Pub Date : 2023-11-14DOI: 10.1080/07060661.2023.2274327
Xinyu Chen, Mei Luo, Meimei Xiang, Lina Xiong, Yongxin Shu, Guohui Yu, Zhangyong Dong, Yunhao Sun
AbstractCylindrocladium parasiticum Crous, Wingfield & Alfenas, the causal agent of Cylindrocladium black rot of peanut, has led to economic losses in China. However, the response of peanut plant to C. parasiticum is poorly understood. Here, two contrasting peanut cultivars, T09 (C. parasiticum-moderately resistant) and P562 (C. parasiticum-susceptible) were used for comparative analysis of protein profiles in root segment of plant tissues in responses to C. parasiticum infection. Proteomic profiling identified 1647 and 391 differentially accumulated proteins (DAPs) in P562 and T09 relative to uninoculated control, respectively. A total of 350 and 1095 DAPs were identified between P562 and T09 after 9 day(s) post infection (dpi), respectively. Functional categorization showed that C. parasiticum-responsive proteins were mainly involved in catalytic activity and binding functions. KEGG pathway analysis indicated both moderately resistant and susceptible peanut cultivars can regulate gene expression in the phenylpropanoid pathway, terpenoid backbone biosynthesis, SA, and JA pathways to induce defensive genes and protein expression which enhances plant defence or susceptibility capacity. However, MAPK signal pathway was more pronounced in moderately resistant peanut cultivar T09. We also observed an increase of CYP73A100 involved in phenylpropanoid and flavonoid biosynthesis pathways in susceptible peanut ecotype P562, while decrease in moderately resistant interaction. Additionally, there was a marked activation of brassinosteroid biosynthesis in T09, which indicated a possible involvement of activation of plant immune response in moderately resistant responses of peanut to C. parasiticum. This study provides some insights into molecular networks involved in cellular and physiological responses to C. parasiticum in peanut.RésuméCylindrocladium parasiticum Crous, Wingfield & Alfenas, l’agent causal de la pourriture noire à Cylindrocladium de l’arachide (Arachis hypogaea), est un champignon qui infecte les racines, causant ainsi d’importantes pertes économiques en Chine, aux États-Unis et ailleurs dans le monde. Toutefois, les réactions physiologiques et biochimiques des plants d’arachides à C. parasiticum sont mal comprises. Nous avons étudié, dans le cadre de cette recherche, deux cultivars de plants d’arachides dont la sensibilité à l’infection causée par C.parasiticum varie, T09 (modérément résistant) et P562 (sensible), en nous basant sur l’analyse protéomique comparative de segments de racines à la suite de l’infection provoquée par C. parasiticum. Nous avons identifié 1 647 et 391 protéines différentiellement abondantes (PDA) chez les plants infectés de P562 et de T09, respectivement, comparativement aux plants témoins non inoculés. Nous avons également identifié 350 et 1 095 PDA chez les plants inoculés et non inoculés de P562 et de T09, et ce, 9 jours après l’infection. La catégorisation fonctionnelle des PDA a montré que les protéines sensi
【摘要】花生黑腐病的病原是花生黑腐病的主要病原菌——克罗斯、Wingfield和Alfenas。然而,花生植株对寄生蜂的反应尚不清楚。以2个花生品种T09(中度抗)和P562(敏感)为研究对象,比较分析了花生对寄生蜂侵染反应的根系蛋白谱。蛋白质组学分析发现,与未接种对照相比,P562和T09分别有1647和391个差异积累蛋白(DAPs)。感染后9天(dpi), P562和T09分别鉴定出350和1095个dap。功能分类表明,寄生蜂应答蛋白主要参与催化活性和结合功能。KEGG途径分析表明,中抗性和易感花生品种均可通过调控苯丙素途径、萜类主干生物合成途径、SA和JA等途径的基因表达,诱导防御基因和蛋白表达,增强植株的防御或易感能力。而MAPK信号通路在中抗性花生品种T09中更为明显。我们还观察到,在花生易感型P562中,参与苯丙素和类黄酮生物合成途径的CYP73A100增加,而在中度抗性相互作用中减少。此外,在T09中,油菜素内酯的生物合成被显著激活,这表明花生对寄生蜂的中度抗性反应可能参与了植物免疫应答的激活。本研究为花生对寄生蜂的细胞和生理反应的分子网络提供了一些新的认识。ransamsamicadium parasiticum Crous, Wingfield & Alfenas, l 'agent causal de la pourcure noire (Arachis hypogaea), est un champignon qui感染的疫苗,causant ainsi 'importantes peres在中国的<s:1> <s:1> (États-Unis), et ailleurs dans le monde。昆虫,昆虫,昆虫,昆虫,昆虫,昆虫,昆虫等。Nous avons <s:2>, dans le cadre de ette recherche,两个品种的植物d 'arachides不具有敏感性,<s:2> '感染引起的csm .parasiticum变种,T09 (modsamacimement, csm .抗)和P562 (sensible),甚至Nous basant sur l 'analyse prosamomique de segments de racines, <s:2> la suite de感染引起的csm .parasiticum。Nous avons分别鉴定了1 647和391种丰富的蛋白质与植物感染的P562和T09的不同,比较了植物感染的P562和T09的不同。Nous avons对350株和1095株植物的感染进行了鉴定,这些植物接种了P562和T09的感染和非接种了P562和T09的感染。寄生c.p atticum sonsonprinciple隐含的原理,即:<s:2> <s:2> <s:2>的变性变性变性,<s:2> <s:2>的变性变性,<s:2> <s:2>的变性变性,<s:2> <s:2>的变性,<s:2>的变性,<s:2>的变性,<s:2>的变性,<s:2>的变性,<s:2>的变性,<s:2>的变性,<s:2>的变性,<s:2>的变性,<s:2>的变性,<s:2>的变性,<s:2>的变性,<s:2>的变性,<s:2>的变性,<s:2>的变性,<s:2>的变性,<s:2>的变性,<s:2>的变性,<s:2>的变性,以及植物的变性。lavoie de signalisation MAPK a semblblous jouer un rôle加上marqueise chechele栽培的modsamr2013.2013.03。复仇,le品种合理P562 affichait des taux + eleves de CYP73A100联合国细胞色素P450 implique在biosynthese des phenilpropanoides et des黄酮类,缆车品种T09。<s:1> <s:1> <s:1>生物合成<e:1>与<s:1> <s:1>生物合成<e:1>与<s:1> <s:1>生物合成<e:1>与<s:1> <s:1>生物合成与<s:1>生物合成与<s:1>生物合成与<s:1>生物合成与<s:1>生物合成与<s:1>生物合成与生物合成与<s:1>生物合成与生物合成与生物合成与生物合成与个体激活的可能性。catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:catia的研究表明:关键词:寄生蜂;细胞和生理反应;蛋白质组;感谢仲恺农业工程大学郑义雄教授提供花生品系T09和P562。披露声明作者未报告潜在的利益冲突。作者贡献:李洪志和张志勇构思并监督了这个项目,李洪志、张志勇和张志勇设计了实验。X.Y.C.做了大部分的实验。m.l.、M.M.X、L.N.X、Y.X.S和G.H.Y.做了一些实验。y.h.s., z.y.d., x.y.c.和L.N.X.分析了数据并撰写了手稿。质谱蛋白质组学数据已通过PRIDE合作伙伴存储库存储到ProteomeXchange Consortium,数据集标识符为PXD024578。https://www.ebi.ac。
{"title":"Comparative proteomic analysis of the moderately resistant and susceptible peanut cultivars during infestation by <i>Cylindrocladium parasiticum</i>","authors":"Xinyu Chen, Mei Luo, Meimei Xiang, Lina Xiong, Yongxin Shu, Guohui Yu, Zhangyong Dong, Yunhao Sun","doi":"10.1080/07060661.2023.2274327","DOIUrl":"https://doi.org/10.1080/07060661.2023.2274327","url":null,"abstract":"AbstractCylindrocladium parasiticum Crous, Wingfield & Alfenas, the causal agent of Cylindrocladium black rot of peanut, has led to economic losses in China. However, the response of peanut plant to C. parasiticum is poorly understood. Here, two contrasting peanut cultivars, T09 (C. parasiticum-moderately resistant) and P562 (C. parasiticum-susceptible) were used for comparative analysis of protein profiles in root segment of plant tissues in responses to C. parasiticum infection. Proteomic profiling identified 1647 and 391 differentially accumulated proteins (DAPs) in P562 and T09 relative to uninoculated control, respectively. A total of 350 and 1095 DAPs were identified between P562 and T09 after 9 day(s) post infection (dpi), respectively. Functional categorization showed that C. parasiticum-responsive proteins were mainly involved in catalytic activity and binding functions. KEGG pathway analysis indicated both moderately resistant and susceptible peanut cultivars can regulate gene expression in the phenylpropanoid pathway, terpenoid backbone biosynthesis, SA, and JA pathways to induce defensive genes and protein expression which enhances plant defence or susceptibility capacity. However, MAPK signal pathway was more pronounced in moderately resistant peanut cultivar T09. We also observed an increase of CYP73A100 involved in phenylpropanoid and flavonoid biosynthesis pathways in susceptible peanut ecotype P562, while decrease in moderately resistant interaction. Additionally, there was a marked activation of brassinosteroid biosynthesis in T09, which indicated a possible involvement of activation of plant immune response in moderately resistant responses of peanut to C. parasiticum. This study provides some insights into molecular networks involved in cellular and physiological responses to C. parasiticum in peanut.RésuméCylindrocladium parasiticum Crous, Wingfield & Alfenas, l’agent causal de la pourriture noire à Cylindrocladium de l’arachide (Arachis hypogaea), est un champignon qui infecte les racines, causant ainsi d’importantes pertes économiques en Chine, aux États-Unis et ailleurs dans le monde. Toutefois, les réactions physiologiques et biochimiques des plants d’arachides à C. parasiticum sont mal comprises. Nous avons étudié, dans le cadre de cette recherche, deux cultivars de plants d’arachides dont la sensibilité à l’infection causée par C.parasiticum varie, T09 (modérément résistant) et P562 (sensible), en nous basant sur l’analyse protéomique comparative de segments de racines à la suite de l’infection provoquée par C. parasiticum. Nous avons identifié 1 647 et 391 protéines différentiellement abondantes (PDA) chez les plants infectés de P562 et de T09, respectivement, comparativement aux plants témoins non inoculés. Nous avons également identifié 350 et 1 095 PDA chez les plants inoculés et non inoculés de P562 et de T09, et ce, 9 jours après l’infection. La catégorisation fonctionnelle des PDA a montré que les protéines sensi","PeriodicalId":9468,"journal":{"name":"Canadian Journal of Plant Pathology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-11-14","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"134954476","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"农林科学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
AbstractMéxico is among the main producers of onions, which are cultivated mainly in the states of Baja California, Chihuahua, Guanajuato, Michoacán, and Zacatecas. During June and November 2017, foliar blight symptoms were observed in commercial onion crops in the municipality of Copándaro, Michoacán. The incidence of the disease was 20% in June and 80% in November. The objective of this work was to identify the causal agent or agents of this disease. Fungal isolates recovered from symptomatic plants presented conidia typical of Alternaria and Stemphylium. Molecular identification and phylogenetic analysis using partial sequences of the nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region, the translation elongation factor-1 alpha (TEF1), and RNA polymerase subunit II (RPB2) genes confirmed the identity of the isolates as species within the Alternaria alternata species complex, and Stemphylium vesicarium. The isolates reproduced foliar blight symptoms in inoculated onion plants in pathogenicity tests. This is the first report of Alternaria alternata sensu lato and Stemphylium vesicarium causing foliar blight in commercial onion crops in Michoacán.Le Mexique est un des principaux producteurs d’oignons, ceux-ci étant cultivés dans les États de Basse-Californie, de Chihuahua, de Guanajuato, de Michoacán et de Zacatecas. Au cours de juin et de novembre 2017, des symptômes de brûlure helminthosporienne ont été observés dans les cultures commerciales de la municipalité de Copándaro, dans le Michoacán. L’incidence de la maladie était de 20 % en juin et de 80 % en novembre. Le but de cette étude était d’identifier l’agent ou les agents causaux de cette maladie. Des isolats fongiques provenant de plants symptomatiques comportaient les conidies typiques d’Alternaria et de Stemphylium. L’identification moléculaire et l’analyse phylogénétique basée sur des séquences partielles de la région de l’espaceur transcrit interne (ITS) de l’ADN ribosomique nucléaire, le facteur d’élongation de la traduction-1 alpha (TEF1) et les gènes de la sous-unité II de l’ARN polymérase (RPB2) ont confirmé l’identité des isolats en tant qu’espèces du complexe Alternaria alternata et Stemphylium vesicarium. Les isolats ont reproduit les symptômes de la brûlure helminthosporienne chez les plants d’oignons inoculés dans le cadre de tests de pathogénicité. Il s’agit de la première mention d’Alternaria alternata et de Stemphylium vesicarium causant la brûlure helminthosporienne dans des cultures commerciales d’oignons au Michoacán.Keywords: Allium cepaKoch’s postulatesleaf blightmultilocus phylogenypathogenicityKEYWORDS: Mots clésAllium cepabrûlure helminthosporiennepathogénicitéphylogénie multilocuspostulats de KochDisclaimerAs a service to authors and researchers we are providing this version of an accepted manuscript (AM). Copyediting, typesetting, and review of the resulting proofs will be undertaken on this manuscript before final publication of the Version of Record (VoR)
墨西哥是洋葱的主要生产商之一,洋葱主要种植在下加利福尼亚州、奇瓦瓦州、瓜纳华托州、Michoacán和萨卡特卡斯州。2017年6月和11月,在Copándaro和Michoacán市的商品洋葱作物中观察到叶枯病症状。6月和11月的发病率分别为20%和80%。这项工作的目的是确定这种疾病的致病因子。从有症状植物中分离的真菌具有典型的互交菌和茎孢菌的分生孢子。利用核糖体内部转录间隔区(ITS)、翻译延伸因子-1 α (TEF1)和RNA聚合酶亚基II (RPB2)基因的部分序列进行分子鉴定和系统发育分析,证实了分离物属于互花孢属(Alternaria alternata)种复合体和水仙花(Stemphylium vesicarium)种。病原菌在接种洋葱植株上重现叶枯病症状。本文是Michoacán地区首次报道了引起洋葱叶枯病的洋葱互花霉和洋葱茎霉。墨西哥的主要生产地是墨西哥、墨西哥、墨西哥、墨西哥、墨西哥、墨西哥、墨西哥、墨西哥、墨西哥、墨西哥和墨西哥。在2017年6月和11月的课程中,des symptômes de br引诱helminthosporienne和观察与les culculescommerciales de la municipalit Copándaro, dans le Michoacán。6月和11月的发病率分别为20%和80%。但是,如果你的病是由你的病引起的,你的病是由你的病引起的。该菌株分离了植物病原性症状,并与典型的交替病和茎类疾病相结合。L 'identification moleculaire等分析phylogenetique basee苏尔des序列partielles de la地区de L 'espaceur transcrit实习医师(其)de L 'ADN ribosomique远离,le因素d 'elongation de la traduction-1α(TEF1) et de la sous-unite les基因2 de L 'ARN聚合酶(RPB2)证实L 'identite des isolats en瞿如此更'especes du complexe主产et Stemphylium vesicarium。分离株不复制株symptômes de la br, helminthosporienne,植物d 'oignons inocul,干系株de tests de pathogsamnicit。我将会在《植物互生线虫》中提到《植物互生线虫》和《植物茎孢病菌》,并在《植物互生线虫》中提到《植物互生线虫》。关键词:葱属植物cepaKoch的postulatesleaf blightmultilocus phylogenypathogenicityKEYWORDS:著clesAllium cepabrulure helminthosporiennepathogenicitephylogenie multilocuspostulats de KochDisclaimerAs作者和研究人员服务我们提供这个版本的一个公认的手稿(AM)。在最终出版版本记录(VoR)之前,将对该手稿进行编辑、排版和审查。在制作和印前,可能会发现可能影响内容的错误,所有适用于期刊的法律免责声明也与这些版本有关。作者感谢Marlene Díaz-Celaya在分离和开发致病性测试过程中的后勤支持。数据可用性声明本研究中分析的分离株可在CM-CNRG (Colección de Microorganismos, Centro Nacional de Recursos gen, Jalisco, m xico)和INIFAP (Instituto Nacional de investigacones Forestales, Agrícolas y Pecuarias) (https://vun.inifap.gob.mx/portalweb/_Centros?C=007)获得。生成的DNA序列可在国家生物技术信息中心(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)的GenBank中获得,登录号为MN596827-MN596834, MW429366, MW429367, ON745744-ON745746, ON859132, ON859133, ON873736, ON873737, ON911543-ON911545。
{"title":"Onion leaf blight caused by <i>Alternaria alternata sensu lato</i> and <i>Stemphylium vesicarium</i> in Michoacán, México","authors":"Alfredo Reyes-Tena, Amelia Cristina Montoya-Martínez, Sylvia Patricia Fernández-Pavía, Ricardo Santillán-Mendoza, Adanely Jiménez-Villegas, Daniela Pineda-Vaca, Gerardo Rodríguez-Alvarado","doi":"10.1080/07060661.2023.2277819","DOIUrl":"https://doi.org/10.1080/07060661.2023.2277819","url":null,"abstract":"AbstractMéxico is among the main producers of onions, which are cultivated mainly in the states of Baja California, Chihuahua, Guanajuato, Michoacán, and Zacatecas. During June and November 2017, foliar blight symptoms were observed in commercial onion crops in the municipality of Copándaro, Michoacán. The incidence of the disease was 20% in June and 80% in November. The objective of this work was to identify the causal agent or agents of this disease. Fungal isolates recovered from symptomatic plants presented conidia typical of Alternaria and Stemphylium. Molecular identification and phylogenetic analysis using partial sequences of the nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region, the translation elongation factor-1 alpha (TEF1), and RNA polymerase subunit II (RPB2) genes confirmed the identity of the isolates as species within the Alternaria alternata species complex, and Stemphylium vesicarium. The isolates reproduced foliar blight symptoms in inoculated onion plants in pathogenicity tests. This is the first report of Alternaria alternata sensu lato and Stemphylium vesicarium causing foliar blight in commercial onion crops in Michoacán.Le Mexique est un des principaux producteurs d’oignons, ceux-ci étant cultivés dans les États de Basse-Californie, de Chihuahua, de Guanajuato, de Michoacán et de Zacatecas. Au cours de juin et de novembre 2017, des symptômes de brûlure helminthosporienne ont été observés dans les cultures commerciales de la municipalité de Copándaro, dans le Michoacán. L’incidence de la maladie était de 20 % en juin et de 80 % en novembre. Le but de cette étude était d’identifier l’agent ou les agents causaux de cette maladie. Des isolats fongiques provenant de plants symptomatiques comportaient les conidies typiques d’Alternaria et de Stemphylium. L’identification moléculaire et l’analyse phylogénétique basée sur des séquences partielles de la région de l’espaceur transcrit interne (ITS) de l’ADN ribosomique nucléaire, le facteur d’élongation de la traduction-1 alpha (TEF1) et les gènes de la sous-unité II de l’ARN polymérase (RPB2) ont confirmé l’identité des isolats en tant qu’espèces du complexe Alternaria alternata et Stemphylium vesicarium. Les isolats ont reproduit les symptômes de la brûlure helminthosporienne chez les plants d’oignons inoculés dans le cadre de tests de pathogénicité. Il s’agit de la première mention d’Alternaria alternata et de Stemphylium vesicarium causant la brûlure helminthosporienne dans des cultures commerciales d’oignons au Michoacán.Keywords: Allium cepaKoch’s postulatesleaf blightmultilocus phylogenypathogenicityKEYWORDS: Mots clésAllium cepabrûlure helminthosporiennepathogénicitéphylogénie multilocuspostulats de KochDisclaimerAs a service to authors and researchers we are providing this version of an accepted manuscript (AM). Copyediting, typesetting, and review of the resulting proofs will be undertaken on this manuscript before final publication of the Version of Record (VoR)","PeriodicalId":9468,"journal":{"name":"Canadian Journal of Plant Pathology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-11-03","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135819604","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"农林科学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-10-16DOI: 10.1080/07060661.2023.2270941
Mehrdad Abbasi, Sarah Hambleton, Miao Liu, Scott A. Redhead, Gurcharn Singh Brar
AbstractHelictotrichon sempervirens (blue oatgrass) is a perennial grass widely grown for ornamental use in Canada. Rusted blue oatgrass plants with diseased leaves covered with uredinia were collected from two locations at metropolitan Vancouver, British Columbia (BC), in summer 2022. The rust fungus was identified as Puccinia gibberosa (= P. coronata var. gibberosa) based on combined results of morphological characteristics and molecular analyses. The internal transcribed spacer two (ITS2) and partial large subunit ribosomal DNA were amplified and sequenced. The sequence obtained for the rust fungus showed 99.9% identity with the previously reported P. coronata var. gibberosa from USA. This is the first report of rust caused by P. gibberosa on blue oatgrass in Canada. Evidence from phylogenetic analyses supports the recognition of this rust at the species level. A revised description for P. gibberosa is provided, including synonyms, host range and distribution across the globe, and incorporating comprehensive molecular and morphological results for several North American and European specimens. In addition, a lectotype and an epitype are designated here for the rust species.Helictotrichon sempervirens (avoine sempervirente) est une graminée vivace cultivée couramment à des fins ornementales au Canada. À l’été 2022, des plants d’avoine sempervirente rouillée dont les feuilles infectées étaient couvertes d’urédosores ont été collectés à deux endroits de la région métropolitaine de Vancouver, en Colombie-Britannique. Le champignon de la rouille a été identifié en tant que Puccinia gibberosa (= P. coronata var. gibberosa), en se basant sur les résultats combinés des analyses des caractéristiques morphologiques et moléculaires. L’espaceur transcrit interne 2 (ITS2) et la grande sous-unité partielle de l’ADN ribosomique ont été amplifiés et séquencés. La séquence obtenue pour le champignon de la rouille était identique à 99,9 % à P. coronata var. gibberosa préalablement rapporté aux États-Unis. Il s’agit de la première mention de rouille causée par P. gibberosa chez l’avoine sempervirente au Canada. L’indice obtenu des analyses phylogénétiques soutient la reconnaissance de cette rouille au niveau de l’espèce. Une description révisée de P. gibberosa est fournie, y compris les synonymes, la gamme d’hôtes ainsi que l’aire de distribution mondiale, et comprend les résultats détaillés des analyses moléculaires et morphologiques pour plusieurs spécimens nord-américains et européens. En outre, un lectotype et un épitype ont été sélectionnés pour l’espèce de rouille.Keywords: British Columbiafungal diseasePoaceaePuccinialesrust fungiKEYWORDS: champignons de la rouilleColombie-Britanniquemaladie fongiquepoacéesPuccinialesDisclaimerAs a service to authors and researchers we are providing this version of an accepted manuscript (AM). Copyediting, typesetting, and review of the resulting proofs will be undertaken on this manuscript before final publication of the
摘要:蓝燕麦是加拿大广泛种植的多年生观赏草。2022年夏天,在不列颠哥伦比亚省(BC)温哥华大都会的两个地点收集了锈蚀的蓝色燕麦草植物,叶子上覆盖着尿毒杆菌。结合形态特征和分子分析结果,鉴定该锈菌为赤霉素(Puccinia gibberosa)。对内部转录间隔区2 (ITS2)和部分大亚基核糖体DNA进行扩增和测序。结果表明,该锈菌与已有报道的美国冠状孢变种赤霉素同源性达99.9%。这是加拿大首次报道由赤霉素引起的蓝燕麦锈病。系统发育分析的证据支持在物种水平上对这种锈病的认识。提供了对赤霉素的修订描述,包括同义词、寄主范围和全球分布,并结合了几个北美和欧洲标本的综合分子和形态学结果。此外,这里还为锈病种指定了一个选型和一个表型。加拿大的长尾鹅(长尾鹅)est une graminsame vivace栽培的长尾鹅。À在哥伦比亚-不列颠哥伦比亚省,2022年,des plants d ' avoine sempervirente rouill - scv - scv - scv - scv - scv - scv - scv - scv - scv - scv - scv - scv - scv - scv - scv - scv - scv - scv - scv - scv - scv - scv。与此同时,我还发现了一种新的研究方法,即在所有的研究对象中,包括所有的研究对象,包括所有的研究对象,所有的研究对象,包括所有的研究对象,所有的研究对象。空间转录因子2 (ITS2)和大单胞核糖体粒子的转录因子1 / 3和转录因子1 / 3的转录因子1 / 3。La ssamquence obtenue pour le champignon de La rouille samtaisidentique 99,9% P. coronata var. gibberosa pracimableable报告员aux États-Unis。请允许我在第一次会议上提及加拿大境内的(或)与其他地方的(或)。L ' index obtenu de de分析系统的和/或所有的系统的 /或所有的系统的 /或所有的系统。一种描述,包括三个同义词,即游戏和'hôtes世界分布模式,包括三个同义词,包括三个同义词,三个同义词,三个同义词,三个同义词,三个同义词,三个同义词,三个同义词,三个同义词,三个同义词,三个同义词,三个同义词,三个同义词,三个同义词,三个同义词,三个同义词,三个同义词,三个同义词,三个同义词,三个同义词,三个同义词。当然,unlectotype, unlecotype, unacemotype, unacemotype, unacemotype, unacemotype, unacemotype, unacemotype。关键字:不列颠哥伦比亚省真菌病(amam)关键字:champignons de la rouillecombibiebritanniquemaladie fongiquepoacacesesucciniales免责声明作为对作者和研究人员的服务,我们提供此版本的已接受稿件(AM)。在最终出版版本记录(VoR)之前,将对该手稿进行编辑、排版和审查。在制作和印前,可能会发现可能影响内容的错误,所有适用于期刊的法律免责声明也与这些版本有关。感谢不列颠哥伦比亚大学植物标本馆苔藓、地衣和真菌藏品馆长Karen Golinski博士和策展助理Spencer Goyette博士,他们使第一作者能够使用显微镜和显微摄影系统。我们感谢瑞典自然历史博物馆(S)和捷克共和国摩拉维亚博物馆(BRNM)以前借出的真品和模式标本,感谢加拿大国家真菌学植物标本馆(DAOM)处理DAOM 984916,也感谢Paul A. Smith教授(南安普顿大学)和R. Nigel Stringer博士(威尔士国家植物园)分享信息和来自英国的DAOM 985058标本。它是爱丁堡皇家植物园植物标本馆# E00982881号标本的子样本(https://data.rbge.org.uk/herb/E00982881)。此外,我们感谢德国Halle (Saale)的Uwe Braun博士(Martin-Luther-Universität)在命名方面提供建议,并感谢渥太华加拿大农业和农业食品部(AAFC)的Julie Carey在DNA提取和测序方面提供技术援助。这项工作的资金部分来自于不列颠哥伦比亚大学(UBC)、不列颠哥伦比亚省和平河谷物工业发展委员会和萨斯喀彻温省小麦发展委员会向Gurcharn S. Brar提供的资金。这项研究也得到了加拿大农业和农业食品项目ID J-002272的支持。
{"title":"First report of Puccinia gibberosa on blue oatgrass (Helictotrichon sempervirens) in Canada, with taxonomic revision of the rust species","authors":"Mehrdad Abbasi, Sarah Hambleton, Miao Liu, Scott A. Redhead, Gurcharn Singh Brar","doi":"10.1080/07060661.2023.2270941","DOIUrl":"https://doi.org/10.1080/07060661.2023.2270941","url":null,"abstract":"AbstractHelictotrichon sempervirens (blue oatgrass) is a perennial grass widely grown for ornamental use in Canada. Rusted blue oatgrass plants with diseased leaves covered with uredinia were collected from two locations at metropolitan Vancouver, British Columbia (BC), in summer 2022. The rust fungus was identified as Puccinia gibberosa (= P. coronata var. gibberosa) based on combined results of morphological characteristics and molecular analyses. The internal transcribed spacer two (ITS2) and partial large subunit ribosomal DNA were amplified and sequenced. The sequence obtained for the rust fungus showed 99.9% identity with the previously reported P. coronata var. gibberosa from USA. This is the first report of rust caused by P. gibberosa on blue oatgrass in Canada. Evidence from phylogenetic analyses supports the recognition of this rust at the species level. A revised description for P. gibberosa is provided, including synonyms, host range and distribution across the globe, and incorporating comprehensive molecular and morphological results for several North American and European specimens. In addition, a lectotype and an epitype are designated here for the rust species.Helictotrichon sempervirens (avoine sempervirente) est une graminée vivace cultivée couramment à des fins ornementales au Canada. À l’été 2022, des plants d’avoine sempervirente rouillée dont les feuilles infectées étaient couvertes d’urédosores ont été collectés à deux endroits de la région métropolitaine de Vancouver, en Colombie-Britannique. Le champignon de la rouille a été identifié en tant que Puccinia gibberosa (= P. coronata var. gibberosa), en se basant sur les résultats combinés des analyses des caractéristiques morphologiques et moléculaires. L’espaceur transcrit interne 2 (ITS2) et la grande sous-unité partielle de l’ADN ribosomique ont été amplifiés et séquencés. La séquence obtenue pour le champignon de la rouille était identique à 99,9 % à P. coronata var. gibberosa préalablement rapporté aux États-Unis. Il s’agit de la première mention de rouille causée par P. gibberosa chez l’avoine sempervirente au Canada. L’indice obtenu des analyses phylogénétiques soutient la reconnaissance de cette rouille au niveau de l’espèce. Une description révisée de P. gibberosa est fournie, y compris les synonymes, la gamme d’hôtes ainsi que l’aire de distribution mondiale, et comprend les résultats détaillés des analyses moléculaires et morphologiques pour plusieurs spécimens nord-américains et européens. En outre, un lectotype et un épitype ont été sélectionnés pour l’espèce de rouille.Keywords: British Columbiafungal diseasePoaceaePuccinialesrust fungiKEYWORDS: champignons de la rouilleColombie-Britanniquemaladie fongiquepoacéesPuccinialesDisclaimerAs a service to authors and researchers we are providing this version of an accepted manuscript (AM). Copyediting, typesetting, and review of the resulting proofs will be undertaken on this manuscript before final publication of the","PeriodicalId":9468,"journal":{"name":"Canadian Journal of Plant Pathology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-10-16","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"136112489","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"农林科学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-10-04DOI: 10.1080/07060661.2023.2266405
Mehrdad Abbasi, Gurcharn Singh Brar, M. Catherine Aime
AbstractAs an agroforestry resource willow species (Salix spp.) becoming increasingly important in the protection of riverbanks, recovery of floodable lands, soil bioremediation, biomass production, and wicker furniture manufacture, Babylon willow (Salix babylonica) is widely planted all over the world and is found throughout Iran as part of the rural landscape and is mostly planted for ornamental or bioremediation purposes. Rust fungi in the genus Melampsora usually cause disease on Salix species. Identification of Melampsora species is often complicated because there are few differences in spore morphology and little publicly available comparative sequence data. Willow trees in Iran have been reported to be infected by 15 Melampsora species; however, most of these records are based on morphological characterization. During surveillance activities carried out in June 2007, a rust species was detected on isolated Babylon willow trees in an area in Northern Iran. Both the rust fungus and the host plant were identified on the basis of morphological features and DNA sequencing. Based on a combination of morphology, large subunit (LSU) rDNA sequencing and phylogenetic analyses, our rust specimen was identified as Melampsora ferrinii, which is newly reported from Iran on Salix babylonica. Melampsora ferrinii was originally described from the Americas and this is the first time this rust has been observed on its telial host, Babylon willow, in Asia. The documentation of the rust fungus was performed using both scanning electron microscopy (SEM) and light microscopy. Additionally, an identification key for Melampsora species reported on Salix spp. in Iran is included.En tant que ressource agroforestière, les espèces de saules (Salix spp.) deviennent de plus en plus importantes dans la protection des berges, la récupération des terres inondables, la bioremédiation des sols, la production de biomasse et la fabrication de meubles en osier. Le saule de Babylone (Salix babylonica) est largement planté dans le monde entier et se trouve dans tout l’Iran dans le cadre du paysage rural principalement planté à des fins ornementales ou de bioremédiation. Les champignons de la rouille du genre Melampsora provoquent généralement des maladies sur les espèces de Salix. L’identification des espèces de Melampsora est souvent compliquée en raison du peu de différences dans la morphologie des spores et du peu de données de séquence comparative accessibles au public. Des saules en Iran ont été signalés comme étant infectés par 15 espèces de Melampsora, cependant, la plupart de ces signalements sont basés sur la caractérisation morphologique. Au cours des activités de surveillance menées en juin 2007, une espèce de rouille a été détectée sur des arbres isolés de saule de Babylone dans une zone située au nord de l’Iran. Le champignon de la rouille et la plante hôte ont été identifiés sur la base des caractéristiques morphologiques et du séquençage de l’ADN. Sur la base de la
巴比伦柳(Salix babylonica)是一种农林资源柳,在河岸保护、可淹地恢复、土壤生物修复、生物质生产和柳条家具制造等方面发挥着越来越重要的作用。巴比伦柳(Salix babylonica)在世界各地广泛种植,在伊朗作为农村景观的一部分被发现,主要用于观赏或生物修复目的。黑霉属的锈菌通常会引起柳属植物的疾病。由于在孢子形态上几乎没有差异,而且很少有公开的比较序列数据,因此黑脓菌的鉴定通常是复杂的。据报道,伊朗的柳树被15种melamsora感染;然而,这些记录大多是基于形态学特征。在2007年6月开展的监测活动中,在伊朗北部一个地区孤立的巴比伦柳树上发现了一种锈病。通过形态特征和DNA序列分析,鉴定出了病原菌和寄主植物。基于形态学、LSU rDNA测序和系统发育分析,我们的锈病标本被鉴定为Melampsora ferrinii,这是一种新报道的来自伊朗Salix babylonica上的锈病。ferinii Melampsora最初是在美洲发现的,这是第一次在亚洲的巴比伦柳树上观察到这种锈病。利用扫描电子显微镜(SEM)和光学显微镜对锈菌进行了记录。此外,还包括在伊朗Salix spp.上报道的melamsora种的鉴定密钥。农林业资源管理、农业资源管理、农业资源管理、农业资源管理、农业资源管理、农业资源管理、农业资源管理、农业资源管理、农业资源管理、农业资源管理、农业资源管理、农业资源管理、农业资源管理。巴比伦柳(Salix babylonica)是最大的植物,是世界上最大的植物,是伊朗最大的植物,是伊朗最大的植物,是伊朗最大的植物,是伊朗最大的植物,是伊朗最大的植物,是伊朗最大的植物。这是一种令人不安的疾病,它是一种令人不安的疾病,它是一种令人不安的疾病。鉴定遗传变异的遗传变异,确定遗传变异的原因,确定遗传变异的形态,确定遗传变异的形态,确定遗传变异的比较可及性。在伊朗,有3种类型的人认为,这些类型的人认为,这些类型的人认为,这些类型的人认为,这些类型的人认为,这些类型的人认为,这些类型的人认为,这些类型的人认为,这些类型的人认为,这些类型的人认为,这些类型的人认为,这些类型的人认为,这些类型的人认为,这些类型的人认为,这些类型的人认为,这些类型的人认为,这些类型的人认为,这些类型的人认为,这些类型的人认为,2007年6月,一项关于监测和交换交换活动的程序,一项关于交换交换和交换交换的程序,一项关于交换交换和交换交换的程序,一项关于交换交换和交换交换的程序,一项关于交换交换和交换交换的程序,一项关于交换交换和交换交换的程序。la rouille和la plante的champignon hôte和其他的samququalage都是基于一个简单的基础,即基于一个简单的基础,即基于一个简单的基础,即基于一个简单的基础,即基于一个简单的基础。苏尔de la la基地combinaison de la morphologie du sequencage de l 'ADNr des外面sous-unites(路易斯安那州立大学)et des分析phylogenetiques诺标本的疾病标识符像Melampsora ferrinii, recemment signale en伊朗苏尔柳树babylonica。Melampsora ferrinii疾病信息decrite des Ameriques等。这就是第一次首映式在大蒜蛋黄酱observee苏尔儿子hote telien, le索勒会战一总,en Asie。杜拉文档食用香草de La大蒜蛋黄酱的疾病realisee现在拉回La microscopie electronique一个扫除(MEB)等La microscopie optique。此外,一份明确的鉴定文件显示,在伊朗,包括:关键词:黑melpsora ferrinia alicaceaaule pleureurudinales免责声明作为对作者和研究人员的服务,我们提供此版本的接受稿件(AM)。在最终出版版本记录(VoR)之前,将对该手稿进行编辑、排版和审查。在制作和印前,可能会发现可能影响内容的错误,所有适用于期刊的法律免责声明也与这些版本有关。感谢不列颠哥伦比亚大学植物标本馆苔藓、地衣和真菌藏品馆长Karen Golinski博士和策展助理Spencer Goyette博士,他们使第一作者能够使用显微镜和显微摄影系统。资金部分由美国国家科学基金会(DEB-2127290和DEB-1458290),美国农业部(AP20PPQS和T00C077)和USDA Hatch #1010662提供。这项研究也得到了英属哥伦比亚大学(UBC)、卑诗省和平河谷物产业发展委员会和萨斯喀彻温省小麦发展委员会的资助。
{"title":"First report of <i>Melampsora ferrinii</i> (pucciniales) on Babylon willow ( <i>Salix babylonica</i> ) in Iran","authors":"Mehrdad Abbasi, Gurcharn Singh Brar, M. Catherine Aime","doi":"10.1080/07060661.2023.2266405","DOIUrl":"https://doi.org/10.1080/07060661.2023.2266405","url":null,"abstract":"AbstractAs an agroforestry resource willow species (Salix spp.) becoming increasingly important in the protection of riverbanks, recovery of floodable lands, soil bioremediation, biomass production, and wicker furniture manufacture, Babylon willow (Salix babylonica) is widely planted all over the world and is found throughout Iran as part of the rural landscape and is mostly planted for ornamental or bioremediation purposes. Rust fungi in the genus Melampsora usually cause disease on Salix species. Identification of Melampsora species is often complicated because there are few differences in spore morphology and little publicly available comparative sequence data. Willow trees in Iran have been reported to be infected by 15 Melampsora species; however, most of these records are based on morphological characterization. During surveillance activities carried out in June 2007, a rust species was detected on isolated Babylon willow trees in an area in Northern Iran. Both the rust fungus and the host plant were identified on the basis of morphological features and DNA sequencing. Based on a combination of morphology, large subunit (LSU) rDNA sequencing and phylogenetic analyses, our rust specimen was identified as Melampsora ferrinii, which is newly reported from Iran on Salix babylonica. Melampsora ferrinii was originally described from the Americas and this is the first time this rust has been observed on its telial host, Babylon willow, in Asia. The documentation of the rust fungus was performed using both scanning electron microscopy (SEM) and light microscopy. Additionally, an identification key for Melampsora species reported on Salix spp. in Iran is included.En tant que ressource agroforestière, les espèces de saules (Salix spp.) deviennent de plus en plus importantes dans la protection des berges, la récupération des terres inondables, la bioremédiation des sols, la production de biomasse et la fabrication de meubles en osier. Le saule de Babylone (Salix babylonica) est largement planté dans le monde entier et se trouve dans tout l’Iran dans le cadre du paysage rural principalement planté à des fins ornementales ou de bioremédiation. Les champignons de la rouille du genre Melampsora provoquent généralement des maladies sur les espèces de Salix. L’identification des espèces de Melampsora est souvent compliquée en raison du peu de différences dans la morphologie des spores et du peu de données de séquence comparative accessibles au public. Des saules en Iran ont été signalés comme étant infectés par 15 espèces de Melampsora, cependant, la plupart de ces signalements sont basés sur la caractérisation morphologique. Au cours des activités de surveillance menées en juin 2007, une espèce de rouille a été détectée sur des arbres isolés de saule de Babylone dans une zone située au nord de l’Iran. Le champignon de la rouille et la plante hôte ont été identifiés sur la base des caractéristiques morphologiques et du séquençage de l’ADN. Sur la base de la","PeriodicalId":9468,"journal":{"name":"Canadian Journal of Plant Pathology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-10-04","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135592759","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"农林科学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-10-02DOI: 10.1080/07060661.2023.2265900
Priyangi Edirisinghe, Lipu Wang, Lester Young, Helen Booker, Khalid Rashid, Hadley Kutcher
AbstractFusarium wilt (FW) caused by the facultative fungal saprophyte Fusarium oxysporum f. sp. lini (Fol) is a major disease affecting flax production. Cultivation of FW-resistant cultivars mitigate effects of the disease and are a requirement for variety registration. Understanding the genetic inheritance of FW resistance will facilitate the development of resistant varieties. In this study, the inheritance of wilt resistance against western Canadian isolates was studied in F8 recombinant inbred lines (RILs) of a cross between cultivars Aurore (moderately resistant) and Oliver (susceptible). Seventeen Fol isolates were collected from across western Canada and tested for differences in the severity of FW on both parental lines and two check lines under controlled environment conditions. Three of the 17 isolates that caused moderate disease severity were selected to screen the RIL population. The segregation of the RILs for FW resistance was determined under controlled conditions and in field wilt nurseries. A 3:1 ratio of susceptible to resistant RILs was observed with two F. oxysporum f. sp. lini isolates, indicating FW resistance was conditioned by two independent recessive genes. Cluster analysis of disease severity data identified two major clusters of phenotypes in the RIL population, in accordance with the 3S:1 R ratio. High heritability of FW resistance was observed at the late flowering stage, indicating a high level of genotypic variation contributing to phenotypic variation.La fusariose, causée par le saprophyte facultatif fongique Fusarium oxysporum f. sp. lini (Fol), est une importante maladie qui nuit à la production de lin. La culture de cultivars résistants à la fusariose atténue les effets de la maladie et est une exigence quant à l’homologation des variétés. La compréhension de l’héritage génétique de la résistance à la fusariose facilitera la mise au point de variétés résistantes. Dans cette étude, l’héritage de la résistance à la flétrissure à l’égard d’isolats de l’Ouest canadien a été examiné dans des lignées endogames recombinantes F8 (LER) issues d’un croisement entre les cultivars Aurore (modérément résistant [rés.]) et Oliver (réceptif [réc.]). Dix-sept isolats de Fol ont été collectés dans tout l’Ouest canadien et testés en fonction de leurs différences relatives à la gravité de la fusariose chez les deux lignées parentales et deux lignées de validation dans des conditions contrôlées. Trois des dix-sept isolats qui ont causé une maladie de gravité modérée ont été sélectionnés pour cribler la population de LER. La ségrégation de LER en vue de la résistance à la fusariose a été déterminée dans des conditions contrôlées et dans des pépinières à fusariose en plein champ. Un rapport de 3:1 de LER réceptives à résistantes a été observé avec deux isolats de Fusarium oxysporum f. sp. lini, indiquant que la résistance à la fusariose dépendait de deux gènes récessifs indépendants. L’analyse typologique des données relatives à la
摘要由兼性腐生真菌Fusarium oxysporum f. sp. lini (Fol)引起的枯萎病(Fusarium wilt, FW)是影响亚麻生产的主要病害。培育抗病品种可减轻该病的影响,是品种登记的必要条件。了解小麦赤霉病抗性的遗传规律,有利于品种的选育。本研究以Aurore(中度抗性)和Oliver(易感)品种杂交的F8重组自交系(RILs)为材料,研究了加拿大西部菌株对黄萎病抗性的遗传。从加拿大西部收集了17株Fol分离株,并在受控环境条件下测试了亲本系和两个对照系FW严重程度的差异。从17株引起中度疾病严重程度的分离株中选择3株筛选RIL群体。在控制条件下和大田青枯病苗圃中测定了抗病基因的分离度。两株尖孢镰刀菌对抗性抗性基因的敏感比为3:1,表明两株尖孢镰刀菌的抗性是由两个独立的隐性基因决定的。疾病严重程度数据的聚类分析确定了RIL人群中两个主要的表型聚类,符合3S: 1r比率。花后期抗病遗传力高,表明高水平的基因型变异导致表型变异。镰孢镰刀菌(Fusarium oxysporum f. sp. lini, Fol)是一种重要的病害,是农业生产中的一种重要病害。变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人的变种人。将所有的薪金和薪金混合起来,将所有的薪金和薪金混合起来,将所有的薪金和薪金混合起来。在这个练习曲,l 'heritage耐de la la fletrissure l 'egard d 'isolats de l财产的法裔加拿大人的疾病检查中des线endogames重组F8 d (l)问题一个croisement品种之间Aurore(耐moderement [>]) et奥利弗(receptif (rec))。Dix-sept isolats de folfolont samas, collecans ans and tout l ' west canadien, test samas en功能de leurs差异samas亲属,la gravit de la fusariose, les diux - lians, samas父母和diux - lians,验证dans and des条件contrôlées。三种分离体不会造成一种严重的疾病,例如:的的;的;的;La ssamgracimage de LER en vue de La ransisiance de La fusariose a samsisiance de samsisiance de de conditions contrôlées et dans de psampiinires de fusariose en plein champ。第3条第1款规定了对镰刀菌的双重隔离,即对镰刀菌的双重隔离,对镰刀菌的双重隔离,即对镰刀菌的双重隔离,即对镰刀菌的双重隔离。3 .分析与疾病有关的人的类型学、疾病的类型、疾病的许可、疾病的类型、疾病的类型、疾病的类型、疾病的类型、疾病的类型、疾病的类型、疾病的类型和疾病的类型。: 1 Res。L ' hsamitabilitise . 电子烟和其他电子烟;电子烟和其他电子烟;和其他电子烟;和其他电子烟;和其他电子烟。关键词:亚麻属(flaxgenus)物种名称(speciesnamesetaincoll1 f. sp. linus)抗性遗传重组自交系(RIL)群体关键词:镰刀菌(fusarium oxysporum f. sp. linhsamriage de la samicsistancelinum usitatissimum l . population de linacimes endogames recombinantes)免责声明为服务于作者和研究人员,我们提供此版本的已接受稿件(AM)。在最终出版版本记录(VoR)之前,将对该手稿进行编辑、排版和审查。在制作和印前,可能会发现可能影响内容的错误,所有适用于期刊的法律免责声明也与这些版本有关。AcknowledgementsDr。法国Terre De Lin的Jean Paul Trouve和Adrian Speck先生慷慨地提供了RIL人员。我们感谢萨斯喀彻温大学的谷物和亚麻病理学工作人员以及S. Froese女士、Ken Jackle先生、B. Boon女士和M. Holland女士提供的有能力的技术援助。披露声明作者未报告潜在的利益冲突。作者感谢萨斯喀彻温省农业部农业发展基金(ADF)提供的资金,项目名称:亚麻种质对枯萎病抗性的表征。项目# 20110205
{"title":"Inheritance of Fusarium wilt resistance in flax","authors":"Priyangi Edirisinghe, Lipu Wang, Lester Young, Helen Booker, Khalid Rashid, Hadley Kutcher","doi":"10.1080/07060661.2023.2265900","DOIUrl":"https://doi.org/10.1080/07060661.2023.2265900","url":null,"abstract":"AbstractFusarium wilt (FW) caused by the facultative fungal saprophyte Fusarium oxysporum f. sp. lini (Fol) is a major disease affecting flax production. Cultivation of FW-resistant cultivars mitigate effects of the disease and are a requirement for variety registration. Understanding the genetic inheritance of FW resistance will facilitate the development of resistant varieties. In this study, the inheritance of wilt resistance against western Canadian isolates was studied in F8 recombinant inbred lines (RILs) of a cross between cultivars Aurore (moderately resistant) and Oliver (susceptible). Seventeen Fol isolates were collected from across western Canada and tested for differences in the severity of FW on both parental lines and two check lines under controlled environment conditions. Three of the 17 isolates that caused moderate disease severity were selected to screen the RIL population. The segregation of the RILs for FW resistance was determined under controlled conditions and in field wilt nurseries. A 3:1 ratio of susceptible to resistant RILs was observed with two F. oxysporum f. sp. lini isolates, indicating FW resistance was conditioned by two independent recessive genes. Cluster analysis of disease severity data identified two major clusters of phenotypes in the RIL population, in accordance with the 3S:1 R ratio. High heritability of FW resistance was observed at the late flowering stage, indicating a high level of genotypic variation contributing to phenotypic variation.La fusariose, causée par le saprophyte facultatif fongique Fusarium oxysporum f. sp. lini (Fol), est une importante maladie qui nuit à la production de lin. La culture de cultivars résistants à la fusariose atténue les effets de la maladie et est une exigence quant à l’homologation des variétés. La compréhension de l’héritage génétique de la résistance à la fusariose facilitera la mise au point de variétés résistantes. Dans cette étude, l’héritage de la résistance à la flétrissure à l’égard d’isolats de l’Ouest canadien a été examiné dans des lignées endogames recombinantes F8 (LER) issues d’un croisement entre les cultivars Aurore (modérément résistant [rés.]) et Oliver (réceptif [réc.]). Dix-sept isolats de Fol ont été collectés dans tout l’Ouest canadien et testés en fonction de leurs différences relatives à la gravité de la fusariose chez les deux lignées parentales et deux lignées de validation dans des conditions contrôlées. Trois des dix-sept isolats qui ont causé une maladie de gravité modérée ont été sélectionnés pour cribler la population de LER. La ségrégation de LER en vue de la résistance à la fusariose a été déterminée dans des conditions contrôlées et dans des pépinières à fusariose en plein champ. Un rapport de 3:1 de LER réceptives à résistantes a été observé avec deux isolats de Fusarium oxysporum f. sp. lini, indiquant que la résistance à la fusariose dépendait de deux gènes récessifs indépendants. L’analyse typologique des données relatives à la","PeriodicalId":9468,"journal":{"name":"Canadian Journal of Plant Pathology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-10-02","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135895224","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"农林科学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-09-29DOI: 10.1080/07060661.2023.2262959
Christian David Vargas Baquero, Alba Marina Cotes
AbstractStromatinia cepivora, the causal agent of white rot, is responsible for 60-80% of economic losses in onion and garlic crops. This work aimed to select biological control agents (BCAs) to control white rot. Ten microorganisms were tested for hyperparasitic activity on S. cepivora sclerotia in garlic (Allium sativum). Bioassays consisted of pots filled with sterile soil and 50 sclerotia in a plastic Tulle bag. Four microorganisms were selected to compare their capability for degrade sclerotia on garlic. Our results showed that increasing degradation happened when Th034, Th035, Th003 and Bs006 were added to the pots containing garlic. Subsequently, three application techniques (seeds, seedlings at transplant, and seeds and transplant) were evaluated. Seven BCAs applied singly and in mixtures were evaluated in semi-field experiments for their ability to reduce white rot symptoms in onion plants in soil inoculated with 300 sclerotia per kilogram. The results indicated that efficacy was dependent on microrganism, mixture, and technique of application. The synergy factor showed that only two treatments have synergistic effects. In both cases, the mixture consisted of a strain of Bacillus and two species of Trichoderma (T. koningiopsis, T. atroviride) applied twice. In most cases, antagonistic interactions among BCAs were observed.Stromatinia cepivora, l’agent causal de la pourriture blanche, est responsable de 60 à 80 % des pertes financières relatives à la culture de l’oignon et de l’ail. Ces travaux visent à sélectionner des agents de lutte biologique (ALB) pour combattre la pourriture blanche. Dix microorganismes ont été testés pour leur activité hyperparasitique envers les sclérotes de S. cepivora chez l’ail (Allium sativum). Des biotests consistaient à placer dans des pots du sol stérile et 50 sclérotes contenus dans des sachets en tulle de plastique. Quatre microorganismes ont été sélectionnés afin de comparer leur capacité à dégrader les sclérotes sur l’ail. Nos résultats ont montré que davantage de dégradation se produisait lorsque Th034, Th035, Th003 et Bs006 étaient ajoutés aux pots contenant l’ail. Subséquemment, trois techniques d’application ont été évaluées (semences, plantules lors de la transplantation et semences et transplantation). Sept ALB appliqués seuls ou combinés ont été évalués au cours d’expériences menées dans des conditions semi-naturelles en vue de déterminer leur capacité à réduire les symptômes de la pourriture blanche chez l’oignon dans un sol inoculé avec 300 sclérotes par kilogramme. Les résultats ont indiqué que l’efficacité dépendait du microorganisme, de la combinaison et de la technique d’application. Le facteur de synergie a démontré que seuls deux traitements ont des effets synergiques. Dans les deux cas, la combinaison consistait en une souche de bacilles et deux espèces de Trichoderma (T. koningiopsis, T. atroviride) appliquées à deux reprises. Dans la plupart des cas, des interactions antagonistes entre
摘要洋葱和大蒜的经济损失中,有60-80%是白腐病的病原菌——头状旋流菌造成的。本研究旨在筛选生物防治剂(bca)防治大蒜白腐病。研究了10种微生物对大蒜白腐病菌核菌的超寄生活性。生物测定包括装满无菌土壤的花盆和一个塑料薄纱袋中的50个菌核。选择4种微生物,比较其对大蒜菌核的降解能力。结果表明,在大蒜罐中添加Th034、Th035、Th003和Bs006后,其降解作用增强。随后,对三种施用技术(种子、移栽苗、种子和移栽)进行了评价。在半田间试验中,评价了7种单独和混合施用bca在每公斤接种300菌核的土壤中减少洋葱白腐病的能力。结果表明,其效果与微生物、混合剂和施用技术有关。协同因子显示只有两种处理具有协同效应。在这两种情况下,混合物由一株芽孢杆菌和两种木霉(T. koningiopsis, T. atroviride)组成。在大多数情况下,观察到bca之间的拮抗相互作用。Stromatinia cepivora,是法国白色葡萄酒业的代理人,负责法国葡萄酒业和法国葡萄酒业的60%至80%的金融业务。生物变异因子(ALB)与生物变异因子(ALB)的对抗。三种微生物不能与洋葱(Allium sativum)进行比较,不能与洋葱(samum sativum)进行比较。德斯生物试验了一致的烟草、烟草、烟草、烟草、烟草、烟草、烟草、烟草、烟草、烟草、烟草、烟草、烟草和烟草。四分之一的微生物与<s:1> <s:1> <s:1> <s:1> <s:1>化学物质与<s:1>化学物质与<s:1>化学物质与<s:1>化学物质与<s:1>化学物质与<s:1>化学物质与<s:1>化学物质与<s:1>化学物质与与。号,结果一看,davantage de退化se produisait当Th034 Th035, Th003等Bs006 ajoutes是辅助锅contenant l 'ail。subssamuquement,三种技术的应用于samuquest, samuquest (semences, plantules de la transplantation, semences and transplantation)。9月1日- 9月1日- 9月1日- 9月1日- 9月1日- 9月1日- 9月1日- 9月1日- 9月1日- 9月1日- 9月1日- 3月1日- 3月1日- 3月1日- 3月1日- 3月1日- 3月1日- 3月1日- 3月1日- 3月1日- 3月1日- 3月1日- 3月1日- 3月1日从微生物学、组合学和技术应用学的角度来看,这是一种非常有效的方法。协同效应因素和其他因素影响协同效应。双生生,双生生的组合包括双生生和双生生的木霉(T. koningiopsis, T. atroviride)和双生生。随着时间的增加,这些相互作用的对抗将会发生,这些对抗将会发生。关键词:拮抗;芽孢杆菌;生物防治;乳酸菌;乳酸菌;在最终出版版本记录(VoR)之前,将对该手稿进行编辑、排版和审查。在制作和印前,可能会发现可能影响内容的错误,所有适用于期刊的法律免责声明也与这些版本有关。这项工作是在哥伦比亚农业研究公司- AGROSAVIA的财政支持下进行的。作者感谢微生物种质资源库提供的生物防治菌株。利益冲突作者声明,不存在可被解释为潜在利益冲突的经济或财务利益。数据和材料的可用性当前研究中使用和/或分析的数据集可根据通讯作者的合理要求提供。参考文献雅培WS 1925。计算杀虫剂效力的方法。中国生物医学工程学报,2016(2):444 - 444。doi: 10.1093 / jee / 18.2.265a。[Crossref], [Google Scholar]张建军,张建军,张建军,等。2018。杨建军,李建军。水硅酸钾与维管丛枝菌根真菌结合防治洋葱白腐病的研究[J] .植物酚类杂志。46(1):125-142。doi: 10.21608 / ejp.2018.87774。[Crossref], [Google Scholar],王晓明,王晓明。头孢菌核静息和萌发菌核的解剖和组织化学。[j] .中国生物医学工程学报,2016,31(4):561-567。doi: 10.1016 / s0007 - 1536(87) 80090 - 6。[Crossref], [Google Scholar]。 2014 3种生物防治剂及天然定殖真菌对鳞状葡萄孢、菌核菌和头孢菌菌核存活的影响分析[硕士论文]。圭尔夫(ON):圭尔夫大学。[Google Scholar]刘建军,刘建军,刘建军,等。麦麸上生长的曲霉霉细胞壁降解酶。[j] .中国生物医学工程学报,2011,31(4):1104 - 1104。[谷歌学术研究]李文杰。2020。头核菌核对大蒜鳞茎细胞活性影响的研究。科学P系列a。LXIII(1): 186 - 191。[谷歌学术]CABI(2021)。洋葱和大蒜的白腐病。出租车国际;[获取于2022年]英国沃林福德。https://www.cabi.org/isc/datasheet/49145 toDistributionMaps。[Google Scholar] Castillo N. 2000 Aislamiento identificación y selección de potenticiales hongos antagonistas al hongo Sclerotium cepivorum Berk causante de la pudrición blanca de la cerbolla de bulbo (AIIium cepa L.)[硕士论文]。突尼斯(Col):哥伦比亚大学Pedagógica和Tecnológica。西班牙语[谷歌学术]钱玉成,黄春华2020。叶面喷施及施解淀粉芽孢杆菌和曲霉木霉生长培养基防治番茄细菌性斑疹病的研究。null。156(4): 995 - 1003。doi: 10.1007 / s10658 - 020 - 01947 - 5。[Crossref]、[Google Scholar]、[c]、[c]。水疱丛枝菌根(VAM)连续有效土壤日晒对洋葱白腐病(Sclerotium cepivorum Berk.)和产量的长期影响。作物学报,11(1):109-117。[Google Scholar] Clarkson JP, Mead A, Payne T, whpps JM 2004。环境因子及头孢菌核菌分离物对木霉菌核降解及白腐病生物防治的影响。null。53(3): 353 - 362。doi: 10.1111 / j.0032-0862.2004.01013.x。[Crossref], [Google Scholar] Clarkson JP, Payne T, Mead A, Whipps JM 2002。英国土壤菌核降解防治白腐病菌核菌生物防治剂的选择。null。51(6): 735 - 745。doi: 10.1046
{"title":"Microbial consortia as an option for biocontrol of <i>Stromatinia cepivora</i>","authors":"Christian David Vargas Baquero, Alba Marina Cotes","doi":"10.1080/07060661.2023.2262959","DOIUrl":"https://doi.org/10.1080/07060661.2023.2262959","url":null,"abstract":"AbstractStromatinia cepivora, the causal agent of white rot, is responsible for 60-80% of economic losses in onion and garlic crops. This work aimed to select biological control agents (BCAs) to control white rot. Ten microorganisms were tested for hyperparasitic activity on S. cepivora sclerotia in garlic (Allium sativum). Bioassays consisted of pots filled with sterile soil and 50 sclerotia in a plastic Tulle bag. Four microorganisms were selected to compare their capability for degrade sclerotia on garlic. Our results showed that increasing degradation happened when Th034, Th035, Th003 and Bs006 were added to the pots containing garlic. Subsequently, three application techniques (seeds, seedlings at transplant, and seeds and transplant) were evaluated. Seven BCAs applied singly and in mixtures were evaluated in semi-field experiments for their ability to reduce white rot symptoms in onion plants in soil inoculated with 300 sclerotia per kilogram. The results indicated that efficacy was dependent on microrganism, mixture, and technique of application. The synergy factor showed that only two treatments have synergistic effects. In both cases, the mixture consisted of a strain of Bacillus and two species of Trichoderma (T. koningiopsis, T. atroviride) applied twice. In most cases, antagonistic interactions among BCAs were observed.Stromatinia cepivora, l’agent causal de la pourriture blanche, est responsable de 60 à 80 % des pertes financières relatives à la culture de l’oignon et de l’ail. Ces travaux visent à sélectionner des agents de lutte biologique (ALB) pour combattre la pourriture blanche. Dix microorganismes ont été testés pour leur activité hyperparasitique envers les sclérotes de S. cepivora chez l’ail (Allium sativum). Des biotests consistaient à placer dans des pots du sol stérile et 50 sclérotes contenus dans des sachets en tulle de plastique. Quatre microorganismes ont été sélectionnés afin de comparer leur capacité à dégrader les sclérotes sur l’ail. Nos résultats ont montré que davantage de dégradation se produisait lorsque Th034, Th035, Th003 et Bs006 étaient ajoutés aux pots contenant l’ail. Subséquemment, trois techniques d’application ont été évaluées (semences, plantules lors de la transplantation et semences et transplantation). Sept ALB appliqués seuls ou combinés ont été évalués au cours d’expériences menées dans des conditions semi-naturelles en vue de déterminer leur capacité à réduire les symptômes de la pourriture blanche chez l’oignon dans un sol inoculé avec 300 sclérotes par kilogramme. Les résultats ont indiqué que l’efficacité dépendait du microorganisme, de la combinaison et de la technique d’application. Le facteur de synergie a démontré que seuls deux traitements ont des effets synergiques. Dans les deux cas, la combinaison consistait en une souche de bacilles et deux espèces de Trichoderma (T. koningiopsis, T. atroviride) appliquées à deux reprises. Dans la plupart des cas, des interactions antagonistes entre","PeriodicalId":9468,"journal":{"name":"Canadian Journal of Plant Pathology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-09-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135200109","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"农林科学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-09-27DOI: 10.1080/07060661.2023.2261890
Marie-Krystel Gauthier, Émilie Bourgault, Amélie Potvin, Guillaume J. Bilodeau, Sven Gustavsson, Sharon Reed, Pierre Therrien, Évelyne Barrette, Philippe Tanguay
Biosurveillance of invasive species is critical for protecting native ecosystems and limiting economic losses. Early detection of pathogens through qPCR methods has recently shown great promise and can potentially slow the spread of devastating diseases. For instance, oak wilt, a disease caused by the fungus Bretziella fagacearum, can kill mature trees within weeks of infection. Originally contained in the United States, oak wilt has finally made its way into Canada, where it was recently observed for the first time in June 2023. This study has laid the foundations for a biosurveillance monitoring program of B. fagacearum in Eastern Canada. From 2019 to 2021, insect vectors were baited and captured in Lindgren traps in various locations of interest, namely sawmills importing oak logs from the United States (US), forested areas containing mature oak trees and strategic sites along the border between the two countries. Insect vectors and collection fluids were analysed with our qPCR detection test for the presence of B. fagacearum. As a positive control to validate this method, we included traps in a known centre of oak wilt infection in Michigan (US). Our analysis showed only one positive site at the border between Ontario (CA) and the US, even though oak wilt has never been observed there. This result confirms that DNA from B. fagacearum can be detected with this method even before the appearance of symptomatic trees, which could be crucial in the current containment efforts in Ontario (CA).
{"title":"Biosurveillance of oak wilt disease in Canadian areas at risk","authors":"Marie-Krystel Gauthier, Émilie Bourgault, Amélie Potvin, Guillaume J. Bilodeau, Sven Gustavsson, Sharon Reed, Pierre Therrien, Évelyne Barrette, Philippe Tanguay","doi":"10.1080/07060661.2023.2261890","DOIUrl":"https://doi.org/10.1080/07060661.2023.2261890","url":null,"abstract":"Biosurveillance of invasive species is critical for protecting native ecosystems and limiting economic losses. Early detection of pathogens through qPCR methods has recently shown great promise and can potentially slow the spread of devastating diseases. For instance, oak wilt, a disease caused by the fungus Bretziella fagacearum, can kill mature trees within weeks of infection. Originally contained in the United States, oak wilt has finally made its way into Canada, where it was recently observed for the first time in June 2023. This study has laid the foundations for a biosurveillance monitoring program of B. fagacearum in Eastern Canada. From 2019 to 2021, insect vectors were baited and captured in Lindgren traps in various locations of interest, namely sawmills importing oak logs from the United States (US), forested areas containing mature oak trees and strategic sites along the border between the two countries. Insect vectors and collection fluids were analysed with our qPCR detection test for the presence of B. fagacearum. As a positive control to validate this method, we included traps in a known centre of oak wilt infection in Michigan (US). Our analysis showed only one positive site at the border between Ontario (CA) and the US, even though oak wilt has never been observed there. This result confirms that DNA from B. fagacearum can be detected with this method even before the appearance of symptomatic trees, which could be crucial in the current containment efforts in Ontario (CA).","PeriodicalId":9468,"journal":{"name":"Canadian Journal of Plant Pathology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-09-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"135539146","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"农林科学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2023-09-04DOI: 10.1080/07060661.2023.2253774
Qinen He, L. Bai, Fang Cai
Abstract In August 2017, severe powdery mildew was observed on Potentilla indica in Minhe, Qinghai province, China. The identification of fungal species was performed by morphological study using an optical microscope and scanning electron microscope (SEM), supplemented by sequence analysis of the internal transcribed spacer (ITS) region of rDNA. Based on a combination of morphology, ITS sequence, and host, the powdery mildew on Potentilla indica was identified as Erysiphe thuemenii, a species belonging to the E. aquilegiae complex. This is the first report of E. thuemenii causing powdery mildew on a new host species, P. indica, in China and also worldwide.
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Pub Date : 2023-06-26DOI: 10.1080/07060661.2023.2224776
J. Holmes, H. Sanghera, Z. Punja
Abstract Crown gall, caused by Agrobacterium tumefaciens (syn. Rhizobium radiobacter), is characterized by gall formation on crowns, stems or roots on many plant species. We describe the occurrence of this disease for the first time on cannabis (Cannabis sativa L. marijuana) plants in two licenced production facilities in British Columbia. Galls were observed on crowns, stems and roots of several genotypes, including ‘White Rhino’, ‘Pink Kush’ and ‘Sour Kush’. The affected plants displayed no other visible symptoms. The incidence of crown gall was extremely low, estimated at 0.01% of total plants. Isolations made from root and stem galls on MacConkey medium (selective for Gram -ve bacteria) and on D1 medium (selective for Agrobacterium spp.) yielded a range of bacterial species, which did not include Agrobacterium sp. However, the presence of Agrobacterium in gall tissues was confirmed following PCR amplification with primers for the indole-acetic acid (iaa) H gene on the T-DNA region of Agrobacterium spp. and showed > 99% similarity to A. tumefaciens. Artificial inoculations were conducted using an A. tumefaciens strain from ATCC (Rhizobium radiobacter, strain designation TT134 [6-1-2, CIP 104 336], cat. 15955) which resulted in gall formation on five cannabis genotypes tested. These galls contained the iaaH gene as determined by PCR and the pathogen was successfully re-isolated on MacConkey agar medium at 4 and 10 weeks post-inoculation. Our findings confirm the occurrence of A. tumefaciens on naturally infected and artificially infected cannabis plants grown under greenhouse conditions and demonstrate reproducible gall symptoms on several cannabis genotypes following A. tumefaciens inoculation.
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