Pub Date : 2021-12-15DOI: 10.15446/abc.v27n2.89521
Fernando Alveiro Alzate Guarín, Dora Emilse Cano Gallego, Rosa del C. Ortiz Gentry
La necesidad actual de conservar la diversidad en los ecosistemas de páramo frente a las múltiples amenazas que los afectan requiere un rápido reconocimiento de las especies más vulnerables. En este estudio se aplican dos metodologías para la evaluación rápida del estado de riesgo de especies de Angiospermas distribuidas en los seis complejos de páramo de Antioquia, denominados el método de NY y el método de US. Ambos métodos usan datos asociados a colecciones de herbario para estimar de forma preliminar el estado de riesgo de las especies. Con la primera metodología basada en el cálculo de la extensión de presencia (EOO), se encontraron 110 especies potencialmente en riesgo, distribuidas en 29 familias y 57 géneros. Con la segunda metodología basada en datos de año/fecha de colección, geográficos y de número de colecciones, se encontraron 192 especies “en riesgo” correspondientes a 42 familias y 100 géneros. Los resultados obtenidos pueden ser de utilidad en la identificación de áreas prioritarias y la orientación de esfuerzos de conservación hacia las áreas y las especies más vulnerables.
{"title":"ESTADO DE CONSERVACIÓN DE LAS ESPECIES DE PLANTAS ANGIOSPERMAS DE LOS PÁRAMOS DE ANTIOQUIA","authors":"Fernando Alveiro Alzate Guarín, Dora Emilse Cano Gallego, Rosa del C. Ortiz Gentry","doi":"10.15446/abc.v27n2.89521","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/abc.v27n2.89521","url":null,"abstract":"La necesidad actual de conservar la diversidad en los ecosistemas de páramo frente a las múltiples amenazas que los afectan requiere un rápido reconocimiento de las especies más vulnerables. En este estudio se aplican dos metodologías para la evaluación rápida del estado de riesgo de especies de Angiospermas distribuidas en los seis complejos de páramo de Antioquia, denominados el método de NY y el método de US. Ambos métodos usan datos asociados a colecciones de herbario para estimar de forma preliminar el estado de riesgo de las especies. Con la primera metodología basada en el cálculo de la extensión de presencia (EOO), se encontraron 110 especies potencialmente en riesgo, distribuidas en 29 familias y 57 géneros. Con la segunda metodología basada en datos de año/fecha de colección, geográficos y de número de colecciones, se encontraron 192 especies “en riesgo” correspondientes a 42 familias y 100 géneros. Los resultados obtenidos pueden ser de utilidad en la identificación de áreas prioritarias y la orientación de esfuerzos de conservación hacia las áreas y las especies más vulnerables.","PeriodicalId":56052,"journal":{"name":"Acta Biologica Colombiana","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.6,"publicationDate":"2021-12-15","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"45091760","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2021-12-15DOI: 10.15446/abc.v27n2.87739
V. Lewandowski, C. Sary, Jaísa Casetta, Felipe Pinheiro De Souza, P. L. de Castro, E. S. R. Goes, Carlos Antonio Lopes De Oliveira, R. Ribeiro, L. Vargas
Specimens of cultured zebrafish acquired from different fish farms in Brazil may show genetic variability and alteration in allele frequency due to genetic drift and selective pressure in a captive environment, resulting in the differentiation of productive and reproductive characteristics. The aim of this study was to evaluate the genetic variability and reproductive characteristics of 180 zebrafish specimens from six Brazilian fish farms. A deviation from the Hardy-Weinberg equilibrium was observed in all evaluated stocks. Differentiation among stocks was observed in the amount of genetic variability with respect to observed heterozygosity and the inbreeding coefficient (FIS). Genetic distance between stocks was determined through the Fst index, and the formation of four distinct groups was observed by plotting the dendrogram based on Nei’s genetic distance. Differences were observed among reproductive parameters, such as the average number of eggs per female and hatchability. This second parameter proved to be related to the level of inbreeding of the population, whereas this effect was not observed for spawning frequency. We conclude that zebrafish stocks from the 6 different Brazilian fish farms present significant genetic and phenotypic variability. The genetic structure affects fecundity and should be considered when carrying out work where reproductive rates are evaluated.
{"title":"GENETIC VARIABILITY AND REPRODUCTIVE CHARACTERISTICS OF ZEBRAFISH (Cyprinidae Danio rerio) STOCKS","authors":"V. Lewandowski, C. Sary, Jaísa Casetta, Felipe Pinheiro De Souza, P. L. de Castro, E. S. R. Goes, Carlos Antonio Lopes De Oliveira, R. Ribeiro, L. Vargas","doi":"10.15446/abc.v27n2.87739","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/abc.v27n2.87739","url":null,"abstract":"Specimens of cultured zebrafish acquired from different fish farms in Brazil may show genetic variability and alteration in allele frequency due to genetic drift and selective pressure in a captive environment, resulting in the differentiation of productive and reproductive characteristics. The aim of this study was to evaluate the genetic variability and reproductive characteristics of 180 zebrafish specimens from six Brazilian fish farms. A deviation from the Hardy-Weinberg equilibrium was observed in all evaluated stocks. Differentiation among stocks was observed in the amount of genetic variability with respect to observed heterozygosity and the inbreeding coefficient (FIS). Genetic distance between stocks was determined through the Fst index, and the formation of four distinct groups was observed by plotting the dendrogram based on Nei’s genetic distance. Differences were observed among reproductive parameters, such as the average number of eggs per female and hatchability. This second parameter proved to be related to the level of inbreeding of the population, whereas this effect was not observed for spawning frequency. We conclude that zebrafish stocks from the 6 different Brazilian fish farms present significant genetic and phenotypic variability. The genetic structure affects fecundity and should be considered when carrying out work where reproductive rates are evaluated.","PeriodicalId":56052,"journal":{"name":"Acta Biologica Colombiana","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.6,"publicationDate":"2021-12-15","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"44567841","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2021-12-15DOI: 10.15446/abc.v27n2.91314
Juan David Linero Barrios, Yeisson David Cera Vallejo, Roberto García Alzate, Leidi Herrera Cabrera, Marlon Mauricio Ardila Chávez
Uno de los focos de leishmaniasis más importante de Colombia está en Los Montes de María, Departamento de Bolívar, específicamente en El Carmen de Bolívar. A la fecha están registradas 19 especies del género Lutzomyia, en este departamento, algunas con antecedentes como vectores de Leishmania spp. La presente nota informa la abundancia y la diversidad de la flebotominofauna en la zona rural de El Carmen de Bolívar. Mediante el uso de trampas de CDC, se colectaron 1327 hembras del género Lutzomyia entre enero a noviembre de 2018: Lu. evansi (81 %), Lu. panamensis (15,5 %), Lu. gomezi (2,9 %), Lu. dubitans (0,15 %), Lu. aclydifera (0,07 %), Lu. c. cayennensis (0,07 %), Lu. rangeliana (0,07 %) y Lu. serrana (0,07 %). La mayor abundancia de flebotomíneos se presentó en noviembre y la menor en abril, coincidiendo con los meses de lluvia y sequía, respectivamente; mientras que en enero se presentó la mayor diversidad. En esta investigación sobresalen Lu. evansi, Lu. panamensis y Lu. gomezi por sus antecedentes como vectores de Leishmania en el Departamento de Bolívar y otras regiones del país. Se reporta por primera vez para el Caribe Colombiano la especie Lu. aclydifera, la cual deberá ser vigilada en cuanto a su capacidad vectorial para Leishmania.
{"title":"FLEBOTOMINOFAUNA Y PRIMER REGISTRO DE Lutzomyia aclydifera (DIPTERA: PSYCHODIDAE) EN EL CARIBE COLOMBIANO","authors":"Juan David Linero Barrios, Yeisson David Cera Vallejo, Roberto García Alzate, Leidi Herrera Cabrera, Marlon Mauricio Ardila Chávez","doi":"10.15446/abc.v27n2.91314","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/abc.v27n2.91314","url":null,"abstract":"Uno de los focos de leishmaniasis más importante de Colombia está en Los Montes de María, Departamento de Bolívar, específicamente en El Carmen de Bolívar. A la fecha están registradas 19 especies del género Lutzomyia, en este departamento, algunas con antecedentes como vectores de Leishmania spp. La presente nota informa la abundancia y la diversidad de la flebotominofauna en la zona rural de El Carmen de Bolívar. Mediante el uso de trampas de CDC, se colectaron 1327 hembras del género Lutzomyia entre enero a noviembre de 2018: Lu. evansi (81 %), Lu. panamensis (15,5 %), Lu. gomezi (2,9 %), Lu. dubitans (0,15 %), Lu. aclydifera (0,07 %), Lu. c. cayennensis (0,07 %), Lu. rangeliana (0,07 %) y Lu. serrana (0,07 %). La mayor abundancia de flebotomíneos se presentó en noviembre y la menor en abril, coincidiendo con los meses de lluvia y sequía, respectivamente; mientras que en enero se presentó la mayor diversidad. En esta investigación sobresalen Lu. evansi, Lu. panamensis y Lu. gomezi por sus antecedentes como vectores de Leishmania en el Departamento de Bolívar y otras regiones del país. Se reporta por primera vez para el Caribe Colombiano la especie Lu. aclydifera, la cual deberá ser vigilada en cuanto a su capacidad vectorial para Leishmania.","PeriodicalId":56052,"journal":{"name":"Acta Biologica Colombiana","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.6,"publicationDate":"2021-12-15","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"45643895","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
La broca del café, Hypothenemus hampei, es un insecto plaga que causa daños significativos al grano de café y grandes pérdidas económicas a los productores en todo el mundo. Al igual que otros insectos, la broca de café requiere de quitina sintasas (CHS) para la biosíntesis de la quitina, componente principal del exoesqueleto del insecto, y de vital importancia para su crecimiento y desarrollo. En este estudio, el gen CHS1 de la broca del café (HhCHS1) fue identificado, caracterizado y posteriormente silenciado mediante el uso de ARNi, mecanismo que permite degradar el ARNm e interrumpir la expresión de proteínas de interés en un organismo. Los perfiles de expresión del gen HhCHS1, medidos por RT-qPCR, mostraron niveles de expresión diferencial en las diferentes etapas del desarrollo del insecto. Los niveles más altos de expresión se encontraron en larvas de segundo estadio (L2) y machos adultos. El ARNcd administrado por vía oral, a concentraciones de 2 µg/100 µL, generó un silenciamiento efectivo del gen HhCHS1 (84 %) después de 7 días de tratamiento. Estos resultados sugieren que el gen HhCHS1 desempeña un papel importante en el desarrollo del insecto, y que, por ende, podría usarse como objetivo para desarrollar nuevas estrategias de manejo de este insecto plaga, mediante el uso de ARNi. Palabras Clave: ARNcd, café, insecto plaga, quitina-sintasa, RT-qPCR.
{"title":"CARACTERIZACIÓN Y DISMINUCIÓN EN LA EXPRESIÓN DE UNA QUITINA SINTASA MEDIADA POR ARNi EN Hypothenemus hampei (CURCULIONIDAE)","authors":"Gustavo Adolfo Ossa Ossa, Bernardo Villegas Estrada, Arnubio Valencia Jiménez","doi":"10.15446/abc.v27n2.89981","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/abc.v27n2.89981","url":null,"abstract":"La broca del café, Hypothenemus hampei, es un insecto plaga que causa daños significativos al grano de café y grandes pérdidas económicas a los productores en todo el mundo. Al igual que otros insectos, la broca de café requiere de quitina sintasas (CHS) para la biosíntesis de la quitina, componente principal del exoesqueleto del insecto, y de vital importancia para su crecimiento y desarrollo. En este estudio, el gen CHS1 de la broca del café (HhCHS1) fue identificado, caracterizado y posteriormente silenciado mediante el uso de ARNi, mecanismo que permite degradar el ARNm e interrumpir la expresión de proteínas de interés en un organismo. Los perfiles de expresión del gen HhCHS1, medidos por RT-qPCR, mostraron niveles de expresión diferencial en las diferentes etapas del desarrollo del insecto. Los niveles más altos de expresión se encontraron en larvas de segundo estadio (L2) y machos adultos. El ARNcd administrado por vía oral, a concentraciones de 2 µg/100 µL, generó un silenciamiento efectivo del gen HhCHS1 (84 %) después de 7 días de tratamiento. Estos resultados sugieren que el gen HhCHS1 desempeña un papel importante en el desarrollo del insecto, y que, por ende, podría usarse como objetivo para desarrollar nuevas estrategias de manejo de este insecto plaga, mediante el uso de ARNi.\u0000 Palabras Clave: ARNcd, café, insecto plaga, quitina-sintasa, RT-qPCR.","PeriodicalId":56052,"journal":{"name":"Acta Biologica Colombiana","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.6,"publicationDate":"2021-12-15","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"48581796","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2021-12-15DOI: 10.15446/abc.v27n2.88832
G. De-la-Torre, Rose Laura, L. Mendoza-Castilla
Seafood contamination with microplastics is one major route for human intake. Shellfish are among the most important since most shellfish species are eaten fresh and entirely. The aim of the present study was to report the abundance and characteristics of microplastics in commercial bivalve Aulacomya atra sold in fisheries from three Peruvian provinces. Market surveys were carried out and standard microplastic extraction, observation, and analysis methods were conducted. The mean microplastic abundance in the three provinces was 0.56 ± 0.08 MP g-1. Lima, the most populated province in Peru, presented the highest concentration (1.04 ± 0.17 MP g-1). The majority of the microplastics were fiber/lines (58.8 %) and blue (40.5 %). The polymer identity of most fiber/lines was polyester, suggesting microfibers that shed from clothes during laundry may be one major source of contamination. Other identified polymers were polyethylene (PE), polypropylene (PP), and polystyrene (PS). The annual dietary microplastic intake by the Peruvian population was estimated to be ~48.18 MP person-1 year-1 via A. atra consumption only, although values could vary depending on the region. The need for a better supply chain, handling conditions, and further research are discussed.
{"title":"ABUNDANCE AND CHARACTERISTICS OF MICROPLASTICS IN MARKET BIVALVE Aulacomya Atra (MYTILIDAE: BIVALVIA)","authors":"G. De-la-Torre, Rose Laura, L. Mendoza-Castilla","doi":"10.15446/abc.v27n2.88832","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/abc.v27n2.88832","url":null,"abstract":"\u0000Seafood contamination with microplastics is one major route for human intake. Shellfish are among the most important since most shellfish species are eaten fresh and entirely. The aim of the present study was to report the abundance and characteristics of microplastics in commercial bivalve Aulacomya atra sold in fisheries from three Peruvian provinces. Market surveys were carried out and standard microplastic extraction, observation, and analysis methods were conducted. The mean microplastic abundance in the three provinces was 0.56 ± 0.08 MP g-1. Lima, the most populated province in Peru, presented the highest concentration (1.04 ± 0.17 MP g-1). The majority of the microplastics were fiber/lines (58.8 %) and blue (40.5 %). The polymer identity of most fiber/lines was polyester, suggesting microfibers that shed from clothes during laundry may be one major source of contamination. Other identified polymers were polyethylene (PE), polypropylene (PP), and polystyrene (PS). The annual dietary microplastic intake by the Peruvian population was estimated to be ~48.18 MP person-1 year-1 via A. atra consumption only, although values could vary depending on the region. The need for a better supply chain, handling conditions, and further research are discussed.\u0000","PeriodicalId":56052,"journal":{"name":"Acta Biologica Colombiana","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.6,"publicationDate":"2021-12-15","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"46738508","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2021-09-27DOI: 10.15446/abc.v27n1.88615
María-Guadalupe González Solórzano, Monserrat Araceli Gómez Torres, Marco Antonio López Luna, A. H. Escobedo Galván
La dispersión de semillas por reptiles (saurocoría) ha recibido atención recientemente y se ha reportado el consumo de frutos y semillas en cocodrilianos, actuando como potenciales dispersores de semillas. Evaluamos si la saurocoría en Crocodylus actus y C. moreletii afecta la viabilidad de tres especies de plantas Delonix regia, Inga sp. y Citrullus lanatus. Se Utilizaron tres individuos juveniles de cada especie de cocodrilo y se alimentaron con 22 semillas por especie de planta, para un total de 66 semillas por recinto (132 para ambos). Las semillas se mezclaron con la dieta habitual cada semana, las semillas no consumidas y las excretadas se recolectaron y sembraron en suelo tratado con composta para evaluar la tasa de germinación relativa. Un total de 99 semillas fueron consumidas pero solo se recuperaron de las heces 14 semillas de C. lanatus, y germinando solo una de ellas (7, 14 %) con respecto al 50 % en el grupo control. Los resultados indican que la saurocoría de C. acutus y C. moreletii tiene un efecto negativo sobre la viabilidad de las semillas de las especies vegetales estudiadas, concordando con otros estudios realizados en diferentes especies.
{"title":"Saurocoría en cocodrilos no favorece la dispersión y viabilidad de semillas","authors":"María-Guadalupe González Solórzano, Monserrat Araceli Gómez Torres, Marco Antonio López Luna, A. H. Escobedo Galván","doi":"10.15446/abc.v27n1.88615","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/abc.v27n1.88615","url":null,"abstract":"La dispersión de semillas por reptiles (saurocoría) ha recibido atención recientemente y se ha reportado el consumo de frutos y semillas en cocodrilianos, actuando como potenciales dispersores de semillas. Evaluamos si la saurocoría en Crocodylus actus y C. moreletii afecta la viabilidad de tres especies de plantas Delonix regia, Inga sp. y Citrullus lanatus. Se Utilizaron tres individuos juveniles de cada especie de cocodrilo y se alimentaron con 22 semillas por especie de planta, para un total de 66 semillas por recinto (132 para ambos). Las semillas se mezclaron con la dieta habitual cada semana, las semillas no consumidas y las excretadas se recolectaron y sembraron en suelo tratado con composta para evaluar la tasa de germinación relativa. Un total de 99 semillas fueron consumidas pero solo se recuperaron de las heces 14 semillas de C. lanatus, y germinando solo una de ellas (7, 14 %) con respecto al 50 % en el grupo control. Los resultados indican que la saurocoría de C. acutus y C. moreletii tiene un efecto negativo sobre la viabilidad de las semillas de las especies vegetales estudiadas, concordando con otros estudios realizados en diferentes especies.","PeriodicalId":56052,"journal":{"name":"Acta Biologica Colombiana","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.6,"publicationDate":"2021-09-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"42557632","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2021-09-27DOI: 10.15446/abc.v27n1.89162
Angie Nurien Duarte Moreno, Daniela Villamizar Escalante, Fernando Rondón González
La infección causada por haemosporidios en colibríes no ha sido estudiada en zonas agroforestales o urbanas de la vertiente occidental de la Cordillera Oriental de los Andes en el departamento de Santander, pese a existir evidencia de esta en otros grupos de aves. Con el fin de detectar e identificar los parásitos causales de infecciones por haemosporidios, se tomaron muestras de sangre de la vena yugular de colibríes en seis localidades. La presencia de infección se llevó a cabo por PCR y la identificación de los parásitos se hizo a partir de secuencias del gen mitocondrial Citocromo b (Cyt b). Se obtuvieron 86 muestras de sangre de 20 especies de colibríes. La prevalencia de infección en general fue del 43 % y en el 18 % de las muestras infectadas del colibrí Amazilia colirufa (Amazilia tzacatl) se identificaron secuencias de Haemoproteus archilochus correspondientes al linaje HUMHA4. Se reporta por primera vez para Colombia la presencia de H. archilochus en A. tzacatl, por medio de técnicas de biología molecular. Este parásito podría estar implicado en la haemoproteosis de colibríes en el país.
{"title":"Detección por PCR de Haemoproteus archilochus en Amazilia tzacatl (Trochilidae) en Colombia","authors":"Angie Nurien Duarte Moreno, Daniela Villamizar Escalante, Fernando Rondón González","doi":"10.15446/abc.v27n1.89162","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/abc.v27n1.89162","url":null,"abstract":"La infección causada por haemosporidios en colibríes no ha sido estudiada en zonas agroforestales o urbanas de la vertiente occidental de la Cordillera Oriental de los Andes en el departamento de Santander, pese a existir evidencia de esta en otros grupos de aves. Con el fin de detectar e identificar los parásitos causales de infecciones por haemosporidios, se tomaron muestras de sangre de la vena yugular de colibríes en seis localidades. La presencia de infección se llevó a cabo por PCR y la identificación de los parásitos se hizo a partir de secuencias del gen mitocondrial Citocromo b (Cyt b). Se obtuvieron 86 muestras de sangre de 20 especies de colibríes. La prevalencia de infección en general fue del 43 % y en el 18 % de las muestras infectadas del colibrí Amazilia colirufa (Amazilia tzacatl) se identificaron secuencias de Haemoproteus archilochus correspondientes al linaje HUMHA4. Se reporta por primera vez para Colombia la presencia de H. archilochus en A. tzacatl, por medio de técnicas de biología molecular. Este parásito podría estar implicado en la haemoproteosis de colibríes en el país.","PeriodicalId":56052,"journal":{"name":"Acta Biologica Colombiana","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.6,"publicationDate":"2021-09-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"45435799","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2021-09-27DOI: 10.15446/abc.v27n1.88309
Melisa Hincapie Agudelo, Belfran Alcides Carbonell Medina, C. M. Arenas Gómez, J. Delgado
Ambystoma mexicanum is a urodele amphibian endemic to Xochimilco Lake in Mexico, it belongs to the salamander family Ambystomatidae. This species has frequently been used as model organism in developmental biology and regeneration laboratories around the world due to its broad regenerative capacities and adaptability to laboratory conditions. In this review we describe the establishment of the first colony of axolotls in Colombia to study tissue regeneration and our perspectives on the use A. mexicanum as a model organism in Colombia are discussed emphasizing its possible uses in regeneration and developmental biology
{"title":"Ambystoma mexicanum, a model organism in developmental biology and regeneration: a colombian experience","authors":"Melisa Hincapie Agudelo, Belfran Alcides Carbonell Medina, C. M. Arenas Gómez, J. Delgado","doi":"10.15446/abc.v27n1.88309","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/abc.v27n1.88309","url":null,"abstract":"Ambystoma mexicanum is a urodele amphibian endemic to Xochimilco Lake in Mexico, it belongs to the salamander family Ambystomatidae. This species has frequently been used as model organism in developmental biology and regeneration laboratories around the world due to its broad regenerative capacities and adaptability to laboratory conditions. In this review we describe the establishment of the first colony of axolotls in Colombia to study tissue regeneration and our perspectives on the use A. mexicanum as a model organism in Colombia are discussed emphasizing its possible uses in regeneration and developmental biology","PeriodicalId":56052,"journal":{"name":"Acta Biologica Colombiana","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.6,"publicationDate":"2021-09-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"45900100","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2021-09-27DOI: 10.15446/abc.v27n1.85989
Marcus Vinicius Brandão de Oliveira, B. Rosa, A. C. Fegies, Sonia Cristina Da Silva Belentani
Cerradomys goytaca is a cricetid rodent endemic to “Restinga” formations from southeastern Atlantic Forest. It is known from only five localities, and it is considered endangered of extinction. Herein, we furnish new data on C. goytaca from an additional locality in Rio de Janeiro state. The present record provides new data on habitat and represents the westernmost geographic limit of this poorly known species.
{"title":"New data on the threatened Cerradomys goytaca (RODENTIA, CRICETIDAE).","authors":"Marcus Vinicius Brandão de Oliveira, B. Rosa, A. C. Fegies, Sonia Cristina Da Silva Belentani","doi":"10.15446/abc.v27n1.85989","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/abc.v27n1.85989","url":null,"abstract":"Cerradomys goytaca is a cricetid rodent endemic to “Restinga” formations from southeastern Atlantic Forest. It is known from only five localities, and it is considered endangered of extinction. Herein, we furnish new data on C. goytaca from an additional locality in Rio de Janeiro state. The present record provides new data on habitat and represents the westernmost geographic limit of this poorly known species.","PeriodicalId":56052,"journal":{"name":"Acta Biologica Colombiana","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.6,"publicationDate":"2021-09-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"48127722","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2021-09-27DOI: 10.15446/abc.v27n1.87401
Iván Yesid López-Ardila, Francisco José Martínez-Pérez, Fernando Rondón-González
El diseño de cebadores es fundamental para amplificar regiones de genes debido a que la especificidad que mantienen cebador-secuencia de interés puede causar el éxito o fracaso en la reacción de PCR. En relación a Potamotrygon magdalenae (especie de interés de acuerdo al PAN Tiburones-Colombia), existe poca información disponible de aspectos relacionados con la genética poblacional de esta Raya. El objetivo del presente trabajo consistió en diseñar cebadores bajo los criterios del Modelo de Pérdida de ADN (DNA-LM), que permitan evaluar el estado genético de las poblaciones de P. magdalenae. Alineamos secuencias de la superfamilia Dayastoidea, disponibles en el NCBI, de los genes mitocondriales Citocromo C Oxidasa 1 (MT-CO1) y Citocromo b (MT-CYB). Se guimos los parámetros Gap open penalty (5), Gap extension penalti (0,2) y Terminal gap penalties (0,1) y seleccionamos dos pares de cebadores de acuerdo con el DNA-LM. Estimamos el producto amplificado del gen MT-CO1 en 916 pb y del gen MT-CYB en 774 pb, en muestras de P. magdalenae procedentes de diferentes ciénagas del Magdalena medio. Discutimos los resultados desde la perspectiva de validar la especificidad de los cebadores diseñados, teniendo en cuenta la correspondencia e identidad de las secuencias de los genes considerados. Los cebadores aquí reportados pueden contribuir a ampliar el conocimiento de la genética poblacional, biogeografía y filogenética de la raya de agua dulce P. magdalenae.
{"title":"Aplicación del modelo de pérdida de ADN para el diseño de cebadores en Potamotrygon magdalenae (Potamotrygonidae)","authors":"Iván Yesid López-Ardila, Francisco José Martínez-Pérez, Fernando Rondón-González","doi":"10.15446/abc.v27n1.87401","DOIUrl":"https://doi.org/10.15446/abc.v27n1.87401","url":null,"abstract":"El diseño de cebadores es fundamental para amplificar regiones de genes debido a que la especificidad que mantienen cebador-secuencia de interés puede causar el éxito o fracaso en la reacción de PCR. En relación a Potamotrygon magdalenae (especie de interés de acuerdo al PAN Tiburones-Colombia), existe poca información disponible de aspectos relacionados con la genética poblacional de esta Raya. El objetivo del presente trabajo consistió en diseñar cebadores bajo los criterios del Modelo de Pérdida de ADN (DNA-LM), que permitan evaluar el estado genético de las poblaciones de P. magdalenae. Alineamos secuencias de la superfamilia Dayastoidea, disponibles en el NCBI, de los genes mitocondriales Citocromo C Oxidasa 1 (MT-CO1) y Citocromo b (MT-CYB). Se guimos los parámetros Gap open penalty (5), Gap extension penalti (0,2) y Terminal gap penalties (0,1) y seleccionamos dos pares de cebadores de acuerdo con el DNA-LM. Estimamos el producto amplificado del gen MT-CO1 en 916 pb y del gen MT-CYB en 774 pb, en muestras de P. magdalenae procedentes de diferentes ciénagas del Magdalena medio. Discutimos los resultados desde la perspectiva de validar la especificidad de los cebadores diseñados, teniendo en cuenta la correspondencia e identidad de las secuencias de los genes considerados. Los cebadores aquí reportados pueden contribuir a ampliar el conocimiento de la genética poblacional, biogeografía y filogenética de la raya de agua dulce P. magdalenae.","PeriodicalId":56052,"journal":{"name":"Acta Biologica Colombiana","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.6,"publicationDate":"2021-09-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"45906259","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":4,"RegionCategory":"生物学","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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