首页 > 最新文献

Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika最新文献

英文 中文
Adaptive reactions of human embryo lung fibroblasts (HELF) to a fullerene derivative modified with 3-benzothienylalanine residues 人胚肺成纤维细胞(HELF)对用 3-苯并噻吩丙氨酸残基修饰的富勒烯衍生物的适应性反应
Pub Date : 2024-02-27 DOI: 10.25557/2073-7998.2024.01.3-18
С. В. Костюк, Е. М. Малиновская, Е. С. Ершова, Л. В. Каменева, Е.А. Савинова, С.Э. Костюк, Т.А. Салимова, А.В. Жиленков, О.А. Краевая, П.А. Трошин, В. Л. Ижевская, С. И. Куцев, Н. Н. Вейко
Исследовано влияние производного фуллерена с пятью присоединенными остатками 3-бензотиенилаланина и одним атомом водорода (Ф1) на функционирование фибробластов легких эмбриона человека (ФЛЭЧ). Показали, что Ф1 в течение 24 часов проникает в цитоплазму большинства клеток в популяции. Для исследования воздействия Ф1 на ФЛЭЧ выбраны две концентрации: 18,3 нг/мл, входящая в диапазон нетоксичных концентраций, и концентрация, близкая к повреждающей – 28 µг/мл, и три времени инкубации клеток с соединениями – 1, 3 и 24 часа. Обнаружили, что через 24 часа в присутствии низких концентраций Ф1 снижается уровень активных форм кислорода (АФК) в клетках, что обусловлено повышением экспрессии гена NRF2 и увеличением его функциональной активности. Соединение Ф1 в концентрации, близкой к токсичной, вызывает в культивируемых ФЛЭЧ повышение уровня экспрессии гена и белка NOX4, что приводит к синтезу АФК в клетках, к окислительным модификациям и двунитевым разрывам ДНК ядер клеток через 24 часа инкубации. Не обнаружено влияния Ф1 на уровень экспрессии гена и белка BRCA1 что, вероятно, способствует образованию в клетках и поддержанию на высоком уровне двунитевых разрывов ДНК через 24 часа инкубации. Повышение экспрессии антиапоптотических генов в ФЛЭЧ через 24 часа культивирования с Ф1 может способствовать выживанию клеток с поврежденной ДНК. We investigated the effort of fullerene derivative with five attached residues of 3-benzothienylalanine and one hydrogen atom (F1) on the functioning of the human embryonic lung fibroblasts (HELF). It was shown that F1 penetrates the cytoplasm of most cells in the population within 24 hours. To study the effect of F1 on HELF, two concentrations were selected: 18.3 ng/ml, which is in the range of non–toxic concentrations and a concentration close to damaging – 28 µg/ml and three incubation times of cells with compounds – 1, 3 and 24 hours. It was found that after 24 hours in the presence of low concentrations of F1, the level of ROS in cells decreases, which is due to an increase in the expression of the NRF2 gene and an increase in its functional activity. The F1 compound in a concentration close to toxic causes an increase in the expression level of the NOX4 gene and protein in cultured HELF, which leads to the synthesis of ROS in cells and oxidative modifications, and double-stranded DNA breaks of cell nuclei after 24 hours of incubations. There was no effect of F1 on the expression level of the BRCA1 gene and protein, which probably contributes to the formation of double-stranded DNA breaks in cells and maintenance at a high level after 24 hours of incubation. An increase in the expression of anti-apoptotic genes in HELF after 24 hours of cultivation with F1 may contribute to the survival of cells with damaged DNA.
研究了一种富勒烯衍生物(F1)对人胚肺成纤维细胞(HELF)功能的影响,该衍生物具有五个 3-苯并噻吩丙氨酸残基和一个氢原子。结果表明,F1 能在 24 小时内渗透到群体中大多数细胞的细胞质中。为了研究 F1 对 FLECs 的影响,我们选择了两种浓度:浓度分别为 18.3 纳克/毫升(在无毒浓度范围内)和 28 微克/毫升(接近破坏性浓度)。结果发现,在低浓度 F1 存在 24 小时后,细胞中的活性氧(ROS)水平下降,这是由于 NRF2 基因的表达增加,其功能活性提高。接近毒性浓度的化合物 F1 会导致培养的 hLECs 中 NOX4 基因和蛋白质的表达水平升高,从而导致细胞中 AFCs 的合成、氧化修饰和细胞核中 DNA 双链断裂。F1 对 BRCA1 基因和蛋白质的表达水平没有影响,这可能是培养 24 小时后细胞中 DNA 双链断裂形成和维持的原因。用 F1 培养 24 小时后,FLECs 中抗凋亡基因的表达增加,这可能有助于 DNA 损伤细胞的存活。我们研究了带有五个 3-苯并噻吩丙氨酸残基和一个氢原子的富勒烯衍生物(F1)对人胚肺成纤维细胞(HELF)功能的影响。研究表明,F1 可在 24 小时内渗透到群体中大多数细胞的细胞质中。为了研究 F1 对 HELF 的影响,选择了两种浓度:18.3 纳克/毫升(在无毒浓度范围内)和接近破坏性的浓度--28 微克/毫升,以及细胞与化合物的三个孵育时间--1、3 和 24 小时。研究发现,在低浓度 F1 存在 24 小时后,细胞中的 ROS 水平下降,这是由于 NRF2 基因的表达增加,其功能活性提高。浓度接近毒性的 F1 化合物会导致培养的 HELF 中 NOX4 基因和蛋白质的表达水平升高,从而导致细胞中 ROS 的合成和氧化修饰,并在培养 24 小时后导致细胞核的双链 DNA 断裂。F1 对 BRCA1 基因和蛋白质的表达水平没有影响,而 BRCA1 基因和蛋白质可能是细胞中双链 DNA 断裂形成的原因,并在培养 24 小时后保持在较高水平。用 F1 培养 24 小时后,HELF 中抗凋亡基因的表达量增加,这可能有助于 DNA 受损细胞的存活。
{"title":"Adaptive reactions of human embryo lung fibroblasts (HELF) to a fullerene derivative modified with 3-benzothienylalanine residues","authors":"С. В. Костюк, Е. М. Малиновская, Е. С. Ершова, Л. В. Каменева, Е.А. Савинова, С.Э. Костюк, Т.А. Салимова, А.В. Жиленков, О.А. Краевая, П.А. Трошин, В. Л. Ижевская, С. И. Куцев, Н. Н. Вейко","doi":"10.25557/2073-7998.2024.01.3-18","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2024.01.3-18","url":null,"abstract":"Исследовано влияние производного фуллерена с пятью присоединенными остатками 3-бензотиенилаланина и одним атомом водорода (Ф1) на функционирование фибробластов легких эмбриона человека (ФЛЭЧ). Показали, что Ф1 в течение 24 часов проникает в цитоплазму большинства клеток в популяции. Для исследования воздействия Ф1 на ФЛЭЧ выбраны две концентрации: 18,3 нг/мл, входящая в диапазон нетоксичных концентраций, и концентрация, близкая к повреждающей – 28 µг/мл, и три времени инкубации клеток с соединениями – 1, 3 и 24 часа. Обнаружили, что через 24 часа в присутствии низких концентраций Ф1 снижается уровень активных форм кислорода (АФК) в клетках, что обусловлено повышением экспрессии гена NRF2 и увеличением его функциональной активности. Соединение Ф1 в концентрации, близкой к токсичной, вызывает в культивируемых ФЛЭЧ повышение уровня экспрессии гена и белка NOX4, что приводит к синтезу АФК в клетках, к окислительным модификациям и двунитевым разрывам ДНК ядер клеток через 24 часа инкубации. Не обнаружено влияния Ф1 на уровень экспрессии гена и белка BRCA1 что, вероятно, способствует образованию в клетках и поддержанию на высоком уровне двунитевых разрывов ДНК через 24 часа инкубации. Повышение экспрессии антиапоптотических генов в ФЛЭЧ через 24 часа культивирования с Ф1 может способствовать выживанию клеток с поврежденной ДНК.\u0000 We investigated the effort of fullerene derivative with five attached residues of 3-benzothienylalanine and one hydrogen atom (F1) on the functioning of the human embryonic lung fibroblasts (HELF). It was shown that F1 penetrates the cytoplasm of most cells in the population within 24 hours. To study the effect of F1 on HELF, two concentrations were selected: 18.3 ng/ml, which is in the range of non–toxic concentrations and a concentration close to damaging – 28 µg/ml and three incubation times of cells with compounds – 1, 3 and 24 hours. It was found that after 24 hours in the presence of low concentrations of F1, the level of ROS in cells decreases, which is due to an increase in the expression of the NRF2 gene and an increase in its functional activity. The F1 compound in a concentration close to toxic causes an increase in the expression level of the NOX4 gene and protein in cultured HELF, which leads to the synthesis of ROS in cells and oxidative modifications, and double-stranded DNA breaks of cell nuclei after 24 hours of incubations. There was no effect of F1 on the expression level of the BRCA1 gene and protein, which probably contributes to the formation of double-stranded DNA breaks in cells and maintenance at a high level after 24 hours of incubation. An increase in the expression of anti-apoptotic genes in HELF after 24 hours of cultivation with F1 may contribute to the survival of cells with damaged DNA.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"50 6","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2024-02-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"140427634","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
The structure of the gene pool of the Tuvan tribal group Mongush according to data on Y-chromosome polymorphism 根据 Y 染色体多态性数据研究图瓦人蒙古斯部落群的基因库结构
Pub Date : 2024-02-27 DOI: 10.25557/2073-7998.2024.01.40-51
Л. Д. Дамба, В. Ю. Пылёв, Г.Ю. Пономарёв, Е. В. Балановская
В дискуссиях о происхождении наиболее многочисленной родовой группы тувинцев монгуш (57 тыс. чел.) преобладают две альтернативные гипотезы. Монгольская версия возводит их этногенез к монголам (или к пришлому населению из Центральной Азии). Тюркская гипотеза связывает их происхождение с местным автохтонным населением, перешедшим на тюркский язык. Цель данной работы по детальной структуре Y-хромосомы в увеличенной выборке изучить генофонд двух подгрупп монгуш (центральных и западных), определить степень их генетического сходства между собой, с генофондами других тувинских родов, популяций Южной Сибири и Монголии. Геногеографический анализ 187 представителей 4 родовых групп тувинцев (монгуш, ооржак, хертек, сат) по панели 60 SNP-маркеров Y-хромосомы включил создание карт распространения наиболее информативных гаплогрупп Y-хромосомы; расчет генетических расстояний между родами тувинцев и народонаселением Южной Сибири и Монголии; создание карт генетических расстояний от каждой родовой группы тувинцев. В генофондах 4 тувинских родов выявлено 13 информативных гаплогрупп Y-хромосомы: «северо-евразийских» N, Q; «западноевразийской» R1a; «восточно-евразийских» С2, D, O; «прочих» R2a, R1b, J2. Во всех родовых группах и «западно-евразийские», и «восточно-евразийские» гаплогруппы не превышают 13-20% генофонда. «Северо-евразийские» гаплогруппы составляют основную часть (60-68%) генофондов всех родов, но в разных пропорциях. Гаплогруппа N максимальна представлена у ооржак (2/3 генофонда), 42% – у монгуш и 1/3 генофонда – у родов сат и хертек. Обратная тенденция у гаплогруппы Q: 30% генофондов у сат и хертек, 16% у монгуш, 7% у ооржак. В генетическом пространстве Южной Сибири выявлены тувинско-тофаларский, алтайский и хакасский кластеры, демонстрирующие три предковых источника генофонда региона. Картографический атлас выявил сходство западных и центральных монгуш с другими тувинскими родами, указывающее на единство происхождения четырех тувинских родовых групп. Преобладание в генофондах обеих групп монгуш «североевразийских» гаплогрупп N и Q подтверждает гипотезу их формирования на самодийско-кетском пласте (VI-III тыс. лет до н.э.) и «тюркскую» гипотезу этногенеза с крайне слабым влиянием монголоязычного компонента на тувинский этнос. n discussions about the origin of the largest tribal group of Tuvans, the Mongush (57 thousand people), two alternative hypotheses prevail. The «Mongolian» version traces their ethnogenesis back to the Mongols (or to the newcomer population from Central Asia). The «Turkic» hypothesis connects their origin with the local autochthonous population who switched to the Turkic language. The purpose of this work is to study the gene pool of two subgroups of the Mongush (central and western) using the detailed structure of the Y-chromosome and an enlarged sample, to determine the degree of their genetic similarity to each other, with the gene pools of other Tuvan tribal groups, populations of Southern Siberia and Mongolia. Genogeographic
关于图瓦人中人数最多的部族蒙古斯(57 000 人)的起源,有两种不同的说法。蒙古人说认为他们的民族起源于蒙古人(或来自中亚的外来人口)。突厥语假说则将他们的起源与采用突厥语的当地原住民联系在一起。这项工作的目的是在扩大的样本中使用详细的 Y 染色体结构研究蒙古斯两个亚群(中部和西部)的基因库,以确定它们之间以及它们与其他图瓦属、南西伯利亚和蒙古人群的基因库之间的遗传相似程度。利用一组 60 个 Y 染色体 SNP 标记,对图瓦人 4 个属类(蒙古什族、奥尔扎克族、克尔泰克族、萨特族)的 187 名代表进行了遗传地理学分析,包括绘制 Y 染色体信息量最大的单倍群分布图;计算图瓦人属类与南西伯利亚和蒙古人口之间的遗传距离;绘制图瓦人各属类之间的遗传距离图。在 4 个图维尼亚部族的基因库中发现了 13 个信息丰富的 Y 染色体单倍群,分别是:"北欧亚 "N、Q;"西欧亚 "R1a;"东欧亚 "C2、D、O;"其他 "R2a、R1b、J2。在所有祖先群体中,"西欧亚 "和 "东欧亚 "单倍群都不超过基因库的 13-20%。"北欧亚 "单倍群占所有种属基因库的主要部分(60-68%),但比例不同。单倍群 N 在 Oorjak 中的比例最高(占基因库的 2/3),在 Mongush 中占 42%,在 Sat 和 Khertek 属中占 1/3。单倍群 Q 的趋势正好相反:萨特族和克尔泰克族占基因库的 30%,蒙古斯族占 16%,奥尔贾克族占 7%。在南西伯利亚的基因空间中,发现了图瓦人-托法拉尔人、阿尔泰人和哈卡斯人聚居区,显示了该地区基因库的三个祖先来源。地图集显示,西部和中部蒙古人与图瓦人的其他种属相似,这表明图瓦人四个祖先群体的起源是统一的。蒙古斯两个族群的基因库中普遍存在 "北欧亚 "单倍群 N 和 Q,这证实了他们形成于萨摩耶德-克梯地层(公元前六至三千年)的假说,也证实了 "突厥 "民族起源假说,即讲蒙古语的部分对图瓦人种的影响极小。在关于图瓦人最大的部落群蒙古人(5.7 万人)起源的讨论中,有两种不同的假说。蒙古人 "假说将他们的民族起源追溯到蒙古人(或来自中亚的新移民)。而 "突厥语 "假说则将他们的起源与改用突厥语的当地原住民联系在一起。这项工作的目的是利用 Y 染色体的详细结构和扩大的样本研究蒙古斯两个亚群(中部和西部)的基因库,以确定它们与其他图瓦部落群体、南西伯利亚和蒙古人口基因库之间的遗传相似程度。利用 60 个 Y 染色体 SNP 标记对图瓦人 4 个部落群(Mongush、Oorzhak、Khertek、Sat)的 187 个个体进行了遗传地理学分析,包括绘制信息量最大的 Y 染色体单倍群分布图;计算图瓦人部落群与南西伯利亚和蒙古人口之间的遗传距离;绘制图瓦人各部落群之间的遗传距离图。在 4 个图瓦人部落群的基因库中,发现了 46 个信息丰富的 Y 染色体单倍群,分别是:"北欧亚 "N、Q;"西欧亚 "R1a;"东欧亚 "C2、D、O;"其他 "R2a、R1b、J2。在所有部落群体中,"西欧亚 "和 "东欧亚 "单倍群都不超过基因库的 13-20%。"北欧亚 "单倍群占所有族属基因库的大部分(60-63%),但比例不同。单倍群 N 在敖尔扎克和蒙 古什(西部)最多,占基因库的 2/3,在蒙古什(中部)、萨特和克尔泰克部落群中占 1/3。单倍群 Q 的趋势与此相反:30% 的基因库是萨特和克尔泰克,20% 是蒙 古什(中部),7% 是奥尔扎克和蒙古什(西部)。在南西伯利亚的基因空间中,发现了图瓦人-托法拉尔人、阿尔泰人和哈卡斯人聚居区,显示了该地区基因库的三个祖先来源。地图集显示,西部和中部的蒙古斯与其他图瓦部落群相似,表明图瓦四个部落群的起源是统一的。蒙 古什两个部落群的基因库中 "北欧亚 "单倍群 N 和 Q 占主导地位,这证实了他们形成于萨摩耶-凯特层(公元前六至公元前三世纪)的假说,以及 "突厥 "人种起源假说,即讲蒙古语的部分对图瓦人种的影响极弱。
{"title":"The structure of the gene pool of the Tuvan tribal group Mongush according to data on Y-chromosome polymorphism","authors":"Л. Д. Дамба, В. Ю. Пылёв, Г.Ю. Пономарёв, Е. В. Балановская","doi":"10.25557/2073-7998.2024.01.40-51","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2024.01.40-51","url":null,"abstract":"В дискуссиях о происхождении наиболее многочисленной родовой группы тувинцев монгуш (57 тыс. чел.) преобладают две альтернативные гипотезы. Монгольская версия возводит их этногенез к монголам (или к пришлому населению из Центральной Азии). Тюркская гипотеза связывает их происхождение с местным автохтонным населением, перешедшим на тюркский язык. Цель данной работы по детальной структуре Y-хромосомы в увеличенной выборке изучить генофонд двух подгрупп монгуш (центральных и западных), определить степень их генетического сходства между собой, с генофондами других тувинских родов, популяций Южной Сибири и Монголии. Геногеографический анализ 187 представителей 4 родовых групп тувинцев (монгуш, ооржак, хертек, сат) по панели 60 SNP-маркеров Y-хромосомы включил создание карт распространения наиболее информативных гаплогрупп Y-хромосомы; расчет генетических расстояний между родами тувинцев и народонаселением Южной Сибири и Монголии; создание карт генетических расстояний от каждой родовой группы тувинцев. В генофондах 4 тувинских родов выявлено 13 информативных гаплогрупп Y-хромосомы: «северо-евразийских» N, Q; «западноевразийской» R1a; «восточно-евразийских» С2, D, O; «прочих» R2a, R1b, J2. Во всех родовых группах и «западно-евразийские», и «восточно-евразийские» гаплогруппы не превышают 13-20% генофонда. «Северо-евразийские» гаплогруппы составляют основную часть (60-68%) генофондов всех родов, но в разных пропорциях. Гаплогруппа N максимальна представлена у ооржак (2/3 генофонда), 42% – у монгуш и 1/3 генофонда – у родов сат и хертек. Обратная тенденция у гаплогруппы Q: 30% генофондов у сат и хертек, 16% у монгуш, 7% у ооржак. В генетическом пространстве Южной Сибири выявлены тувинско-тофаларский, алтайский и хакасский кластеры, демонстрирующие три предковых источника генофонда региона. Картографический атлас выявил сходство западных и центральных монгуш с другими тувинскими родами, указывающее на единство происхождения четырех тувинских родовых групп. Преобладание в генофондах обеих групп монгуш «североевразийских» гаплогрупп N и Q подтверждает гипотезу их формирования на самодийско-кетском пласте (VI-III тыс. лет до н.э.) и «тюркскую» гипотезу этногенеза с крайне слабым влиянием монголоязычного компонента на тувинский этнос.\u0000 n discussions about the origin of the largest tribal group of Tuvans, the Mongush (57 thousand people), two alternative hypotheses prevail. The «Mongolian» version traces their ethnogenesis back to the Mongols (or to the newcomer population from Central Asia). The «Turkic» hypothesis connects their origin with the local autochthonous population who switched to the Turkic language. The purpose of this work is to study the gene pool of two subgroups of the Mongush (central and western) using the detailed structure of the Y-chromosome and an enlarged sample, to determine the degree of their genetic similarity to each other, with the gene pools of other Tuvan tribal groups, populations of Southern Siberia and Mongolia. Genogeographic","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"269 4","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2024-02-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"140427792","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Study of the influence of androgen receptor gene CAG polymorphism and the parental origin of the additional X chromosome on clinical and laboratory parameters in adolescents with Klinefelter syndrome 研究雄激素受体基因 CAG 多态性和父母额外 X 染色体来源对克氏综合征青少年临床和实验室指标的影响
Pub Date : 2024-02-27 DOI: 10.25557/2073-7998.2024.01.26-39
Д.А. Беспалюк, И.С. Чугунов, В. Б. Черных, Н.В. Опарина, А.А. Степанова, О.А. Щагина, М.А. Карева, В. А. Петеркова
Введение. Синдром Клайнфельтера (СК) – аномалия половых хромосом, характеризующаяся высокой распространенностью в различных популяциях, гипергонадотропным гипогонадизмом и мужским бесплодием, выраженной клинической вариабельностью симптомов и часто поздней диагностикой. Причины фенотипической вариабельности СК, в том числе роль генетических, эпигенетических и средовых факторов, до сих пор недостаточно изучены. Цель: исследование влияния CAG-полиморфизма гена андрогенового рецептора (AR) и родительского происхождения дополнительной Х-хромосомы на клинико-лабораторные показатели у пациентов с СК. Методы. Обследованы 34 пациента с СК от 5 до 18 лет, имеющие кариотипы 47,XXY (n=32); 48,XXYY (n=1) и mos 47,ХХY[22]/46,XY[8] (n=1). Два пациента являлись монозиготными близнецами, остальные не были родственниками. Родительское происхождение Х-хромосом определяли путём генотипирования пациентов и родителей по (CAG)n-полиморфному локусу гена AR и (GAAA)n полиморфному локусу, расположенному вблизи гена RP2. Влияние родительского происхождения дополнительной хромосомы Х и количества CAG-повторов на клинико-лабораторные показатели оценено у 22 подростков с кариотипом 47,ХХY, достигших стадии полового развития по Таннеру ≥2, не получавших заместительную терапию препаратами тестостерона на момент обследования. Результаты. Количество CAG-повторов в гене AR у пациентов с СК варьировало от 16 до 27, 22 аллеля (32,4%) содержали 20 или 21 повтор. По числу CAG-повторов группа из 22 подростков с СК была разделена на 3 подгруппы: носители «коротких» аллелей ((CAG)n ≤19; 6 пациентов), «средних» аллелей ((CAG)n=20–25; 12 пациентов) и «длинных» аллелей ((CAG)n ≥26; 4 пациента). Сравнительный анализ данных антропометрии (SDS роста и ИМТ, ΔSDS сегментов тела) не выявил статистически значимых различий между подгруппами. В группе носителей «длинных» аллелей отмечены более высокие уровни тестостерона и инсулина, больший объем тестикул по сравнению с носителями «средних» и «коротких» аллелей. По уровням гонадотропинов (ЛГ, ФСГ), показателям метаболического профиля (ХС общего, ЛПНП, ЛПВП, ТГ), исследуемые группы также не различались. Родительское происхождение дополнительной Х-хромосомы установлено у 33 пациентов, из них у 22 (67%) выявлено материнское происхождение (Хm), у 11 (33%) – отцовское (Хр). Анализ влияния происхождения хромосомы Х на показатели антропометрии, гормонального и липидного профиля у отобранных для исследования 22 подростков (из них 15 с дополнительной Хm, 7 с дополнительной Хр) не выявил статистически значимых различий между подгруппами. Таким образом, существенного влияния родительского происхождения дополнительной Х-хромосомы на клинические и гормонально-метаболические показатели в исследованной выборке пациентов с СК не выявлено. Introduction. Klinefelter syndrome (KS) is a sex chromosome abnormality characterized by high prevalence in various populations, hypergonadotropic hypogonadism, male infertility, pronounced clinical variability of symptoms and c
简介克雷菲尔特综合征(KS)是一种性染色体异常,其特点是在不同人群中发病率高、性腺功能亢进和男性不育、临床症状明显多变以及诊断往往较晚。人们对 SC 表型变异的原因,包括遗传、表观遗传和环境因素的作用,仍然知之甚少。目的:研究雄激素受体(AR)基因 CAG 多态性和父母额外 X 染色体来源对 SC 患者临床和实验室指标的影响。方法研究对象为 34 名 5 至 18 岁的 SC 患者,核型分别为 47,XXY (n=32); 48,XXYY (n=1) 和 mos 47,XXYY[22]/46,XY[8] (n=1)。其中两名患者为单卵双胞胎,其余均无血缘关系。通过在 AR 基因的 (CAG)n 多态位点和位于 RP2 基因附近的 (GAAA)n 多态位点对患者和父母进行基因分型,确定了 X 染色体的父母来源。在 22 名核型为 47.XXY 的青少年中,评估了额外 X 染色体的父母来源和 CAG 重复数目对临床和实验室参数的影响,这些青少年的性发育已达到 Tanner 阶段≥2,且在检查时未接受睾酮替代治疗。结果SC患者AR基因中的CAG重复序列数目从16到27不等,其中22个等位基因(32.4%)含有20或21个重复序列。根据CAG重复序列的数量,22名SC青少年被分为3个亚组:"短 "等位基因携带者((CAG)n≤19;6名患者)、"中 "等位基因携带者((CAG)n=20-25;12名患者)和 "长 "等位基因携带者((CAG)n≥26;4名患者)。人体测量数据(身高和体重指数的 SDS、身体各部分的 ΔSDS)的比较分析表明,亚组之间没有显著的统计学差异。与 "中等 "和 "短 "等位基因携带者相比,"长 "等位基因携带者组的睾酮和胰岛素水平更高,睾丸体积更大。在促性腺激素(LH、FSH)水平、代谢轮廓指标(总胆固醇、低密度脂蛋白、高密度脂蛋白、总胆固醇)方面,研究组之间也没有差异。33 名患者的额外 X 染色体的亲本来源已经确定,其中 22 人(67%)为母本(Xm),11 人(33%)为父本(Chr)。在对被选中进行研究的 22 名青少年(其中 15 人有额外的 Xm 染色体,7 人有额外的 Xr 染色体)的 X 染色体来源对人体测量、荷尔蒙和血脂特征参数的影响进行分析后,并未发现亚组之间存在显著的统计学差异。因此,在所研究的 SC 患者样本中,额外 X 染色体的父母来源对临床和激素代谢参数没有明显影响。引言克雷菲尔特综合征(KS)是一种性染色体异常,其特点是在不同人群中发病率高、性腺功能减退、男性不育、临床症状变化明显以及通常诊断较晚。KS 表型变异的原因,包括遗传、表观遗传和环境因素对其的影响,至今仍不十分清楚。目的:评估雄激素受体(AR)基因的 CAG 多态性和 X 染色体的父母来源对 Klinefelter 综合征患者临床和实验室指标的影响。研究方法我们对 34 名 5-18 岁的 KS 患者进行了检查,他们的核型如下:47,XXY(32 人);48,XXYY(1 人)和 mos 47,XXYY[22]/46,XY[8](1 人)。两名患者是单卵双胞胎,其他患者没有血缘关系。通过对患者和父母的 AR 基因 (CAG)n 多态性和 RP2 基因附近的 (GAAA)n 多态性进行基因分型,确定了 X 染色体的父母来源。在 22 名核型为 47,XXY 的青少年中,评估了额外 X 染色体的来源和 AR 基因的 CAG 重复对临床和实验室参数的影响,这些青少年的性发育已达到 Tanner 阶段≥2,且在检查时未接受睾酮替代治疗。结果KS患者AR基因的CAG重复序列数为16至27个,其中22个等位基因(32.4%)含有20或21个重复序列。根据CAG重复序列,22名KS青少年被分为3个亚组:"短 "等位基因携带者((CAG)n≤19;6名患者)、"中 "等位基因携带者((CAG)n=20-25;12名患者)和 "长 "等位基因携带者((CAG)n≥26;4名患者)。人体测量数据(身高和体重指数的 SDS、身体各部分的 ΔSDS)的比较分析并未发现亚组之间存在显著的统计学差异。与 "中等 "和 "短 "等位基因携带者相比,"长 "等位基因携带者组的睾酮和胰岛素水平更高,睾丸体积更大。各研究组在促性腺激素(LH、FSH)水平和代谢概况指标(总胆固醇、低密度脂蛋白、高密度脂蛋白、总胆固醇)方面也没有差异。
{"title":"Study of the influence of androgen receptor gene CAG polymorphism and the parental origin of the additional X chromosome on clinical and laboratory parameters in adolescents with Klinefelter syndrome","authors":"Д.А. Беспалюк, И.С. Чугунов, В. Б. Черных, Н.В. Опарина, А.А. Степанова, О.А. Щагина, М.А. Карева, В. А. Петеркова","doi":"10.25557/2073-7998.2024.01.26-39","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2024.01.26-39","url":null,"abstract":"Введение. Синдром Клайнфельтера (СК) – аномалия половых хромосом, характеризующаяся высокой распространенностью в различных популяциях, гипергонадотропным гипогонадизмом и мужским бесплодием, выраженной клинической вариабельностью симптомов и часто поздней диагностикой. Причины фенотипической вариабельности СК, в том числе роль генетических, эпигенетических и средовых факторов, до сих пор недостаточно изучены. Цель: исследование влияния CAG-полиморфизма гена андрогенового рецептора (AR) и родительского происхождения дополнительной Х-хромосомы на клинико-лабораторные показатели у пациентов с СК. Методы. Обследованы 34 пациента с СК от 5 до 18 лет, имеющие кариотипы 47,XXY (n=32); 48,XXYY (n=1) и mos 47,ХХY[22]/46,XY[8] (n=1). Два пациента являлись монозиготными близнецами, остальные не были родственниками. Родительское происхождение Х-хромосом определяли путём генотипирования пациентов и родителей по (CAG)n-полиморфному локусу гена AR и (GAAA)n полиморфному локусу, расположенному вблизи гена RP2. Влияние родительского происхождения дополнительной хромосомы Х и количества CAG-повторов на клинико-лабораторные показатели оценено у 22 подростков с кариотипом 47,ХХY, достигших стадии полового развития по Таннеру ≥2, не получавших заместительную терапию препаратами тестостерона на момент обследования. Результаты. Количество CAG-повторов в гене AR у пациентов с СК варьировало от 16 до 27, 22 аллеля (32,4%) содержали 20 или 21 повтор. По числу CAG-повторов группа из 22 подростков с СК была разделена на 3 подгруппы: носители «коротких» аллелей ((CAG)n ≤19; 6 пациентов), «средних» аллелей ((CAG)n=20–25; 12 пациентов) и «длинных» аллелей ((CAG)n ≥26; 4 пациента). Сравнительный анализ данных антропометрии (SDS роста и ИМТ, ΔSDS сегментов тела) не выявил статистически значимых различий между подгруппами. В группе носителей «длинных» аллелей отмечены более высокие уровни тестостерона и инсулина, больший объем тестикул по сравнению с носителями «средних» и «коротких» аллелей. По уровням гонадотропинов (ЛГ, ФСГ), показателям метаболического профиля (ХС общего, ЛПНП, ЛПВП, ТГ), исследуемые группы также не различались. Родительское происхождение дополнительной Х-хромосомы установлено у 33 пациентов, из них у 22 (67%) выявлено материнское происхождение (Хm), у 11 (33%) – отцовское (Хр). Анализ влияния происхождения хромосомы Х на показатели антропометрии, гормонального и липидного профиля у отобранных для исследования 22 подростков (из них 15 с дополнительной Хm, 7 с дополнительной Хр) не выявил статистически значимых различий между подгруппами. Таким образом, существенного влияния родительского происхождения дополнительной Х-хромосомы на клинические и гормонально-метаболические показатели в исследованной выборке пациентов с СК не выявлено.\u0000 Introduction. Klinefelter syndrome (KS) is a sex chromosome abnormality characterized by high prevalence in various populations, hypergonadotropic hypogonadism, male infertility, pronounced clinical variability of symptoms and c","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"35 10","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2024-02-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"140425741","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Study of a rare variant of the CFTR c.1329_1350del gene in a homozygous state in a child with cystic fibrosis using functional tests 利用功能测试研究囊性纤维化患儿的 CFTR c.1329_1350del 基因同源罕见变体
Pub Date : 2024-02-27 DOI: 10.25557/2073-7998.2024.01.60-68
Елена Ивановна Кондратьева, М.Г. Краснова, Ю.Л. Мельяновская, В. Д. Шерман, Д.О. Мокроусова, А.С. Ефремова, Н. В. Булатенко, Т. Б. Бухарова, Дмитрий Вадимович Гольдштейн
Изучение редких вариантов в гене CFTR является актуальным в эпоху таргетной терапии CFTR-модуляторами. В данном исследовании изучена клиническая картина муковисцидоза, а также функция CFTR-канала у гомозиготного носителя редкого патогенного варианта c.1329_1350del (p.Asp443GlufsX19), относящегося к I классу нарушений в гене CFTR. Получена полная корреляция результатов функциональных тестов с фенотипической картиной муковисцидоза и потовым тестом. Метод определения разности кишечных потенциалов продемонстрировал отсутствие функциональной активности хлорного CFTR канала в ректальном биоптате; при стимулировании форсколином органоиды пациента не ответили набуханием, что свидетельствует о полном нарушении образования функционального белка CFTR. Воздействие на кишечные органоиды всеми зарегистрированными для терапии таргетными препаратами не привело к их набуханию, в отличие от контрольной культуры, гомозиготной по F508del, таким образом, хлорный канал пациента с генотипом p.Asp443GlufsX19/p.Asp443GlufsX19 оказался нечувствителен ни к одному CFTR-модулятору. The study of rare variants in the CFTR gene is relevant in the era of targeted therapy with CFTR modulators. In this study, we studied the clinical picture of cystic fibrosis, as well as the function of the CFTR channel in a homozygous carrier of a rare pathogenic variant c.1329_1350del (p.Asp443GlufsX19), belonging to class I disorders in the CFTR gene. A complete correlation of the results of functional tests with the phenotypic pattern of CF and data of a sweat test was obtained. The method for determining the difference in intestinal potentials demonstrated the absence of functional activity of the chloride CFTR channel in the rectal biopsy, and when stimulated with forskolin, the patient’s organoids did not swell, which indicates a complete violation of the functional CFTR protein production. Exposure to intestinal organoids by all registered for therapy targeted drugs did not lead to their swelling, unlike the control culture, homozygous for F508del. The chloride channel of a patient with genotype p.Asp443GlufsX19/p.Asp443GlufsX19 turned out to be insensitive to any CFTR modulator.
在使用 CFTR 调节剂进行靶向治疗的时代,对 CFTR 基因罕见变异的研究具有重要意义。在这项研究中,我们调查了一位罕见致病变体c.1329_1350del(p.Asp443GlufsX19)同基因携带者的囊性纤维化临床表现和CFTR通道功能。功能测试结果与囊性纤维化的表型和汗液测试结果完全相关。肠电位差测定法表明,直肠活检中的氯CFTR通道没有功能活性;用福斯克林刺激时,患者的器官组织没有肿胀反应,表明功能性CFTR蛋白的形成完全受损。与同型F508del的对照培养物相比,将肠道器官组织暴露于所有登记用于治疗的靶向药物都不会导致其肿胀;因此,基因型为p.Asp443GlufsX19/p.Asp443GlufsX19的患者的氯离子通道对任何CFTR调节剂都不敏感。在使用 CFTR 调节剂进行靶向治疗的时代,对 CFTR 基因罕见变异的研究具有重要意义。在这项研究中,我们研究了囊性纤维化的临床表现,以及属于 CFTR 基因 I 类疾病的罕见致病变体 c.1329_1350del (p.Asp443GlufsX19) 同源携带者的 CFTR 通道功能。功能测试结果与 CF 表型模式和汗液测试数据完全相关。确定肠电位差的方法表明,直肠活检中的 CFTR 氯离子通道没有功能性活动,当使用福斯可林刺激时,患者的器官组织没有膨胀,这表明 CFTR 蛋白的功能性生成完全被破坏。与对照培养物(F508del基因同源)不同的是,所有注册的治疗靶向药物接触肠道器官组织都不会导致其肿胀。基因型为 p.Asp443GlufsX19/p.Asp443GlufsX19 的患者的氯离子通道对任何 CFTR 调节剂都不敏感。
{"title":"Study of a rare variant of the CFTR c.1329_1350del gene in a homozygous state in a child with cystic fibrosis using functional tests","authors":"Елена Ивановна Кондратьева, М.Г. Краснова, Ю.Л. Мельяновская, В. Д. Шерман, Д.О. Мокроусова, А.С. Ефремова, Н. В. Булатенко, Т. Б. Бухарова, Дмитрий Вадимович Гольдштейн","doi":"10.25557/2073-7998.2024.01.60-68","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2024.01.60-68","url":null,"abstract":"Изучение редких вариантов в гене CFTR является актуальным в эпоху таргетной терапии CFTR-модуляторами. В данном исследовании изучена клиническая картина муковисцидоза, а также функция CFTR-канала у гомозиготного носителя редкого патогенного варианта c.1329_1350del (p.Asp443GlufsX19), относящегося к I классу нарушений в гене CFTR. Получена полная корреляция результатов функциональных тестов с фенотипической картиной муковисцидоза и потовым тестом. Метод определения разности кишечных потенциалов продемонстрировал отсутствие функциональной активности хлорного CFTR канала в ректальном биоптате; при стимулировании форсколином органоиды пациента не ответили набуханием, что свидетельствует о полном нарушении образования функционального белка CFTR. Воздействие на кишечные органоиды всеми зарегистрированными для терапии таргетными препаратами не привело к их набуханию, в отличие от контрольной культуры, гомозиготной по F508del, таким образом, хлорный канал пациента с генотипом p.Asp443GlufsX19/p.Asp443GlufsX19 оказался нечувствителен ни к одному CFTR-модулятору.\u0000 The study of rare variants in the CFTR gene is relevant in the era of targeted therapy with CFTR modulators. In this study, we studied the clinical picture of cystic fibrosis, as well as the function of the CFTR channel in a homozygous carrier of a rare pathogenic variant c.1329_1350del (p.Asp443GlufsX19), belonging to class I disorders in the CFTR gene. A complete correlation of the results of functional tests with the phenotypic pattern of CF and data of a sweat test was obtained. The method for determining the difference in intestinal potentials demonstrated the absence of functional activity of the chloride CFTR channel in the rectal biopsy, and when stimulated with forskolin, the patient’s organoids did not swell, which indicates a complete violation of the functional CFTR protein production. Exposure to intestinal organoids by all registered for therapy targeted drugs did not lead to their swelling, unlike the control culture, homozygous for F508del. The chloride channel of a patient with genotype p.Asp443GlufsX19/p.Asp443GlufsX19 turned out to be insensitive to any CFTR modulator.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"34 11","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2024-02-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"140424704","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Experience with exon 45 skipping therapy in patients with Duchenne muscular dystrophy 对杜氏肌营养不良症患者进行外显子 45 跳接疗法的经验
Pub Date : 2024-02-27 DOI: 10.25557/2073-7998.2024.01.19-25
С. Б. Артемьева, Е. Д. Белоусова, Д. В. Влодавец, Л М Кузенкова, С.В. Михайлова, Т В Подклетнова, С.Г. Попович, Е.В. Увакина, Е.Л. Усачева
Прогрессирующая мышечная дистрофия Дюшенна (ПМД Дюшенна) является наиболее распространенным нервно-мышечным заболеванием в мире. ПМД Дюшенна относится к группе так называемых дистрофинопатий, связанных с мутациями в гене DMD, наследуется по Х-сцепленному рецессивному типу и обусловлена либо полным отсутствием белка дистрофина, либо его дефектным синтезом. В настоящее время появилось несколько патогенетических лекарственных препаратов, направленных на восстановление синтеза белка дистрофина. Одним из них является антисмысловой олигонуклеотид касимерсен, работающий по технологии экзон-скиппинга 45 экзона. В статье представлен первый опыт применения препарата касимерсен у 6 пациентов из России, причем пациенты значимо отличались друг от друга по функциональному статусу и имеющимся осложнениям основного заболевания. У всех пациентов применение касимерсена было безопасным, не было выявлено никаких нежелательных явлений, связанных с применением препарата. А у одного из пациентов, находящегося на ранней амбулаторной стадии болезни, которому патогенетическая терапия была инициирована в возрасте 7 лет, констатирована выраженная положительная динамика в виде прироста дистанции на 140 метров по результатам 6-минутного теста ходьбы и увеличения на 10 баллов по шкале «Северная Звезда». Duchenne muscular dystrophy (DMD) is the most common neuromuscular disease in the world. DMD belongs to the group of so-called dystrophinopathies associated with mutations in the DMD gene, is inherited in an X-linked recessive manner and is caused by either the complete absence of the dystrophin protein or its defective synthesis. Currently, several pathogenetic drugs have appeared aimed at restoring the synthesis of the dystrophin protein. One of them is the antisense oligonucleotide casimersen, which works using exon skipping technology of exon 45 in DMD gene. The article presents the first experience of using the drug casimersen in 6 patients from Russia, and the patients differed significantly from each other in functional status and existing complications of the underlying disease. In all patients, the use of casimersen was safe, and no adverse events associated with the use of the drug were identified. And in one of the patients, who was at an early outpatient stage of the disease, for whom pathogenetic therapy was initiated at the age of 7 years, pronounced positive dynamics were noted in the form of an increase in distance by 140 meters according to the results of a 6-minute walking test and an increase of 10 points on the «North Star».
进行性杜氏肌营养不良症(DMD)是世界上最常见的神经肌肉疾病。渐进性杜氏肌营养不良症属于一组与 DMD 基因突变有关的所谓肌营养不良性疾病,以 X 连锁隐性遗传方式进行遗传,其病因是肌营养不良蛋白完全缺失或合成缺陷。目前已经出现了几种旨在恢复肌营养不良蛋白合成的致病药物。其中一种是反义寡核苷酸 kasimersen,它采用的是外显子 45 的外显子跳转技术。文章介绍了在俄罗斯 6 名患者中使用 kasimersen 药物的首次经验,这些患者在功能状态和基础疾病的现有并发症方面存在显著差异。在所有患者中,卡西美森的使用都是安全的,没有发现与用药相关的不良反应。其中一名患者在 7 岁时开始接受病理治疗,在疾病的早期活动阶段,根据 6 分钟步行测试的结果,他的步行距离增加了 140 米,北斗星量表也增加了 10 分。杜兴氏肌肉萎缩症(DMD)是世界上最常见的神经肌肉疾病。DMD 属于与 DMD 基因突变有关的所谓肌营养不良症,以 X 连锁隐性方式遗传,由肌营养不良蛋白完全缺失或合成缺陷引起。目前,已经出现了几种旨在恢复肌营养不良蛋白合成的致病药物。其中一种是反义寡核苷酸 Casimersen,它利用 DMD 基因第 45 号外显子跳过技术发挥作用。文章介绍了俄罗斯 6 名患者使用 Casimersen 药物的首次经验,这些患者在功能状态和基础疾病的现有并发症方面存在显著差异。在所有患者中,使用卡西美森都是安全的,没有发现与使用该药物相关的不良反应。其中一名患者处于疾病的早期门诊阶段,在其 7 岁时开始接受病理治疗,其病情出现了明显的积极变化,根据 6 分钟步行测试的结果,步行距离增加了 140 米,"北极星 "指数增加了 10 点。
{"title":"Experience with exon 45 skipping therapy in patients with Duchenne muscular dystrophy","authors":"С. Б. Артемьева, Е. Д. Белоусова, Д. В. Влодавец, Л М Кузенкова, С.В. Михайлова, Т В Подклетнова, С.Г. Попович, Е.В. Увакина, Е.Л. Усачева","doi":"10.25557/2073-7998.2024.01.19-25","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2024.01.19-25","url":null,"abstract":"Прогрессирующая мышечная дистрофия Дюшенна (ПМД Дюшенна) является наиболее распространенным нервно-мышечным заболеванием в мире. ПМД Дюшенна относится к группе так называемых дистрофинопатий, связанных с мутациями в гене DMD, наследуется по Х-сцепленному рецессивному типу и обусловлена либо полным отсутствием белка дистрофина, либо его дефектным синтезом. В настоящее время появилось несколько патогенетических лекарственных препаратов, направленных на восстановление синтеза белка дистрофина. Одним из них является антисмысловой олигонуклеотид касимерсен, работающий по технологии экзон-скиппинга 45 экзона. В статье представлен первый опыт применения препарата касимерсен у 6 пациентов из России, причем пациенты значимо отличались друг от друга по функциональному статусу и имеющимся осложнениям основного заболевания. У всех пациентов применение касимерсена было безопасным, не было выявлено никаких нежелательных явлений, связанных с применением препарата. А у одного из пациентов, находящегося на ранней амбулаторной стадии болезни, которому патогенетическая терапия была инициирована в возрасте 7 лет, констатирована выраженная положительная динамика в виде прироста дистанции на 140 метров по результатам 6-минутного теста ходьбы и увеличения на 10 баллов по шкале «Северная Звезда».\u0000 Duchenne muscular dystrophy (DMD) is the most common neuromuscular disease in the world. DMD belongs to the group of so-called dystrophinopathies associated with mutations in the DMD gene, is inherited in an X-linked recessive manner and is caused by either the complete absence of the dystrophin protein or its defective synthesis. Currently, several pathogenetic drugs have appeared aimed at restoring the synthesis of the dystrophin protein. One of them is the antisense oligonucleotide casimersen, which works using exon skipping technology of exon 45 in DMD gene. The article presents the first experience of using the drug casimersen in 6 patients from Russia, and the patients differed significantly from each other in functional status and existing complications of the underlying disease. In all patients, the use of casimersen was safe, and no adverse events associated with the use of the drug were identified. And in one of the patients, who was at an early outpatient stage of the disease, for whom pathogenetic therapy was initiated at the age of 7 years, pronounced positive dynamics were noted in the form of an increase in distance by 140 meters according to the results of a 6-minute walking test and an increase of 10 points on the «North Star».","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"10 12","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2024-02-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"140426316","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Association of H19 polymorphism with breast cancer risk: a meta-analysis H19 多态性与乳腺癌风险的关系:一项荟萃分析
Pub Date : 2024-02-27 DOI: 10.25557/2073-7998.2024.01.52-59
С.В. Тимофеева, А.О. Ситковская, С.Ю. Филиппова, Т.В. Чембарова, Инна Арнольдовна Новикова, О.И. Кит, Л.Н. Ващенко, С.М. Бабиева, С.М. Бакулина, Э.Э. Кечеджиева, Е.А. Андрейко, Станислав Станиславович Мезенцев, Ю.В. Пржедецкий, Е.Н. Колесников
Мета-анализ был направлен на оценку связи между полиморфизмами rs2107425, rs2839698, rs217727, rs3741219 гена H19 и риском развития рака молочной железы. Поиск публикаций проводили в базах данных Google Scholar и PubMed за последние 13 лет. Ассоциацию оценивали по статистическим критериям отношения шансов (ОШ) с 95% доверительным интервалом (ДИ). Для проведения мета-анализа использовали программное обеспечение RevMan (Cochrane Collaboration, 5.3. Копенгаген). Для оценки связи четырех полиморфизмов rs2107425, rs2839698, rs217727, rs3741219 с риском развития рака молочной железы в мета-анализ были включены 9 исследований случай-контроль с общей выборкой из 6572 пациентов с раком молочной железы и 6968 доноров в контрольной группе. В результате исследования мы наблюдали связь между rs2839698 H19 и риском развития рака молочной железы в аллельной модели (ОШ = 1,33, 95% ДИ: 1,00- 1,76, Pz = 0,005, Pi2 = <0.00001). Кроме того, в рецессивной модели риск развития рака молочной железы также был ассоциирован с мутантным аллелем rs2839698 (ОШ = 1,33, 95% ДИ: 1,03-1,71, Pz = 0,03, Pi2 = 0,05). Значимых ассоциаций с риском развития рака молочной железы полиморфизмов rs2107425, rs217727, rs3741219 не обнаружили. Настоящий мета анализ показал, что полиморфизм rs2839698 H19 ассоциирован с риском развития рака молочной железы. The meta-analysis was aimed to evaluate the association between polymorphisms rs2107425, rs2839698, rs217727, rs3741219 of the H19 gene and the risk of developing of breast cancer. Publications were searched in the Google Scholar and PubMed databases until August 2023. The association was assessed by statistical odds ratio (OR) criteria with a 95% confidence interval (CI). RevMan software (Cochrane Collaboration, 5.3. Copenhagen) was used for the meta-analysis. To assess the association of polymorphisms rs2107425, rs2839698, rs217727, rs3741219 with the risk of developing breast cancer, 9 case-control studies with a total sample of 6572 patients with breast cancer and 6968 donors in the control group were included in the meta-analysis. As a result of the study, we observed an association between rs2839698 H19 and the risk of developing breast cancer when calculating the allelic model (OR = 1.33, 95% CI: 1.00-1.76, Pz = 0.005, Pi2 = <0.00001). In addition, analysis of the recessive model also showed that the risk of developing breast cancer was significantly associated in individuals with a mutation in the polymorphic allele rs2839698 (OR = 1.33, 95% CI: 1.03-1.71, Pz = 0.03, Pi2 = 0.05). When calculating genetic models for the rs2107425, rs217727, rs3741219 polymorphisms, no statistically significant associations with the risk of developing breast cancer were found. The present meta-analysis showed that the H19 rs2839698 polymorphism associated with the risk of breast cancer.
荟萃分析旨在评估 H19 基因多态性 rs2107425、rs2839698、rs217727 和 rs3741219 与乳腺癌风险之间的关联。在谷歌学术和PubMed数据库中搜索了过去13年的文献。相关性以几率比(OR)和 95% 置信区间(CI)的统计标准进行评估。使用 RevMan 软件(Cochrane Collaboration,5.3.哥本哈根)进行荟萃分析。为了评估四个多态性 rs2107425、rs2839698、rs217727 和 rs3741219 与乳腺癌风险的关系,荟萃分析纳入了 9 项病例对照研究,研究样本包括 6572 名乳腺癌患者和 6968 名供体对照。在等位基因模型中,我们观察到 rs2839698 H19 与乳腺癌风险之间存在关联(OR = 1.33,95% CI:1.00- 1.76,Pz = 0.005,Pi2 = <0.00001)。此外,在隐性模型中,乳腺癌风险也与 rs2839698 突变等位基因有关(OR = 1.33,95% CI:1.03-1.71,Pz = 0.03,Pi2 = 0.05)。多态性 rs2107425、rs217727 和 rs3741219 与乳腺癌风险无明显关联。本荟萃分析表明,rs2839698 H19 多态性与乳腺癌风险有关。荟萃分析旨在评估 H19 基因 rs2107425、rs2839698、rs217727 和 rs3741219 多态性与乳腺癌发病风险之间的关联。在谷歌学术(Google Scholar)和PubMed数据库中检索了截至2023年8月的文献。相关性以统计学中的几率比(OR)标准和 95% 的置信区间(CI)进行评估。RevMan软件(Cochrane Collaboration, 5.3 Copenhagen)用于荟萃分析。为了评估多态性 rs2107425、rs2839698、rs217727 和 rs3741219 与乳腺癌发病风险的关系,荟萃分析纳入了 9 项病例对照研究,样本总数为 6572 名乳腺癌患者和 6968 名对照组供体。研究结果显示,在计算等位基因模型时,我们观察到 rs2839698 H19 与乳腺癌发病风险之间存在关联(OR = 1.33,95% CI:1.00-1.76,Pz = 0.005,Pi2 = <0.00001)。此外,对隐性模型的分析还显示,多态等位基因 rs2839698 发生突变的个体患乳腺癌的风险显著相关(OR = 1.33,95% CI:1.03-1.71,Pz = 0.03,Pi2 = 0.05)。在计算rs2107425、rs217727、rs3741219多态性的遗传模型时,没有发现与乳腺癌发病风险有统计学意义的关联。本荟萃分析表明,H19 rs2839698 多态性与乳腺癌发病风险有关。
{"title":"Association of H19 polymorphism with breast cancer risk: a meta-analysis","authors":"С.В. Тимофеева, А.О. Ситковская, С.Ю. Филиппова, Т.В. Чембарова, Инна Арнольдовна Новикова, О.И. Кит, Л.Н. Ващенко, С.М. Бабиева, С.М. Бакулина, Э.Э. Кечеджиева, Е.А. Андрейко, Станислав Станиславович Мезенцев, Ю.В. Пржедецкий, Е.Н. Колесников","doi":"10.25557/2073-7998.2024.01.52-59","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2024.01.52-59","url":null,"abstract":"Мета-анализ был направлен на оценку связи между полиморфизмами rs2107425, rs2839698, rs217727, rs3741219 гена H19 и риском развития рака молочной железы. Поиск публикаций проводили в базах данных Google Scholar и PubMed за последние 13 лет. Ассоциацию оценивали по статистическим критериям отношения шансов (ОШ) с 95% доверительным интервалом (ДИ). Для проведения мета-анализа использовали программное обеспечение RevMan (Cochrane Collaboration, 5.3. Копенгаген). Для оценки связи четырех полиморфизмов rs2107425, rs2839698, rs217727, rs3741219 с риском развития рака молочной железы в мета-анализ были включены 9 исследований случай-контроль с общей выборкой из 6572 пациентов с раком молочной железы и 6968 доноров в контрольной группе. В результате исследования мы наблюдали связь между rs2839698 H19 и риском развития рака молочной железы в аллельной модели (ОШ = 1,33, 95% ДИ: 1,00- 1,76, Pz = 0,005, Pi2 = <0.00001). Кроме того, в рецессивной модели риск развития рака молочной железы также был ассоциирован с мутантным аллелем rs2839698 (ОШ = 1,33, 95% ДИ: 1,03-1,71, Pz = 0,03, Pi2 = 0,05). Значимых ассоциаций с риском развития рака молочной железы полиморфизмов rs2107425, rs217727, rs3741219 не обнаружили. Настоящий мета анализ показал, что полиморфизм rs2839698 H19 ассоциирован с риском развития рака молочной железы.\u0000 The meta-analysis was aimed to evaluate the association between polymorphisms rs2107425, rs2839698, rs217727, rs3741219 of the H19 gene and the risk of developing of breast cancer. Publications were searched in the Google Scholar and PubMed databases until August 2023. The association was assessed by statistical odds ratio (OR) criteria with a 95% confidence interval (CI). RevMan software (Cochrane Collaboration, 5.3. Copenhagen) was used for the meta-analysis. To assess the association of polymorphisms rs2107425, rs2839698, rs217727, rs3741219 with the risk of developing breast cancer, 9 case-control studies with a total sample of 6572 patients with breast cancer and 6968 donors in the control group were included in the meta-analysis. As a result of the study, we observed an association between rs2839698 H19 and the risk of developing breast cancer when calculating the allelic model (OR = 1.33, 95% CI: 1.00-1.76, Pz = 0.005, Pi2 = <0.00001). In addition, analysis of the recessive model also showed that the risk of developing breast cancer was significantly associated in individuals with a mutation in the polymorphic allele rs2839698 (OR = 1.33, 95% CI: 1.03-1.71, Pz = 0.03, Pi2 = 0.05). When calculating genetic models for the rs2107425, rs217727, rs3741219 polymorphisms, no statistically significant associations with the risk of developing breast cancer were found. The present meta-analysis showed that the H19 rs2839698 polymorphism associated with the risk of breast cancer.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"20 4","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2024-02-27","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"140427549","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Investigation of VPS33A protein function in mucopolysaccharidosis-plus syndrome VPS33A蛋白在粘多糖沉积综合征中的功能研究
Pub Date : 2022-12-26 DOI: 10.25557/2073-7998.2022.12.10-15
Васильев, Ф.Ф., Софронова, В.М., Максимова, Н.Р., Каваками, Ю., Отомо, Т.
Ранее нами было выявлено новое заболевание из группы наследственных болезней обмена веществ с аутосомно-рецессивным типом наследования - мукополисахаридоз-плюс синдром (МПСПС). В результате проведенного полноэкзомного секвенирования была установлена патогенная гомозиготная мутация p.R498W в гене VPS33A. Целью настоящего исследования являлось изучение влияния мутации p.R498W в гене VPS33A на уровень белка и его функции. Клеточная модель заболевания была сгенерирована методом Crispr-Cas9. Исследование активности аутофагии проводилось путем анализа различий в количестве маркера аутофагосом LC3-II между образцами в присутствии или отсутствии ингибитора лизосом бафиломицина A1. Уровень эндоцитоза был определен при исследовании деградации рецепторов EGF. Было выявлено снижение уровня белка VPS33A в клеточных линиях с мутацией p.R498W в гетерозиготном и гомозиготном состоянии до ~43% и ~25%, соответственно. Мы выявили, что мутация p.R498W не оказывает влияния на основные известные функции белка VPS33A - эндоцитоз и аутофагию. Интенсивность флуоресценции в мутантных клетках была значительно повышена в сравнении с контролем, что свидетельствовало о смещении pH лизосом в кислую сторону. Повреждение домена 2-2, в котором расположена мутация p.R498W, приводило к дисфункции белка VPS33A. Фундаментальная значимость исследования обусловлена необходимостью расшифровки механизмов развития данного заболевания с целью поиска подходов к адекватной терапии. Previously, we identified a novel disease from the group of hereditary metabolic diseases with an autosomal-recessive type of inheritance - mucopolysaccharidosis-plus syndrome (MPSPS). Using whole exome sequencing, we revealed pathogenic homozygous mutation p.R498W in the VPS33A gene. The objective of study was to analyze the effect of the mutation in the VPS33A gene on the protein level and its function. The cellular model of the disease was generated using Crispr-Cas9 system. Determination of autophagic activity was carried out by analyzing differences in the amount of the LC3-II between samples with and without addition of lysosome inhibitor bafilomycin A1. The level of endocytosis was determined by analysis of EGFR degradation. In the present study we revealed a reduction in the level of the VPS33A protein in cell lines with heterozygous and homozygous p.R498W mutations up to ~43% and ~25%, respectively. We also found that p.R498W mutation does not affect to the main known functions of the VPS33A - endocytosis and autophagy. The fluorescence intensity in the mutant cells was significantly increased compared to the controls, which indicated a shift of lysosomal pH to the acid side. Impairment of domain 2-2 led to dysfunction of the VPS33A protein. The fundamental significance of the study is due to decipher the pathological mechanisms of disease development to find approaches to adequate therapy.
早些时候,我们从一组遗传代谢疾病中发现了一种新的疾病,一种自体衰退型的遗传疾病——多糖症加上综合征。经过全面的外来测序,在VPS33A基因中引入了一种病原体pr498w突变。本研究的目标是研究VPS33A基因中的p.R498W突变对蛋白质及其功能的影响。这种疾病的细胞模型是由Crispr-Cas9生成的。对自发性的研究是通过分析在A1存在或没有抑制剂的情况下LC3-II自身噬菌体的数量差异来进行的。EGF受体退化的研究确定了内细胞增生的水平。在细胞中,VPS33A蛋白水平已经被检测到,p r498w突变为异质和同性恋,分别为43%和25%。我们发现p.R498W突变不会影响VPS33A -内分泌酶和自残蛋白的主要功能。与控制相比,突变细胞中的荧光强度明显升高,这表明pH值已被酸性转化为酸性。p.R498W突变发生的2-2域损坏导致VPS33A蛋白功能障碍。研究的根本意义在于需要解码这种疾病的发展机制,以找到适当治疗的方法。先验,我们从传统金属乐队中分离出了一种由独立金属乐队(MPSPS)开发的自动反应型。在VPS33A基因中,我们恢复了正常的心理状态。研究对象是在protein level和its function上发现了VPS33A基因中的突变。这个发现的cellular模型是通用的usr -Cas9系统。在LC3-II between samples中,自动化是一种由lysosome inhibitor bafilomycin A1提供动力。endocytosis的level是EGFR degradation分析的结果。在前一段时间,我们在牢房里找到了一份工作,里面有heterozygous和homoz8w兵变的43%和25%。我们已经发现了这种p.R498W的变化并没有影响到VPS33A - endocytosis和autophagy。在叛变的cells中,fluorescence intensity是对控制的significent命令,而不是对acid side的lysosomal。《domain 2-2》是对VPS33A protein的致敬。这是一种令人难以置信的签名,这是一种解构解构机制的方法。
{"title":"Investigation of VPS33A protein function in mucopolysaccharidosis-plus syndrome","authors":"Васильев, Ф.Ф., Софронова, В.М., Максимова, Н.Р., Каваками, Ю., Отомо, Т.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.12.10-15","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.12.10-15","url":null,"abstract":"Ранее нами было выявлено новое заболевание из группы наследственных болезней обмена веществ с аутосомно-рецессивным типом наследования - мукополисахаридоз-плюс синдром (МПСПС). В результате проведенного полноэкзомного секвенирования была установлена патогенная гомозиготная мутация p.R498W в гене VPS33A. Целью настоящего исследования являлось изучение влияния мутации p.R498W в гене VPS33A на уровень белка и его функции. Клеточная модель заболевания была сгенерирована методом Crispr-Cas9. Исследование активности аутофагии проводилось путем анализа различий в количестве маркера аутофагосом LC3-II между образцами в присутствии или отсутствии ингибитора лизосом бафиломицина A1. Уровень эндоцитоза был определен при исследовании деградации рецепторов EGF. Было выявлено снижение уровня белка VPS33A в клеточных линиях с мутацией p.R498W в гетерозиготном и гомозиготном состоянии до ~43% и ~25%, соответственно. Мы выявили, что мутация p.R498W не оказывает влияния на основные известные функции белка VPS33A - эндоцитоз и аутофагию. Интенсивность флуоресценции в мутантных клетках была значительно повышена в сравнении с контролем, что свидетельствовало о смещении pH лизосом в кислую сторону. Повреждение домена 2-2, в котором расположена мутация p.R498W, приводило к дисфункции белка VPS33A. Фундаментальная значимость исследования обусловлена необходимостью расшифровки механизмов развития данного заболевания с целью поиска подходов к адекватной терапии.\u0000 Previously, we identified a novel disease from the group of hereditary metabolic diseases with an autosomal-recessive type of inheritance - mucopolysaccharidosis-plus syndrome (MPSPS). Using whole exome sequencing, we revealed pathogenic homozygous mutation p.R498W in the VPS33A gene. The objective of study was to analyze the effect of the mutation in the VPS33A gene on the protein level and its function. The cellular model of the disease was generated using Crispr-Cas9 system. Determination of autophagic activity was carried out by analyzing differences in the amount of the LC3-II between samples with and without addition of lysosome inhibitor bafilomycin A1. The level of endocytosis was determined by analysis of EGFR degradation. In the present study we revealed a reduction in the level of the VPS33A protein in cell lines with heterozygous and homozygous p.R498W mutations up to ~43% and ~25%, respectively. We also found that p.R498W mutation does not affect to the main known functions of the VPS33A - endocytosis and autophagy. The fluorescence intensity in the mutant cells was significantly increased compared to the controls, which indicated a shift of lysosomal pH to the acid side. Impairment of domain 2-2 led to dysfunction of the VPS33A protein. The fundamental significance of the study is due to decipher the pathological mechanisms of disease development to find approaches to adequate therapy.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"11 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-12-26","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"115653300","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Polymorphism of the rs1815739 locus of the «speed gene» ACTN3 in Siberian populations 西伯利亚人群“速度基因”ACTN3 rs1815739位点多态性分析
Pub Date : 2022-12-26 DOI: 10.25557/2073-7998.2022.12.48-51
Малярчук, Б.А., Деренко, М.В., Денисова, Г.А., Литвинов, А.Н.
Потеря активности гена ACTN3 из-за стоп-кодона в локусе rs1815739 (аллель rs1815739-T или 577X) приводит к отсутствию α-актинина-3 в быстросокращающихся мышечных волокнах, что способствует повышению выносливости и устойчивости к холоду. Эти обстоятельства стали основой для гипотезы о том, что повышение частоты аллеля rs1815739-T в популяциях Евразии и Америки в сравнении с Африкой произошло под действием отбора еще на начальных этапах освоения планеты человеком. В настоящей работе нами проанализирован полиморфизм локуса rs1815739 в популяциях Сибири - на юге (буряты, алтайцы, тувинцы, тоджинцы) и на севере (чукчи, коряки, эвены, эвенки) региона. Показано, что, вопреки вышеупомянутой гипотезе, частота аллеля rs1815739-T выше на юге Сибири, а к северу, наоборот, повышается частота аллеля rs1815739-C и генотипа CC. Результаты исследования позволяют предположить, что характер распространения вариантов полиморфизма локуса rs1815739 гена ACTN3 в сибирских популяциях не связан с адаптацией к холоду. Loss of ACTN3 gene activity due to a stop codon at the rs1815739 locus (rs1815739-T or 577X allele) leads to the absence of α-actinin-3 in fast-twitch muscle fibers, which contributes to increased endurance and resistance to cold. These circumstances became the basis for the hypothesis that the increase in the frequency of the rs1815739-T allele in the populations of Eurasia and America, in comparison with Africa, occurred under the influence of selection at the initial stages of human exploration of the planet. In this work, we analyzed the polymorphism of the rs1815739 locus in the populations of Siberia - in the south (Buryats, Altaians, Tuvinians, Todjins) and north (Chukchi, Koryaks, Evens, Evenks) of the region. We have shown that, contrary to the above hypothesis, the frequency of the rs1815739-T allele is higher in the south of Siberia, while in the northern direction, on the contrary, the frequency of the rs1815739-C allele and the CC genotype increases. The results of the study suggest that the distribution pattern of the rs1815739 polymorphic variants in Siberian populations is not associated with adaptation to cold.
由于rs1815739(等位基因rs187739 -T或577X)中的停止代码丢失,导致快速收缩的肌肉纤维中缺乏ACTN3,从而增加耐受性和耐受性。这些情况为这样一种假设奠定了基础,即欧亚和美国人口中rs1815739-T等位基因的增大是在人类早期阶段的选择下发生的。在本文中,我们分析了西伯利亚人口中的多态rs1815739——南部的风暴、阿尔泰人、图万人、托金人(图万人、图金人)和北部(爱琴海、科隆人、埃文斯基人、埃文斯基人)。研究表明,与上述假设相反,rs1815739-T等位基因高于西伯利亚南部,而在北部,rs1815739-C等位基因和CC型基因的频率正在上升。研究结果表明,西伯利亚种群中ACTN3多态性的传播与适应寒冷无关。《ACTN3基因活性due》(rs1815739-T或577X allele)的结尾和回归冷。在欧洲和美国的“自由”中,在非洲的指挥下,在人类探索的基本原则下,有一种神秘的存在。在这篇文章中,我们分析了塞伯里亚、阿尔泰人、塔文尼人、图德金斯和诺斯(Chukchi、Koryaks、Evens、Evenks)中的多毛症。我们应该意识到这一点,控制着塞伯里亚南部的自由,控制着诺瑟恩方向的自由,控制着rs1815739和CC genothases。塞伯里的波利形态变异并没有与他的同伴一起走向寒冷。
{"title":"Polymorphism of the rs1815739 locus of the «speed gene» ACTN3 in Siberian populations","authors":"Малярчук, Б.А., Деренко, М.В., Денисова, Г.А., Литвинов, А.Н.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.12.48-51","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.12.48-51","url":null,"abstract":"Потеря активности гена ACTN3 из-за стоп-кодона в локусе rs1815739 (аллель rs1815739-T или 577X) приводит к отсутствию α-актинина-3 в быстросокращающихся мышечных волокнах, что способствует повышению выносливости и устойчивости к холоду. Эти обстоятельства стали основой для гипотезы о том, что повышение частоты аллеля rs1815739-T в популяциях Евразии и Америки в сравнении с Африкой произошло под действием отбора еще на начальных этапах освоения планеты человеком. В настоящей работе нами проанализирован полиморфизм локуса rs1815739 в популяциях Сибири - на юге (буряты, алтайцы, тувинцы, тоджинцы) и на севере (чукчи, коряки, эвены, эвенки) региона. Показано, что, вопреки вышеупомянутой гипотезе, частота аллеля rs1815739-T выше на юге Сибири, а к северу, наоборот, повышается частота аллеля rs1815739-C и генотипа CC. Результаты исследования позволяют предположить, что характер распространения вариантов полиморфизма локуса rs1815739 гена ACTN3 в сибирских популяциях не связан с адаптацией к холоду.\u0000 Loss of ACTN3 gene activity due to a stop codon at the rs1815739 locus (rs1815739-T or 577X allele) leads to the absence of α-actinin-3 in fast-twitch muscle fibers, which contributes to increased endurance and resistance to cold. These circumstances became the basis for the hypothesis that the increase in the frequency of the rs1815739-T allele in the populations of Eurasia and America, in comparison with Africa, occurred under the influence of selection at the initial stages of human exploration of the planet. In this work, we analyzed the polymorphism of the rs1815739 locus in the populations of Siberia - in the south (Buryats, Altaians, Tuvinians, Todjins) and north (Chukchi, Koryaks, Evens, Evenks) of the region. We have shown that, contrary to the above hypothesis, the frequency of the rs1815739-T allele is higher in the south of Siberia, while in the northern direction, on the contrary, the frequency of the rs1815739-C allele and the CC genotype increases. The results of the study suggest that the distribution pattern of the rs1815739 polymorphic variants in Siberian populations is not associated with adaptation to cold.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"5 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-12-26","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"121829962","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Meiotic segregation and interchromosomal effect of heterochromatin small supernumerary marker chromosomes 异染色质小多余标记染色体的减数分裂分离和染色体间效应
Pub Date : 2022-12-26 DOI: 10.25557/2073-7998.2022.12.64-70
Тарлычева, А.А., Маркова, Ж.Г., Миньженкова, М.Е., Шилова, Н.В.
Введение. Малые сверхчисленные маркерные хромосомы (мСМХ), состоящие из гетерохроматиновых районов, могут быть обнаружены у индивидуумов без видимых аномалий фенотипа. Их наличие в кариотипе иногда приводит к репродуктивным проблемам, связанным с риском возникновения ошибок мейоза вследствие нарушения межхромосомного синапсиса и процесса расхождения гомологичных хромосом. Цель: изучение мейотической сегрегации и оценка частоты формирования гамет с анеуплоидией у мужчин с кариотипом 47,XY,+mar без клинически значимых аномалий фенотипа. Материалы и методы: флуоресцентная in situ гибридизация (FISH) на препаратах из эякулята семи мужчин, асимптоматических носителей мСМХ. Результаты: у всех носителей мСМХ частота сперматозоидов, содержащих маркерную хромосому, не превышала 28% и в среднем составляла 15,04±9,4 (±SD). Доля анеуплоидных сперматозоидов не превышала 3,1% и в среднем составляла 1,9±1,1 что сопоставимо с частотой анеуплоидии в гаметах индивидуумов с различными показателями спермы и нормальным кариотипом, которая не превышает 5,9% и в среднем составляет 2,2±1,8. Выводы: в мейозе носителей гетерохроматиновых мСМХ гаметы преимущественно формируются без маркерной хромосомы. Показано, что присутствие мСМХ в клетках эякулята не оказывает существенного влияния на мейотическую сегрегацию других хромосом, т.е. межхромосомный эффект отсутствует. Introduction. Small supernumerary marker chromosomes (sSMCs) consisting of heterochromatin regions can be found in individuals without visible phenotypic abnormalities. Their presence in the karyotype sometimes leads to reproductive problems associated with the risk of meiosis errors due to interchromosomal synapses and the process of non-disjunction of homologous chromosomes. Aim: to investigate meiotic segregation and evaluate the frequency of gamete formation with aneuploidy in males with karyotype 47,XY,+mar without clinically significant phenotypic abnormalities. Materials and Methods: fluorescence in situ hybridization (FISH) on fixed sperm preparations in 7 male patients-asymptomatic carriers of sSMC. Results. In all sSMC carriers, the frequency of spermatozoa containing the marker chromosome did not exceed 30% and averaged 15.04±9.4 (±SD). The proportion of aneuploid spermatozoa did not exceed 3.1% and, on average, was 1.9%±1.1, which does not differ from the frequency of aneuploidy in gametes in individuals with normal karyotype (does not exceed 5.9% and, on average, is 2.2±1.8). Conclusions. In carriers of heterochromatinous sSMC gametes in meiosis are predominantly formed without a marker chromosome. It has been shown that the presence of a high proportion of sSMC in the ejaculate cells does not significantly affect the meiotic segregation of other chromosomes, i.e., there is no interchromosomal effect.
引入。由异色区域组成的小型超数值标记染色体可以在没有可见异常现象的个体中检测到。它们存在于线粒体中,有时会导致由于染色体间突触断裂和同源染色体分离过程而导致的生殖问题。目标:研究杂交隔离和估计无节育47、XY、+mar没有临床意义的表型异常的男性的抗生育能力。材料和方法:situ中的荧光杂交(鱼)是由7名男性射精剂(渐近的mvs携带者)制成的。结果:所有mmx载体中含有标记染色体的精子数量不超过28%,平均为15.04 9.4 (SD)。非致性精子的比例不到3.1%,平均为1.9 1.1,与不同精子杂质的非致性频率和正常的卡里奥提斯相匹配,不超过5.9%,平均为2.2 1.8。结论:在maios中,配子的异色msmmma主要是在没有标记染色体的情况下形成的。射精细胞中mvs的存在对其他染色体的混乱隔离没有明显影响,也就是说染色体间的作用是不存在的。=。小的超级记号笔(sSMCs)可以在没有可见的色素特征的情况下找到。在卡yotype sometemes中,有一种方法可以让人联想到混合的合成器问题和非分裂的chromomosomes。Aim:用karyotype 47、XY、+mar缺乏动力动力动力。物质和媒介:在sSMC的7个小patrit -asymptomatic carriers上进行混合的fluorescence。Results。在所有sSMC carriers中,斯皮马托佐的滑线占了30%,滑线占了15.04 9.4 (SD)。在average上,有1.9%的人不喜欢玩游戏,而在游戏中,有5.9%的人不喜欢游戏(2.2 1.8)。Conclusions。在海特罗玛提乌斯sSMC游戏中,meiosis中没有一个标记为chromosome。这是一个很好的例子,展示了sSMC在其他chromosomes中的表现。
{"title":"Meiotic segregation and interchromosomal effect of heterochromatin small supernumerary marker chromosomes","authors":"Тарлычева, А.А., Маркова, Ж.Г., Миньженкова, М.Е., Шилова, Н.В.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.12.64-70","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.12.64-70","url":null,"abstract":"Введение. Малые сверхчисленные маркерные хромосомы (мСМХ), состоящие из гетерохроматиновых районов, могут быть обнаружены у индивидуумов без видимых аномалий фенотипа. Их наличие в кариотипе иногда приводит к репродуктивным проблемам, связанным с риском возникновения ошибок мейоза вследствие нарушения межхромосомного синапсиса и процесса расхождения гомологичных хромосом. Цель: изучение мейотической сегрегации и оценка частоты формирования гамет с анеуплоидией у мужчин с кариотипом 47,XY,+mar без клинически значимых аномалий фенотипа. Материалы и методы: флуоресцентная in situ гибридизация (FISH) на препаратах из эякулята семи мужчин, асимптоматических носителей мСМХ. Результаты: у всех носителей мСМХ частота сперматозоидов, содержащих маркерную хромосому, не превышала 28% и в среднем составляла 15,04±9,4 (±SD). Доля анеуплоидных сперматозоидов не превышала 3,1% и в среднем составляла 1,9±1,1 что сопоставимо с частотой анеуплоидии в гаметах индивидуумов с различными показателями спермы и нормальным кариотипом, которая не превышает 5,9% и в среднем составляет 2,2±1,8. Выводы: в мейозе носителей гетерохроматиновых мСМХ гаметы преимущественно формируются без маркерной хромосомы. Показано, что присутствие мСМХ в клетках эякулята не оказывает существенного влияния на мейотическую сегрегацию других хромосом, т.е. межхромосомный эффект отсутствует.\u0000 Introduction. Small supernumerary marker chromosomes (sSMCs) consisting of heterochromatin regions can be found in individuals without visible phenotypic abnormalities. Their presence in the karyotype sometimes leads to reproductive problems associated with the risk of meiosis errors due to interchromosomal synapses and the process of non-disjunction of homologous chromosomes. Aim: to investigate meiotic segregation and evaluate the frequency of gamete formation with aneuploidy in males with karyotype 47,XY,+mar without clinically significant phenotypic abnormalities. Materials and Methods: fluorescence in situ hybridization (FISH) on fixed sperm preparations in 7 male patients-asymptomatic carriers of sSMC. Results. In all sSMC carriers, the frequency of spermatozoa containing the marker chromosome did not exceed 30% and averaged 15.04±9.4 (±SD). The proportion of aneuploid spermatozoa did not exceed 3.1% and, on average, was 1.9%±1.1, which does not differ from the frequency of aneuploidy in gametes in individuals with normal karyotype (does not exceed 5.9% and, on average, is 2.2±1.8). Conclusions. In carriers of heterochromatinous sSMC gametes in meiosis are predominantly formed without a marker chromosome. It has been shown that the presence of a high proportion of sSMC in the ejaculate cells does not significantly affect the meiotic segregation of other chromosomes, i.e., there is no interchromosomal effect.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"204 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-12-26","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"132941768","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
MiR-9, miR-27 a, miR-34a, miR-146a, miR-155 microRNA expression in the retina during the development of retinopathy similar to age-related macular degeneration in OXYS rats MiR-9, mir - 27a, miR-34a, miR-146a, miR-155 microRNA在OXYS大鼠视网膜病变类似年龄相关性黄斑变性发展过程中的表达
Pub Date : 2022-12-26 DOI: 10.25557/2073-7998.2022.12.30-32
Шкляр, А.А., Колосова, Н.Г., Кожевникова, О.С.
Возрастная макулярная дегенерации (ВМД) - комплексное нейродегенеративное заболевание, которое становится основной причиной потери центрального зрения людьми старше 60 лет. Развитие ВМД контролируется множеством взаимодействующих генетических и средовых факторов, определяющих форму, скорость прогрессии заболевания. Существенно влияют на эти параметры и эпигенетические механизмы, включая изменения паттернов экспрессии микроРНК, оценка циркулирующего пула которых рассматривается как перспективный подход к ранней диагностике, прогнозу течения и оценке эффективности лечения ВМД. Однако информация о паттернах экспрессии микроРНК в сетчатке на разных стадиях развития ВМД, тем более доклинических, практически отсутствует, а получить её позволяет только использование адекватных биологических моделей. Настоящее исследование выполнено на линии крыс OXYS (ИЦиГ СО РАН) - уникальной модели преждевременного старения, одним из проявлений которого становится развитие комплекса ключевых признаков ВМД. Его целью явилась оценка изменений экспрессии ряда перспективных с прогностической точки зрения микроРНК (miR-9, miR-27a, miR-34a miR-146a, miR-155) с возрастом в сетчатке крыс Вистар (контроль) и OXYS при развитии аналогичной ВМД ретинопатии. Экспрессию микроРНК оценивали методом ПЦР в реальном времени. Было выявлено увеличение уровня экспрессии miR-27a в сетчатке крыс OXYS с возрастом и по мере развития признаков ретинопатии, которое может вносить вклад в развитие признаков ВМД. Age-related macular degeneration (AMD) is a complex neurodegenerative disease that becomes the main cause of central vision loss in people over 60 years of age. The development of AMD is controlled by a variety of interacting genetic and environmental factors that determine the form and rate of progression of the disease. Epigenetic mechanisms also significantly affect these parameters, including changes in microRNA expression patterns, the assessment of the circulating pool of which is considered as a promising approach to early diagnosis, prognosis of the course and evaluation of the effectiveness of AMD treatment. However, there is practically no information about the patterns of microRNA expression in the retina at different stages of AMD development, especially preclinical ones, and it can only be obtained using adequate biological models. The present study was performed on a line of OXYS rats (ICG SB RAS) - a unique model of premature aging, one of the manifestations of which is the development of a complex of key signs of AMD. Its purpose was to evaluate changes in the expression of a number of prognostically promising microRNAs (miR-9, miR-27a, miR-34a, miR-146a, miR-155) with age in the retina of Wistar rats (control) and OXYS with the development of AMD-like retinopathy. microRNA expression was evaluated by real-time PCR An increase in the level of miR-27a expression in the retina of OXYS rats was revealed with age and with the development of signs of retinopathy, which may cont
黄斑变性(mvd)是一种复杂的神经退行性疾病,是60岁以上人们失去中央视力的主要原因。海军的发展受到许多相互作用的遗传和关键因素的控制,这些因素决定了疾病的形状和速度。这些参数和表观基因机制,包括微na模式的改变,对循环普尔的评估被认为是早期诊断、流预测和海军治疗效率评估的一个很好的方法。然而,在海军发展的不同阶段,特别是在临床前阶段,关于mirna表达模式的信息几乎不存在,只有充分的生物模型才能获得。真正的研究是在OXYS (izig seo rang)老鼠系列中完成的,这是一种独特的过早老化模式,海军的关键特征之一。他的目标是评估mirna (miR-9、miR-27a、miR-34a miR-146a、miR-155)和OXYS的表现变化,以及类似海军的发展。mirna表达被pcr实时评估。随着年龄和视网膜病变的发展,OXYS的miR-27a视网膜表达水平增加,这可能对海军的视网膜增大。传统的麦克拉尔变性(AMD)是一个完整的发现,发现了60年前人们失去的中央视觉中心。AMD的开发是由交互式基因和环境工厂控制的,这些工厂的形状和性能都很差。在米罗纳高速公路上,圆圈的开关被称为“早期diagnosis”、“早期diagnosis”和“AMD赞助”。However,这是一个没有信息的密尔沃基密尔沃基模式,由密尔沃基密尔纳快讯,由密尔沃基密尔纳快讯,“牧师”是“OXYS SB RAS”线上的表演,是一个“灵长类”模型。Its purpose是miR-9、miR-27a、miR-34a、miR-146a和miR-155的进化。米orna expression是在miR-27a rats的现实生活中被发现的,是在retinopathy的时代和开发中被发现的。
{"title":"MiR-9, miR-27 a, miR-34a, miR-146a, miR-155 microRNA expression in the retina during the development of retinopathy similar to age-related macular degeneration in OXYS rats","authors":"Шкляр, А.А., Колосова, Н.Г., Кожевникова, О.С.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.12.30-32","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.12.30-32","url":null,"abstract":"Возрастная макулярная дегенерации (ВМД) - комплексное нейродегенеративное заболевание, которое становится основной причиной потери центрального зрения людьми старше 60 лет. Развитие ВМД контролируется множеством взаимодействующих генетических и средовых факторов, определяющих форму, скорость прогрессии заболевания. Существенно влияют на эти параметры и эпигенетические механизмы, включая изменения паттернов экспрессии микроРНК, оценка циркулирующего пула которых рассматривается как перспективный подход к ранней диагностике, прогнозу течения и оценке эффективности лечения ВМД. Однако информация о паттернах экспрессии микроРНК в сетчатке на разных стадиях развития ВМД, тем более доклинических, практически отсутствует, а получить её позволяет только использование адекватных биологических моделей. Настоящее исследование выполнено на линии крыс OXYS (ИЦиГ СО РАН) - уникальной модели преждевременного старения, одним из проявлений которого становится развитие комплекса ключевых признаков ВМД. Его целью явилась оценка изменений экспрессии ряда перспективных с прогностической точки зрения микроРНК (miR-9, miR-27a, miR-34a miR-146a, miR-155) с возрастом в сетчатке крыс Вистар (контроль) и OXYS при развитии аналогичной ВМД ретинопатии. Экспрессию микроРНК оценивали методом ПЦР в реальном времени. Было выявлено увеличение уровня экспрессии miR-27a в сетчатке крыс OXYS с возрастом и по мере развития признаков ретинопатии, которое может вносить вклад в развитие признаков ВМД.\u0000 Age-related macular degeneration (AMD) is a complex neurodegenerative disease that becomes the main cause of central vision loss in people over 60 years of age. The development of AMD is controlled by a variety of interacting genetic and environmental factors that determine the form and rate of progression of the disease. Epigenetic mechanisms also significantly affect these parameters, including changes in microRNA expression patterns, the assessment of the circulating pool of which is considered as a promising approach to early diagnosis, prognosis of the course and evaluation of the effectiveness of AMD treatment. However, there is practically no information about the patterns of microRNA expression in the retina at different stages of AMD development, especially preclinical ones, and it can only be obtained using adequate biological models. The present study was performed on a line of OXYS rats (ICG SB RAS) - a unique model of premature aging, one of the manifestations of which is the development of a complex of key signs of AMD. Its purpose was to evaluate changes in the expression of a number of prognostically promising microRNAs (miR-9, miR-27a, miR-34a, miR-146a, miR-155) with age in the retina of Wistar rats (control) and OXYS with the development of AMD-like retinopathy. microRNA expression was evaluated by real-time PCR An increase in the level of miR-27a expression in the retina of OXYS rats was revealed with age and with the development of signs of retinopathy, which may cont","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"55 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-12-26","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"126227061","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
期刊
Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika
全部 Acc. Chem. Res. ACS Applied Bio Materials ACS Appl. Electron. Mater. ACS Appl. Energy Mater. ACS Appl. Mater. Interfaces ACS Appl. Nano Mater. ACS Appl. Polym. Mater. ACS BIOMATER-SCI ENG ACS Catal. ACS Cent. Sci. ACS Chem. Biol. ACS Chemical Health & Safety ACS Chem. Neurosci. ACS Comb. Sci. ACS Earth Space Chem. ACS Energy Lett. ACS Infect. Dis. ACS Macro Lett. ACS Mater. Lett. ACS Med. Chem. Lett. ACS Nano ACS Omega ACS Photonics ACS Sens. ACS Sustainable Chem. Eng. ACS Synth. Biol. Anal. Chem. BIOCHEMISTRY-US Bioconjugate Chem. BIOMACROMOLECULES Chem. Res. Toxicol. Chem. Rev. Chem. Mater. CRYST GROWTH DES ENERG FUEL Environ. Sci. Technol. Environ. Sci. Technol. Lett. Eur. J. Inorg. Chem. IND ENG CHEM RES Inorg. Chem. J. Agric. Food. Chem. J. Chem. Eng. Data J. Chem. Educ. J. Chem. Inf. Model. J. Chem. Theory Comput. J. Med. Chem. J. Nat. Prod. J PROTEOME RES J. Am. Chem. Soc. LANGMUIR MACROMOLECULES Mol. Pharmaceutics Nano Lett. Org. Lett. ORG PROCESS RES DEV ORGANOMETALLICS J. Org. Chem. J. Phys. Chem. J. Phys. Chem. A J. Phys. Chem. B J. Phys. Chem. C J. Phys. Chem. Lett. Analyst Anal. Methods Biomater. Sci. Catal. Sci. Technol. Chem. Commun. Chem. Soc. Rev. CHEM EDUC RES PRACT CRYSTENGCOMM Dalton Trans. Energy Environ. Sci. ENVIRON SCI-NANO ENVIRON SCI-PROC IMP ENVIRON SCI-WAT RES Faraday Discuss. Food Funct. Green Chem. Inorg. Chem. Front. Integr. Biol. J. Anal. At. Spectrom. J. Mater. Chem. A J. Mater. Chem. B J. Mater. Chem. C Lab Chip Mater. Chem. Front. Mater. Horiz. MEDCHEMCOMM Metallomics Mol. Biosyst. Mol. Syst. Des. Eng. Nanoscale Nanoscale Horiz. Nat. Prod. Rep. New J. Chem. Org. Biomol. Chem. Org. Chem. Front. PHOTOCH PHOTOBIO SCI PCCP Polym. Chem.
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
0
微信
客服QQ
Book学术公众号 扫码关注我们
反馈
×
意见反馈
请填写您的意见或建议
请填写您的手机或邮箱
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
现在去查看 取消
×
提示
确定
Book学术官方微信
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术
文献互助 智能选刊 最新文献 互助须知 联系我们:info@booksci.cn
Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。
Copyright © 2023 Book学术 All rights reserved.
ghs 京公网安备 11010802042870号 京ICP备2023020795号-1