Pub Date : 2021-08-31DOI: 10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.11
D. Harahap
Bacteria can symbiotic mutualism and synergize with plants in the tissue and do not cause harm to plants. On the other hand, bacteria resistance provides an opportunity to search for antibacterials from natural material without threatening plant biodiversity. The purpose of this study was to characterize and test the antibacterial activity of endophytic bacteria from the fruit of the Arecaceae family against antibiotic-resistant bacteria Escherichia coli. The method used was direct culture on the growth of media in the laboratory by first sterilizing the surface of the flesh of the samples, such as Aren (Arenga pinnata), Coconut (Cocos nucifera), and Sago (Metroxylon sagu). The pure isolates obtained were characterized according to Bergeys Manual for Identification by performing Gram stain, catalase, and coagulase test. The results obtained were five isolates with codes A1, A2, K, S1, and S2 with variation in morphology colonies. Gram staining, catalase, and coagulase verification of the five isolates were groups of Grampositive cocci, catalase-positive, and coagulase-negative bacteria. Based on tests carried out on the characters of the endophytic bacteria, it was obtained a close relationship with the genus Staphylococcus. The results of the inhibitory activity test showed that Staphylococcus sp. K with the highest criteria of 43.26 mm and Staphylococcus sp. A1 with the lowest inhibition criteria with a value of 24.73 mm. Both are categorized as very strong inhibition criteria.
{"title":"Characterization and Antibacterial Activity of Endophytic Bacteria from Flesh Fruit of the Arecaceae Family Against Antibiotic Resistant Bacteria Escherichia coli","authors":"D. Harahap","doi":"10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.11","DOIUrl":"https://doi.org/10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.11","url":null,"abstract":"Bacteria can symbiotic mutualism and synergize with plants in the tissue and do not cause harm to plants. On the other hand, bacteria resistance provides an opportunity to search for antibacterials from natural material without threatening plant biodiversity. The purpose of this study was to characterize and test the antibacterial activity of endophytic bacteria from the fruit of the Arecaceae family against antibiotic-resistant bacteria Escherichia coli. The method used was direct culture on the growth of media in the laboratory by first sterilizing the surface of the flesh of the samples, such as Aren (Arenga pinnata), Coconut (Cocos nucifera), and Sago (Metroxylon sagu). The pure isolates obtained were characterized according to Bergeys Manual for Identification by performing Gram stain, catalase, and coagulase test. The results obtained were five isolates with codes A1, A2, K, S1, and S2 with variation in morphology colonies. Gram staining, catalase, and coagulase verification of the five isolates were groups of Grampositive cocci, catalase-positive, and coagulase-negative bacteria. Based on tests carried out on the characters of the endophytic bacteria, it was obtained a close relationship with the genus Staphylococcus. The results of the inhibitory activity test showed that Staphylococcus sp. K with the highest criteria of 43.26 mm and Staphylococcus sp. A1 with the lowest inhibition criteria with a value of 24.73 mm. Both are categorized as very strong inhibition criteria.","PeriodicalId":9004,"journal":{"name":"Biotropika: Journal of Tropical Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2021-08-31","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"76649388","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2021-08-31DOI: 10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.07
S. C. Febriansyah, C. Retnaningdyah
Catfish is a freshwater fish that is widely cultivated but overfeeding causes organic pollution. This study aims to evaluate the water quality profile based on physicochemical and plankton as bioindicators in catfish ponds in Gondosuli Village, Tulungagung Regency. This type of research was ex post facto by monitoring the physicochemical parameters of water and the structure of the plankton community in control ponds, ponds with catfish aged <1 month, 2-3 months, and 3-4 months each with three replications. Water samples for each pond were measured on the physicochemical water quality included water temperature, conductivity, pH, water transparency, DO, BOD, and turbidity. Plankton identified and analyzed to determine community structure (Abundance, Frequency, Relative Abundance, Relative Frequency, Important Value Index) and biotic index (H', TDI, and %PTV) for water quality. The results of measurements of each physicochemical parameter between locations were statistically analyzed inferentially using a different test. The interaction between the plankton community structure and the physicochemical of water quality was analyzed using biplots. The results showed that ponds with the age of catfish ready to harvest had an impact on decreasing water quality. This condition was indicated by the high organic matter pollution reflected by the high BOD, high turbidity levels, and low DO values. Catfish pond waters quality based on the H' value of plankton community showed that organic matter pollution had not yet occurred. Based on TDI values, catfish pond waters were categorized as poor status (hyper eutrophic) and based on the %PTV index in ponds with catfish age 2-3 and 3-4 months were classified as high levels of organic matter pollution.
{"title":"Evaluation of The Effect of Age of Cultivation of Dumbo Catfish (Clarias gariepinus) on Changes in Pond Water Quality Using Plankton as Bioindicator in Gondosuli Village, Tulungagung Regency","authors":"S. C. Febriansyah, C. Retnaningdyah","doi":"10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.07","DOIUrl":"https://doi.org/10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.07","url":null,"abstract":"Catfish is a freshwater fish that is widely cultivated but overfeeding causes organic pollution. This study aims to evaluate the water quality profile based on physicochemical and plankton as bioindicators in catfish ponds in Gondosuli Village, Tulungagung Regency. This type of research was ex post facto by monitoring the physicochemical parameters of water and the structure of the plankton community in control ponds, ponds with catfish aged <1 month, 2-3 months, and 3-4 months each with three replications. Water samples for each pond were measured on the physicochemical water quality included water temperature, conductivity, pH, water transparency, DO, BOD, and turbidity. Plankton identified and analyzed to determine community structure (Abundance, Frequency, Relative Abundance, Relative Frequency, Important Value Index) and biotic index (H', TDI, and %PTV) for water quality. The results of measurements of each physicochemical parameter between locations were statistically analyzed inferentially using a different test. The interaction between the plankton community structure and the physicochemical of water quality was analyzed using biplots. The results showed that ponds with the age of catfish ready to harvest had an impact on decreasing water quality. This condition was indicated by the high organic matter pollution reflected by the high BOD, high turbidity levels, and low DO values. Catfish pond waters quality based on the H' value of plankton community showed that organic matter pollution had not yet occurred. Based on TDI values, catfish pond waters were categorized as poor status (hyper eutrophic) and based on the %PTV index in ponds with catfish age 2-3 and 3-4 months were classified as high levels of organic matter pollution.","PeriodicalId":9004,"journal":{"name":"Biotropika: Journal of Tropical Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2021-08-31","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"90030684","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2021-08-31DOI: 10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.04
Novianti Adi Rohmanna, Nurul Azizah, N. Hidayat
Industri susu merupakan salah satu industri penghasil limbah cair yang cukup besar. Pengolahan produk susu untuk setiap produk yang berbeda menghasilkan limbah cair dengan karakteristik yang berbeda pula dan berdampak pada lingkungan. Hal tersebut membutuhkan perhatian lebih terkait penanganan limbah cair yang sesuai. Tujuan dari naskah ini adalah untuk meninjau tentang teknologi penanganan limbah cair industri pengolahan susu secara biologis dari berbagai penelitian yang telah ada. Sumber dan karakteristik limbah cair industri pengolahan susu, opsi penanganan dan teknologi pengolahannya dideskripsikan. Penanganan secara biologis berupa penanganan aerobik dan anaerobik merupakan teknologi penanganan yang umum dilakukan pada limbah cair industri pengolahan susu dengan kelebihan dan kelemahan masing-masing dijelaskan secara detail. Berdasarkan pendekatan tersebut, pengolahan limbah cair pada industri susu lebih efektif dengan metode anaerob
{"title":"Teknologi Penanganan Limbah Cair Industri Pengolahan Susu Sapi Secara Biologis: Artikel Review","authors":"Novianti Adi Rohmanna, Nurul Azizah, N. Hidayat","doi":"10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.04","DOIUrl":"https://doi.org/10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.04","url":null,"abstract":"Industri susu merupakan salah satu industri penghasil limbah cair yang cukup besar. Pengolahan produk susu untuk setiap produk yang berbeda menghasilkan limbah cair dengan karakteristik yang berbeda pula dan berdampak pada lingkungan. Hal tersebut membutuhkan perhatian lebih terkait penanganan limbah cair yang sesuai. Tujuan dari naskah ini adalah untuk meninjau tentang teknologi penanganan limbah cair industri pengolahan susu secara biologis dari berbagai penelitian yang telah ada. Sumber dan karakteristik limbah cair industri pengolahan susu, opsi penanganan dan teknologi pengolahannya dideskripsikan. Penanganan secara biologis berupa penanganan aerobik dan anaerobik merupakan teknologi penanganan yang umum dilakukan pada limbah cair industri pengolahan susu dengan kelebihan dan kelemahan masing-masing dijelaskan secara detail. Berdasarkan pendekatan tersebut, pengolahan limbah cair pada industri susu lebih efektif dengan metode anaerob","PeriodicalId":9004,"journal":{"name":"Biotropika: Journal of Tropical Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2021-08-31","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"82968181","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2021-08-31DOI: 10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.08
F. Fatchiyah, E. Suyanto, R. N. Rohmah, Lidwina Faraline Triprisila, H. N. Meidinna, Dewi Ratih Tirto Sari, Iva Himmatul Aliyah
The aim of this study was to make animal dyslipidemia models in Sprague Dawley strains induced by a high fat goat diet formula as hypercholesterol feed for two months. The experimental animal used in this study was 30 male rats (Rattus norvegicus strain Sprague Dawley) with an age of 2-3 months with an average body weight of 150g. Animal models are divided into two groups consisting of a control group without additional diet and dyslipidemia group given food consumption goat hypercholesterolemia with high-fat diet formula orally every day for two months. Physiological characteristics of dyslipidemia SD rats had higher body weight, increased food consumption and fecal weight, and decreased water intake and urine volume than the control group. Total cholesterol, triglyceride, and LDL-cholesterol levels increased, while HDL-cholesterol levels did not change in the dyslipidemia rats group compared to the control group. The conclusion of this study indicated that the hypercholesterol diet formula with a high composition of goat fat was successfully induced the SD rats to become dyslipidemia model rat with specific hypercholerol characteristics.
{"title":"Oral Administration of The Hypercholesterol Rat Feed Formula to Making The Animal Dyslipidemia Model on Sprague Dawley Rats","authors":"F. Fatchiyah, E. Suyanto, R. N. Rohmah, Lidwina Faraline Triprisila, H. N. Meidinna, Dewi Ratih Tirto Sari, Iva Himmatul Aliyah","doi":"10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.08","DOIUrl":"https://doi.org/10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.08","url":null,"abstract":"The aim of this study was to make animal dyslipidemia models in Sprague Dawley strains induced by a high fat goat diet formula as hypercholesterol feed for two months. The experimental animal used in this study was 30 male rats (Rattus norvegicus strain Sprague Dawley) with an age of 2-3 months with an average body weight of 150g. Animal models are divided into two groups consisting of a control group without additional diet and dyslipidemia group given food consumption goat hypercholesterolemia with high-fat diet formula orally every day for two months. Physiological characteristics of dyslipidemia SD rats had higher body weight, increased food consumption and fecal weight, and decreased water intake and urine volume than the control group. Total cholesterol, triglyceride, and LDL-cholesterol levels increased, while HDL-cholesterol levels did not change in the dyslipidemia rats group compared to the control group. The conclusion of this study indicated that the hypercholesterol diet formula with a high composition of goat fat was successfully induced the SD rats to become dyslipidemia model rat with specific hypercholerol characteristics.","PeriodicalId":9004,"journal":{"name":"Biotropika: Journal of Tropical Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2021-08-31","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"85033371","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2021-08-31DOI: 10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.06
Handi Prasetyo, Abdul Rahman Singkam, Hilman Fauzi, Muhammad Izzudin Al Qosam
Pekarangan merupakan ruang terbuka hijau yang berada di antara rumah atau gedung dan difungsikan sebagai lahan untuk menanam. Pekarangan dapat juga difungsikan sebagai tempat konservasi keanekaragaman hayati. Struktur tanaman pekarangan biasanya dipengaruhi faktor iklim, edafik, dan sosial budaya masyarakat sekitar. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis hubungan keanekaragaman tanaman pekarangan terhadap pola budaya masyarakat setempat. Pengumpulan data dilakukan melalui identifikasi spesies tanaman di lahan pekarangan dan penentuan nilai indeks kepentingan setiap spesies yang ditemukan. Pengambilan data dilakukan pada tiga daerah dengan pola budaya yang berbeda yaitu di Pematangsiantar untuk Suku Batak, di Ciracas Jakarta Timur untuk Suku Betawi, dan di Cibadak Sukabumi untuk Suku Sunda. Analisis data dilakukan dalam bentuk perhitungan nilai indeks keanekaragaman spesies Shannon-Wiener, indeks kemerataan (evenness), dan indeks kepentingan budaya (ICS). Hasil analisis menunjukkan nilai indeks keanekaragaman spesies tertinggi terdapat di Cibadak sebesar 2,48 sedangkan nilai kemerataan spesies tertinggi adalah di Ciracas dengan nilai sempurna yaitu 1. Nilai ICS tertinggi pada masing-masing lokasi adalah cokelat di Pematangsiantar dengan nilai 72, pepaya, jambu bol, dan mangga di Cibadak dengan nilai 21, dan kelapa di Ciracas dengan nilai 18. Spesies tanaman yang ditemukan di ketiga lokasi umumnya adalah tanaman budidaya, buah-buahan dan perkebunan. Fungsi tanaman pekarangan di Pematangsiantar terutama sebagai sumber pendapatan tambahan, di Cibadak sebagai sumber makanan tambahan, sedangkan di Ciracas terutama sebagai penghias rumah atau tempat berteduh.
{"title":"Hubungan Antara Keanekaragaman Tanaman Pekarangan Dengan Pola Sosial Budaya Masyarakat Setempat","authors":"Handi Prasetyo, Abdul Rahman Singkam, Hilman Fauzi, Muhammad Izzudin Al Qosam","doi":"10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.06","DOIUrl":"https://doi.org/10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.06","url":null,"abstract":"Pekarangan merupakan ruang terbuka hijau yang berada di antara rumah atau gedung dan difungsikan sebagai lahan untuk menanam. Pekarangan dapat juga difungsikan sebagai tempat konservasi keanekaragaman hayati. Struktur tanaman pekarangan biasanya dipengaruhi faktor iklim, edafik, dan sosial budaya masyarakat sekitar. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis hubungan keanekaragaman tanaman pekarangan terhadap pola budaya masyarakat setempat. Pengumpulan data dilakukan melalui identifikasi spesies tanaman di lahan pekarangan dan penentuan nilai indeks kepentingan setiap spesies yang ditemukan. Pengambilan data dilakukan pada tiga daerah dengan pola budaya yang berbeda yaitu di Pematangsiantar untuk Suku Batak, di Ciracas Jakarta Timur untuk Suku Betawi, dan di Cibadak Sukabumi untuk Suku Sunda. Analisis data dilakukan dalam bentuk perhitungan nilai indeks keanekaragaman spesies Shannon-Wiener, indeks kemerataan (evenness), dan indeks kepentingan budaya (ICS). Hasil analisis menunjukkan nilai indeks keanekaragaman spesies tertinggi terdapat di Cibadak sebesar 2,48 sedangkan nilai kemerataan spesies tertinggi adalah di Ciracas dengan nilai sempurna yaitu 1. Nilai ICS tertinggi pada masing-masing lokasi adalah cokelat di Pematangsiantar dengan nilai 72, pepaya, jambu bol, dan mangga di Cibadak dengan nilai 21, dan kelapa di Ciracas dengan nilai 18. Spesies tanaman yang ditemukan di ketiga lokasi umumnya adalah tanaman budidaya, buah-buahan dan perkebunan. Fungsi tanaman pekarangan di Pematangsiantar terutama sebagai sumber pendapatan tambahan, di Cibadak sebagai sumber makanan tambahan, sedangkan di Ciracas terutama sebagai penghias rumah atau tempat berteduh.","PeriodicalId":9004,"journal":{"name":"Biotropika: Journal of Tropical Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2021-08-31","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"74351711","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Kawasan Pantai Pangandaran merupakan kawasan wisata dan penangkapan ikan bagi nelayan. Hasil tangkapan nelayan terdiri dari berbagai spesies ikan. Untuk mengetahui hasil tangkapan nelayan tersebut perlu dilakukan identifikasi spesies ikan. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi spesies ikan berdasarkan struktur morfologis dan morfometrik. Metode penelitian yang dilakukan yaitu pengamatan secara morfologis dan morfometrik menggunakan sampel ikan masing-masing tiga ekor jenis ikan yang mewakili ikan terbanyak pada hasil tangkapan nelayan. Berdasarkan hasil identifikasi jenis ikan yang paling banyak dari hasil tangkapan nelayan didapat spesies ikan laut Kembung (Rastrelliger brachysoma) yang memiliki ekor berwarna kuning; ikan Talang (Scomberoides tol) yang memiliki corak keperakkan di sepanjang tubuh; dan ikan Kakapasan (Geres punctatus) yang memiliki bentuk mulut superior yang khas. Berdasarkan pengukuran morfometrik terdapat spesies ikan yang memiliki ukuran paling besar yaitu ikan laut Kembung (R. brachysoma) dengan panjang total 25,1 cm dan berat rata-rata 215 g. Kesimpulan penelitian menunjukkan bahwa hasil tangkapan nelayan di Pantai Timur Pananjung Pangandaran berdasarkan hasil identifikasi terdapat tiga jenis ikan yang paling dominan untuk itu perlu dilakukan pemeliharaan kawasan agar memungkinkan berbagai jenis ikan dapat berkembang biak.
{"title":"Identifikasi Ikan Hasil Tangkapan Nelayan di Pantai Timur Pananjung Pangandaran","authors":"Kartiawati Alipin, Nining Ratningsih, Retnaningtyas Siska Dianty","doi":"10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.05","DOIUrl":"https://doi.org/10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.05","url":null,"abstract":"Kawasan Pantai Pangandaran merupakan kawasan wisata dan penangkapan ikan bagi nelayan. Hasil tangkapan nelayan terdiri dari berbagai spesies ikan. Untuk mengetahui hasil tangkapan nelayan tersebut perlu dilakukan identifikasi spesies ikan. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi spesies ikan berdasarkan struktur morfologis dan morfometrik. Metode penelitian yang dilakukan yaitu pengamatan secara morfologis dan morfometrik menggunakan sampel ikan masing-masing tiga ekor jenis ikan yang mewakili ikan terbanyak pada hasil tangkapan nelayan. Berdasarkan hasil identifikasi jenis ikan yang paling banyak dari hasil tangkapan nelayan didapat spesies ikan laut Kembung (Rastrelliger brachysoma) yang memiliki ekor berwarna kuning; ikan Talang (Scomberoides tol) yang memiliki corak keperakkan di sepanjang tubuh; dan ikan Kakapasan (Geres punctatus) yang memiliki bentuk mulut superior yang khas. Berdasarkan pengukuran morfometrik terdapat spesies ikan yang memiliki ukuran paling besar yaitu ikan laut Kembung (R. brachysoma) dengan panjang total 25,1 cm dan berat rata-rata 215 g. Kesimpulan penelitian menunjukkan bahwa hasil tangkapan nelayan di Pantai Timur Pananjung Pangandaran berdasarkan hasil identifikasi terdapat tiga jenis ikan yang paling dominan untuk itu perlu dilakukan pemeliharaan kawasan agar memungkinkan berbagai jenis ikan dapat berkembang biak.","PeriodicalId":9004,"journal":{"name":"Biotropika: Journal of Tropical Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2021-08-31","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"90570258","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Kabau (Archidendron bubalinum) merupakan tumbuhan yang termasuk famili Leguminosae berbentuk pohon dan menghasilkan biji berwarna hijau. Masyarakat Bengkulu memanfaatkan buah kabau sebagai lalapan. Bagian kulit buah tumbuhan kabau berpotensi sebagai antifungi Candida albicans karena mengandung senyawa fitokimia. C. albicans merupakan salah satu mikroorganisme patogen penyebab infeksi seperti kandidiasis, sariawan, lesi pada kulit, dan vulvovaginitis. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi ekstrak kulit buah kabau sebagai antifungi serta mengetahui konsentrasi ekstrak yang optimal dalam menghambat pertumbuhan fungi. Ekstrak kulit buah kabau diuji pada fungi C. albicans dengan metode difusi menggunakan kertas cakram pada media Sabouraud Dextrose Agar (SDA). Ekstrak kulit buah kabau dilarutkan dengan pelarut aquades dan dimetil sulfoksida 2% pada konsentrasi ekstrak 5%, 10%, 20%, 40% dan 80%. Hasil penelitian menunjukkan konsentrasi 40% dengan pelarut aquades yang paling efektif dalam menghambat pertumbuhan fungi C. albicans dengan diameter daya hambat 4,05 mm. Dari data hasil penelitian tersebut, maka dapat disimpulkan bahwa ekstrak kulit buah kabau berpotensi sebagai antifungi C. albicans.
{"title":"Potensi Pemanfaatan Kulit Buah Kabau (Archidendron bubalinum) sebagai Antifungi Candida albicans ATCC 10231","authors":"Rizka Fitria Ningrum, Sipriyadi Sipriyadi, Euis Nursa’adah","doi":"10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.03","DOIUrl":"https://doi.org/10.21776/ub.biotropika.2021.009.02.03","url":null,"abstract":"Kabau (Archidendron bubalinum) merupakan tumbuhan yang termasuk famili Leguminosae berbentuk pohon dan menghasilkan biji berwarna hijau. Masyarakat Bengkulu memanfaatkan buah kabau sebagai lalapan. Bagian kulit buah tumbuhan kabau berpotensi sebagai antifungi Candida albicans karena mengandung senyawa fitokimia. C. albicans merupakan salah satu mikroorganisme patogen penyebab infeksi seperti kandidiasis, sariawan, lesi pada kulit, dan vulvovaginitis. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi ekstrak kulit buah kabau sebagai antifungi serta mengetahui konsentrasi ekstrak yang optimal dalam menghambat pertumbuhan fungi. Ekstrak kulit buah kabau diuji pada fungi C. albicans dengan metode difusi menggunakan kertas cakram pada media Sabouraud Dextrose Agar (SDA). Ekstrak kulit buah kabau dilarutkan dengan pelarut aquades dan dimetil sulfoksida 2% pada konsentrasi ekstrak 5%, 10%, 20%, 40% dan 80%. Hasil penelitian menunjukkan konsentrasi 40% dengan pelarut aquades yang paling efektif dalam menghambat pertumbuhan fungi C. albicans dengan diameter daya hambat 4,05 mm. Dari data hasil penelitian tersebut, maka dapat disimpulkan bahwa ekstrak kulit buah kabau berpotensi sebagai antifungi C. albicans.","PeriodicalId":9004,"journal":{"name":"Biotropika: Journal of Tropical Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2021-08-31","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"74151842","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2021-04-30DOI: 10.21776/UB.BIOTROPIKA.2021.009.01.09
Syamsidar Gaffar, Sumarlin Sumarlin, M. Haryono, Harisna Pidar
Pari yang diperdagangkan di Tempat Penampungan Ikan (TPI) Tarakan perlu diketahui jenisnya. Hal ini merupakan langkah awal agar jenis pari yang tergolong dilindungi atau populasinya telah berkurang di alam dapat dihindari untuk diperdagangkan. Penelitian ini dilakukan dengan tujuan untuk mengungkap spesies pari layang-layang yang diperdagangkan dari TPI Gunung Lingkas, Tarakan, Kalimantan Utara, dengan menggunakan metode pengidentifikasian secara molekuler (DNA barcoding) dan menentukan status konservasinya. Berdasarkan hasil BLAST, sampel teridentifikasi memiliki kemiripan 99,80% dengan spesies Aetoplatea zonura isolate GZON2. Hasil BOLD-IDS juga memberikan persentase kemiripan sebesar 99,8% dengan spesies Gymnura zonura (sinonim A. zonura). Nilai kemiripan >98% menjelaskan bahwa homologi sekuen berada pada tingkat spesies sehingga sampel yang diidentifikasi merupakan G. zonura. Hasil analisis filogenetik dengan menggunakan tiga metode analisis yaitu NJ, ML, dan ME menempatkan sampel ray-T2, G. zonura, dan G. cf zonura konsisten berada pada kelompok yang sama (monofiletik). Artinya, sampel ray-T2 berkerabat dekat dengan G. zonura. Status konservasi G. zonura terkategori vulnerable (vu) di laman IUCN yang berarti spesies ini sedang menghadapi risiko kepunahan di alam sedangkan status pada CITES masih dalam posisi belum terevaluasi.
{"title":"Penentuan Jenis dan Status Konservasi Pari Layang-Layang yang Didaratkan Di TPI Gunung Lingkas Kota Tarakan Dengan Pendekatan Molekuler","authors":"Syamsidar Gaffar, Sumarlin Sumarlin, M. Haryono, Harisna Pidar","doi":"10.21776/UB.BIOTROPIKA.2021.009.01.09","DOIUrl":"https://doi.org/10.21776/UB.BIOTROPIKA.2021.009.01.09","url":null,"abstract":"Pari yang diperdagangkan di Tempat Penampungan Ikan (TPI) Tarakan perlu diketahui jenisnya. Hal ini merupakan langkah awal agar jenis pari yang tergolong dilindungi atau populasinya telah berkurang di alam dapat dihindari untuk diperdagangkan. Penelitian ini dilakukan dengan tujuan untuk mengungkap spesies pari layang-layang yang diperdagangkan dari TPI Gunung Lingkas, Tarakan, Kalimantan Utara, dengan menggunakan metode pengidentifikasian secara molekuler (DNA barcoding) dan menentukan status konservasinya. Berdasarkan hasil BLAST, sampel teridentifikasi memiliki kemiripan 99,80% dengan spesies Aetoplatea zonura isolate GZON2. Hasil BOLD-IDS juga memberikan persentase kemiripan sebesar 99,8% dengan spesies Gymnura zonura (sinonim A. zonura). Nilai kemiripan >98% menjelaskan bahwa homologi sekuen berada pada tingkat spesies sehingga sampel yang diidentifikasi merupakan G. zonura. Hasil analisis filogenetik dengan menggunakan tiga metode analisis yaitu NJ, ML, dan ME menempatkan sampel ray-T2, G. zonura, dan G. cf zonura konsisten berada pada kelompok yang sama (monofiletik). Artinya, sampel ray-T2 berkerabat dekat dengan G. zonura. Status konservasi G. zonura terkategori vulnerable (vu) di laman IUCN yang berarti spesies ini sedang menghadapi risiko kepunahan di alam sedangkan status pada CITES masih dalam posisi belum terevaluasi.","PeriodicalId":9004,"journal":{"name":"Biotropika: Journal of Tropical Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2021-04-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"90548716","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2021-04-23DOI: 10.21776/UB.BIOTROPIKA.2021.009.01.07
Enny Sudarmonowati, N. Rahman, N. S. Hartati
Kriopreservasi (penyimpanan dalam -198ºC) merupakan pilihan untuk menyimpan dalam jangka panjang bahan tanaman ubi kayu yang selama ini menggunakan “shoot tips” atau “axilary buds” dari planlet in vitro. Penggunaan mata tunas dari batang ubi kayu merupakan yang pertama dan berhasil diregenerasikan menjadi tanaman setelah penyimpanan di tangki nitrogen. Beragam faktor yang mempengaruhi keberhasilan kriopreservasi yaitu jenis bahan tanaman ubi kayu (stek super mini, mata tunas tanpa atau dengan bagian batang, mata tunas belum merekah atau merekah) empat genotip ubi kayu lokal Indonesia (Manggu, Mentega 2, Kristal Merah, Nangka), komposisi larutan krioprotektan 87% gliserol, 5% DMSO atau 10% DMSO sendiri atau dikombinasikan, metoda pencairan (thawing), lama penyimpanan dalam nitrogen cair (45 menit atau 3 minggu) serta metode dan media regenerasi (secara in vitro dengan media MS, di tissue yang dibasahi air atau larutan hara makro MS). Daya hidup tertinggi (40%) adalah mata tunas merekah tanpa bagian batang genotip Manggu dan Nangka yang direndam dalam larutan kombinasi 87% gliserol dan 5% DMSO yang yang dicairkan cepat dalam water bath, dibiakkan pada tissue lembab setelah disimpan dalam nitrogen cair 3 minggu. Hasil penelitian ini mempermudah dan mempersingkat prosedur kriopreservasi bagian tanaman ubi kayu sehingga dapat mendukung pelestarian plasma nutfah dalam jangka panjang.
{"title":"KRIOPRESERVASI MATA TUNAS UBI KAYU LOKAL INDONESIA: FAKTOR PENENTU KEBERHASILAN","authors":"Enny Sudarmonowati, N. Rahman, N. S. Hartati","doi":"10.21776/UB.BIOTROPIKA.2021.009.01.07","DOIUrl":"https://doi.org/10.21776/UB.BIOTROPIKA.2021.009.01.07","url":null,"abstract":"Kriopreservasi (penyimpanan dalam -198ºC) merupakan pilihan untuk menyimpan dalam jangka panjang bahan tanaman ubi kayu yang selama ini menggunakan “shoot tips” atau “axilary buds” dari planlet in vitro. Penggunaan mata tunas dari batang ubi kayu merupakan yang pertama dan berhasil diregenerasikan menjadi tanaman setelah penyimpanan di tangki nitrogen. Beragam faktor yang mempengaruhi keberhasilan kriopreservasi yaitu jenis bahan tanaman ubi kayu (stek super mini, mata tunas tanpa atau dengan bagian batang, mata tunas belum merekah atau merekah) empat genotip ubi kayu lokal Indonesia (Manggu, Mentega 2, Kristal Merah, Nangka), komposisi larutan krioprotektan 87% gliserol, 5% DMSO atau 10% DMSO sendiri atau dikombinasikan, metoda pencairan (thawing), lama penyimpanan dalam nitrogen cair (45 menit atau 3 minggu) serta metode dan media regenerasi (secara in vitro dengan media MS, di tissue yang dibasahi air atau larutan hara makro MS). Daya hidup tertinggi (40%) adalah mata tunas merekah tanpa bagian batang genotip Manggu dan Nangka yang direndam dalam larutan kombinasi 87% gliserol dan 5% DMSO yang yang dicairkan cepat dalam water bath, dibiakkan pada tissue lembab setelah disimpan dalam nitrogen cair 3 minggu. Hasil penelitian ini mempermudah dan mempersingkat prosedur kriopreservasi bagian tanaman ubi kayu sehingga dapat mendukung pelestarian plasma nutfah dalam jangka panjang.","PeriodicalId":9004,"journal":{"name":"Biotropika: Journal of Tropical Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2021-04-23","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"91396799","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2021-04-18DOI: 10.21776/UB.BIOTROPIKA.2021.009.01.04
N. Dewi, A. Kurnianto
The study aims to analyze the vertical and horizontal distribution of bird communities in agricultural areas and their interactions with the conservation area in MBNP. Research is carried out in agricultural areas in the Buffer zone, Rehabilitation Zone, and on the edge of the plantation. The research location was determined at 37 points: Rajekwesi (4), Sukamade (12), Bandealit (8), Wonoasri (5), Andongrejo (3), Sanenrejo (5). We applied the point count method (r = 17.5 m) in this study, where each point is at least 100-150 meters apart. In the study, 74.6% of records were birds with agricultural specialties and 71.30% of individuals using tree habitats. Birds with specialization in agriculture were found in large numbers related to the protection provided by the TNMB conservation area to bird habitat. Sukamade is the area with the highest number of records. As many as 40.10% were found in tree habitats. Followed by Seedling (16.28%), Pole (15.93%), Flying over (15.76%), and Sapling (11.90%).
{"title":"Buffer Zone Management Impact on Birds Assemblage in the High Nature Value Farmland (HNVf) : a study case on Meru Betiri National Park","authors":"N. Dewi, A. Kurnianto","doi":"10.21776/UB.BIOTROPIKA.2021.009.01.04","DOIUrl":"https://doi.org/10.21776/UB.BIOTROPIKA.2021.009.01.04","url":null,"abstract":"The study aims to analyze the vertical and horizontal distribution of bird communities in agricultural areas and their interactions with the conservation area in MBNP. Research is carried out in agricultural areas in the Buffer zone, Rehabilitation Zone, and on the edge of the plantation. The research location was determined at 37 points: Rajekwesi (4), Sukamade (12), Bandealit (8), Wonoasri (5), Andongrejo (3), Sanenrejo (5). We applied the point count method (r = 17.5 m) in this study, where each point is at least 100-150 meters apart. In the study, 74.6% of records were birds with agricultural specialties and 71.30% of individuals using tree habitats. Birds with specialization in agriculture were found in large numbers related to the protection provided by the TNMB conservation area to bird habitat. Sukamade is the area with the highest number of records. As many as 40.10% were found in tree habitats. Followed by Seedling (16.28%), Pole (15.93%), Flying over (15.76%), and Sapling (11.90%).","PeriodicalId":9004,"journal":{"name":"Biotropika: Journal of Tropical Biology","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2021-04-18","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"72868499","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
京公网安备 11010802042870号
京ICP备2023020795号-1
扫码关注我们
求助内容：
应助结果提醒方式：