Revue Fran?aise des Laboratoires最新文献

Le Réseau international des Instituts Pasteur (RIIP) compte à ce jour 29 instituts dont 17 sont installés en zone tropicale. Les laboratoires d'analyses de biologie médicale (LABM) des instituts du RIIP ont à la fois un rôle de diagnostic, d'expertise, de recherche et de formation. Le plus souvent situés dans des pays en développement, ils ont accumulé l'expérience de plusieurs générations de biologistes pour essayer de répondre au mieux à une forte demande des populations et des autorités sanitaires malgré des ressources parfois limitées. À partir d'exemples concrets et d'expériences vécues, les auteurs dépeignent les principales difficultés rencontrées dans leur exercice de la biologie médicale en zone tropicale et proposent des moyens pour les surmonter.

The Réseau international des Instituts Pasteur (RIIP) includes 29 institutes of which 17 are located in tropical area. The clinical analysis laboratoires from the RIIP play a significant role in different fields: diagnosis, expertise, research and training. Eventhough the laboratories are usually located in a tropical environment in which financial resources, as well as the amount of equipment are both restricted, they have been able to gain experience through several generations of biologists in order to answer the needs of populations and health authorities. Based on practicle examples and reports of field situations, the authors show the major difficulties encountered in reference laboratories in such tropical area and suggest solving solutions.

Les épidémies récurrentes de méningite bactérienne aiguë (MBA) demeurent un problème majeur en Afrique subsaharienne. Les conditions d'utilisation des méthodes bactériologiques conventionnelles dans ces pays limitent leur intérêt pour le diagnostic des MBA. L'émergence récente de Neisseria meningitidis (Nm) W135 et également le nombre important de cas dus à Streptococcus pneumoniae (Sp) ont rendu nécessaire une surveillance microbiologique renforcée, en particulier par l'utilisation de la technique de réaction de polymérisation en chaîne (PCR). Nous décrivons ici le processus de son transfert au Centre Muraz à Bobo-Dioulasso, Burkina Faso.

Nous avons évalué la spécificité des amorces pour l'identification des isolats de Nm et pour la détermination de leur sérogroupe, ainsi que la performance de la PCR par rapport à la culture pour l'identification de Nm, Sp et Haemophilus influenzae (Hi). Un échantillon d'extraits d'ADN a été contrôlé à l'Institut Pasteur de Paris (IPP) pour calculer le coefficient de concordance Kappa. Le laboratoire du Centre Muraz a participé à une étude multicentrique avec plusieurs laboratoires de référence européens.

Entre avril 2002 et juin 2004, un total de 1 645 échantillons de LCR ont été testés par PCR (dont 1 455 au Centre Muraz, 190 à l'IPP) et 801 par culture ; 560 (34 %) bactéries ont été identifiées par PCR — dont 281 (50 %) Nm, 193 (34 %) Sp, 86 (15 %) Hi — contre 288 (36 %) par culture. Parmi les 560 cas confirmés par PCR, 383 cas ont bénéficié d'une culture dont seulement 263 (69 %) étaient positives. — dont 161 (56 %) Nm, 99 (34 %) Sp et 28 (10 %) Hi. Parmi les 560 cas confirmés par PCR, 383 cas ont également bénéficié d'une culture du LCR, dont seulement 263 (69 %) étaient positives. Parmi les 288 cas confirmés par culture, 283 cas ont également bénéficié d'une PCR, dont 263 (93 %) positives. La sensibilité de la PCR était respectivement de 95, 75 et 81 % pour Nm, Sp et Hi, avec une spécificité d'au moins 95 % pour les trois espèces. La spécificité des amorces crgA, siaD et mynB pour l'identification de Nm et la détermination du génogroupe correspondant était de 100 %. Le coefficient Kappa était de 0,80.

Dans les conditions actuelles en Afrique subsaharienne, nous observons que la PCR est performante et permet d'identifier davantage d'agents étiologiques des MBA par rapport à la culture. Nous recommandons son utilisation dans les laboratoires de référence régionaux pour la surveillance microbiologique renforcée en complément des analyses bactériologiques classiques. L'utilisation de cette technique contribuera à l'organisation de ripostes vaccinales ciblées et facilitera l'introduction de nouveaux vaccins dans la ceinture méningitique.

The recognition of Neisseria meningitidis (Nm) W135 and Streptococcus pneumoniae (Sp) as major causes of acute bacterial meningitis (ABM) emphasizes the need for field-base