Pub Date : 2023-06-21DOI: 10.5753/eradrj.2023.231720
Lucas Cruz, Micaella Coelho, Luiz M. R. Gadelha, C. Osthoff, Kary A. C. S. Ocaña
O artigo traz discussões sobre a eleição de modificações no formato de execução do workflow ParslRNA-Seq, que levam a melhora do desempenho e escalabilidade computacional, baseado em redução de gastos com operações de E/S com o uso de SSD em relação ao sistema de arquivos paralelos Lustre no supercomputador Santos Dumont.
{"title":"Otimizações em um Workflow Científico de Alto Desempenho","authors":"Lucas Cruz, Micaella Coelho, Luiz M. R. Gadelha, C. Osthoff, Kary A. C. S. Ocaña","doi":"10.5753/eradrj.2023.231720","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231720","url":null,"abstract":"O artigo traz discussões sobre a eleição de modificações no formato de execução do workflow ParslRNA-Seq, que levam a melhora do desempenho e escalabilidade computacional, baseado em redução de gastos com operações de E/S com o uso de SSD em relação ao sistema de arquivos paralelos Lustre no supercomputador Santos Dumont.","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"85919407","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-06-21DOI: 10.5753/eradrj.2023.231711
Guilherme Freire, Kary A. C. S. Ocaña, Micaella Coelho, C. Osthoff
Este trabalho apresenta um estudo de desempenho desenvolvido para o software RAxML. O estudo avalia o tempo de execução do RAxML segundo os recursos computacionais alocados e os parâmetros de entrada da aplicação no ambiente do Supercomputador Santos Dumont (SDumont).
{"title":"Avaliação da aplicação RAxML no Ambiente do Supercomputador SDumont","authors":"Guilherme Freire, Kary A. C. S. Ocaña, Micaella Coelho, C. Osthoff","doi":"10.5753/eradrj.2023.231711","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231711","url":null,"abstract":"Este trabalho apresenta um estudo de desempenho desenvolvido para o software RAxML. O estudo avalia o tempo de execução do RAxML segundo os recursos computacionais alocados e os parâmetros de entrada da aplicação no ambiente do Supercomputador Santos Dumont (SDumont).","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"77709376","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-06-21DOI: 10.5753/eradrj.2023.231713
A. L. Nunes, L. Drummond, C. Boeres
Provedores de nuvens públicas oferecem uma grande variedade de serviços e recursos computacionais. A utilização de serviços mais especializados e automaticamente gerenciados pelos provedores, tal como o modelo de Plataforma como Serviço (PaaS), é uma das causas para o aumento de custos monetários cobrados aos usuários. Neste trabalho apresentamos uma ferramenta de implantação e execução de clusters Spark que utiliza o modelo de Infraestrutura como Serviço (IaaS). Os resultados obtidos a partir de diversos casos de uso apontam que a ferramenta proposta, comparada ao PaaS, é capaz de reduzir razoavelmente os custos de execução de aplicações Spark na nuvem.
{"title":"Reduzindo Custos de Implantação e Execução de Clusters Spark em Nuvens Públicas","authors":"A. L. Nunes, L. Drummond, C. Boeres","doi":"10.5753/eradrj.2023.231713","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231713","url":null,"abstract":"Provedores de nuvens públicas oferecem uma grande variedade de serviços e recursos computacionais. A utilização de serviços mais especializados e automaticamente gerenciados pelos provedores, tal como o modelo de Plataforma como Serviço (PaaS), é uma das causas para o aumento de custos monetários cobrados aos usuários. Neste trabalho apresentamos uma ferramenta de implantação e execução de clusters Spark que utiliza o modelo de Infraestrutura como Serviço (IaaS). Os resultados obtidos a partir de diversos casos de uso apontam que a ferramenta proposta, comparada ao PaaS, é capaz de reduzir razoavelmente os custos de execução de aplicações Spark na nuvem.","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"84829048","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-06-21DOI: 10.5753/eradrj.2023.231719
Raphael Mesquita, Pedro Von Zuben, Juliana V. Valério, S. Rossetto
Simulações de fluidos em tempo real requerem cálculos rápidos e precisos do modelo físico descrito pelas equações de Navier-Stokes. Neste trabalho implementamos as equações de Navier-Stokes utilizando técnicas de programação paralela em GPUs, avaliamos o desempenho alcançado e apresentamos uma forma de visualizar estas simulações.
{"title":"Navier-Stokes: visualização em tempo real","authors":"Raphael Mesquita, Pedro Von Zuben, Juliana V. Valério, S. Rossetto","doi":"10.5753/eradrj.2023.231719","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231719","url":null,"abstract":"Simulações de fluidos em tempo real requerem cálculos rápidos e precisos do modelo físico descrito pelas equações de Navier-Stokes. Neste trabalho implementamos as equações de Navier-Stokes utilizando técnicas de programação paralela em GPUs, avaliamos o desempenho alcançado e apresentamos uma forma de visualizar estas simulações.","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"75960599","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-06-21DOI: 10.5753/eradrj.2023.231722
Mateus F. Lima de Souza, Rômulo T. Lima, Roberto P. Souto, Antônio Tadeu A. Gomes, Tiziano Labruzzo, Andrea Zerilli
Este trabalho apresenta um resultado de execução paralela no supercomputador Santos Dumont para uma implementação do método CSEM 3D. Conceitos e métodos de implementação de processamento paralelo foram empregados para enfatizar o uso de recursos computacionais em cada nó. Assim, pode-se verificar que existe uma limitação na melhoria de desempenho ao aumentar o número de núcleos computacionais utilizados na arquitetura de CPU multicore disponível.
{"title":"Avaliação de desempenho de implementação paralela do método CSEM 3D no supercomputador Santos Dumont","authors":"Mateus F. Lima de Souza, Rômulo T. Lima, Roberto P. Souto, Antônio Tadeu A. Gomes, Tiziano Labruzzo, Andrea Zerilli","doi":"10.5753/eradrj.2023.231722","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231722","url":null,"abstract":"Este trabalho apresenta um resultado de execução paralela no supercomputador Santos Dumont para uma implementação do método CSEM 3D. Conceitos e métodos de implementação de processamento paralelo foram empregados para enfatizar o uso de recursos computacionais em cada nó. Assim, pode-se verificar que existe uma limitação na melhoria de desempenho ao aumentar o número de núcleos computacionais utilizados na arquitetura de CPU multicore disponível.","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"73362009","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-06-21DOI: 10.5753/eradrj.2023.231723
Rômulo T. Lima, Mateus F. Lima de Souza, Roberto P. Souto, Antônio Tadeu A. Gomes, Tiziano Labruzzo, Andrea Zerilli
Perfis de desempenho paralelos foram obtidos para uma implementação do método CSEM 3D, que é uma técnica geofísica usada para localizar reservas de petróleo no fundo do mar. Uma rotina da biblioteca PETSC domina o tempo total de execução, fazendo com que sua execução paralela eficiente resulte em um bom ganho no tempo geral da aplicação.
{"title":"Perfil de desempenho e oportunidades de otimização da implementação do método CSEM 3D","authors":"Rômulo T. Lima, Mateus F. Lima de Souza, Roberto P. Souto, Antônio Tadeu A. Gomes, Tiziano Labruzzo, Andrea Zerilli","doi":"10.5753/eradrj.2023.231723","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231723","url":null,"abstract":"Perfis de desempenho paralelos foram obtidos para uma implementação do método CSEM 3D, que é uma técnica geofísica usada para localizar reservas de petróleo no fundo do mar. Uma rotina da biblioteca PETSC domina o tempo total de execução, fazendo com que sua execução paralela eficiente resulte em um bom ganho no tempo geral da aplicação.","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"87134688","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-06-21DOI: 10.5753/eradrj.2023.231537
A. B. Vasconcelos, R. Brum, A. Paes, L. Drummond
Diversas iniciativas investigam a detecção automática de depressão através de publicações em redes sociais utilizando de modelos de aprendizado de máquina. A forma mais adequada de obter conjuntos de dados seria pelo consentimento dos usuários em compartilhar seus dados. Porém, compartilhar estas publicações para outros grupos de pesquisa nem sempre é recomendado dada a sensibilidade dos dados. Uma solução para este problema, é se valer de técnicas de Aprendizado Federado para trocar modelos no lugar de dados. Neste trabalho, investigamos como combinar Transformers, a arquitetura estado da arte para word embedding, treinados para abordar a detecção automática de depressão nas mídias sociais.
{"title":"Detecção de Depressão nas Mídias Sociais usando Transformers com Aprendizado Federado","authors":"A. B. Vasconcelos, R. Brum, A. Paes, L. Drummond","doi":"10.5753/eradrj.2023.231537","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231537","url":null,"abstract":"Diversas iniciativas investigam a detecção automática de depressão através de publicações em redes sociais utilizando de modelos de aprendizado de máquina. A forma mais adequada de obter conjuntos de dados seria pelo consentimento dos usuários em compartilhar seus dados. Porém, compartilhar estas publicações para outros grupos de pesquisa nem sempre é recomendado dada a sensibilidade dos dados. Uma solução para este problema, é se valer de técnicas de Aprendizado Federado para trocar modelos no lugar de dados. Neste trabalho, investigamos como combinar Transformers, a arquitetura estado da arte para word embedding, treinados para abordar a detecção automática de depressão nas mídias sociais.","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"91198761","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-06-21DOI: 10.5753/eradrj.2023.231712
M. S. D. Melo, L. Drummond, Roberto P. Souto
A utilização de nuvens computacionais em computação de alto desempenho tem levantado questões sobre a vantagem desse tipo de sistema em relação a sistemas tradicionais (on premise). Porém, comparar esses dois sistemas não é trivial, devido a diversos fatores como a quantidade de soluções que os provedores de nuvens oferecem e também do comportamento da aplicação. Este estudo visou analisar o modelo numérico de previsão de tempo e clima BRAMS nos dois sistemas. Observou-se que para um estudo de caso pequeno, a aplicação possui desempenho semelhantemente nos sistemas. Também foi analisado o custo da execução da aplicação em diferentes mercados ofertados pela AWS, que para o problema utilizado, é aconselhado o uso do mercado spot.
{"title":"Análise de desempenho de um sistema de modelagem atmosférica em nuvens computacionais","authors":"M. S. D. Melo, L. Drummond, Roberto P. Souto","doi":"10.5753/eradrj.2023.231712","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231712","url":null,"abstract":"A utilização de nuvens computacionais em computação de alto desempenho tem levantado questões sobre a vantagem desse tipo de sistema em relação a sistemas tradicionais (on premise). Porém, comparar esses dois sistemas não é trivial, devido a diversos fatores como a quantidade de soluções que os provedores de nuvens oferecem e também do comportamento da aplicação. Este estudo visou analisar o modelo numérico de previsão de tempo e clima BRAMS nos dois sistemas. Observou-se que para um estudo de caso pequeno, a aplicação possui desempenho semelhantemente nos sistemas. Também foi analisado o custo da execução da aplicação em diferentes mercados ofertados pela AWS, que para o problema utilizado, é aconselhado o uso do mercado spot.","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"91056232","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-06-21DOI: 10.5753/eradrj.2023.231704
Gabriel C. Mills, S. M. Cavalcante, C. Boeres, V. Rebello
A eficiência e o baixo custo da Computação em Nuvem dependem do gerenciamento de recursos computacionais. Um aspecto vital dessa tarefa é a estimativa do tempo de execução a fim de definir bons escalonamentos. Este artigo analisa a previsibilidade desse tempo de um serviço em Nuvem para o alinhamento de sequências de DNA projetado com o fim de utilizar recursos eficientemente e viabilizar a análise pelos cientistas dos milhares de alinhamentos que podem compor um único experimento. Entretanto, a qualidade da alocação de recursos é baseada na hipótese de que todos os alinhamentos do experimento demandam o mesmo tempo. Este trabalho visa à análise de fatores e os respectivos graus com que impactam o tempo de execução de cada alinhamento.
{"title":"Estimativa de Tempo de Alinhamentos Biológicos na Nuvem","authors":"Gabriel C. Mills, S. M. Cavalcante, C. Boeres, V. Rebello","doi":"10.5753/eradrj.2023.231704","DOIUrl":"https://doi.org/10.5753/eradrj.2023.231704","url":null,"abstract":"A eficiência e o baixo custo da Computação em Nuvem dependem do gerenciamento de recursos computacionais. Um aspecto vital dessa tarefa é a estimativa do tempo de execução a fim de definir bons escalonamentos. Este artigo analisa a previsibilidade desse tempo de um serviço em Nuvem para o alinhamento de sequências de DNA projetado com o fim de utilizar recursos eficientemente e viabilizar a análise pelos cientistas dos milhares de alinhamentos que podem compor um único experimento. Entretanto, a qualidade da alocação de recursos é baseada na hipótese de que todos os alinhamentos do experimento demandam o mesmo tempo. Este trabalho visa à análise de fatores e os respectivos graus com que impactam o tempo de execução de cada alinhamento.","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-21","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"82216963","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-01-01DOI: 10.30749/2177-8337.v27n57p40-70
Alexandre Cesar dos Santos
{"title":"EM BUSCA DO ELEMENTO ESSENCIAL NA ESTRUTURA DA NORMA JURÍDICA PARA A CARACTERIZAÇÃO DO SEU CONCEITO","authors":"Alexandre Cesar dos Santos","doi":"10.30749/2177-8337.v27n57p40-70","DOIUrl":"https://doi.org/10.30749/2177-8337.v27n57p40-70","url":null,"abstract":"","PeriodicalId":52776,"journal":{"name":"Revista da Secao Judiciaria do Rio de Janeiro","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-01-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"69588621","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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