Journal of health informatics最新文献

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Challenges and Issues on Extracting Named Entities from Oncology Clinical Notes 从肿瘤临床记录中提取命名实体的挑战和问题

Journal of health informatics

Pub Date : 2023-07-20 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1097

Luiz Henrique Pereira Niero, João Vitor Andrioli de Souza, Luciana Martins Gomes da Silva, Yohan Bonescki Gumiel, N. H. Borges, G. Piotto, Gustavo Giavarini, Lucas E. S. Oliveira

This article aims to describe the annotation process of a multi-institutional corpus of clinical texts in the oncology specialty and to train models for the Recognition of Named Entities. We use the annotated corpus to train models with different amounts of data and compare the model result with the amount of data used in training. The training of the models was done from the fine-tuning of the Bidirectional Encoder Representations from Transformers adapted to the medical-biological domain of the Portuguese language (BioBERTpt). To compare model behavior with increasing training data, models were trained with incremental amounts of data. As a result, we found that models trained with smaller but fully revised datasets performed better than models trained with larger datasets with little revision.

本文旨在描述肿瘤专业临床文本的多机构语料库的注释过程，并为命名实体识别训练模型。我们使用标注的语料库训练不同数据量的模型，并将模型结果与训练中使用的数据量进行比较。模型的训练是通过对变形金刚的双向编码器表示进行微调，使其适应葡萄牙语的医学-生物领域(BioBERTpt)。为了比较模型在增加训练数据时的行为，模型使用增量数据量进行训练。结果，我们发现用更小但完全修正的数据集训练的模型比用更大的数据集训练的模型表现得更好。

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Editorial 社论

Journal of health informatics

Pub Date : 2023-07-20 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1072

Julian E. Gaspar

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Sistema para auxílio na aplicação e análise da Ausculta Pulmonar 肺听诊的应用和分析辅助系统

Journal of health informatics

Pub Date : 2023-07-20 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1105

G. Leon, É. Amaral, Julio Saraçol Domingues Júnior

A fisioterapia respiratória é um dos principais tratamentos para as doenças pulmonares. A ausculta pulmonar é extremamente importante, pois trata-se do principal método de exame físico do tórax que permite uma melhor análise do funcionamento pulmonar para detecção de doenças respiratórias. Trata-se do desenvolvimento de um sistema capaz de auxiliar na aplicação da técnica de ausculta pulmonar, por meio de um dispositivo capaz de capturar dados sonoros durante a etapa da aplicação da técnica. Este sistema conta com integração de hardware e software. Além disso, o sistema permitiu que estudantes e profissionais de saúde realizassem uma capacitação para o auxílio na identificação acústica de sons pulmonares. Ademais, foram realizados experimentos com fisioterapeutas, avaliando todas as funções desenvolvidas na solução. Os resultados obtidos demonstraram um alto potencial de aplicabilidade para a problemática proposta.

呼吸物理疗法是治疗肺部疾病的主要方法之一。肺部听诊非常重要，因为它是胸部体检的主要方法，可以更好地分析肺功能，以检测呼吸道疾病。这是一种能够通过能够在肺听诊技术应用阶段捕获声音数据的设备来帮助应用该技术的系统的开发。该系统具有硬件和软件集成功能。此外，该系统允许学生和卫生专业人员进行培训，以协助肺部声音的声学识别。此外，还与物理治疗师一起进行了实验，评估了解决方案中开发的所有功能。结果表明，该问题具有很高的适用性。

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Application of transcranial brain stimulation in dementia. 经颅脑刺激在痴呆中的应用。

IF 1.5

Journal of health informatics

Pub Date : 2023-07-12 eCollection Date: 2023-10-01 DOI: 10.4103/tcmj.tcmj_91_23

Yuncin Luo, Feng-Yi Yang, Raymond Y Lo

The number of patients with dementia grows rapidly as the global population ages, which posits tremendous health-care burden to the society. Only cholinesterase inhibitors and a N-methyl-D-aspartate receptor antagonist have been approved for treating patients with Alzheimer's disease (AD), and their clinical effects remained limited. Medical devices serve as an alternative therapeutic approach to modulating neural activities and enhancing cognitive function. Four major brain stimulation technologies including deep brain stimulation (DBS), transcranial magnetic stimulation (TMS), transcranial direct current stimulation (tDCS), and transcranial ultrasound stimulation (TUS) have been applied to AD in a clinical trial setting. DBS allows electrical stimulation at the specified nucleus but remains resource-demanding, and after all, an invasive surgery; whereas TMS and tDCS are widely available and affordable but less ideal with respect to localization. The unique physical property of TUS, on the other hand, allows both thermal and mechanical energy to be transduced and focused for neuromodulation. In the context of dementia, using focused ultrasound to induce blood-brain barrier opening for delivering drugs and metabolizing amyloid protein has drawn great attention in recent years. Furthermore, low-intensity pulsed ultrasound has demonstrated its neuroprotective effects in both in vitro and in vivo studies, leading to ongoing clinical trials for AD. The potential and limitation of transcranial brain stimulation for treating patients with dementia would be discussed in this review.

随着全球人口老龄化，痴呆症患者数量迅速增长，给社会带来了巨大的医疗负担。只有胆碱酯酶抑制剂和n -甲基- d -天冬氨酸受体拮抗剂已被批准用于治疗阿尔茨海默病(AD)患者，其临床效果仍然有限。医疗器械是调节神经活动和增强认知功能的一种替代治疗方法。脑深部电刺激(DBS)、经颅磁刺激(TMS)、经颅直流电刺激(tDCS)和经颅超声刺激(TUS)四种主要的脑刺激技术已经在临床试验中应用于AD。DBS允许对特定的核进行电刺激，但仍然需要资源，毕竟是一种侵入性手术;而TMS和tDCS广泛可用且价格合理，但在本地化方面不太理想。另一方面，TUS独特的物理性质允许热能和机械能被转导并集中用于神经调节。在痴呆的背景下，利用聚焦超声诱导血脑屏障打开以传递药物和代谢淀粉样蛋白近年来备受关注。此外，低强度脉冲超声在体外和体内研究中都证明了其神经保护作用，因此正在进行阿尔茨海默病的临床试验。本综述将讨论经颅脑刺激治疗痴呆患者的潜力和局限性。

{"title":"Application of transcranial brain stimulation in dementia.","authors":"Yuncin Luo, Feng-Yi Yang, Raymond Y Lo","doi":"10.4103/tcmj.tcmj_91_23","DOIUrl":"10.4103/tcmj.tcmj_91_23","url":null,"abstract":"The number of patients with dementia grows rapidly as the global population ages, which posits tremendous health-care burden to the society. Only cholinesterase inhibitors and a N-methyl-D-aspartate receptor antagonist have been approved for treating patients with Alzheimer's disease (AD), and their clinical effects remained limited. Medical devices serve as an alternative therapeutic approach to modulating neural activities and enhancing cognitive function. Four major brain stimulation technologies including deep brain stimulation (DBS), transcranial magnetic stimulation (TMS), transcranial direct current stimulation (tDCS), and transcranial ultrasound stimulation (TUS) have been applied to AD in a clinical trial setting. DBS allows electrical stimulation at the specified nucleus but remains resource-demanding, and after all, an invasive surgery; whereas TMS and tDCS are widely available and affordable but less ideal with respect to localization. The unique physical property of TUS, on the other hand, allows both thermal and mechanical energy to be transduced and focused for neuromodulation. In the context of dementia, using focused ultrasound to induce blood-brain barrier opening for delivering drugs and metabolizing amyloid protein has drawn great attention in recent years. Furthermore, low-intensity pulsed ultrasound has demonstrated its neuroprotective effects in both in vitro and in vivo studies, leading to ongoing clinical trials for AD. The potential and limitation of transcranial brain stimulation for treating patients with dementia would be discussed in this review.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":"1 1","pages":"300-305"},"PeriodicalIF":1.5,"publicationDate":"2023-07-12","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10683520/pdf/","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"88451203","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

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Leishmaniose Cutânea no Estado do Pará, Brasil: Análise Baseada em Lógica Fuzzy 巴西para州皮肤利什曼病:基于模糊逻辑的分析

Journal of health informatics

Pub Date : 2023-06-19 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.986

Bruna Costa de Souza, Gabriela Sato Santa Brígida, Cláudia do Socorro Carvalho Miranda, Danilo De Souza Novaes, R. C. Figueiredo, Simone Beverly Nascimento da Costa, Silvana Rossy de Brito, Emerson Cordeiro Morais, Leonardo Luis De Oliveira Miranda, Nelson Veiga Gonçalves

Objetivo: Analisar a ocorrência da leishmaniose cutânea e sua associação com variáveis epidemiológicas, socioeconômicas e de políticas públicas em saúde, utilizando um sistema fuzzy, nas regiões de integração do estado do Pará, no período de 2015 a 2019. Métodos: Neste estudo experimental foram utilizados dados oficiais epidemiológicos, socioeconômicos e de políticas públicas em saúde, cuja associação foi analisada por um sistema fuzzy, utilizando um algoritmo de inferência mamdani, desenvolvido com python 3.7. Para validação dos resultados foi realizada uma análise da associação entre a ocorrência dos casos da doença e o desmatamento. Resultados: A região do Xingu apresentou o maior risco para a doença com grandes diferenças nas pertinências de suas variáveis, bem como o maior percentual de incremento do desmatamento. Conclusão: O sistema foi satisfatório para identificar regiões com maior risco para a doença e necessidade de intensificação de ações de vigilância em saúde.

目的:利用模糊系统分析2015 - 2019年para州整合地区皮肤利什曼病的发生及其与流行病学、社会经济和公共卫生政策变量的关系。方法:本实验研究使用流行病学、社会经济和公共卫生政策的官方数据，使用使用python 3.7开发的mamdani推理算法，通过模糊系统分析其关联。为了验证结果，对疾病病例的发生与森林砍伐之间的关系进行了分析。结果:兴古地区的疾病风险最高，各变量的相关性差异很大，森林砍伐增幅最高。结论:该系统在确定疾病风险较高的地区和需要加强卫生监测方面是令人满意的。

{"title":"Leishmaniose Cutânea no Estado do Pará, Brasil: Análise Baseada em Lógica Fuzzy","authors":"Bruna Costa de Souza, Gabriela Sato Santa Brígida, Cláudia do Socorro Carvalho Miranda, Danilo De Souza Novaes, R. C. Figueiredo, Simone Beverly Nascimento da Costa, Silvana Rossy de Brito, Emerson Cordeiro Morais, Leonardo Luis De Oliveira Miranda, Nelson Veiga Gonçalves","doi":"10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.986","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.986","url":null,"abstract":"Objetivo: Analisar a ocorrência da leishmaniose cutânea e sua associação com variáveis epidemiológicas, socioeconômicas e de políticas públicas em saúde, utilizando um sistema fuzzy, nas regiões de integração do estado do Pará, no período de 2015 a 2019. Métodos: Neste estudo experimental foram utilizados dados oficiais epidemiológicos, socioeconômicos e de políticas públicas em saúde, cuja associação foi analisada por um sistema fuzzy, utilizando um algoritmo de inferência mamdani, desenvolvido com python 3.7. Para validação dos resultados foi realizada uma análise da associação entre a ocorrência dos casos da doença e o desmatamento. Resultados: A região do Xingu apresentou o maior risco para a doença com grandes diferenças nas pertinências de suas variáveis, bem como o maior percentual de incremento do desmatamento. Conclusão: O sistema foi satisfatório para identificar regiões com maior risco para a doença e necessidade de intensificação de ações de vigilância em saúde.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-06-19","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"42460922","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}

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Otimizando a detecção de reação adversa a medicamentos com a informatização do Trigger Tool 利用触发器工具的计算机化优化药物不良反应检测

Journal of health informatics

Pub Date : 2023-06-19 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.984

Cássio José de Oliveira Rodrigues, H. Costa, Edineide da Costa Pereira Fulco, Rand Randall Martins

Objetivo: Avaliar os impactos que a informatização dos gatilhos utilizados no processo de investigação ativa de reação adversa a medicamentos (RAM) promoveu a um serviço de farmacovigilância. Metodologia: Estudo observacional e retrospectivo com dados de dispensação de medicamentos classificados como “gatilhos” em prontuário eletrônico, cujo sistema informatizado de informação em saúde (SIS) gerou relatórios contendo dados do paciente e do medicamento para ele dispensado, eliminando a etapa manual de investigação. Resultado: Houve um aumento de 48,5% na média mensal de detecção e notificação de RAM na instituição quando comparado aos períodos anteriores a informatização, assim como houve redução do tempo empregado para a execução do processo de trabalho. Conclusão: Os resultados evidenciam a relevância que os SIS podem conferir aos serviços de farmacovigilância, permitindo melhorar a acurácia da metodologia ativa de detecção de RAM, reduzir o tempo para execução do processo de trabalho e otimizar a logística de trabalho.

目的：评估在药物不良反应（ADR）主动调查过程中使用的触发因素计算机化对药物警戒服务的影响。方法：观察和回顾性研究，将配药数据归类为电子医疗记录中的“触发因素”，其计算机化健康信息系统（SIS）生成包含患者数据和配药给他的药物的报告，消除了手动调查阶段。结果：与计算机化前相比，该机构ADR的月平均检测和通知次数增加了48.5%，执行工作流程的时间也减少了。结论：研究结果表明，SIS可以为药物警戒服务提供相关性，从而提高RAM主动检测方法的准确性，缩短工作流程的执行时间，优化工作物流。

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Digital inclusion analysis for Brazil’s unified health system 巴西统一卫生系统的数字包容性分析

Journal of health informatics

Pub Date : 2023-06-19 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.967

Shirley Karolina Da Silva Ferreira, I. G. Sene Junior

Objective: Analyzes the coverage of the digital inclusion programs in health units. Method: The public data of the Cidades Digitais and Wi-fi Brasil programs were analyzed, extracting the number and type of health units supported by the programs, for each Brazilian region and state. Results: The North and Northeast regions have the largest number of health units attended by the programs. The collected data shows that 4.4% of the Wi-fi Brasil’s total access points are in health units and mainly in Indigenous Health Centers (28%), whilst Cidades Digitais corresponds to 4.3%, supporting the Basic Health Units (33%). Conclusion: To recognize the community’s level of access to the internet it is important to propitiate the digital inclusion in health units and then contribute to the National Health Data Network, following the Digital Health Strategy 2020-2028 guidelines.

目的：分析卫生单位数字包容项目的覆盖范围。方法：分析Cidades Digitais和Wi-fi Brasil项目的公共数据，提取巴西每个地区和州项目支持的卫生单位的数量和类型。结果：北部和东北部地区参加该项目的卫生单位数量最多。收集的数据显示，巴西Wi-fi接入点总数的4.4%在卫生单位，主要在土著卫生中心（28%），而Cidades Digitais对应于4.3%，支持基本卫生单位（33%）。结论：为了认识到社区的互联网接入水平，重要的是按照《2020-2028年数字健康战略》的指导方针，倡导卫生单位的数字包容，然后为国家卫生数据网络做出贡献。

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Estudo de usabilidade de aplicativo móvel para diagnóstico da endometriose 子宫内膜异位症诊断手机应用可用性研究

Journal of health informatics

Pub Date : 2023-06-19 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.977

Ingrid Iana Fernandes Medeiros, Fabiana Gomes Batista, Alef Emannuel Trigueiro Dias, Juliana Dantas Camargo, Itamir de Morais Barroca Filho, Ricardo Ney Oliveira Cobucci

Objetivos: Avaliar a usabilidade entre médicos de um aplicativo móvel, Endometriosis Intelligent Application (ENIA), criado para facilitar o diagnóstico da endometriose. Métodos: O estudo envolveu 15 médicos especialistas e 21 residentes em Ginecologia e Obstetrícia de uma maternidade localizada no Estado do Rio Grande do Norte, Brasil, no período de julho a novembro de 2020, contando como instrumento de avaliação o mHealth App Usability Questionnaire (MAUQ). Resultados: Acerca da confiabilidade geral, a escala apresentou boa consistência interna determinada por um alfa de Cronbach de 0,871. Sobre a facilidade de uso e satisfação, organização das informações no sistema e utilidade, os valores de alfa foram 0,80, 0,65 e 0,87, respectivamente. Verifica-se concordância máxima acima de 70% na maioria das questões da subescala de utilidade. Conclusão: Satisfação e utilidade foram relatadas pela maioria dos médicos que avaliaram o ENIA, indicando que o aplicativo, após validação, poderá ser usado na prática destes profissionais.

目的：评估医生对移动应用程序“子宫内膜异位症智能应用程序”（ENIA）的可用性，该应用程序旨在促进子宫内膜异位的诊断。方法：2020年7月至11月，这项研究涉及巴西北里奥格兰德州一家妇产医院的15名医学专家和21名妇产科住院医师，将mHealth应用程序可用性问卷（MAUQ）作为评估工具。结果：关于总体可靠性，该量表表现出良好的内部一致性，由0.871的Cronbachα确定。关于易用性和满意度、系统中信息的组织和效用，α值分别为0.80、0.65和0.87。在效用分量表的大多数问题中观察到70%以上的最大一致性。结论：大多数评估ENIA的医生都表示满意和有用，这表明该应用程序经过验证后，可以用于这些专业人员的实践。

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Usability evaluation of a mHealth application for overweight and obesity mHealth应用程序对超重和肥胖的可用性评估

Journal of health informatics

Pub Date : 2023-06-19 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.i1.2023.966

Giselle Christina Felix da Silva Palma, Márcia Ito, Jean Jose Silva, Alexandra Monteiro

The objective of the article is to evaluate the usability of a mobile application (Healthfy) that makes the prevention and control of overweight and obesity in adults. For the evaluation, a questionnaire adapted from the uMARS method was applied, which was validated by Cronbach's Alpha analysis. Healthfy was used by 26 employees for 21 days of exclusive Home Office. The Pareto method was used for the quantitative statistical analysis, and for the free field responses, the Bardin Content Analysis method. The uMARS validation achieved acceptable reliability (??=0.79). The application met the expectation and encouraged changes in health-related behaviors with a 73.03% agreement. The qualitative analysis of 53 testimonies showed a greater recurrence of records related to behavior to change habits (45%). Thus, it is possible to conclude that the application has characteristics that interfere in the behavior and motivation for healthy habits by workers in an exclusive home office, although there seem to be users limitations in planning and execution of activities.

本文的目的是评估一个移动应用程序(Healthfy)的可用性，该应用程序可以预防和控制成人超重和肥胖。为了进行评估，采用了uMARS方法的问卷调查，并通过Cronbach's Alpha分析进行了验证。26名员工使用Healthfy进行了为期21天的内政部专属服务。定量统计分析采用Pareto法，自由场响应采用Bardin含量分析法。uMARS验证达到可接受信度(??=0.79)。该应用程序符合预期，并鼓励改变与健康相关的行为，有73.03%的同意。对53份证词的定性分析显示，与改变习惯的行为相关的记录的复发率更高(45%)。因此，可以得出结论，尽管用户在计划和执行活动方面似乎存在限制，但该应用程序具有干扰员工在独家家庭办公室中养成健康习惯的行为和动机的特征。

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Trend of Intentional Self-harm Methods and Recovery Rate Including Non-death in Hospital Discharge Registry Investigation in Korea 2005-2016 2005-2016年韩国出院登记调查中故意自残方法的趋势和包括非死亡在内的康复率

Journal of health informatics

Pub Date : 2021-05-31 DOI: 10.21032/JHIS.2021.46.2.181

A-Reum Kim, Sun-Rak Jeong, Eunseok Kim, W. Lee

Trend of Intentional Self-harm Methods and Recovery Rate Including Non-death in Hospital Discharge Registry Investigation in Korea 2005-2016 Ah-reum Kim, Sun-Rak Jeong, Eun-Seok Kim, Won Kee Lee Graduate Student, Graduate School of Public Health Kyungpook National University, Daegu; Professor, Department of Dental Hygiene, Daegu Health College, Daegu; Professor, Department of Clinical Pathology, Daegu Health College, Daegu; Professor, Department of Biostatistics, School of Medicine, Kyungpook National University, Daegu, Korea

2005-2016年韩国出院登记调查中故意自残方法的趋势和包括非死亡在内的康复率大邱国立大学公共卫生研究生院Ah reum Kim，Sun Rak Jeong，Eun Seok Kim，Won Kee Lee；大邱健康学院口腔卫生系教授，大邱；大邱健康学院临床病理学系教授，大邱；韩国大邱庆浦国立大学医学院生物统计学系教授

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