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Developing a Transformer-based Clinical Part-of-Speech Tagger for Brazilian Portuguese 基于Transformer的巴西葡萄牙语临床词性标注器的开发
Pub Date : 2023-07-20 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1086
Elisa Terumi Rubel Schneider, Yohan Bonescki Gumiel, L. A. F. D. Oliveira, Carolina de Oliveira Montenegro, Laura Rubel Barzotto, C. Moro, A. Pagano, E. Paraiso
Electronic Health Records are a valuable source of information to be extracted by means of natural language processing (NLP) tasks, such as morphosyntactic word tagging. Although there have been significant advances in health NLP, such as the Transformer architecture, languages such as Portuguese are still underrepresented. This paper presents taggers developed for Portuguese texts, fine-tuned using BioBERtpt (clinical/biomedical) and BERTimbau (generic) models on a POS-tagged corpus. We achieved an accuracy of 0.9826, state-of-the-art for the corpus used. In addition, we performed a human-based evaluation of the trained models and others in the literature, using authentic clinical narratives. Our clinical model achieved 0.8145 in accuracy compared to 0.7656 for the generic model. It also showed competitive results compared to models trained specifically with clinical texts, evidencing domain impact on the base model in NLP tasks.
电子健康记录是一种有价值的信息来源,可以通过自然语言处理(NLP)任务(如形态句法词标记)进行提取。尽管在健康NLP方面取得了重大进展,例如Transformer架构,但葡萄牙语等语言的代表性仍然不足。本文介绍了为葡萄牙语文本开发的标记器,在pos标记的语料库上使用BioBERtpt(临床/生物医学)和BERTimbau(通用)模型进行微调。我们实现了0.9826的准确率,对于所使用的语料库来说是最先进的。此外,我们使用真实的临床叙述,对经过训练的模型和文献中的其他模型进行了基于人类的评估。我们的临床模型的准确率为0.8145,而通用模型的准确率为0.7656。与专门用临床文本训练的模型相比,它还显示了竞争性结果,证明了领域对NLP任务中基础模型的影响。
{"title":"Developing a Transformer-based Clinical Part-of-Speech Tagger for Brazilian Portuguese","authors":"Elisa Terumi Rubel Schneider, Yohan Bonescki Gumiel, L. A. F. D. Oliveira, Carolina de Oliveira Montenegro, Laura Rubel Barzotto, C. Moro, A. Pagano, E. Paraiso","doi":"10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1086","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1086","url":null,"abstract":"Electronic Health Records are a valuable source of information to be extracted by means of natural language processing (NLP) tasks, such as morphosyntactic word tagging. Although there have been significant advances in health NLP, such as the Transformer architecture, languages such as Portuguese are still underrepresented. This paper presents taggers developed for Portuguese texts, fine-tuned using BioBERtpt (clinical/biomedical) and BERTimbau (generic) models on a POS-tagged corpus. We achieved an accuracy of 0.9826, state-of-the-art for the corpus used. In addition, we performed a human-based evaluation of the trained models and others in the literature, using authentic clinical narratives. Our clinical model achieved 0.8145 in accuracy compared to 0.7656 for the generic model. It also showed competitive results compared to models trained specifically with clinical texts, evidencing domain impact on the base model in NLP tasks.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-07-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"43623603","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Tecnologias De Engenharia de Software para o Desenvolvimento de Sistemas de Saúde de Código Aberto: um Mapeamento Sistemático da Literatura 开发开源健康系统的软件工程技术:文献的系统映射
Pub Date : 2023-07-20 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1079
Luís Felipe Bertucci Lima, Flavia Meireles, L. Peres
Este artigo investiga as tecnologias de engenharia de software (ES) usadas durante o desenvolvimento de sistemas de saúde de código aberto (SSCAs) por meio de um mapeamento sistemático da literatura. O mapeamento resultou na seleção de 67 estudos a partir de buscas em quatro bibliotecas digitais. Os resultados indicaram que as principais tecnologias de ES utilizadas são padrões e modelos de representação e transmissão de dados de saúde. Além disso, os resultados permitiram obter uma visão geral sobre o desenvolvimento, a disponibilização e a aplicabilidade dos SSCAs.
本文通过对文献的系统映射,研究了在开源卫生系统(SSCAs)开发过程中使用的软件工程技术(ES)。从四个数字图书馆的搜索中选择了67项研究。结果表明,使用的主要ES技术是表示和传输健康数据的模式和模型。此外,研究结果还概述了SSCAs的发展、可用性和适用性。
{"title":"Tecnologias De Engenharia de Software para o Desenvolvimento de Sistemas de Saúde de Código Aberto: um Mapeamento Sistemático da Literatura","authors":"Luís Felipe Bertucci Lima, Flavia Meireles, L. Peres","doi":"10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1079","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1079","url":null,"abstract":"Este artigo investiga as tecnologias de engenharia de software (ES) usadas durante o desenvolvimento de sistemas de saúde de código aberto (SSCAs) por meio de um mapeamento sistemático da literatura. O mapeamento resultou na seleção de 67 estudos a partir de buscas em quatro bibliotecas digitais. Os resultados indicaram que as principais tecnologias de ES utilizadas são padrões e modelos de representação e transmissão de dados de saúde. Além disso, os resultados permitiram obter uma visão geral sobre o desenvolvimento, a disponibilização e a aplicabilidade dos SSCAs.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-07-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"44516705","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Interação humano-computador e Letramento digital em saúde utilizando aplicações móveis: Revisão Sistemática 使用移动应用程序的健康领域人机交互和数字素养:系统综述
Pub Date : 2023-07-20 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1102
Hugo Miranda de Oliveira, Sérgio Carvalho, F. Anjos
Este trabalho teve como escopo fazer uma revisão sistemática da literatura objetivando identificar as principais diretrizes e interfaces de interação humano-computador adotadas pelos pesquisadores para o desenvolvimento de aplicativos móveis em saúde com foco no letramento digital em saúde no período entre 2018 e 2022. A mesma foi elaborada tendo como base as recomendações do PRISMA (Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyzes). A partir da busca nas bases de dados estabelecidas obtiveram-se um total de 129 artigos dos quais 11 entraram na revisão. Como resultado pode-se destacar as metodologias de design centrado no usuário, design instrucional sistemático, além de interfaces como desenvolvimento de personagens 3D e chatbots. Conclui-se que a utilização de aplicativos móveis, por diferentes abordagens, tem se mostrado como uma ferramenta importante que favorece o trabalho do profissional ou mesmo, privilegiando o autocuidado e qualidade de vida, principalmente em populações marginalizadas que não possuem acesso facilitado a informação de qualidade.
本研究旨在对文献进行系统综述,以确定研究人员在2018年至2022年期间开发以数字卫生素养为重点的移动卫生应用程序时采用的主要指导方针和人机交互界面。它是根据PRISMA(系统审查和元分析的首选报告项目)的建议编制的。通过对已建立的数据库的搜索,共获得129篇文章,其中11篇进入综述。因此,我们可以突出以用户为中心的设计方法,系统的教学设计,以及界面,如3D角色开发和聊天机器人。结论是,通过不同的方法使用移动应用程序已被证明是一种重要的工具,有利于专业人员的工作,甚至有利于自我护理和生活质量,特别是在不容易获得高质量信息的边缘化人群中。
{"title":"Interação humano-computador e Letramento digital em saúde utilizando aplicações móveis: Revisão Sistemática","authors":"Hugo Miranda de Oliveira, Sérgio Carvalho, F. Anjos","doi":"10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1102","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1102","url":null,"abstract":"Este trabalho teve como escopo fazer uma revisão sistemática da literatura objetivando identificar as principais diretrizes e interfaces de interação humano-computador adotadas pelos pesquisadores para o desenvolvimento de aplicativos móveis em saúde com foco no letramento digital em saúde no período entre 2018 e 2022. A mesma foi elaborada tendo como base as recomendações do PRISMA (Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyzes). A partir da busca nas bases de dados estabelecidas obtiveram-se um total de 129 artigos dos quais 11 entraram na revisão. Como resultado pode-se destacar as metodologias de design centrado no usuário, design instrucional sistemático, além de interfaces como desenvolvimento de personagens 3D e chatbots. Conclui-se que a utilização de aplicativos móveis, por diferentes abordagens, tem se mostrado como uma ferramenta importante que favorece o trabalho do profissional ou mesmo, privilegiando o autocuidado e qualidade de vida, principalmente em populações marginalizadas que não possuem acesso facilitado a informação de qualidade.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-07-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"44582294","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Caracterização e Classificação de Conjuntos Desbalanceados de Dermoscopias Dermoscopy不平衡集的特征与分类
Pub Date : 2023-07-20 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1085
Newton Spolaôr, H. D. Lee, Weber S. R. Takaki, Leandro A. Ensina, Antonio Rafael Sabino Parmezan, M. Maciel, C. Coy, Feng Chung Wu
Objetivo: Investigar técnicas de inteligência computacional para caracterizar e classificar conjuntos desbalanceados de lesões dermoscópicas. Métodos: O método desenvolvido contempla técnicas para pré-processamento de imagens, extração de atributos (características), sobreamostragem, seleção de atributos, e construção e avaliação de classificadores. Vinte configurações do método foram avaliadas em 274 dermoscopias públicas com 48 melanomas e 226 nevos. Resultados: Atingiu-se a maior acurácia média, 83,57%, após reduzir o número de características em pelo menos 48,86%. Em geral, a sobreamostragem melhorou a sensitividade média. Conclusão: Os melhores resultados do método na caracterização e classificação de um conjunto desbalanceado de dermoscopias foram promissores e competitivos com algumas referências recentes.
目的:研究计算智能技术来描述和分类不平衡的皮肤镜下病变。方法:该方法包括图像预处理、特征提取、过采样、属性选择、分类器构建和评价等技术。对274例公共皮肤镜检查中48例黑色素瘤和226例痣进行了评估。结果:平均准确率最高,83.57%,特征数量减少至少48.86%。总的来说,过度采样提高了平均灵敏度。结论:该方法在一组不平衡的皮肤镜的表征和分类方面的最佳结果是有希望的和有竞争力的,最近的一些参考文献。
{"title":"Caracterização e Classificação de Conjuntos Desbalanceados de Dermoscopias","authors":"Newton Spolaôr, H. D. Lee, Weber S. R. Takaki, Leandro A. Ensina, Antonio Rafael Sabino Parmezan, M. Maciel, C. Coy, Feng Chung Wu","doi":"10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1085","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1085","url":null,"abstract":"Objetivo: Investigar técnicas de inteligência computacional para caracterizar e classificar conjuntos desbalanceados de lesões dermoscópicas. Métodos: O método desenvolvido contempla técnicas para pré-processamento de imagens, extração de atributos (características), sobreamostragem, seleção de atributos, e construção e avaliação de classificadores. Vinte configurações do método foram avaliadas em 274 dermoscopias públicas com 48 melanomas e 226 nevos. Resultados: Atingiu-se a maior acurácia média, 83,57%, após reduzir o número de características em pelo menos 48,86%. Em geral, a sobreamostragem melhorou a sensitividade média. Conclusão: Os melhores resultados do método na caracterização e classificação de um conjunto desbalanceado de dermoscopias foram promissores e competitivos com algumas referências recentes.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-07-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"46705176","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Algoritmos de Machine Learning para Predição da Sobrevida do Câncer de Mama 预测乳腺癌生存的机器学习算法
Pub Date : 2023-07-20 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1091
Pablo Deoclecia dos Santos, Erika Yahata, Talita Santos Piheiro, Fellipe Soares de Oliveira, P. W. Simões
Objetivo: O presente artigo apresenta uma análise comparativa de algoritmos de Aprendizado de Máquina aplicados à predição da Sobrevida do Câncer de Mama. Métodos: Estudo descritivo que considerou dados de 1.570 pacientes com câncer de mama estágio I-III. A técnica Synthetic Minority Oversampling Technique foi aplicada devido ao desbalanceamento do conjunto de dados. Foram considerados no estudo os algoritmos Naive Bayes, Random Forest, Multilayer Perceptron e AdaBoost, e como estratégia de aprendizagem a validação cruzada. Resultados: O modelo desenvolvido a partir do algoritmo Random Forest apresentou maior acurácia (96,2%; IC95%: 95,5%-96,9%) e especificidade (97,4%; IC95%: 96,6%-98,2%); e o modelo desenvolvido a partir do AdaBoost, maior sensibilidade (95,3%; IC95%: 94,3%-96,4%). Conclusão: Assim, dentre os modelos apresentados em nosso estudo, o desenvolvido a partir do algoritmo Random Forest apresentou, no geral, as melhores medidas de avaliação na predição da sobrevida do Câncer de Mama.
目的:对机器学习算法应用于癌症生存率预测的比较分析。方法:对1570例Ⅰ-Ⅲ期癌症患者的资料进行描述性研究。由于数据集不平衡,采用了合成少数派过采样技术。研究中考虑了Naive Bayes、Random Forest、多层感知器和AdaBoost算法,并将交叉验证作为一种学习策略。结果:随机森林算法建立的模型具有较高的准确性(96.2%;95%CI:95.5%-96.9%)和特异性(97.4%;95%CI:96.6%-98.2%);AdaBoost模型灵敏度较高(95.3%;95%CI:94.3%-96.4%)。结论:因此,在我们研究中提出的模型中,由随机森林算法开发的模型总体上提出了预测乳腺癌症生存率的最佳评估措施。
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SISVAL-RENAL: apoio à decisão no manejo da anemia na insuficiência renal crônica SISVAL-RENAL:慢性肾功能衰竭贫血治疗的决策支持
Pub Date : 2023-07-20 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1108
Gabrielle dos Santos Leandro, C. Moro
Objetivo: avaliar o SISVAL-RENAL, que é um sistema de apoio à decisão clínica (SADC) no manejo da anemia na insuficiência renal crônica. Método: Estudo aplicado, de avaliação de um SADC englobando os aspectos: confiabilidade e usabilidade (satisfação de uso, efetividade e eficiência). Foi utilizada a abordagem de desenvolvimento centrado no usuário, padrão de interoperabilidade de arquétipos da openEHR, e realizado avaliações durante todo o ciclo de vida do sistema. Resultados: Identificou-se o cenário e perfil do usuário para o desenvolvimento do SADC. A taxa de avaliação de confiabilidade inicial do sistema foi de 72%, precisando realizar alguns ajustes antes da avaliação em ambiente clínico. A taxa de satisfação do usuário pelos nefrologistas em ambiente clínico foi de 98,4%, efetividade de 100% e eficiência de 1,13% de metas alcançadas por segundo. Conclusão: A abordagem avaliativa permitiu a correção de problemas de assertividade do sistema antes do uso em ambiente clínico.
目的:评价临床决策支持系统SISVAL-RNAL在治疗慢性肾功能衰竭贫血中的作用。方法:应用研究,评估SADC,包括可靠性和可用性(使用满意度、有效性和效率)。我们使用了以用户为中心的开发方法、openEHR原型互操作性标准,并在整个系统生命周期中进行了评估。结果:我们确定了南共体发展的情景和用户概况。该系统的初始可靠性评估率为72%,在临床环境中进行评估之前需要进行一些调整。肾科医生在临床环境中的用户满意度为98.4%,有效性为100%,每秒实现目标的效率为1.13%。结论:该评估方法可以在临床环境中使用前纠正系统的自信问题。
{"title":"SISVAL-RENAL: apoio à decisão no manejo da anemia na insuficiência renal crônica","authors":"Gabrielle dos Santos Leandro, C. Moro","doi":"10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1108","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1108","url":null,"abstract":"Objetivo: avaliar o SISVAL-RENAL, que é um sistema de apoio à decisão clínica (SADC) no manejo da anemia na insuficiência renal crônica. Método: Estudo aplicado, de avaliação de um SADC englobando os aspectos: confiabilidade e usabilidade (satisfação de uso, efetividade e eficiência). Foi utilizada a abordagem de desenvolvimento centrado no usuário, padrão de interoperabilidade de arquétipos da openEHR, e realizado avaliações durante todo o ciclo de vida do sistema. Resultados: Identificou-se o cenário e perfil do usuário para o desenvolvimento do SADC. A taxa de avaliação de confiabilidade inicial do sistema foi de 72%, precisando realizar alguns ajustes antes da avaliação em ambiente clínico. A taxa de satisfação do usuário pelos nefrologistas em ambiente clínico foi de 98,4%, efetividade de 100% e eficiência de 1,13% de metas alcançadas por segundo. Conclusão: A abordagem avaliativa permitiu a correção de problemas de assertividade do sistema antes do uso em ambiente clínico.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-07-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"49524971","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Modelagem probabilística do tempo para a primeira infecção da Covid-19 de uma cidade conectada à outra em crescimento exponencial de infectados 一个连接城市首次感染Covid-19的概率时间模型,感染者呈指数增长
Pub Date : 2023-07-20 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1089
Thiago Santos de Paula Silva, P. Ciarelli, Jugurta Montalvão, E. Salles
Após a chegada da Covid-19 ao Brasil, em que os primeiros casos aconteceram em centros populacionais e comerciais, sua propagação regional continuou para cidades marginais conectadas a esses centros, num processo de interiorização das infecções. Modelos que explicam esse fenômeno podem ajudar na preparação das medidas necessárias para contenção dos novos casos. Em vista disso, o presente trabalho propõe uma nova variável aleatória que modela a probabilidade de atraso, em dias, da primeira infecção numa cidade marginal acoplada a um centro já infectado, uma cidade polo com transmissão comunitária da infecção. A nova variável e sua distribuição de probabilidade são formuladas sob premissas teóricas gerais, ao passo que uma metodologia de uso é exemplificada no cenário real das cidades do Espírito Santo, em que os resultados corroboram a utilidade da nova variável na avaliação de risco da primeira infecção por importação.
新冠肺炎抵达巴西后,第一批病例发生在人口和商业中心,在感染内部化的过程中,其区域传播继续蔓延到与这些中心相连的边缘城市。解释这一现象的模型可以帮助准备遏制新病例的必要措施。有鉴于此,本工作提出了一个新的随机变量,该变量对边缘城市与已经感染的中心,即感染社区传播的极点城市的首次感染延迟的概率(以天为单位)进行建模。新变量及其概率分布是在一般理论前提下制定的,而使用方法则以圣埃斯皮里托市的实际情况为例,其中的结果证实了新变量在首次输入感染风险评估中的有用性。
{"title":"Modelagem probabilística do tempo para a primeira infecção da Covid-19 de uma cidade conectada à outra em crescimento exponencial de infectados","authors":"Thiago Santos de Paula Silva, P. Ciarelli, Jugurta Montalvão, E. Salles","doi":"10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1089","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1089","url":null,"abstract":"Após a chegada da Covid-19 ao Brasil, em que os primeiros casos aconteceram em centros populacionais e comerciais, sua propagação regional continuou para cidades marginais conectadas a esses centros, num processo de interiorização das infecções. Modelos que explicam esse fenômeno podem ajudar na preparação das medidas necessárias para contenção dos novos casos. Em vista disso, o presente trabalho propõe uma nova variável aleatória que modela a probabilidade de atraso, em dias, da primeira infecção numa cidade marginal acoplada a um centro já infectado, uma cidade polo com transmissão comunitária da infecção. A nova variável e sua distribuição de probabilidade são formuladas sob premissas teóricas gerais, ao passo que uma metodologia de uso é exemplificada no cenário real das cidades do Espírito Santo, em que os resultados corroboram a utilidade da nova variável na avaliação de risco da primeira infecção por importação.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-07-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"47713326","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Comparação de Classificadores de Complexos QRS Desenvolvidos Utilizando Técnicas de Aprendizado de Máquina 利用机器学习技术开发的复杂QRS分类器的比较
Pub Date : 2023-07-20 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1074
Guilherme Bachega Gomes, R. C. Silva, Adriana Kauati, Lucas Guilherme Hübner
Doenças cardiovasculares são a maior causa de morte no mundo e sua prevenção é feita através de seu diagnóstico precoce(1). Em 2019, cerca de 17,9 milhões de mortes por doenças cardiovasculares ocorreram globalmente(1). Em especial as arritmias cardíacas que podem ser diagnosticadas por eletrocardiografia(2). Estudos propuseram modelos com algoritmos de aprendizado de máquina para classificação de batimento cardíaco, utilizando a base de dados do MIT-BIH Arrhythmia Database(3-7). Este trabalho apresenta três modelos preditivos, baseados na derivação D2 da base MIT-BIH, utilizando Árvore de Decisão, rede neural Multilayer Perceptron e Deep Neural Network com dois tipos de balanceamento da base de dados para a classificação de 10 arritmias. Os algoritmos foram treinados utilizando 5-fold stratified cross-validation e sua performance, em F1-Score, foram submetidos à análise estatística, tendo a Deep Neural Network, em ambas as bases, obtido o melhor desempenho.
心血管疾病是世界范围内死亡的主要原因,通过早期诊断进行预防(1)。2019年,全球约有1790万人死于心血管疾病(1)。尤其是可以通过心电图诊断的心律失常(2)。研究已经提出了使用MIT-BIH心律失常数据库(3-7)进行心率分类的具有机器学习算法的模型。本工作基于MIT-BIH数据库的D2推导,提出了三个预测模型,使用决策树、多层感知器神经网络和深度神经网络,并使用两种类型的数据库平衡对10种心律失常进行分类。使用5倍分层交叉验证对算法进行训练,并将其在F1分数中的性能提交给统计分析,其中深度神经网络在这两个基础上都获得了最佳性能。
{"title":"Comparação de Classificadores de Complexos QRS Desenvolvidos Utilizando Técnicas de Aprendizado de Máquina","authors":"Guilherme Bachega Gomes, R. C. Silva, Adriana Kauati, Lucas Guilherme Hübner","doi":"10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1074","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1074","url":null,"abstract":"Doenças cardiovasculares são a maior causa de morte no mundo e sua prevenção é feita através de seu diagnóstico precoce(1). Em 2019, cerca de 17,9 milhões de mortes por doenças cardiovasculares ocorreram globalmente(1). Em especial as arritmias cardíacas que podem ser diagnosticadas por eletrocardiografia(2). Estudos propuseram modelos com algoritmos de aprendizado de máquina para classificação de batimento cardíaco, utilizando a base de dados do MIT-BIH Arrhythmia Database(3-7). Este trabalho apresenta três modelos preditivos, baseados na derivação D2 da base MIT-BIH, utilizando Árvore de Decisão, rede neural Multilayer Perceptron e Deep Neural Network com dois tipos de balanceamento da base de dados para a classificação de 10 arritmias. Os algoritmos foram treinados utilizando 5-fold stratified cross-validation e sua performance, em F1-Score, foram submetidos à análise estatística, tendo a Deep Neural Network, em ambas as bases, obtido o melhor desempenho.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-07-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"45416008","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Diagnosticando Tuberculose com Redes Neurais Artificiais e Recursos BPPC 利用人工神经网络和BPPC资源诊断结核病
Pub Date : 2023-07-20 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1106
Afonso Ueslei Fonseca, Juliana Paula Félix, Gabriel Silva Vieira, Bruno Moraes Rocha, E. Nogueira, C. E. Araújo, D. Fernandes, F. Soares
Tuberculose é uma doença grave e contagiosa que mata milhões de pessoas, sendo um problema de saúde pública global. Enquanto isso, o uso da Inteligência Artificial na radiologia tem despertado crescente interesse de pesquisadores e da indústria. Soluções para auxiliar no diagnóstico já são uma realidade, mas ainda distante de populações vulneráveis e regiões subdesenvolvidas. Logo, soluções acessíveis são essenciais para populações altamente dependentes de ações e serviços públicos. Assim, propomos um método de baixo custo computacional e alta eficiência para auxiliar no diagnóstico de tuberculose. Utilizamos imagens de radiografia torácicas e construímos um modelo de rede neural artificial com recursos BPPC com e sem a geração de dados sintéticos. Os resultados equivalentes à literatura relacionada mostram o desempenho excepcional e de baixo custo da solução, colocando-a como uma solução alternativa viável.
结核病是一种严重的传染性疾病,造成数百万人死亡,是一个全球公共卫生问题。与此同时,人工智能在放射学中的应用引起了研究人员和工业界越来越多的兴趣。帮助诊断的解决方案已经成为现实,但距离脆弱人口和欠发达地区仍有很长的路要走。因此,负担得起的解决方案对高度依赖公共行动和服务的人口至关重要。因此,我们提出了一种计算成本低、效率高的结核病诊断方法。我们使用胸片图像,建立了一个具有BPPC功能的人工神经网络模型,有或没有合成数据生成。与相关文献的等效结果表明,该解决方案具有优异的性能和低成本,是一种可行的替代方案。
{"title":"Diagnosticando Tuberculose com Redes Neurais Artificiais e Recursos BPPC","authors":"Afonso Ueslei Fonseca, Juliana Paula Félix, Gabriel Silva Vieira, Bruno Moraes Rocha, E. Nogueira, C. E. Araújo, D. Fernandes, F. Soares","doi":"10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1106","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1106","url":null,"abstract":"Tuberculose é uma doença grave e contagiosa que mata milhões de pessoas, sendo um problema de saúde pública global. Enquanto isso, o uso da Inteligência Artificial na radiologia tem despertado crescente interesse de pesquisadores e da indústria. Soluções para auxiliar no diagnóstico já são uma realidade, mas ainda distante de populações vulneráveis e regiões subdesenvolvidas. Logo, soluções acessíveis são essenciais para populações altamente dependentes de ações e serviços públicos. Assim, propomos um método de baixo custo computacional e alta eficiência para auxiliar no diagnóstico de tuberculose. Utilizamos imagens de radiografia torácicas e construímos um modelo de rede neural artificial com recursos BPPC com e sem a geração de dados sintéticos. Os resultados equivalentes à literatura relacionada mostram o desempenho excepcional e de baixo custo da solução, colocando-a como uma solução alternativa viável.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-07-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"45253570","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Registros multiprofissionais antes e depois da implantação de sistema informatizado sobre sepse 脓毒症计算机化系统实施前后的多专业记录
Pub Date : 2023-07-20 DOI: 10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1081
Luciana Schleder Gonçalves, Maria Luiza de Medeiros Amaro
Objetivo: Comparar os registros multiprofissionais de preenchimento do protocolo institucional de sepse no prontuário eletrônico, antes e depois da implantação de um sistema informatizado de alerta. Método: Foi empregado o método de estudo quasi experimental, sem grupo controle e com desenho pré e pós intervenção, em que foram comparados os registros da equipe multidisciplinar de um hospital do sul do Brasil com prontuário eletrônico. Resultados: A amostra compreendeu 209 protocolos: 107 do período anterior (janeiro a maio/2018) e 102 do período após (julho a novembro/2018) a implantação do sistema informatizado de alertas. No período pós implantação do sistema foram identificados resultados significativos na frequência e média de verificação de sinais vitais por paciente (p<0,001).Conclusão: Houve diferença no cumprimento dos registros de preenchimento do protocolo institucional de sepse após a implantação do sistema informatizado de alerta.
目的:比较在实施计算机警报系统之前和之后,电子病历中完成机构败血症方案的多专业记录。方法:采用准实验研究方法,不设对照组,采用干预前后设计,将巴西南部一家医院多学科团队的记录与电子病历进行比较。结果:样本包括209个方案:前一时期(2018年1月至5月)的107个方案和实施计算机警报系统后(2018年7月至11月)的102个方案。在该系统实施后的一段时间内,每个患者的生命体征验证频率和平均值都有显著结果(p<0.001)。结论:在实施计算机警报系统后,对机构败血症方案完成记录的遵守情况存在差异。
{"title":"Registros multiprofissionais antes e depois da implantação de sistema informatizado sobre sepse","authors":"Luciana Schleder Gonçalves, Maria Luiza de Medeiros Amaro","doi":"10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1081","DOIUrl":"https://doi.org/10.59681/2175-4411.v15.iespecial.2023.1081","url":null,"abstract":"Objetivo: Comparar os registros multiprofissionais de preenchimento do protocolo institucional de sepse no prontuário eletrônico, antes e depois da implantação de um sistema informatizado de alerta. Método: Foi empregado o método de estudo quasi experimental, sem grupo controle e com desenho pré e pós intervenção, em que foram comparados os registros da equipe multidisciplinar de um hospital do sul do Brasil com prontuário eletrônico. Resultados: A amostra compreendeu 209 protocolos: 107 do período anterior (janeiro a maio/2018) e 102 do período após (julho a novembro/2018) a implantação do sistema informatizado de alertas. No período pós implantação do sistema foram identificados resultados significativos na frequência e média de verificação de sinais vitais por paciente (p<0,001).Conclusão: Houve diferença no cumprimento dos registros de preenchimento do protocolo institucional de sepse após a implantação do sistema informatizado de alerta.","PeriodicalId":91119,"journal":{"name":"Journal of health informatics","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-07-20","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"42613593","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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Journal of health informatics
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