的构建等。
{"title":"Structural and Functional Genes, and Highly Repetitive Sequences Commonly Used in the Phylogeny and Species Concept of the Phylum Cyanobacteria","authors":"B. Nowruzi, Lenka Hutárová","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a3","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a3","url":null,"abstract":"ABSTRACT Cyanobacteria are a lineage of Eubacteria that have long captured the attention of scientists. Approximately 5310 species of cyanobacteria have been hitherto described and new species are continually being found, named and described according to established rules. The correct determination of cyanobacteria strains concerns new biotechnological applications as well as ecological studies. There are many situations where it is crucial to recognise distinct algae species, however methods for doing so vary greatly. The aim of this review is to summarize the state of the art of the main and most recent molecular studies focusing on the phylum Cyanobacteria, with particular attention to the most frequently used gene markers. For a long time, the classification method used for cyanobacteria as well as traditionally described species was mainly based on morphology. Over time, integrative taxonomy, which involves the inclusion of many characters and comprehensive taxa sampling, has become the rule as it provides a better resolution of species relationships. For a better resolution of the phylogenies of the phylum Cyanobacteria, it is usually necessary to focus on different genetic markers: from the most common, like the 16S and 23S rRNA, ITS, rbcLXS and rpoC genes, to genes not so widely used, such as hetR, psbA, tufA, gyp and cpcBA. Also, the highly repetitive sequences often used for the symbiotic cyanobacteria represent an important factor in the inference of the phylogenetic relationships. RÉSUMÉ Gènes structurels, fonctionnels, et séquences hautement répétitives couramment utilisés pour la phylogénie et concept d'espèces dans le phylum des cyanobactéries. Les cyanobactéries sont une lignée d'eubactéries qui attirent depuis longtemps l'attention des scientifiques. Environ 5 310 espèces de cyanobactéries ont été décrites jusqu'à présent et de nouvelles espèces sont continuellement découvertes, généralement nommées et décrites d'après des règles précises. La détermination correcte des souches de cyanobactéries a des répercussions sur de nouvelles applications biotechnologiques ainsi que sur des études écologiques. Dans de nombreuses situations, il est crucial de reconnaître des espèces d'algues distinctes, mais les méthodes pour y parvenir varient considérablement. L'objectif de cette revue est de faire le point sur les principales et les plus récentes études moléculaires portant sur le phylum des cyanobactéries, en accordant une attention particulière aux marqueurs génétiques les plus fréquemment utilisés. Pendant longtemps, la méthode de classification utilisée pour les cyanobactéries et les espèces traditionnellement décrites était principalement basée sur la morphologie. Au fil du temps, la taxonomie intégrative, qui implique l'inclusion de nombreux caractères et un échantillonnage complet des taxons, est devenue la règle car elle permet une meilleure résolution des relations entre espèces. Pour une meilleure résolution des phylogénies du ph","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.3,"publicationDate":"2023-06-28","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"75059202","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Phylogenetic Analysis of the Red Algal Tribe Ceramieae Reveals Multiple Morphological Homoplasies but Defines New Genera 红藻族Ceramieae的系统发育分析揭示了多种形态同源性,但定义了新属
IF 1.3 4区 生物学 Q3 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2023-05-04 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a2
M. B. Barros‐Barreto, Maria Alejandra Jaramillo, M. Hommersand, Paulo Cavalcante Gomes Ferreira, C. Maggs
ABSTRACT Despite the importance of morphological characters for classification, molecular data are now more widely used than morphology in phylogenetic reconstructions, particularly in studies of algae. The tribe Ceramieae C.Agardh ex Greville (Ceramiaceae) is a widespread, speciose, and morphologically diverse group of valuable red algae with many identified bioactives. We aimed to elucidate phylogenetic relationships in the tribe to delimit genera and provide a new classification. Generic delimitation is currently based on morphological characters, and there has been no overall reassessment of generic circumscriptions and evolutionary relationships using molecular data. We used three molecular markers (mitochondrial COI-5P, plastid rbcL and nuclear LSU). Within the Ceramieae, several clades are recovered, although the relationships among major clades are not supported. These clades are here recognized as genera, with new circumscriptions for Ceramium Roth, Carpoblepharis Kützing, Herpochondria F.Schmitz & Falkenberg, Campylaephora J.Agardh and Celeceras Kützing, and the proposal of Pseudoceramium Barros-Barreto & Maggs, gen. nov., Yoneshiguea Barros-Barreto, Maggs & M.A.Jaramillo, gen. nov. and Stirkia Barros-Barreto & Maggs, gen. nov. The Ceramieae show a high degree of morphological homoplasy among species as well as extreme phenotypic plasticity within species. Genera lack unique synapomorphies and multiple morphological characters are required to define most of them. Molecular data are critical for understanding systematics in this group. RÉSUMÉ L'analyse phylogénétique de la tribu des algues rouges Ceramieae révèle de multiples homoplasies morphologiques mais définit de nouveaux genres. Malgré l'importance des caractères morphologiques dans la classification, les données moléculaires sont désormais plus largement utilisées que la morphologie dans les reconstructions phylogénétiques, en particulier dans les études sur les algues. La tribu Ceramieae C.Agardh ex Greville (Ceramiaceae) est un groupe répandu, spécifique et morphologiquement diversifié d'algues rouges d'intérêt avec de nombreux bioactifs identifiés. Nous avons cherché à élucider les relations phylogénétiques dans la tribu pour délimiter les genres et fournir une nouvelle classification. La délimitation générique est actuellement basée sur des caractères morphologiques, et il n'y a pas eu de réévaluation globale des circonscriptions génériques et des relations évolutives à l'aide de données moléculaires. Nous avons utilisé trois marqueurs moléculaires (COI-5P mitochondrial, rbcL chloroplastique et LSU nucléaire). Au sein des Ceramieae, plusieurs clades sont reconnus, bien que les relations entre les principaux clades ne soient pas résolues. Ces clades sont ici reconnus comme des genres, avec de nouvelles circonscriptions pour Ceramium Roth, Carpoblepharis Kützing, Herpochondria F.Schmitz & Falkenberg, Campylaephora J.Agardh et Celeceras Kützing, et la proposition de Pseudoceramiu
尽管形态特征对分类很重要,但在系统发育重建中,分子数据比形态学应用更广泛,特别是在藻类研究中。ceramiae C.Agardh ex Greville (Ceramiaceae)是一种分布广泛、种类繁多、形态多样的有价值的红藻,具有许多已确定的生物活性。我们的目的是阐明部落的系统发育关系,以划分属和提供一个新的分类。目前的属界划分是基于形态特征,并没有利用分子数据对属界和进化关系进行全面的重新评估。我们使用了三种分子标记(线粒体COI-5P、质体rbcL和细胞核LSU)。在陶瓷科中,虽然主要分支之间的关系没有得到支持,但仍有几个分支被恢复。这些进化支在这里被认定为属,新定义为Ceramium Roth, Carpoblepharis k tzing, Herpochondria F.Schmitz & Falkenberg, Campylaephora J.Agardh和celeleceras k tzing,并提出Pseudoceramium Barros-Barreto & Maggs, gen. nov., Yoneshiguea Barros-Barreto, Maggs & M.A.Jaramillo, gen. nov.和Stirkia Barros-Barreto & Maggs。陶瓷科在种间表现出高度的形态同质性,在种内表现出极端的表型可塑性。属缺乏独特的突触形态,大多数属需要多种形态特征来定义。分子数据对于理解这一群体的系统分类学至关重要。RÉSUMÉ我分析系统的变种,如:变种,如:变种,如:变种,如:新类型。malgraise的“重要特征形态与分类”、“不重要的特征形态与分类”、“不重要的特征形态与分类”、“不重要的特征形态与分类”、“不重要的特征形态与分类”、“不重要的特征形态与分类”、“不重要的特征形态与分类”、“不重要的特征形态与分类”、“不重要的特征形态与分类”、“不重要的特征形态与分类”、“不重要的特征形态与分类”。La tribu Ceramieae C.Agardh ex Greville (Ceramiaceae) est un group resamicpandu, spsamiccifique et形态学多样性d'algues rouges和'intérêt avec de nombreux生物活性鉴定。常识是我们要沉积les关系phylogenetiques在tribu倒分隔符les流派等fournir一个中篇小说分类。3 . a .限制,限定,限定,限定,限定,限定,限定,限定,限定,限定,限定,限定,限定,限定,限定,限定,限定,限定,限定,限定,限定。Nous avons utilitis三种marqueurs molsamculaires (COI-5P线粒体,rbcL叶绿体和LSU核samuaire)。“我的朋友,我的朋友,我的朋友,我的朋友,我的朋友,我的朋友,我的朋友,我的朋友,我的朋友,我的朋友,”他说。“新一代的神经系统研究”,“新一代的神经系统研究”,Carpoblepharis k tzing, Herpochondria F.Schmitz & Falkenberg, Campylaephora j.a agardh et celeleceras k tzing, et la proposition de Pseudoceramium Barros-Barreto & Maggs, gen. 11, Yoneshiguea Barros-Barreto, Maggs & M.A.Jaramillo, gen. 11, et Stirkia Barros-Barreto & Maggs”,11 . Les Ceramieae montrene undegrise。Les genre manquents de synapomorphies unique et plurieurs caractires morphologiques sont samessaires pour dsamessaires la plupart d'entre eux。“donnsamas molsamculaires”为理解“系统sammatique舞蹈组”提供了必要条件。
{"title":"Phylogenetic Analysis of the Red Algal Tribe Ceramieae Reveals Multiple Morphological Homoplasies but Defines New Genera","authors":"M. B. Barros‐Barreto, Maria Alejandra Jaramillo, M. Hommersand, Paulo Cavalcante Gomes Ferreira, C. Maggs","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a2","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a2","url":null,"abstract":"ABSTRACT Despite the importance of morphological characters for classification, molecular data are now more widely used than morphology in phylogenetic reconstructions, particularly in studies of algae. The tribe Ceramieae C.Agardh ex Greville (Ceramiaceae) is a widespread, speciose, and morphologically diverse group of valuable red algae with many identified bioactives. We aimed to elucidate phylogenetic relationships in the tribe to delimit genera and provide a new classification. Generic delimitation is currently based on morphological characters, and there has been no overall reassessment of generic circumscriptions and evolutionary relationships using molecular data. We used three molecular markers (mitochondrial COI-5P, plastid rbcL and nuclear LSU). Within the Ceramieae, several clades are recovered, although the relationships among major clades are not supported. These clades are here recognized as genera, with new circumscriptions for Ceramium Roth, Carpoblepharis Kützing, Herpochondria F.Schmitz & Falkenberg, Campylaephora J.Agardh and Celeceras Kützing, and the proposal of Pseudoceramium Barros-Barreto & Maggs, gen. nov., Yoneshiguea Barros-Barreto, Maggs & M.A.Jaramillo, gen. nov. and Stirkia Barros-Barreto & Maggs, gen. nov. The Ceramieae show a high degree of morphological homoplasy among species as well as extreme phenotypic plasticity within species. Genera lack unique synapomorphies and multiple morphological characters are required to define most of them. Molecular data are critical for understanding systematics in this group. RÉSUMÉ L'analyse phylogénétique de la tribu des algues rouges Ceramieae révèle de multiples homoplasies morphologiques mais définit de nouveaux genres. Malgré l'importance des caractères morphologiques dans la classification, les données moléculaires sont désormais plus largement utilisées que la morphologie dans les reconstructions phylogénétiques, en particulier dans les études sur les algues. La tribu Ceramieae C.Agardh ex Greville (Ceramiaceae) est un groupe répandu, spécifique et morphologiquement diversifié d'algues rouges d'intérêt avec de nombreux bioactifs identifiés. Nous avons cherché à élucider les relations phylogénétiques dans la tribu pour délimiter les genres et fournir une nouvelle classification. La délimitation générique est actuellement basée sur des caractères morphologiques, et il n'y a pas eu de réévaluation globale des circonscriptions génériques et des relations évolutives à l'aide de données moléculaires. Nous avons utilisé trois marqueurs moléculaires (COI-5P mitochondrial, rbcL chloroplastique et LSU nucléaire). Au sein des Ceramieae, plusieurs clades sont reconnus, bien que les relations entre les principaux clades ne soient pas résolues. Ces clades sont ici reconnus comme des genres, avec de nouvelles circonscriptions pour Ceramium Roth, Carpoblepharis Kützing, Herpochondria F.Schmitz & Falkenberg, Campylaephora J.Agardh et Celeceras Kützing, et la proposition de Pseudoceramiu","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.3,"publicationDate":"2023-05-04","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"86083850","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Molecular Characterization and Morpho-Taxonomy of Gambierdiscus caribaeus Vandersea, Litaker, M.A.Faust, Kibler, W.C.Holland & P.A.Tester (Dinophyceae) from Mauritius Island, South-West Indian Ocean 西南印度洋毛里求斯岛Gambierdiscus caribaeus Vandersea, Litaker, M.A.Faust, Kibler, W.C.Holland和p.a.t est(恐龙科)的分子特征和形态分类
IF 1.3 4区 生物学 Q3 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2023-01-30 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a1
P. Mussai, J. Larsen, R. Jeewon
ABSTRACT Species of the marine benthic dinoflagellate genus Gambierdiscus Adachi & Fukuyo are morphologically similar, and DNA based sequence analyses are necessary to complement morphological species determination. Gambierdiscus species may produce ciguatoxins, the causative agents of human illness ciguatera poisoning (CP). In this study, morphological descriptions, based on laboratory cultures, using light and scanning electron microscopy and DNA based characterisation of one strain (ISOG4) isolated from Petite Rivière Noire, Mauritius are provided. Our morphological observations coupled with DNA based sequence analyses indicate that the Mauritian strain is Gambierdiscus caribaeus Vandersea, Litaker, M.A.Faust, Kibler, W.C.Holland & P.A.Tester. Our strain bears close similarity (LSU 99% identity) to Gambierdiscus caribaeus (GenBank[KY448444]) isolated from Canary Islands, Spain, and phylogenetic results depict it as sister to G. jejuensis S.H.Jang & H.J.Jeong. Gambierdiscus caribaeus (ISOG4) is herein a first report from Mauritius Island and the Mascarene region. RÉSUMÉ Caractérisation moléculaire et morpho-taxonomie de Gambierdiscus caribaeus Vandersea, Litaker, M.A.Faust, Kibler, W.C.Holland & P.A.Tester (Dinophyceae) de l'île Maurice, sud-ouest de l'océan Indien. Les espèces du genre de dinoflagellés benthiques marins Gambierdiscus Adachi & Fukuyo sont morphologiquement similaires, et des analyses de séquences basées sur l'ADN sont nécessaires pour compléter la détermination morphologique des espèces. Les espèces de Gambierdiscus peuvent produire des ciguatoxines, agents responsables de la maladie humaine qu'est la ciguatera (CP). Dans cette étude, des descriptions morphologiques, basées sur des cultures en laboratoire, réalisées par microscopie optique et électronique à balayage, et une caractérisation basée sur l'ADN d'une souche (ISOG4) isolée de Petite Rivière Noire, Maurice sont fournies. Nos observations morphologiques couplées aux analyses de séquences basées sur l'ADN indiquent que la souche mauricienne est Gambierdiscus caribaeus Vandersea, Litaker, M.A.Faust, Kibler, W.C.Holland & P.A.Tester. Notre souche est très similaire (LSU 99 %) à Gambierdiscus caribaeus (GenBank[KY448444]) isolé des îles Canaries, Espagne, et les résultats phylogénétiques la décrivent comme sœur de G. jejuensis S.H.Jang & H.J.Jeong. Gambierdiscus caribaeus (ISOG4) est ici signalé pour la première fois à l'île Maurice et dans la région des Mascareignes.
摘要:Gambierdiscus Adachi和Fukuyo的海洋底栖鞭毛属物种在形态上相似,基于DNA的序列分析是补充形态物种确定的必要条件。冈比亚铁饼可以产生雪卡毒素,这是人类疾病雪卡毒素中毒(CP)的病原体。在这项研究中,形态学描述,基于实验室培养,使用光学和扫描电子显微镜和DNA为基础的特征,从Petite riviires Noire,毛里求斯分离的菌株(ISOG4)提供。形态学观察和DNA序列分析表明毛里求斯菌株为Gambierdiscus caribaeus Vandersea, Litaker, M.A.Faust, Kibler, W.C.Holland和p.a.t tester。该菌株与从西班牙加那利群岛分离的Gambierdiscus caribaeus (GenBank[KY448444])具有相似度(LSU 99%的一致性),系统发育结果表明它是G. jejuensis S.H.Jang和h.j.k jeong的姐妹菌株。Gambierdiscus caribaeus (ISOG4)是毛里求斯岛和马斯克林地区的首次报告。RÉSUMÉ caract le Maurice (Dinophyceae), de l' ococine Indien - western, carbierdiscus caribaeus。Adachi & Fukuyo的sonologiquement similaires, et des analyses de ssamquences basacimes sur l’Adachi & Fukuyo的soncomessaires pour comcomsimonologique des esp。冈比亚预防生产机构,负责人类疾病和毒素的机构(CP)。Dans cette, desdesmorologiques, basicasses sur des cultures en laboratory, basicassines par显微镜光学和basicelectronicque balayage, et une caracacimrisation basicassei sur l'ADN d'une souche (ISOG4), isolacacimise de Petite riviires Noire, Maurice sontfouries。范德西,李泰克,m.a.f asust, Kibler, w.c.h olholland和p.a.d tester。Notre souche est trtr s similaire (LSU 99%) Gambierdiscus caribaeus (GenBank[KY448444]) isol des les Canaries, Espagne, et les r sultats phylogs2013.2013.33 la dsamrivent comme sœur de G. jejuensis s.h.j jang & h.j.d jeong。Gambierdiscus caribaus (ISOG4)是一种新型的生物技术,它可以为人类提供优质的医疗服务。
{"title":"Molecular Characterization and Morpho-Taxonomy of Gambierdiscus caribaeus Vandersea, Litaker, M.A.Faust, Kibler, W.C.Holland & P.A.Tester (Dinophyceae) from Mauritius Island, South-West Indian Ocean","authors":"P. Mussai, J. Larsen, R. Jeewon","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a1","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2023v44a1","url":null,"abstract":"ABSTRACT Species of the marine benthic dinoflagellate genus Gambierdiscus Adachi & Fukuyo are morphologically similar, and DNA based sequence analyses are necessary to complement morphological species determination. Gambierdiscus species may produce ciguatoxins, the causative agents of human illness ciguatera poisoning (CP). In this study, morphological descriptions, based on laboratory cultures, using light and scanning electron microscopy and DNA based characterisation of one strain (ISOG4) isolated from Petite Rivière Noire, Mauritius are provided. Our morphological observations coupled with DNA based sequence analyses indicate that the Mauritian strain is Gambierdiscus caribaeus Vandersea, Litaker, M.A.Faust, Kibler, W.C.Holland & P.A.Tester. Our strain bears close similarity (LSU 99% identity) to Gambierdiscus caribaeus (GenBank[KY448444]) isolated from Canary Islands, Spain, and phylogenetic results depict it as sister to G. jejuensis S.H.Jang & H.J.Jeong. Gambierdiscus caribaeus (ISOG4) is herein a first report from Mauritius Island and the Mascarene region. RÉSUMÉ Caractérisation moléculaire et morpho-taxonomie de Gambierdiscus caribaeus Vandersea, Litaker, M.A.Faust, Kibler, W.C.Holland & P.A.Tester (Dinophyceae) de l'île Maurice, sud-ouest de l'océan Indien. Les espèces du genre de dinoflagellés benthiques marins Gambierdiscus Adachi & Fukuyo sont morphologiquement similaires, et des analyses de séquences basées sur l'ADN sont nécessaires pour compléter la détermination morphologique des espèces. Les espèces de Gambierdiscus peuvent produire des ciguatoxines, agents responsables de la maladie humaine qu'est la ciguatera (CP). Dans cette étude, des descriptions morphologiques, basées sur des cultures en laboratoire, réalisées par microscopie optique et électronique à balayage, et une caractérisation basée sur l'ADN d'une souche (ISOG4) isolée de Petite Rivière Noire, Maurice sont fournies. Nos observations morphologiques couplées aux analyses de séquences basées sur l'ADN indiquent que la souche mauricienne est Gambierdiscus caribaeus Vandersea, Litaker, M.A.Faust, Kibler, W.C.Holland & P.A.Tester. Notre souche est très similaire (LSU 99 %) à Gambierdiscus caribaeus (GenBank[KY448444]) isolé des îles Canaries, Espagne, et les résultats phylogénétiques la décrivent comme sœur de G. jejuensis S.H.Jang & H.J.Jeong. Gambierdiscus caribaeus (ISOG4) est ici signalé pour la première fois à l'île Maurice et dans la région des Mascareignes.","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.3,"publicationDate":"2023-01-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"81657648","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Ulva L. biodiversity in the central Mediterranean Sea: cryptic species and new records 地中海中部Ulva .生物多样性:隐种和新记录
IF 1.3 4区 生物学 Q3 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2022-12-14 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a14
Angela G. Bartolo, G. Zammit, F. Küpper
ABSTRACT Ulva L. species are problematic to identify since they have cryptic morphologies with few distinctive features, as well as significant intraspecific variation. In this study, we report two new records for the Maltese islands: the heterokont benthic multicellular algae Ulva torta (Mertens) Trevisan and Ulva californica Wille, which were isolated and grown in culture from incubated natural substrata. This study includes an integrative systematics approach using both morphology and barcode sequencing of the nuclear internal transcribed spacer (ITS) region (ITS1-5.8S-ITS2), the chloroplast RUBISCO LSU (rbcL) gene and the elongation factor Tu (tufA). Subsequent phylogenetic analyses, supported the separation of these two species from other closely-related congeners that have previously been reported from the Maltese islands. RÉSUMÉ Biodiversité des Ulva L. en Méditerranée centrale: espèces cryptiques et signalements nouveaux. Certaines espèces d'Ulva L. sont difficiles à identifier car elles sont cryptiques, soit par manque de caractères distinctifs, soit en raison de variation phénotypique intraspécifique. Cette étude documente deux nouvelles espèces pour les îles maltaises: les algues multicellulaires benthiques hétérokontes Ulva torta (Mertens) Trevisan et Ulva californica Wille, qui ont été isolées et cultivées en culture à partir de substrats naturels incubés. Cette étude comprend une approche intégrative utilisant la morphologie aussi bien que le séquençage d'ADN de la région de l'espaceur transcrit interne nucléaire (ITS) (ITS1-5.8S-ITS2), du gène chloroplastique RUBISCO LSU (rbcL) et du facteur d'élongation Tu (tufA). Ces deux espèces ont été séparées de leurs proches congénères des îles maltaises grâce aux analyses phylogénétiques.
Ulva L.物种的鉴定存在问题,因为它们具有几乎没有显著特征的隐形态,以及显着的种内变异。在这项研究中,我们报告了马耳他群岛的两个新记录:异源底栖多细胞藻类Ulva torta (Mertens) Trevisan和Ulva californica Wille,它们是从培养的自然基质中分离和培养的。本研究采用综合系统学方法,对核内转录间隔区(ITS - 1-5.8 s - its2)、叶绿体RUBISCO LSU (rbcL)基因和延伸因子Tu (tufA)进行形态学和条形码测序。随后的系统发育分析支持了这两个物种与之前在马耳他群岛报道的其他密切相关的同系物的分离。RÉSUMÉ生物多样性(生物多样性与生物多样性)。某些特定的个体在识别个体时遇到了困难,在识别个体时遇到了困难,在识别个体时遇到了困难,在识别个体时遇到了困难,在识别个体时遇到了困难,在识别个体时遇到了困难。ceta文件《关于马耳他人的新信息》:《关于多细胞生物的基本信息》:《关于马耳他人的多细胞生物的基本信息》:《关于马耳他人的多细胞生物的基本信息》;《关于加利福尼亚人的基本信息》;《关于马耳他人的基本信息》;《关于马耳他人的基本信息》。这个练习曲comprend一approche综合使用la morphologie也很好,le sequencage d 'ADN de la地区de l 'espaceur transcrit实习医师远离(其)(its1 - 5.8 (its2), du基因chloroplastique RUBISCO路易斯安那州立大学(rbcL)而du因素d 'elongation涂(凝灰岩)。cedeux esectrots ont samsamparacmes de leurs处理consamures nres des les maltaises graise , ceaux分析phylogsamusts。
{"title":"Ulva L. biodiversity in the central Mediterranean Sea: cryptic species and new records","authors":"Angela G. Bartolo, G. Zammit, F. Küpper","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a14","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a14","url":null,"abstract":"ABSTRACT Ulva L. species are problematic to identify since they have cryptic morphologies with few distinctive features, as well as significant intraspecific variation. In this study, we report two new records for the Maltese islands: the heterokont benthic multicellular algae Ulva torta (Mertens) Trevisan and Ulva californica Wille, which were isolated and grown in culture from incubated natural substrata. This study includes an integrative systematics approach using both morphology and barcode sequencing of the nuclear internal transcribed spacer (ITS) region (ITS1-5.8S-ITS2), the chloroplast RUBISCO LSU (rbcL) gene and the elongation factor Tu (tufA). Subsequent phylogenetic analyses, supported the separation of these two species from other closely-related congeners that have previously been reported from the Maltese islands. RÉSUMÉ Biodiversité des Ulva L. en Méditerranée centrale: espèces cryptiques et signalements nouveaux. Certaines espèces d'Ulva L. sont difficiles à identifier car elles sont cryptiques, soit par manque de caractères distinctifs, soit en raison de variation phénotypique intraspécifique. Cette étude documente deux nouvelles espèces pour les îles maltaises: les algues multicellulaires benthiques hétérokontes Ulva torta (Mertens) Trevisan et Ulva californica Wille, qui ont été isolées et cultivées en culture à partir de substrats naturels incubés. Cette étude comprend une approche intégrative utilisant la morphologie aussi bien que le séquençage d'ADN de la région de l'espaceur transcrit interne nucléaire (ITS) (ITS1-5.8S-ITS2), du gène chloroplastique RUBISCO LSU (rbcL) et du facteur d'élongation Tu (tufA). Ces deux espèces ont été séparées de leurs proches congénères des îles maltaises grâce aux analyses phylogénétiques.","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.3,"publicationDate":"2022-12-14","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"91131415","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Nitella sonderi A.Braun (Charales, Charophyceae) – a New Record for South America, and First Record from Outside Australia 南美新纪录及澳洲以外首个纪录
IF 1.3 4区 生物学 Q3 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2022-11-28 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a13
R. Romanov, R. Vidal-Russell, V. Nikulin, A. Gontcharov, M. P. Quiroga
ABSTRACT Nitella sonderi A.Braun is newly reported from the Patagonian Plateau, Argentina. This species was only reliably known from Australia until now. The morphological and genetic studies carried out here found no difference between Argentinian and Australian specimens. The species is dioecious, mucous-bearing on fertile whorls, with two to three-forked homeoclemous, macrodactylous branchlets with a long primary ray, an evident central secondary ray, bicellulate dactyls with a shortly narrowing tip of the penultimate cell, which is confluent with a small discoloured conical cell and large antheridia. Although only male plants were found in Patagonia, this combination of traits allowed its differentiation from other species of Nitella C.Agardh known from South America, but pointed towards the similarity with N. papillata F.S.Han & W.Q.Chen found only in South-East China. Nitella sonderi is the first dioecious species from the section Gioallenia R.D.Wood found in South America. Additions to the description of N. sonderi were suggested here based on specimens from Argentina and Australia. Doubt concerning a species record of N. morongii Allen for Australia published elsewhere was outlined. The new species record for South America highlights an unexpected biogeographical pattern, rare for dioecious species, or may suggest a case of invasion. Future taxonomic research is desirable to clarify the affinity of N. sonderi and N. papillata. RÉSUMÉ Nitella sonderi A.Braun (Charales, Charophyceae) – un nouvel enregistrement pour l'Amérique du Sud, et un premier signalement en dehors de l'Australie. Nitella sonderi A.Braun est nouvellement signalée sur le plateau patagonien, en Argentine. Cette espèce n'était connue de manière fiable que d'Australie. Les études morphologiques et génétiques menées ici n'ont révélé aucune différence entre les spécimens argentins et australiens. L'espèce est dioïque, avec des mucosités sur les verticilles fertiles, des rameaux macrodactyles homéoclémeux à deux ou trois fourches avec un long rayon primaire, un rayon secondaire central évident, des dactyles constitués de deux cellules avec une pointe peu rétrécie de l'avant-dernière cellule, qui est confluente avec une petite cellule conique et hyaline et de grandes anthéridies. Bien que seules des plantes mâles aient été trouvées en Patagonie, cette combinaison de traits a permis sa différenciation des autres espèces de Nitella C.Agardh connues d'Amérique du Sud, mais a pointé des similitudes avec N. papillata F.S.Han & W.Q.Chen trouvée uniquement dans le sud-est de la Chine. Nitella sonderi est la première espèce dioïque de la section Gioallenia R.D.Wood trouvée en Amérique du Sud. Des ajouts à la description de N. sonderi ont été suggérés ici sur la base de spécimens étudiés d'Argentine et d'Australie. Des doutes concernant le premier enregistrement de l'espèce de N. morongii Allen en Australie, publié ailleurs, sont émis. Le nouvel enregistrement de l'espèce pour l'Amériqu
摘要:阿根廷巴塔哥尼亚高原新报道了一种名为sonderi a.b araun的植物。直到现在,这个物种只在澳大利亚被可靠地认识。在这里进行的形态学和遗传学研究发现阿根廷和澳大利亚的标本没有区别。本种雌雄异株,在可育的轮生上有粘液,具二至三分叉同色,大趾小枝具一长初级射线,一明显的中央次级射线,双细胞趾尖具一短变窄的第二细胞的尖端,它与一个小的变色锥形细胞和大的肛门汇合。虽然在巴塔哥尼亚只发现了雄性植物,但这一特征的组合使其与南美洲已知的其他Nitella C.Agardh物种区分开来,但指出了与只在中国东南部发现的N. papillata F.S.Han和W.Q.Chen的相似性。sonderi是在南美洲发现的第一个来自Gioallenia R.D.Wood的雌雄异株物种。本文以阿根廷和澳大利亚的标本为基础,对sonderi的描述作了补充。概述了对在其他地方发表的一份澳大利亚褐毛蕨物种记录的质疑。南美洲的新物种记录突出了一种意想不到的生物地理模式,雌雄异株物种很罕见,或者可能表明入侵的情况。未来的分类学研究将有助于阐明sonderi和N. papillata的亲缘关系。RÉSUMÉ尼特拉sonderi A.Braun (Charales, charophysiae) -新注册的l' amsamrique du Sud,以及澳大利亚首屈一指的信号系统。在阿根廷巴塔哥尼亚高原上的新信号采集。Cette espece和' acei ' acei和' acei ' acei。不同的samologiques,不同的samologiques,不同的samologiques,不同的samologiques,不同的samologiques,不同的samologiques,不同的samologiques,不同的samologiques,不同的samologiques,不同的samologiques,不同的samologiques,不同的samologiquesL 'espece dioique,用des mucosites苏尔les verticilles肥沃,des rameaux macrodactyles homeoclemeux联合国两个或者三个fourches长人造丝primaire,联合国人造丝secondaire中央明显,des扬抑抑格构建德两个小房用一个黑一些retrecie de L 'avant-derniere小房,任何人confluente用一个娇小的小房conique et de外面antheridies透明等。“Bien que seules des plantes”、“les aient samtous”、“been que seules des plantes”、“been que seles”、“been que seles”、“been que”、“been que”、“been que”、“been que”、“been que”、“been que”、“been que”、“been que”、“been que”、“been que”、“been que”、“been que”、“been que”、“been que”。在Gioallenia r.d.w oallenia r.d.w oallenia r.d.w oallenia r.d.w oallenia r.d.w oallenia r.d.w oallenia s.s.org org网站上发布的最新消息:Des ajouts de la描述n sonderi位于安大略省suggeres ici苏尔那儿基地de标本etudies d 'Argentine et d 'Australie。关于澳大利亚联邦调查局局长登记的问题,公共事务主管,联邦调查局局长,联邦调查局局长。新登记的1 ' amsamrique du sudmet en samidence un schamacimma biogmographique inattendu,罕见的1 ' les espires dioïques,你的建议的1 ' amsamrique在入侵。他的研究方向是分类分类,未来可食用的种类有:澄清鱼、亲缘鱼、乳突鱼和乳突鱼。
{"title":"Nitella sonderi A.Braun (Charales, Charophyceae) – a New Record for South America, and First Record from Outside Australia","authors":"R. Romanov, R. Vidal-Russell, V. Nikulin, A. Gontcharov, M. P. Quiroga","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a13","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a13","url":null,"abstract":"ABSTRACT Nitella sonderi A.Braun is newly reported from the Patagonian Plateau, Argentina. This species was only reliably known from Australia until now. The morphological and genetic studies carried out here found no difference between Argentinian and Australian specimens. The species is dioecious, mucous-bearing on fertile whorls, with two to three-forked homeoclemous, macrodactylous branchlets with a long primary ray, an evident central secondary ray, bicellulate dactyls with a shortly narrowing tip of the penultimate cell, which is confluent with a small discoloured conical cell and large antheridia. Although only male plants were found in Patagonia, this combination of traits allowed its differentiation from other species of Nitella C.Agardh known from South America, but pointed towards the similarity with N. papillata F.S.Han & W.Q.Chen found only in South-East China. Nitella sonderi is the first dioecious species from the section Gioallenia R.D.Wood found in South America. Additions to the description of N. sonderi were suggested here based on specimens from Argentina and Australia. Doubt concerning a species record of N. morongii Allen for Australia published elsewhere was outlined. The new species record for South America highlights an unexpected biogeographical pattern, rare for dioecious species, or may suggest a case of invasion. Future taxonomic research is desirable to clarify the affinity of N. sonderi and N. papillata. RÉSUMÉ Nitella sonderi A.Braun (Charales, Charophyceae) – un nouvel enregistrement pour l'Amérique du Sud, et un premier signalement en dehors de l'Australie. Nitella sonderi A.Braun est nouvellement signalée sur le plateau patagonien, en Argentine. Cette espèce n'était connue de manière fiable que d'Australie. Les études morphologiques et génétiques menées ici n'ont révélé aucune différence entre les spécimens argentins et australiens. L'espèce est dioïque, avec des mucosités sur les verticilles fertiles, des rameaux macrodactyles homéoclémeux à deux ou trois fourches avec un long rayon primaire, un rayon secondaire central évident, des dactyles constitués de deux cellules avec une pointe peu rétrécie de l'avant-dernière cellule, qui est confluente avec une petite cellule conique et hyaline et de grandes anthéridies. Bien que seules des plantes mâles aient été trouvées en Patagonie, cette combinaison de traits a permis sa différenciation des autres espèces de Nitella C.Agardh connues d'Amérique du Sud, mais a pointé des similitudes avec N. papillata F.S.Han & W.Q.Chen trouvée uniquement dans le sud-est de la Chine. Nitella sonderi est la première espèce dioïque de la section Gioallenia R.D.Wood trouvée en Amérique du Sud. Des ajouts à la description de N. sonderi ont été suggérés ici sur la base de spécimens étudiés d'Argentine et d'Australie. Des doutes concernant le premier enregistrement de l'espèce de N. morongii Allen en Australie, publié ailleurs, sont émis. Le nouvel enregistrement de l'espèce pour l'Amériqu","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.3,"publicationDate":"2022-11-28","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"76345556","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Oospore Features among Morphologically Similar and Closely Related Charophyte Species: Consistency and Variability 形态相似和亲缘关系密切的绿叶植物物种的卵孢子特征:一致性和变异性
IF 1.3 4区 生物学 Q3 Agricultural and Biological Sciences Pub Date : 2022-11-16 DOI: 10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a12
Vanja Milovanović, S. Popović, D. Predojević, G. Šimić, Ana Ržaničanin, J. Sekulić, Ivana Trbojević
ABSTRACT The precise determination of charophytes to the species level is important for many reasons, but the common morphological taxonomic characteristics, particularly between morphologically similar taxa can be insufficient or misleading. The aim of our study was to create a comparative analysis of the oospore's morphometric parameters in morphologically similar taxa such as Chara globularis Thuil., C. “connivens” P.Salzmann ex A.Braun, C. braunii C.C.Gmel. and C. baueri A.Braun (from Serbia). The potential for applying oospore features in species delineation was assessed, along with the interpopulation variability of oospore parameters in geographically remote populations of C. globularis and C. braunii. Common oospore parameters (height, width, number of ridges, width of fossa, and distance between the apical pole of the oospore and its widest part) were measured and the isopolarity index and anisopolarity index indices were calculated. Both interpopulation variability and interspecific differences were confirmed using oospore morphology for the selected charophyte species. Although interpopulation variability does in fact exist, oospore parameters clearly differ between morphologically similar taxa. These results are important from a taxonomic perspective, but also from the aspect of diaspore bank characterization and its potential application in restoration projects. The results also justify the need for the development of oospore identification keys at the local and regional level, particularly in the regions where they are completely lacking (e.g. Balkans). Collecting more data on oospore morphometry is necessary for our results to be widely used. RÉSUMÉ Caractéristiques des oospores parmi des espèces de charophytes morphologiquement similaires et étroitement apparentées: cohérence et variabilité. La détermination précise des charophytes au niveau de l'espèce est importante sous de nombreux aspects, mais les caractéristiques taxonomiques morphologiques communes dans certains cas, en particulier entre des taxons morphologiquement similaires, peuvent être insuffisantes ou trompeuses. L'objectif de notre étude était de créer une analyse comparative des paramètres morphométriques des oospores de taxons morphologiquement similaires comme Chara globularis Thuil. et C. “connivens” P.Salzmann ex A.Braun, ou C. braunii C.C.Gmel. et C. baueri A.Braun (Serbie). Le potentiel d'application des caractéristiques des oospores dans la délimitation des espèces a été évalué, ainsi que la variabilité interpopulations des paramètres des oospores dans les populations géographiquement éloignées de C. globularis et C. braunii. Les paramètres courants des oospores (hauteur des oospores, largeur des oospores, nombre de crêtes, largeur du sillon et distance entre le pôle apical de l'oospore et de sa partie la plus large) ont été mesurés et les indices ISI et ANI ont été calculés. La variabilité interpopulations et les différences interspécifiques ont été confirmé
在种水平上精确地确定蕨类植物是很重要的,但常见的形态分类特征,特别是在形态相似的分类群之间,可能是不够的或误导的。本研究的目的是建立形态相似类群(如Chara globularis Thuil)中卵孢子形态计量参数的比较分析。, C.“纵容”p .萨尔兹曼前a .布劳恩,C.布劳尼C.C.Gmel。C. baueri A.Braun(来自塞尔维亚)。研究了卵孢子特征在物种划分中应用的潜力,以及地理位置偏远的球孢和褐孢种群中卵孢子参数的种群间变异性。测定了常见的卵孢子参数(卵孢子的高度、宽度、脊数、窝宽度、顶极与最宽部分的距离),并计算了卵孢子的等极性指数和非等极性指数。利用卵孢子形态对所选蕨属植物的种群间变异和种间差异进行了验证。虽然种群间变异确实存在,但卵孢子参数在形态相似的分类群之间明显不同。这些结果不仅从分类学的角度,而且从一水硬铝石库的特征及其在恢复工程中的潜在应用方面具有重要意义。结果还证明需要在地方和区域一级开发卵孢子识别密钥,特别是在完全缺乏这些密钥的区域(例如巴尔干)。为了使我们的研究结果得到更广泛的应用,有必要收集更多的卵孢子形态测量数据。RÉSUMÉ caractsamistiques des oo孢子parmi des espires de charophytes形态学上的相似点et samaires et samtroitement明显的samises:一致的samisement和变异性的samisement。在某些情况下,主要是在分类单元形态相似的情况下,防止être不充分的情况下,在某些情况下,主要是在分类单元形态相似性方面。目的:对不同种类的孢子的形态、分类、形态相似性进行比较分析。et C.“connivens”P.Salzmann ex A.Braun, C. braunii C.C.Gmel。等C. baueri A.Braun(塞尔维亚)。Le potentiel d 'application des的特性des合子在划定des易翔疾病安勤科技,依照ainsi乘缆车variabilite interpopulations des产品des合子在人口geographiquement eloignees de c globularis et braunii。莱斯产品报des合子(傲慢des合子,des合子的宽度滑道克里特,du sillon et距离之间的宽度le杆顶端de l 'oospore et de sa一部分la +大)位于安大略省的疾病措施等里面的ISI指数等ANI高频计算的。变异是指种群间的变异,是指个体间的变异,是指个体间的变异,是指个体间的变异,是指个体间的变异和个体间的变异。种群间存在有效变异,不同的种群间具有不同的类群形态相似性。这是一种重要的数据点价值分类法,主要的数据点价值分类法,数据点价值分类法,数据点价值分类法,数据点价值分类法,数据点价值分类法,数据点价值分类法,数据点价值分类法,数据点价值分类法,数据点价值分类法,数据点价值分类法,数据点价值分类法,数据点价值分类法,数据点价值分类法,数据点价值分类法。有理由的调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器、调剂器等(例如巴尔干)。收集到的所有的薪金薪金和薪金薪金都是由薪金薪金和薪金薪金组成的。
{"title":"Oospore Features among Morphologically Similar and Closely Related Charophyte Species: Consistency and Variability","authors":"Vanja Milovanović, S. Popović, D. Predojević, G. Šimić, Ana Ržaničanin, J. Sekulić, Ivana Trbojević","doi":"10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a12","DOIUrl":"https://doi.org/10.5252/cryptogamie-algologie2022v43a12","url":null,"abstract":"ABSTRACT The precise determination of charophytes to the species level is important for many reasons, but the common morphological taxonomic characteristics, particularly between morphologically similar taxa can be insufficient or misleading. The aim of our study was to create a comparative analysis of the oospore's morphometric parameters in morphologically similar taxa such as Chara globularis Thuil., C. “connivens” P.Salzmann ex A.Braun, C. braunii C.C.Gmel. and C. baueri A.Braun (from Serbia). The potential for applying oospore features in species delineation was assessed, along with the interpopulation variability of oospore parameters in geographically remote populations of C. globularis and C. braunii. Common oospore parameters (height, width, number of ridges, width of fossa, and distance between the apical pole of the oospore and its widest part) were measured and the isopolarity index and anisopolarity index indices were calculated. Both interpopulation variability and interspecific differences were confirmed using oospore morphology for the selected charophyte species. Although interpopulation variability does in fact exist, oospore parameters clearly differ between morphologically similar taxa. These results are important from a taxonomic perspective, but also from the aspect of diaspore bank characterization and its potential application in restoration projects. The results also justify the need for the development of oospore identification keys at the local and regional level, particularly in the regions where they are completely lacking (e.g. Balkans). Collecting more data on oospore morphometry is necessary for our results to be widely used. RÉSUMÉ Caractéristiques des oospores parmi des espèces de charophytes morphologiquement similaires et étroitement apparentées: cohérence et variabilité. La détermination précise des charophytes au niveau de l'espèce est importante sous de nombreux aspects, mais les caractéristiques taxonomiques morphologiques communes dans certains cas, en particulier entre des taxons morphologiquement similaires, peuvent être insuffisantes ou trompeuses. L'objectif de notre étude était de créer une analyse comparative des paramètres morphométriques des oospores de taxons morphologiquement similaires comme Chara globularis Thuil. et C. “connivens” P.Salzmann ex A.Braun, ou C. braunii C.C.Gmel. et C. baueri A.Braun (Serbie). Le potentiel d'application des caractéristiques des oospores dans la délimitation des espèces a été évalué, ainsi que la variabilité interpopulations des paramètres des oospores dans les populations géographiquement éloignées de C. globularis et C. braunii. Les paramètres courants des oospores (hauteur des oospores, largeur des oospores, nombre de crêtes, largeur du sillon et distance entre le pôle apical de l'oospore et de sa partie la plus large) ont été mesurés et les indices ISI et ANI ont été calculés. La variabilité interpopulations et les différences interspécifiques ont été confirmé","PeriodicalId":51000,"journal":{"name":"Cryptogamie Algologie","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":1.3,"publicationDate":"2022-11-16","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"89756508","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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