首页 > 最新文献

Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika最新文献

英文 中文
Damage to cellular DNA is associated with a decrease in the number of the satellite III repeat copies (1q12) in the blood cells DNA of patients with schizophrenia 细胞DNA损伤与精神分裂症患者血细胞DNA中卫星III重复拷贝(1q12)数量的减少有关
Pub Date : 2022-07-29 DOI: 10.25557/2073-7998.2022.07.50-51
Жесткова, Е.М., Ершова, Е.С., Захарова, Н.В., Каменева, Л.В., Вейко, Н.Н., Костюк, С.В.
Шизофрения относится к многофакторным заболеваниям, которые возникают как следствие генетических нарушений и неблагоприятных условий эмбрионального развития и жизни человека. В работе обнаружена выраженная отрицательная корреляция между маркерами повреждения ДНК лимфоцитов крови (маркер окисления 8-oxodG, маркер двунитевых разрывов γH2AX) и содержанием повтора - субфракции сателлита III (f-SatIII), локализованного в прицентромерном гетерохроматине 1q12) в выборке больных шизофренией в стадии обострения (N = 97). Низкое содержание повтора f-SatIII в ДНК лейкоцитов больных можно рассматривать в качестве потенциального маркера уровня хронического окислительного стресса и повреждения ДНК при шизофрении. Schizophrenia is a multifactorial disease resulting from genetic disorders and unfavorable conditions of embryonic development and later life. The study revealed a pronounced negative correlation between markers of DNA damage in blood lymphocytes (oxidation marker 8-oxodG, double-strand break marker γH2AX) and the repeat content - satellite III subfraction (located in pericentromeric heterochromatin 1q12) in a sample of patients with schizophrenia in the acute stage (N = 97). The low content of the f-SatIII repeat in the DNA of leukocytes of patients can be considered as a potential marker of the level of both chronic oxidative stress and DNA damage in schizophrenia.
精神分裂症是一种多方面的疾病,是由基因紊乱、胚胎发育和人类生活条件不佳引起的。报告显示,淋巴细胞损伤标记(8-oxodG)、H2AX二链断裂标记(H2AX)和在急性精神分裂症患者(N = 97)样本中发现的satellite III (f-SatIII)的复数次方(N -SatIII)之间存在明显的负相关性。患者白细胞dna中f-SatIII重播的低水平可以被认为是慢性氧化压力水平的潜在标记,以及精神分裂症时dna损伤。Schizophrenia是一个多工厂的解决方案,从基因发现和不可思议的概念开发和later生活。血液中的DNA测序器(H2AX)和血液中的DNA测序器(N = 97)中的解码器(N = 97)。在“堕落”DNA中,“堕落”可能会被施伊佐菲尼亚的“堕落”标记所取代。
{"title":"Damage to cellular DNA is associated with a decrease in the number of the satellite III repeat copies (1q12) in the blood cells DNA of patients with schizophrenia","authors":"Жесткова, Е.М., Ершова, Е.С., Захарова, Н.В., Каменева, Л.В., Вейко, Н.Н., Костюк, С.В.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.07.50-51","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.07.50-51","url":null,"abstract":"Шизофрения относится к многофакторным заболеваниям, которые возникают как следствие генетических нарушений и неблагоприятных условий эмбрионального развития и жизни человека. В работе обнаружена выраженная отрицательная корреляция между маркерами повреждения ДНК лимфоцитов крови (маркер окисления 8-oxodG, маркер двунитевых разрывов γH2AX) и содержанием повтора - субфракции сателлита III (f-SatIII), локализованного в прицентромерном гетерохроматине 1q12) в выборке больных шизофренией в стадии обострения (N = 97). Низкое содержание повтора f-SatIII в ДНК лейкоцитов больных можно рассматривать в качестве потенциального маркера уровня хронического окислительного стресса и повреждения ДНК при шизофрении.\u0000 Schizophrenia is a multifactorial disease resulting from genetic disorders and unfavorable conditions of embryonic development and later life. The study revealed a pronounced negative correlation between markers of DNA damage in blood lymphocytes (oxidation marker 8-oxodG, double-strand break marker γH2AX) and the repeat content - satellite III subfraction (located in pericentromeric heterochromatin 1q12) in a sample of patients with schizophrenia in the acute stage (N = 97). The low content of the f-SatIII repeat in the DNA of leukocytes of patients can be considered as a potential marker of the level of both chronic oxidative stress and DNA damage in schizophrenia.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"30 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-07-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"121112361","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
The relation of relative leukocyte telomere length to clinical and anamnestic characteristics of patients with chronic alcohol addiction 白细胞相对端粒长度与慢性酒精成瘾患者临床及遗忘特征的关系
Pub Date : 2022-07-29 DOI: 10.25557/2073-7998.2022.07.56-59
Казанцева, А.В., Фасхутдинова, Г.Г., Давыдова, Ю.Д., Еникеева, Р.Ф., Асадуллин, А.Р., Хуснутдинова, Э.К.
Литературные данные указывают на снижение относительной длины теломерных повторов (ОДТП) у лиц, имеющих диагностированную клиническую картину алкогольной зависимости, в то же время связи клинико-анамнестических характеристик с укорочением теломер у лиц с алкоголизмом выявлено не было. Целью настоящей работы являлось изучение связи ОДТП с риском развития хронического алкоголизма, а также выявление индивидуальных различий в ОДТП у пациентов с хроническим алкоголизмом в зависимости от клинико-анамнестических характеристик. В результате анализа не было продемонстрировано статистически значимых различий в показателях ОДТП между группой больных алкоголизмом и контрольной группой (β=-0,044, р=0,437). Однако мы выявили более резкое укорочение ОДТП с возрастом у больных алкоголизмом (β=-0,246, р=0,007) по сравнению со здоровыми донорами (β=-0,151, р=0,050). Идентифицирован статистически значимый характер включения в регрессионную модель таких клинико-анамнестических характеристик как возраст появления абстинентного синдрома (β=-0,385, р=0,001) и возраст начала злоупотребления алкоголем (β=-0,254, р=0,006), связанных с укорочением теломер. Полученные данные подтверждают ускорение клеточного старения организма на основе ОДТП у индивидов, злоупотребляющих алкоголем. Published data indicate a decreased relative leukocyte telomere length (RLTL) in individuals diagnosed with clinical alcohol dependence; at the same time, to date no association of clinical and anamnestic characteristics with telomere shortening in patients with alcohol addiction were reported. The present study aimed to assess the association between RLTL and the risk of developing chronic alcoholism, and to identify individual differences in RLTL in addicted patients accounting for clinical and anamnestic parameters. As a result of the analysis, no statistically significant differences in RLTL were demonstrated between patients and control group (β=-0.044, p=0.437). However, we observed more rapid telomeres shortening with age in patients with alcoholism (β=-0.246, p=0.007) compared with healthy donors (β=-0.151, p=0.050). A statistically significant effect of the inclusion in the regression model of such clinical and anamnestic characteristics as the age of onset of withdrawal syndrome (β=-0.385, p=0.001) and alcohol abuse (β=-0.254, p=0.006) on telomere shortening was identified. The data obtained confirm the acceleration of cellular aging of the organism based on RLTL in individuals who alcohol addiction.
文学数据显示,在被诊断为酒精成瘾者的临床记录中,身体重复性(mtp)相对较短,但酒精成瘾者的临床病史没有显示。本工作的目的是研究与慢性酒精中毒相关的创伤后应激障碍,并根据临床历史确定慢性酒精中毒患者的个人差异。结果,酒精中毒小组和对照组之间的统计数据没有显示出重大的交通事故差异(b = 0.044, r = 0.437)。然而,我们发现,与健康捐助者相比,酒精中毒患者(0.246,r = 0.007)的dtp缩短幅度要大得多。= =临床历史= =在临床历史模型中发现,临床历史特征包括戒断综合征(0.385,p = 0.001)和酒精滥用年龄(0.254,r = 0.006)的统计意义。这些数据证实,在滥用酒精的个体中,细胞老化加速。公开性的数据披露,在独立文件中使用clinical alcohol解码(RLTL);在same时间,在alcohol毒瘾报告中,使用telomere在病人中抽动。“最好的学习工具”和“开发历史文献”,以及“上瘾的精神导师”中的“身份差异”。作为对分析的回应,没有明显的迹象表明缺乏权威和控制集团(0.044,p=0.437)。However,我们观察到更多的移动电话与alcoholism (0.246, p=0.007)共享。在魔法山(0.385、p=0.001)和alcohol abuse (p= 0.254, p=0.006)的回归模式中,有一种模式是确定的。这是一个组织的基础上的组织,由谁发起的。
{"title":"The relation of relative leukocyte telomere length to clinical and anamnestic characteristics of patients with chronic alcohol addiction","authors":"Казанцева, А.В., Фасхутдинова, Г.Г., Давыдова, Ю.Д., Еникеева, Р.Ф., Асадуллин, А.Р., Хуснутдинова, Э.К.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.07.56-59","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.07.56-59","url":null,"abstract":"Литературные данные указывают на снижение относительной длины теломерных повторов (ОДТП) у лиц, имеющих диагностированную клиническую картину алкогольной зависимости, в то же время связи клинико-анамнестических характеристик с укорочением теломер у лиц с алкоголизмом выявлено не было. Целью настоящей работы являлось изучение связи ОДТП с риском развития хронического алкоголизма, а также выявление индивидуальных различий в ОДТП у пациентов с хроническим алкоголизмом в зависимости от клинико-анамнестических характеристик. В результате анализа не было продемонстрировано статистически значимых различий в показателях ОДТП между группой больных алкоголизмом и контрольной группой (β=-0,044, р=0,437). Однако мы выявили более резкое укорочение ОДТП с возрастом у больных алкоголизмом (β=-0,246, р=0,007) по сравнению со здоровыми донорами (β=-0,151, р=0,050). Идентифицирован статистически значимый характер включения в регрессионную модель таких клинико-анамнестических характеристик как возраст появления абстинентного синдрома (β=-0,385, р=0,001) и возраст начала злоупотребления алкоголем (β=-0,254, р=0,006), связанных с укорочением теломер. Полученные данные подтверждают ускорение клеточного старения организма на основе ОДТП у индивидов, злоупотребляющих алкоголем.\u0000 Published data indicate a decreased relative leukocyte telomere length (RLTL) in individuals diagnosed with clinical alcohol dependence; at the same time, to date no association of clinical and anamnestic characteristics with telomere shortening in patients with alcohol addiction were reported. The present study aimed to assess the association between RLTL and the risk of developing chronic alcoholism, and to identify individual differences in RLTL in addicted patients accounting for clinical and anamnestic parameters. As a result of the analysis, no statistically significant differences in RLTL were demonstrated between patients and control group (β=-0.044, p=0.437). However, we observed more rapid telomeres shortening with age in patients with alcoholism (β=-0.246, p=0.007) compared with healthy donors (β=-0.151, p=0.050). A statistically significant effect of the inclusion in the regression model of such clinical and anamnestic characteristics as the age of onset of withdrawal syndrome (β=-0.385, p=0.001) and alcohol abuse (β=-0.254, p=0.006) on telomere shortening was identified. The data obtained confirm the acceleration of cellular aging of the organism based on RLTL in individuals who alcohol addiction.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"35 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-07-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"122452748","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Molecular similarity of multifactorial and Mendelian diseases 多因子和孟德尔疾病的分子相似性
Pub Date : 2022-07-29 DOI: 10.25557/2073-7998.2022.07.30-32
Брагина, Е.Ю., Назаренко, М.С., Пузырёв, В.П.
В работе изучена генетическая связь 22 многофакторных и 6 менделевских болезней, основываясь на данных, экстрагированных из курируемой базы DisGenNet. Для анализа рассчитан коэффициент генетической «общности» между болезнями, а также использованы методы кластеризации и приоритизации. В результате установлена выраженная общая наследственная компонента многофакторных болезней разных патогенетических групп. Неполные знания о вкладе генов-модификаторов в развитие менделевских заболеваний, как и многофакторных болезней, существенно лимитируют оценку их молекулярного сходства. The genetic relationship of 22 multifactorial and 6 Mendelian diseases based on data extracted from the curated DisGenNet database were studied. The coefficient of genetic «commonality» between diseases was calculated and as well as methods of clustering and prioritization were used. As a result, a pronounced common hereditary component of multifactorial diseases of various pathogenetic groups was established. The assessment of molecular similarity between Mendelian and multifactorial diseases is significantly limits due to incomplete knowledge about the contribution of genes.
根据从DisGenNet控制数据库中提取的数据,研究了22种多因子和6种门德尔松疾病的遗传联系。它计算了疾病之间的遗传“共性”系数,并使用了集群和优化方法。结果是确定了不同病原体多相疾病的共同遗传成分。不完全了解修改基因对门捷尔疾病的影响,就像多方面疾病一样,大大限制了它们的分子相似性。22个多工厂基因相关性和6个孟德尔离散数据从工作室扭曲的分裂数据库。基因“共同”的分裂被称为“共同”,并被称为“共同”。作为一个result,作为一个早期社区遗产公司,多工厂病原体发育障碍是一个耻辱。《莫莱莱的简单技能》和《多工厂的分歧》是《基因的融合》的签名。
{"title":"Molecular similarity of multifactorial and Mendelian diseases","authors":"Брагина, Е.Ю., Назаренко, М.С., Пузырёв, В.П.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.07.30-32","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.07.30-32","url":null,"abstract":"В работе изучена генетическая связь 22 многофакторных и 6 менделевских болезней, основываясь на данных, экстрагированных из курируемой базы DisGenNet. Для анализа рассчитан коэффициент генетической «общности» между болезнями, а также использованы методы кластеризации и приоритизации. В результате установлена выраженная общая наследственная компонента многофакторных болезней разных патогенетических групп. Неполные знания о вкладе генов-модификаторов в развитие менделевских заболеваний, как и многофакторных болезней, существенно лимитируют оценку их молекулярного сходства.\u0000 The genetic relationship of 22 multifactorial and 6 Mendelian diseases based on data extracted from the curated DisGenNet database were studied. The coefficient of genetic «commonality» between diseases was calculated and as well as methods of clustering and prioritization were used. As a result, a pronounced common hereditary component of multifactorial diseases of various pathogenetic groups was established. The assessment of molecular similarity between Mendelian and multifactorial diseases is significantly limits due to incomplete knowledge about the contribution of genes.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"34 1 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-07-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"132083679","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Association of FTO rs9939609, TCF7L2 rs7903146, FABP2 rs1799883 polymorphisms with morbid obesity in women FTO rs9939609、TCF7L2 rs7903146、FABP2 rs1799883多态性与女性病态肥胖的关联
Pub Date : 2022-07-29 DOI: 10.25557/2073-7998.2022.07.52-55
Зорина, В.В., Мельникова, Е.С., Иванова, А.А., Гуражева, А.А., Максимов, В.Н.
Цель. Изучение ассоциации полиморфизмов rs9939609 гена FTO, rs7903146 гена TCF7L2, rs1799883 гена FABP2 с морбидным ожирением у женщин. Материалы и методы. Группа морбидного ожирения (n=192, средний возраст 57,02 ± 7,16 лет, ИМТ> 40 кг/м2) и контрольная группа (n=450, средний возраст 55,44 ± 7,41 лет, ИМТ 20 - 25 кг/м2) сформированы из банка ДНК международного исследования HAPIEE. Генотипирование выполнено методами ПЦР-ПДРФ и ПЦР в режиме реального времени с использованием TaqMan зондов (Applied Biosystems, США). Статистическая обработка полученных результатов осуществлена в программном обеспечении SPSS. Результаты. Не выявлено статистически значимых различий между группой морбидного ожирения и контрольной группой по частотам генотипов rs7903146 гена TCF7L2, rs1799883 гена FABP2 (р>0,05). В группе морбидного ожирения у женщин доля носителей генотипа ТТ полиморфизма rs9939609 гена FTO статистически значимо меньше (26,6%), а генотипа АТ значимо больше (53,6%), чем в контрольной группе (38,4%; 45,1%, соответственно), (ОШ=0,58, 95%ДИ 0,4-0,84, p=0,004; ОШ=1,41, 95%ДИ 1,003-1,98, p=0,047, соответственно). Выводы. Генотип АТ полиморфизма rs9939609 гена FTO является генотипом риска морбидного ожирения у женщин, а генотип ТТ обладает протективным эффектом в его отношении. Не обнаружено ассоциации вариантов нуклеотидной последовательности rs7903146 гена TCF7L2 и rs1799883 гена FABP2 с морбидным ожирением у женщин. Aim. Study the association of FTO rs9939609, TCF7L2 rs7903146, rs1799883 FABP2 polymorphisms on the risk of morbid obesity in women. Materials and methods. The morbid obesity group (n=192, average age 57.02 ± 7.16 years, BMI > 40 kg/m2) and the control group (n=450, average age 55.44 ± 7.41 years, BMI 20-25 kg/m2) were formed from the DNA bank of the international HAPIEE research. Genotyping was performed by PCR-RFLP and real time PCR using TaqMan (Applied Biosystems, USA). The results were statistically processed in the SPSS software. Results. There were no statistically significant differences in the genotype frequencies of TCF7L2 rs7903146, FABP2 rs1799883 (р>0.05) between the morbid obesity group and the control group. The morbid obesity group has the number of TT genotype carriers of FTO rs9939609 polymorphism less (26,6%) and AT genotype more (53,6%) than in the control group (38,4%; 45,1%, respectively), (OR=0.58, 95%CI 0.4-0.84, p=0.004; OR=1.41, 95%CI 1.003-1.98, p=0.047, respectively). Conclusion. AT genotype of FTO rs9939609 is the genotype of the risk of morbid obesity in women and TT genotype has a protective effect against it. Polymorphisms TCF7L2 rs7903146, FABP2 rs1799883 were not associated with morbid obesity in the studied group of women.
目标。研究rs9999609 FTO基因,rs7903146 TCF7L2基因,rs1799883 FABP2基因与morbid肥胖。材料和方法。morbid肥胖组(n=192,平均年龄为57.02 7.16,imt > > 40公斤/ m2)和控制组(n=450,平均年龄为55.44岁,20 - 25公斤/ m2)是由HAPIEE国际dna研究银行组成的。基因测序是由pcr - pdrf和pcr实时执行的,使用的是TaqMan探测器(美国应用生物系统)。统计结果的处理是在SPSS软件中进行的。结果。在rs7903146 TCF7L2基因频率上,rs1799883 FABP2基因(r > 0.05)之间没有明显的统计差异。据统计,rs9999609 FTO基因载体的rs999609基因比对照组(38.4%)小(26.6%),而a型基因比对照组(53.6%)大(38.4%);分别为45.1% (oc = 0.58, 95%), 0.4 - 0.84, p= 0.004;= = 1.41,95%的di, 1,003- 1.98, p= 0.047。结论。rs99999609 FTO基因型是女性患肥胖风险的基因测序器,tt型基因对其具有保护作用。rs7903146型TCF7L2基因和rs1799883型FABP2基因与morbid肥胖无关。Aim。FTO rs999609, tc7703146, rs1799883 FABP2在女性形态的上升。物质和媒介。morbid obesity组(n=192, average时代57.2,BMI > 40 kg/m2)和控制组(n=450, 55.44年,25 kg/m2)基因是由PCR-RFLP和实时时间TaqMan实现的。在SPSS软件中提供的资源是实实在在的。Results。在tcf7703146、FABP2 rs1799883、FABP2 rs1799883和控制组。在控制组(38.4%)中,又有53.6%的人在控制组(38.4%);45.1%(或0.58),95%CI 0.4-0.84, p=0.004;OR=1.41, 95%的ci 1.003-1.98, p=0.047,反应。Conclusion。FTO的基因类型rs9939609是女性和TT基因类型的基因类型。TCF7L2 rs7903146, FABP2 rs1799883,在女性工作室组中没有与morbid相关。
{"title":"Association of FTO rs9939609, TCF7L2 rs7903146, FABP2 rs1799883 polymorphisms with morbid obesity in women","authors":"Зорина, В.В., Мельникова, Е.С., Иванова, А.А., Гуражева, А.А., Максимов, В.Н.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.07.52-55","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.07.52-55","url":null,"abstract":"Цель. Изучение ассоциации полиморфизмов rs9939609 гена FTO, rs7903146 гена TCF7L2, rs1799883 гена FABP2 с морбидным ожирением у женщин. Материалы и методы. Группа морбидного ожирения (n=192, средний возраст 57,02 ± 7,16 лет, ИМТ> 40 кг/м2) и контрольная группа (n=450, средний возраст 55,44 ± 7,41 лет, ИМТ 20 - 25 кг/м2) сформированы из банка ДНК международного исследования HAPIEE. Генотипирование выполнено методами ПЦР-ПДРФ и ПЦР в режиме реального времени с использованием TaqMan зондов (Applied Biosystems, США). Статистическая обработка полученных результатов осуществлена в программном обеспечении SPSS. Результаты. Не выявлено статистически значимых различий между группой морбидного ожирения и контрольной группой по частотам генотипов rs7903146 гена TCF7L2, rs1799883 гена FABP2 (р>0,05). В группе морбидного ожирения у женщин доля носителей генотипа ТТ полиморфизма rs9939609 гена FTO статистически значимо меньше (26,6%), а генотипа АТ значимо больше (53,6%), чем в контрольной группе (38,4%; 45,1%, соответственно), (ОШ=0,58, 95%ДИ 0,4-0,84, p=0,004; ОШ=1,41, 95%ДИ 1,003-1,98, p=0,047, соответственно). Выводы. Генотип АТ полиморфизма rs9939609 гена FTO является генотипом риска морбидного ожирения у женщин, а генотип ТТ обладает протективным эффектом в его отношении. Не обнаружено ассоциации вариантов нуклеотидной последовательности rs7903146 гена TCF7L2 и rs1799883 гена FABP2 с морбидным ожирением у женщин.\u0000 Aim. Study the association of FTO rs9939609, TCF7L2 rs7903146, rs1799883 FABP2 polymorphisms on the risk of morbid obesity in women. Materials and methods. The morbid obesity group (n=192, average age 57.02 ± 7.16 years, BMI > 40 kg/m2) and the control group (n=450, average age 55.44 ± 7.41 years, BMI 20-25 kg/m2) were formed from the DNA bank of the international HAPIEE research. Genotyping was performed by PCR-RFLP and real time PCR using TaqMan (Applied Biosystems, USA). The results were statistically processed in the SPSS software. Results. There were no statistically significant differences in the genotype frequencies of TCF7L2 rs7903146, FABP2 rs1799883 (р>0.05) between the morbid obesity group and the control group. The morbid obesity group has the number of TT genotype carriers of FTO rs9939609 polymorphism less (26,6%) and AT genotype more (53,6%) than in the control group (38,4%; 45,1%, respectively), (OR=0.58, 95%CI 0.4-0.84, p=0.004; OR=1.41, 95%CI 1.003-1.98, p=0.047, respectively). Conclusion. AT genotype of FTO rs9939609 is the genotype of the risk of morbid obesity in women and TT genotype has a protective effect against it. Polymorphisms TCF7L2 rs7903146, FABP2 rs1799883 were not associated with morbid obesity in the studied group of women.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"603 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-07-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"116361446","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
The effect of genes regulating glutamatergic and GABAergic neurotransmission in working memory 调节谷氨酸能和gaba能神经传递的基因在工作记忆中的作用
Pub Date : 2022-07-29 DOI: 10.25557/2073-7998.2022.07.46-49
Еникеева, Р. Ф., Казанцева, А. В., Давыдова, Ю. Д., Мустафин, Р. Н., Лобаскова, М.М., Малых, С.Б., Хуснутдинова, Э.К.
Целью нашего исследования являлась оценка вовлеченности полиморфных вариантов генов, отвечающих за регуляцию глутаматергических и ГАМКергических нейромедиаторов, в формирование различий в объёме рабочей памяти у 1011 студентов университетов Республики Башкортостан и Республики Удмуртия. В результате линейного регрессионного анализа была показана ассоциация полиморфного локуса rs4971648 гена NRXN1 (p = 0,008; β = - 0,84) с вариациями в объёме рабочей памяти у курящих индивидов. Полученные данные вносят вклад в понимание молекулярно-генетических механизмов, лежащих в основе индивидуальных различии в объеме рабочей памяти. The aim of our study was to assess the involvement of polymorphic variants of genes responsible for the regulation of glutamatergic and GABAergic neurotransmission in the formation of differences in the volume of working memory in 1011 university students of the Republic of Bashkortostan and the Republic of Udmurtia. As a result of linear regression analysis, the association of the polymorphic locus rs4971648 of the NRXN1 gene was shown (p = 0.008; β = - 0.84) with variations in the amount of working memory in smoking individuals.The obtained data contribute to the understanding of the molecular genetic mechanisms underlying individual differences in the amount of working memory.
我们的研究重点是评估负责调节味精和甘卡氏神经递质的多态性基因的参与,以区别于巴什科尔托斯坦大学1011名学生和乌得穆尔蒂亚共和国的工作记忆。线性回归分析显示,rs4971648 NRXN1基因协会(p = 0.008;吸烟的个体的工作容量有不同的变化。由此产生的数据有助于理解工作内存中个人差异的分子-基因机制。在1011年的巴什科托斯坦大学和Udmurtia学院工作的记忆中,我们的研究是对基因变化的无知。作为linear regression分析的一部分,NRXN1基因的聚合体rs4971648是一个展示(p = 0.008);在smoking individuals的记忆中,有一个变化。在工作记忆的大纲中,被蒙在鼓里的数据连接到基因机体的底层。
{"title":"The effect of genes regulating glutamatergic and GABAergic neurotransmission in working memory","authors":"Еникеева, Р. Ф., Казанцева, А. В., Давыдова, Ю. Д., Мустафин, Р. Н., Лобаскова, М.М., Малых, С.Б., Хуснутдинова, Э.К.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.07.46-49","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.07.46-49","url":null,"abstract":"Целью нашего исследования являлась оценка вовлеченности полиморфных вариантов генов, отвечающих за регуляцию глутаматергических и ГАМКергических нейромедиаторов, в формирование различий в объёме рабочей памяти у 1011 студентов университетов Республики Башкортостан и Республики Удмуртия. В результате линейного регрессионного анализа была показана ассоциация полиморфного локуса rs4971648 гена NRXN1 (p = 0,008; β = - 0,84) с вариациями в объёме рабочей памяти у курящих индивидов. Полученные данные вносят вклад в понимание молекулярно-генетических механизмов, лежащих в основе индивидуальных различии в объеме рабочей памяти.\u0000 The aim of our study was to assess the involvement of polymorphic variants of genes responsible for the regulation of glutamatergic and GABAergic neurotransmission in the formation of differences in the volume of working memory in 1011 university students of the Republic of Bashkortostan and the Republic of Udmurtia. As a result of linear regression analysis, the association of the polymorphic locus rs4971648 of the NRXN1 gene was shown (p = 0.008; β = - 0.84) with variations in the amount of working memory in smoking individuals.The obtained data contribute to the understanding of the molecular genetic mechanisms underlying individual differences in the amount of working memory.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"1 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-07-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"125848704","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Relationship between schizophrenia polygenic risk scores and schizotypy: dimensional and taxonomic approaches 精神分裂症多基因风险评分与分裂型的关系:维度和分类学方法
Pub Date : 2022-07-29 DOI: 10.25557/2073-7998.2022.07.8-10
Алфимова, М.В., Кондратьев, Н.В., Плакунова, В.В., Лежейко, Т.В., Голимбет, В.Е.
Шизотипию рассматривают как фенотип, отражающий доклинические проявления генетической предрасположенности к шизофрении. Существует два взгляда на природу этой связи - дименсиональный и таксономический. Предыдущие исследования вклада полигенных показателей риска (PRS) шизофрении в выраженность шизотипии были проведены в западноевропейских популяциях, использовали дименсиональную модель и получили отрицательные результаты. Цель настоящего исследования заключалась в оценке связи PRS шизофрении с дименсиями и таксонами шизотипии в русской популяции. Методы. Полногеномные данные были получены для выборки из 290 здоровых испытуемых, принадлежащих к кластерам лиц с низкой, позитивной, негативной и высокой смешанной шизотипией. Шизотипию измеряли с использованием Опросника шизотипической личности (SPQ). Результаты. PRS шизофрении не коррелировали с когнитивно-перцептивным, параноидным, межличностным или дезорганизационным дименсиями SPQ. Таксоноподобные группы (кластеры) различались по PRS на уровне тенденции с максимальными PRS в группе с высоко выраженной смешанной шизотипией. Заключение. Результаты согласуются с предположением таксономической модели о том, что у части здоровых лиц с высокой выраженностью шизотипических личностных черт последние являются отражением генетической предрасположенности к шизофрении. Schizotypy is considered as a phenotype that reflects preclinical manifestations of a genetic predisposition to schizophrenia. There are two views on the nature of this relationship - dimensional and taxonomic. Previous studies on the contribution of schizophrenia polygenic risk scores (PRS) to schizotypy were conducted in Western European populations using the dimensional model and yielded negative results. The objective of this study was to assess the relationship between schizophrenia PRS and dimensions and taxa of schizotypy in the Russian population. Methods. Genome-wide data were obtained from a sample of 290 healthy subjects belonging to the clusters of individuals with low, positive, negative, and high mixed schizotypy. Schizotypy was measured using the Schizotypal Personality Questionnaire (SPQ). Results. The schizophrenia PRS did not correlate with cognitive-perceptual, paranoid, interpersonal, or disorganized SPQ factors. Taxon-like groups (clusters) differed in PRS at a trend level, with the highest PRS being found in the high mixed schizotypy group. Conclusion. The results are consistent with the assumption of the taxonomic model of schizotypy that in some healthy individuals with a high degree of schizotypal personality traits, these traits reflect the genetic predisposition to schizophrenia.
精神分裂被认为是一种表型,反映了前临床表现的遗传倾向于精神分裂症。对这种联系的性质有两种看法——二门论和分类学。之前的研究表明,精神分裂症多基因风险指数(PRS)对精神分裂症表征的影响是在西欧种群中进行的,使用了二月形模型,结果呈阴性。这项研究的目的是评估PRS与dimensia和taxon之间的联系。方法。完整的基因组数据来自290个健康的受试者,他们属于低、正、负、高、混合分裂型人格。分裂型人格是用分裂型人格调查(SPQ)来衡量的。结果。PRS精神分裂症与认知感知、偏执、人际或无组织性痴呆无关。分类组(集群)在趋势上与PRS不同,PRS在高度表达的混合分裂型群体中是最大的。囚犯。结果符合分类学模型的假设,一些具有高度分裂人格特征的健康人最近反映了精神分裂症的遗传倾向。Schizotypy是一种受影响的体能,这种反射是对schizophrenia的遗传预览。在这种相关性的本质上有两种观点。在欧洲西部的施利泽模型和yielded negative results上的预览工作室。这个工作室的主题是俄罗斯流行音乐中的相关性。Methods。Genome-wide从290个不同的下属那里获得了数据,他们带着低、低、低、高混合schizotypy来到了印度俱乐部。Schizotypy是一个伟大的人物探索(SPQ)。Results。schizophrenia PRS没有与cognitive- persertual、妄想狂、interpersonal或分裂的SPQ工厂合作。Taxon-like groups(俱乐部)在trend level上与最高的pass一起被发现。Conclusion。在某种程度上,这是一种体能训练,是一种体能训练,是一种体能训练。
{"title":"Relationship between schizophrenia polygenic risk scores and schizotypy: dimensional and taxonomic approaches","authors":"Алфимова, М.В., Кондратьев, Н.В., Плакунова, В.В., Лежейко, Т.В., Голимбет, В.Е.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.07.8-10","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.07.8-10","url":null,"abstract":"Шизотипию рассматривают как фенотип, отражающий доклинические проявления генетической предрасположенности к шизофрении. Существует два взгляда на природу этой связи - дименсиональный и таксономический. Предыдущие исследования вклада полигенных показателей риска (PRS) шизофрении в выраженность шизотипии были проведены в западноевропейских популяциях, использовали дименсиональную модель и получили отрицательные результаты. Цель настоящего исследования заключалась в оценке связи PRS шизофрении с дименсиями и таксонами шизотипии в русской популяции. Методы. Полногеномные данные были получены для выборки из 290 здоровых испытуемых, принадлежащих к кластерам лиц с низкой, позитивной, негативной и высокой смешанной шизотипией. Шизотипию измеряли с использованием Опросника шизотипической личности (SPQ). Результаты. PRS шизофрении не коррелировали с когнитивно-перцептивным, параноидным, межличностным или дезорганизационным дименсиями SPQ. Таксоноподобные группы (кластеры) различались по PRS на уровне тенденции с максимальными PRS в группе с высоко выраженной смешанной шизотипией. Заключение. Результаты согласуются с предположением таксономической модели о том, что у части здоровых лиц с высокой выраженностью шизотипических личностных черт последние являются отражением генетической предрасположенности к шизофрении.\u0000 Schizotypy is considered as a phenotype that reflects preclinical manifestations of a genetic predisposition to schizophrenia. There are two views on the nature of this relationship - dimensional and taxonomic. Previous studies on the contribution of schizophrenia polygenic risk scores (PRS) to schizotypy were conducted in Western European populations using the dimensional model and yielded negative results. The objective of this study was to assess the relationship between schizophrenia PRS and dimensions and taxa of schizotypy in the Russian population. Methods. Genome-wide data were obtained from a sample of 290 healthy subjects belonging to the clusters of individuals with low, positive, negative, and high mixed schizotypy. Schizotypy was measured using the Schizotypal Personality Questionnaire (SPQ). Results. The schizophrenia PRS did not correlate with cognitive-perceptual, paranoid, interpersonal, or disorganized SPQ factors. Taxon-like groups (clusters) differed in PRS at a trend level, with the highest PRS being found in the high mixed schizotypy group. Conclusion. The results are consistent with the assumption of the taxonomic model of schizotypy that in some healthy individuals with a high degree of schizotypal personality traits, these traits reflect the genetic predisposition to schizophrenia.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"46 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-07-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"114677108","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Whole genome analysis of alternative splicing in human placental decidual cells 人胎盘蜕细胞选择性剪接的全基因组分析
Pub Date : 2022-07-29 DOI: 10.25557/2073-7998.2022.07.36-39
Гавриленко, М.М., Бабовская, А.А., Зарубин, А.А., Трифонова, Е.А., Степанов, В.А.
Альтернативный сплайсинг (АС) мРНК является ключевым этапом посттранскрипционной регуляции экспрессии генов, который обеспечивает формирование тканеспецифичных и клеткоспецифичных изоформ РНК. Вероятно, этот механизм оказывает значительное влияние на развитие и функционирование плаценты. В качестве объекта исследования выбраны децидуальные клетки (ДК), которые играют важную роль в поддержании физиологической гестации. Проведено глубокое полнотранскриптомное секвенирование РНК ДК образцов плацентарной ткани, полученных от пациенток с физиологическом течением беременности, в ходе которого идентифицированы 151233 события АС в 352 генах. Примечательно, что только 130 генов характеризовались двумя и более событиями АС. Данные гены вовлечены в канонический сигнальный путь Wnt, регуляцию субстрат-зависимой миграции клеток, активацию андрогенных рецепторов, сплайсинг мРНК. Максимальное число альтернативных событий установлено для гена FN1, продукт которого ассоциирован с развитием преэклампсии и является скрининговым маркером преждевременных родов. Исследование продемонстрировало перспективность дальнейшего изучения распределения альтернативно сплайсированных изоформ гена FN1 в группе пациенток как с физиологической беременностью, так и в когорте с акушерской патологией. Alternative splicing (AS) of mRNA is a key stage of post-transcriptional regulation of gene expression, which ensures the expression of various isoforms of RNA. Probably, this mechanism plays an important role in the development and functioning of the placenta. Decidual cells (DC) were chosen as the object of research due to their key role in physiological pregnancy. Whole transcriptome sequencing of DC RNA of placental tissue samples obtained from patients with the physiological pregnancy was performed, during which 151233 AS events in 352 genes were identified. It is noteworthy that two or more AS events characterized only 130 genes. These genes are involved in the canonical Wnt signaling pathway, regulation of substrate-dependent cell migration, activation of androgen receptors, and mRNA splicing. The maximum number of alternative events per gene established for the FN1 gene, the product of which is associated with the development of preeclampsia and is a screening marker of premature birth. The study suggests the prospects for further exploring of the distribution of alternatively spliced isoforms of the FN1 gene in a cohort of patients with both physiological pregnancy and obstetric pathology.
另一种融合(as) mrna是转录后基因表达调节的关键阶段,该阶段为rna形成组织和细胞亚型。这种机制可能对胎盘的发育和功能产生重大影响。研究对象是分泌物细胞(dk),它们在维持生理盖世太保方面起着重要作用。从怀孕生理过程中提取的胎盘样本对rna dk进行了深度全转录测序,确定了352个基因中的ace事件151233。值得注意的是,只有130个基因被两个或两个以上的ace事件定义。这些基因参与了典型的Wnt信号路径,调节细胞亚细胞系迁移,激活雌激素受体,mrna融合。FN1基因的选择数量最多,其产品与子痫前期有关,是早产的截面标记。研究表明,有可能进一步研究将替代融合的FN1基因转移到一组患者中,无论是生理怀孕还是助产士病理学。mRNA的另一个阶段是基因快照的关键阶段,而RNA的另一个快照是RNA快照的另一个快照。prochanism播放了这款机器游戏,这款游戏是在开发和宣传中引入的。最终的cells (DC)是一种选择,这是一种体格优美的研究方法。在352个基因中,有一种现象是,151233个基因中有一种现象。这是一个noteworthy两个或更多的只是130个基因。These genes在canonical Wnt信号通路、次级通路、androgen receptors和mRNA splicing都被激活了。在FN1基因上,这是一种混合了“牧师”的产品,是一种“灵巧诞生”的尖叫标记。= =历史= = FN1基因在一种不同的物种中具有不同的体格和特征特征。
{"title":"Whole genome analysis of alternative splicing in human placental decidual cells","authors":"Гавриленко, М.М., Бабовская, А.А., Зарубин, А.А., Трифонова, Е.А., Степанов, В.А.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.07.36-39","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.07.36-39","url":null,"abstract":"Альтернативный сплайсинг (АС) мРНК является ключевым этапом посттранскрипционной регуляции экспрессии генов, который обеспечивает формирование тканеспецифичных и клеткоспецифичных изоформ РНК. Вероятно, этот механизм оказывает значительное влияние на развитие и функционирование плаценты. В качестве объекта исследования выбраны децидуальные клетки (ДК), которые играют важную роль в поддержании физиологической гестации. Проведено глубокое полнотранскриптомное секвенирование РНК ДК образцов плацентарной ткани, полученных от пациенток с физиологическом течением беременности, в ходе которого идентифицированы 151233 события АС в 352 генах. Примечательно, что только 130 генов характеризовались двумя и более событиями АС. Данные гены вовлечены в канонический сигнальный путь Wnt, регуляцию субстрат-зависимой миграции клеток, активацию андрогенных рецепторов, сплайсинг мРНК. Максимальное число альтернативных событий установлено для гена FN1, продукт которого ассоциирован с развитием преэклампсии и является скрининговым маркером преждевременных родов. Исследование продемонстрировало перспективность дальнейшего изучения распределения альтернативно сплайсированных изоформ гена FN1 в группе пациенток как с физиологической беременностью, так и в когорте с акушерской патологией.\u0000 Alternative splicing (AS) of mRNA is a key stage of post-transcriptional regulation of gene expression, which ensures the expression of various isoforms of RNA. Probably, this mechanism plays an important role in the development and functioning of the placenta. Decidual cells (DC) were chosen as the object of research due to their key role in physiological pregnancy. Whole transcriptome sequencing of DC RNA of placental tissue samples obtained from patients with the physiological pregnancy was performed, during which 151233 AS events in 352 genes were identified. It is noteworthy that two or more AS events characterized only 130 genes. These genes are involved in the canonical Wnt signaling pathway, regulation of substrate-dependent cell migration, activation of androgen receptors, and mRNA splicing. The maximum number of alternative events per gene established for the FN1 gene, the product of which is associated with the development of preeclampsia and is a screening marker of premature birth. The study suggests the prospects for further exploring of the distribution of alternatively spliced isoforms of the FN1 gene in a cohort of patients with both physiological pregnancy and obstetric pathology.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"63 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-07-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"134299490","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
The effect of DNA methylation and genetic variants of the hypothalamic-pituitary-adrenal system with phenotypic variations in depression DNA甲基化和下丘脑-垂体-肾上腺系统遗传变异对抑郁症表型变异的影响
Pub Date : 2022-07-29 DOI: 10.25557/2073-7998.2022.07.40-42
Давыдова, Ю.Д., Казанцева, А.В., Еникеева, Р.Ф., Мустафин, Р.Н., Лобаскова, М.М., Малых, С.Б., Хуснутдинова, Э.К.
Целью настоящего исследования стала оценка связи уровня метилирования ДНК и полиморфных вариантов генов гипоталамо-гипофизарно-надпочечниковой системы с фенотипическими вариациями уровня депрессивности у 1065 психически здоровых индивидов с учётом половой и этнической принадлежности. В результате линейного регрессионного анализа была выявлена ассоциация полиморфных локусов rs53576, rs7632287 и rs2254298 гена OXTR, rs1042615 и rs3803107 гена AVPR1A, а также rs28632197 гена AVPR1B с вариациями уровня депрессивности. Кроме того, обнаружена ассоциация статуса метилирования генов OXT (р=0,003; OR=2,12) и AVPR1A (р=0,013; OR=3,38) с повышенной депрессивностью. Полученные результаты вносят вклад в понимание биологических основ депрессии и могут быть рассмотрены в качестве биомаркеров депрессивного поведения. The present study aimed to assess the effect of DNA methylation and genetic variants of the hypothalamic-pituitary-adrenal system with phenotypic variance in depression in 1065 mentally healthy individuals controlling for sex and ethnicity. As a result of linear regression analysis, the association of polymorphic loci rs53576, rs7632287 and rs2254298 of the OXTR gene, rs1042615 and rs3803107 of the AVPR1A gene, as well as rs28632197 of the AVPR1B gene with depression level was revealed. In addition, the association of the methylation status of the OXT (Р=0,003; OR=2,12) and AVPR1A (Р=0,013; OR=3,38) genes and an increased risk of developing depression was found. The results contribute to understanding the biological basis of depression and identifying biomarkers of depressive behavior.
本研究的目标是评估dna甲基化水平和下丘脑下垂体肾上腺基因的多态性变异,1065名心理健康的个体因性别和种族而抑郁。通过线性回归分析,rs53576、rs76387和rs74298 OXTR基因、rs104615和rs383107 AVPR1A基因的rs2863197被诊断出患有抑郁症。此外,还发现了OXT基因甲基化状态协会(r = 0.003);OR= 2.12)和AVPR1A (r = 0.013);OR= 3.38)患有严重抑郁。这些结果有助于理解抑郁的生物学基础,并可以被视为抑郁行为的生物标记。在1065年的《心理健康》中,现代的DNA突变和遗传的遗传系统与心理健康的遗传变异一起控制性和以太性。作为一个linear regression分析,rs76387, rs76298的OXTR基因,rs104615和rs3803107的基因,作为AVPR1A基因,在addition,介质状态协会(r = 003);OR= 2.12)和AVPR1A (r = 0.013;或者是3.38)基因和不受开发depression定义的risk是found。这是一种被称为“depression”和“dehavior”的生物标记的回归。
{"title":"The effect of DNA methylation and genetic variants of the hypothalamic-pituitary-adrenal system with phenotypic variations in depression","authors":"Давыдова, Ю.Д., Казанцева, А.В., Еникеева, Р.Ф., Мустафин, Р.Н., Лобаскова, М.М., Малых, С.Б., Хуснутдинова, Э.К.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.07.40-42","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.07.40-42","url":null,"abstract":"Целью настоящего исследования стала оценка связи уровня метилирования ДНК и полиморфных вариантов генов гипоталамо-гипофизарно-надпочечниковой системы с фенотипическими вариациями уровня депрессивности у 1065 психически здоровых индивидов с учётом половой и этнической принадлежности. В результате линейного регрессионного анализа была выявлена ассоциация полиморфных локусов rs53576, rs7632287 и rs2254298 гена OXTR, rs1042615 и rs3803107 гена AVPR1A, а также rs28632197 гена AVPR1B с вариациями уровня депрессивности. Кроме того, обнаружена ассоциация статуса метилирования генов OXT (р=0,003; OR=2,12) и AVPR1A (р=0,013; OR=3,38) с повышенной депрессивностью. Полученные результаты вносят вклад в понимание биологических основ депрессии и могут быть рассмотрены в качестве биомаркеров депрессивного поведения.\u0000 The present study aimed to assess the effect of DNA methylation and genetic variants of the hypothalamic-pituitary-adrenal system with phenotypic variance in depression in 1065 mentally healthy individuals controlling for sex and ethnicity. As a result of linear regression analysis, the association of polymorphic loci rs53576, rs7632287 and rs2254298 of the OXTR gene, rs1042615 and rs3803107 of the AVPR1A gene, as well as rs28632197 of the AVPR1B gene with depression level was revealed. In addition, the association of the methylation status of the OXT (Р=0,003; OR=2,12) and AVPR1A (Р=0,013; OR=3,38) genes and an increased risk of developing depression was found. The results contribute to understanding the biological basis of depression and identifying biomarkers of depressive behavior.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"36 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-07-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"132293756","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Identification of population characteristics of the decidual cells transcriptome in severe preeclampsia 重度子痫前期蜕膜细胞转录组群体特征的鉴定
Pub Date : 2022-07-29 DOI: 10.25557/2073-7998.2022.07.15-18
Бабовская, А.А., Трифонова, Е. А., Сереброва, В. Н., Сваровская, М. Г., Зарубин, А. А., Рычкова, Л. В., Степанов, В. А.
Известно, что дефекты децидуализации на ранних сроках гестации приводят к задержке роста плода, прерыванию беременности или различным акушерским осложнениям на более поздних сроках. Цель - выявление особенностей транскриптомного профиля децидуальных клеток (ДК) при тяжелой форме преэклампсии (ПЭ) у русских и бурят. Осуществлен полнотранскриптомный анализ ДК плаценты представителей двух этнических групп (русские (n=4) и буряты (n=4)). Единичные ДК были получены с использованием технологии лазерной микродиссекциии препаратов тонких окрашенных срезов. При сравнении экспрессионных профилей ДК в обследованных группах статистически значимые различия (FDR<0,05) были выявлены для 61 транскрипта. Для большей части идентифицированных дифференциально-экспрессирующихся генов (ДЭГ) была характерна гиперэкспрессия в образцах русских, но лишь 15 генов показали высокий уровень экспрессии у бурят. Полученные результаты cвидетельствуют, что в дифференциации транскриптомного профиля ДК русских и бурятских женщин с ПЭ преобладают пути системы врожденного иммунитета, сопряженные с активностью белков интерферона, что подтверждено не только функциональной аннотацией списка идентифицированных ДЭГ, но и при сетевом анализе данных. Decidualization defects in early gestation are known to lead to fetal growth retardation, miscarriage, or various obstetric complications. The aim is to reveal the transcriptomic profile of decidual cells (DC) in severe preeclampsia in Russians and Buryats. A full-transcriptomic analysis of placenta DC was carried out in representatives of two ethnic groups (Russians (n=4) and Buryats (n=4)). Single DC were obtained using laser microdissection technology and thin stained section preparations. When comparing expression profiles of DC in the examined groups, statistically significant differences (FDR<0.05) were revealed for 61 transcripts. Most of the identified differentially expressed genes (DEGs) were characterized by overexpression in Russian samples, while only 15 genes showed a high level of expression in Buryats. The results obtained indicate that the pathways of the innate immunity system associated with the activity of interferon proteins predominate in the differentiation of the DC transcriptomic profile of Russian and Buryat women with preeclampsia, which was confirmed not only by functional annotation of the list of identified DEG genes, but also by network analysis of data.
众所周知,盖世太保早期的排异缺陷会导致胎儿发育迟缓、妊娠中断或后来的助产士并发症。目标是在俄罗斯人的严重子痫前期(pe)中发现超密码型分泌物细胞特征。两个民族(n=4)和风暴(n=4)的胎盘完全转录分析正在进行中。单个dk是通过激光显微解剖技术获得的。相比dk在调查组中的表现特征,统计差异(FDR< 0.05)为61个转录本被发现。大多数被识别的微分表达基因(dag)在俄罗斯样本中表现出过度表达,但只有15个基因显示出在钻探中表现良好。结果显示,俄罗斯和巴解组织pe的转录资料显示,与干扰素蛋白相关的先天性免疫系统占主导地位,这不仅是通过功能概述来证实的,而且通过网络数据分析也证实了这一点。早期地理位置上的Decidualization defectation, miscarriage,或不同的实体编译器。The aim is to reveal》The transcriptomic profile of decidual cells (DC) in severe preeclampsia in Russians and Buryats。两层楼高的俄罗斯人(n=4)和伯亚茨人(n=4)在两层楼(4)中保持着热情。单个DC是指使用激光微分裂技术和单个基准部分。DC in the examined与When comparing expression of groups, statistically differences一张重要(罗斯福< 0.05)61 transcripts were revealed for。俄罗斯samples上最著名的分裂基因(DEGs)是由15个基因在Buryats上展示的。The results obtained indicate that The pathways of The innate美联社(associated with The based immunity system of peg proteins DC transcriptomic predominate in The differentiation of The profile of俄罗斯and Buryat women with preeclampsia主演was confirmed not only by functional annotation of The list of identify DEG genes, but also by network analysis of data。
{"title":"Identification of population characteristics of the decidual cells transcriptome in severe preeclampsia","authors":"Бабовская, А.А., Трифонова, Е. А., Сереброва, В. Н., Сваровская, М. Г., Зарубин, А. А., Рычкова, Л. В., Степанов, В. А.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.07.15-18","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.07.15-18","url":null,"abstract":"Известно, что дефекты децидуализации на ранних сроках гестации приводят к задержке роста плода, прерыванию беременности или различным акушерским осложнениям на более поздних сроках. Цель - выявление особенностей транскриптомного профиля децидуальных клеток (ДК) при тяжелой форме преэклампсии (ПЭ) у русских и бурят. Осуществлен полнотранскриптомный анализ ДК плаценты представителей двух этнических групп (русские (n=4) и буряты (n=4)). Единичные ДК были получены с использованием технологии лазерной микродиссекциии препаратов тонких окрашенных срезов. При сравнении экспрессионных профилей ДК в обследованных группах статистически значимые различия (FDR<0,05) были выявлены для 61 транскрипта. Для большей части идентифицированных дифференциально-экспрессирующихся генов (ДЭГ) была характерна гиперэкспрессия в образцах русских, но лишь 15 генов показали высокий уровень экспрессии у бурят. Полученные результаты cвидетельствуют, что в дифференциации транскриптомного профиля ДК русских и бурятских женщин с ПЭ преобладают пути системы врожденного иммунитета, сопряженные с активностью белков интерферона, что подтверждено не только функциональной аннотацией списка идентифицированных ДЭГ, но и при сетевом анализе данных.\u0000 Decidualization defects in early gestation are known to lead to fetal growth retardation, miscarriage, or various obstetric complications. The aim is to reveal the transcriptomic profile of decidual cells (DC) in severe preeclampsia in Russians and Buryats. A full-transcriptomic analysis of placenta DC was carried out in representatives of two ethnic groups (Russians (n=4) and Buryats (n=4)). Single DC were obtained using laser microdissection technology and thin stained section preparations. When comparing expression profiles of DC in the examined groups, statistically significant differences (FDR<0.05) were revealed for 61 transcripts. Most of the identified differentially expressed genes (DEGs) were characterized by overexpression in Russian samples, while only 15 genes showed a high level of expression in Buryats. The results obtained indicate that the pathways of the innate immunity system associated with the activity of interferon proteins predominate in the differentiation of the DC transcriptomic profile of Russian and Buryat women with preeclampsia, which was confirmed not only by functional annotation of the list of identified DEG genes, but also by network analysis of data.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"28 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-07-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"122217856","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
Analysis of the association of the polymorphic locus rs17878362 of the TP53 gene with the risk of ovarian cancer TP53基因多态性位点rs17878362与卵巢癌发病风险的相关性分析
Pub Date : 2022-07-29 DOI: 10.25557/2073-7998.2022.07.63-65
Коростелева, А.В., Харина, О.К., Мингажева, Э.Т., Валова, Я.В., Андреева, Е.А., Прокофьева, Д.С., Хуснутдинова, Э.К.
Среди злокачественных новообразований органов женской репродуктивной системы рак яичников (РЯ) лидирует по числу смертей. Молекулярный механизм развития опухолей яичников содержит разнообразные генетические и эпигенетические события, лежащие в основе злокачественной трансформации клеток, которые вызывают активацию онкогенов и инактивацию генов-супрессоров опухолей. К числу генов-супрессоров опухолевого роста относится ген TP53. Нарушение или недостаточное функционирование белкового продукта данного гена приводит к развитию различных онкологических заболеваний, в том числе и к РЯ. В данной работе представлен ассоциативный анализ варианта rs17878362 гена TP53 с риском развития РЯ у женщин из Республики Башкортостан. Among malignant neoplasms of the organs of the female reproductive system, ovarian cancer (OC) leads in the number of deaths. The molecular mechanism of ovarian tumor development contains a variety of genetic and epigenetic events that cause activation of oncogenes and inactivation of tumor suppressor genes underlying malignant cell transformation [2]. The TP53 gene is one of the tumor suppressor genes. Violation or insufficient functioning of the protein product of this gene leads to the development of various oncological diseases, including ovarian cancer. This paper presents an associative analysis of the variant rs17878362 of the TP53 gene with the risk of ovarian cancer in women from the Republic of Bashkortostan.
在女性生殖系统的恶性肿瘤中,卵巢癌(rh)是死亡人数最多的癌症。卵巢肿瘤的分子发育机制包含多种遗传和表观事件,这些事件是导致肿瘤基因激活和肿瘤抑制基因失活的恶性细胞转化的基础。肿瘤生长抑制基因包括TP53基因。该基因蛋白质产品的缺陷或功能不足会导致多种癌症疾病,包括癌症。这份工作对rs1788362 TP53基因的变体进行了联想分析,风险来自巴什科尔托斯坦共和国的妇女。阿瓦里安·坎克(ovarian cancer)在死亡数字中的领导地位。莫勒库尔机械公司是由奥瓦里安·塔莫设计的,这是一种不同的基因,是由基因驱动的。TP53基因是tumor suppressor基因中的一个。暴力或暴力是这一基因走向单色分裂的先驱者,是奥瓦里安·坎克尔的启发。这是来自巴什科托斯坦共和国的奥瓦里安·坎克的《变种人》。
{"title":"Analysis of the association of the polymorphic locus rs17878362 of the TP53 gene with the risk of ovarian cancer","authors":"Коростелева, А.В., Харина, О.К., Мингажева, Э.Т., Валова, Я.В., Андреева, Е.А., Прокофьева, Д.С., Хуснутдинова, Э.К.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.07.63-65","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.07.63-65","url":null,"abstract":"Среди злокачественных новообразований органов женской репродуктивной системы рак яичников (РЯ) лидирует по числу смертей. Молекулярный механизм развития опухолей яичников содержит разнообразные генетические и эпигенетические события, лежащие в основе злокачественной трансформации клеток, которые вызывают активацию онкогенов и инактивацию генов-супрессоров опухолей. К числу генов-супрессоров опухолевого роста относится ген TP53. Нарушение или недостаточное функционирование белкового продукта данного гена приводит к развитию различных онкологических заболеваний, в том числе и к РЯ. В данной работе представлен ассоциативный анализ варианта rs17878362 гена TP53 с риском развития РЯ у женщин из Республики Башкортостан.\u0000 Among malignant neoplasms of the organs of the female reproductive system, ovarian cancer (OC) leads in the number of deaths. The molecular mechanism of ovarian tumor development contains a variety of genetic and epigenetic events that cause activation of oncogenes and inactivation of tumor suppressor genes underlying malignant cell transformation [2]. The TP53 gene is one of the tumor suppressor genes. Violation or insufficient functioning of the protein product of this gene leads to the development of various oncological diseases, including ovarian cancer. This paper presents an associative analysis of the variant rs17878362 of the TP53 gene with the risk of ovarian cancer in women from the Republic of Bashkortostan.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"154 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-07-29","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"127342322","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
引用次数: 0
期刊
Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika
全部 Acc. Chem. Res. ACS Applied Bio Materials ACS Appl. Electron. Mater. ACS Appl. Energy Mater. ACS Appl. Mater. Interfaces ACS Appl. Nano Mater. ACS Appl. Polym. Mater. ACS BIOMATER-SCI ENG ACS Catal. ACS Cent. Sci. ACS Chem. Biol. ACS Chemical Health & Safety ACS Chem. Neurosci. ACS Comb. Sci. ACS Earth Space Chem. ACS Energy Lett. ACS Infect. Dis. ACS Macro Lett. ACS Mater. Lett. ACS Med. Chem. Lett. ACS Nano ACS Omega ACS Photonics ACS Sens. ACS Sustainable Chem. Eng. ACS Synth. Biol. Anal. Chem. BIOCHEMISTRY-US Bioconjugate Chem. BIOMACROMOLECULES Chem. Res. Toxicol. Chem. Rev. Chem. Mater. CRYST GROWTH DES ENERG FUEL Environ. Sci. Technol. Environ. Sci. Technol. Lett. Eur. J. Inorg. Chem. IND ENG CHEM RES Inorg. Chem. J. Agric. Food. Chem. J. Chem. Eng. Data J. Chem. Educ. J. Chem. Inf. Model. J. Chem. Theory Comput. J. Med. Chem. J. Nat. Prod. J PROTEOME RES J. Am. Chem. Soc. LANGMUIR MACROMOLECULES Mol. Pharmaceutics Nano Lett. Org. Lett. ORG PROCESS RES DEV ORGANOMETALLICS J. Org. Chem. J. Phys. Chem. J. Phys. Chem. A J. Phys. Chem. B J. Phys. Chem. C J. Phys. Chem. Lett. Analyst Anal. Methods Biomater. Sci. Catal. Sci. Technol. Chem. Commun. Chem. Soc. Rev. CHEM EDUC RES PRACT CRYSTENGCOMM Dalton Trans. Energy Environ. Sci. ENVIRON SCI-NANO ENVIRON SCI-PROC IMP ENVIRON SCI-WAT RES Faraday Discuss. Food Funct. Green Chem. Inorg. Chem. Front. Integr. Biol. J. Anal. At. Spectrom. J. Mater. Chem. A J. Mater. Chem. B J. Mater. Chem. C Lab Chip Mater. Chem. Front. Mater. Horiz. MEDCHEMCOMM Metallomics Mol. Biosyst. Mol. Syst. Des. Eng. Nanoscale Nanoscale Horiz. Nat. Prod. Rep. New J. Chem. Org. Biomol. Chem. Org. Chem. Front. PHOTOCH PHOTOBIO SCI PCCP Polym. Chem.
×
引用
GB/T 7714-2015
复制
MLA
复制
APA
复制
导出至
BibTeX EndNote RefMan NoteFirst NoteExpress
×
0
微信
客服QQ
Book学术公众号 扫码关注我们
反馈
×
意见反馈
请填写您的意见或建议
请填写您的手机或邮箱
×
提示
您的信息不完整,为了账户安全,请先补充。
现在去补充
×
提示
您因"违规操作"
具体请查看互助需知
我知道了
×
提示
现在去查看 取消
×
提示
确定
Book学术官方微信
Book学术文献互助
Book学术文献互助群
群 号:481959085
Book学术
文献互助 智能选刊 最新文献 互助须知 联系我们:info@booksci.cn
Book学术提供免费学术资源搜索服务,方便国内外学者检索中英文文献。致力于提供最便捷和优质的服务体验。
Copyright © 2023 Book学术 All rights reserved.
ghs 京公网安备 11010802042870号 京ICP备2023020795号-1