Мышечная дистрофия Дюшенна/Беккера (МДД/МДБ) является наиболее частой формой мышечных дистрофий, на которую приходится более 50% всех случаев. С 01.10.2018 года в лаборатории ДНК-диагностики ФГБНУ «МГНЦ» ведется программа селективного скрининга МДД/МДБ, направленная на раннее выявление больных. Основными критериями включения являются: мужской пол, клинически установленный диагноз МДД или МДБ или значительное повышение уровня креатинфосфокиназы (КФК) (>2000 ЕД/л). На первом этапе скрининга пациентам проводится поиск протяженных делеций и дупликаций методом мультиплексной лигазозависимой амплификации проб. Второй этап заключается в поиске малых мутаций с использованием кастомной панели методом массового параллельного секвенирования. В рамках скрининговой программы обследован 1071 неродственный пробанд. Варианты в гене DMD были обнаружены в 818 (75,3%) случаях. Также в 96 (8,9%) случаях были выявлены другие генетические причины прогрессирующих мышечных дистрофий. Duchenne/Becker muscular dystrophy (DMD/DMB) is the most common form of muscular dystrophy, accounting for over 50% of all cases. Since 01.10.2018, a program of selective screening for DMD/DMB has been conducted on the basis of the DNA diagnostics laboratory of the Research Centre of Medical Genetics, aimed at early detection of patients. The main inclusion criteria are male gender, an established clinical diagnosis of DMD or DMB, or a significant increase in the level of creatine phosphokinase (>2000 U/l). At the first stage of screening, patients are scanned for extended deletions and duplications in the DMD gene using multiplex ligase-dependent probe amplification. The second stage is the search for small mutations using a custom NGS panel. In a screening of 1071 unrelated probands with a referral Duchenne/Becker diagnosis, pathogenic variants in the DMD gene were found in 818 boys (in 75,3% of cases). Also, in 96 (8.9%) cases, other genetic causes of progressive muscular dystrophies were identified.
{"title":"Results of the selective Duchenne/Becker screening program","authors":"Зинина, Е.В., Булах, М.В., Щагина, О.А., Поляков, А.В.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.09.45-47","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.09.45-47","url":null,"abstract":"Мышечная дистрофия Дюшенна/Беккера (МДД/МДБ) является наиболее частой формой мышечных дистрофий, на которую приходится более 50% всех случаев. С 01.10.2018 года в лаборатории ДНК-диагностики ФГБНУ «МГНЦ» ведется программа селективного скрининга МДД/МДБ, направленная на раннее выявление больных. Основными критериями включения являются: мужской пол, клинически установленный диагноз МДД или МДБ или значительное повышение уровня креатинфосфокиназы (КФК) (>2000 ЕД/л). На первом этапе скрининга пациентам проводится поиск протяженных делеций и дупликаций методом мультиплексной лигазозависимой амплификации проб. Второй этап заключается в поиске малых мутаций с использованием кастомной панели методом массового параллельного секвенирования. В рамках скрининговой программы обследован 1071 неродственный пробанд. Варианты в гене DMD были обнаружены в 818 (75,3%) случаях. Также в 96 (8,9%) случаях были выявлены другие генетические причины прогрессирующих мышечных дистрофий.\u0000 Duchenne/Becker muscular dystrophy (DMD/DMB) is the most common form of muscular dystrophy, accounting for over 50% of all cases. Since 01.10.2018, a program of selective screening for DMD/DMB has been conducted on the basis of the DNA diagnostics laboratory of the Research Centre of Medical Genetics, aimed at early detection of patients. The main inclusion criteria are male gender, an established clinical diagnosis of DMD or DMB, or a significant increase in the level of creatine phosphokinase (>2000 U/l). At the first stage of screening, patients are scanned for extended deletions and duplications in the DMD gene using multiplex ligase-dependent probe amplification. The second stage is the search for small mutations using a custom NGS panel. In a screening of 1071 unrelated probands with a referral Duchenne/Becker diagnosis, pathogenic variants in the DMD gene were found in 818 boys (in 75,3% of cases). Also, in 96 (8.9%) cases, other genetic causes of progressive muscular dystrophies were identified.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"181 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-09-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"113953320","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Абдоминальное ожирение, связанное с полигенными наследственными дефектами, считается начальным событием в развитии метаболического синдрома (МС). Целью исследования был анализ частоты полиморфизма генов адипонектина (ADIPOQ) и лептина (LEP) у пациентов с МС, а также ассоциации симптомов МС с полиморфизмом названных генов. ДНК была выделена из цельной крови 207 пациентов с МС и 100 здоровых лиц (контрольная группа). Полиморфизмы генов определяли методом полимеразной цепной реакции в реальном времени. Установлена ассоциация генотипа GG полиморфизма -2548 A/G (rs7799039) гена LEP с риском высокого артериального давления у пациентов с МС, а генотипа GG полиморфизма +45 T/G (rs2241766) гена ADIPOQ с гипергликемией как ведущим звеном развития МС. Установлена статистически значимая связь риска развития МС с аллелем G полиморфизма +45 T/G (rs2241766) гена ADIPOQ (OR (95% СI)= 5,6 (2,4-13,0)), а также с генотипами TG и GG данного варианта (OR (95% СI)=3,81 (1,79-8,09) и OR (95% СI)=10,0 (2,25-44,7). Abdominal obesity connecting with polygenic hereditary defects is considered the initial event in metabolic syndrome (MS) development. The purpose of study was to analyse the frequency of adiponectin (ADIPOQ) and leptin (LEP) gene polymorphisms in patients with MS, and the association of MS’s symptoms with named genes’ polymorphism. DNA was isolated from the whole blood of 207 patients with MS and 100 healthy individuals (control group). Gene polymorphisms were determined by real-time polymerase chain reaction. The association of the GG genotype of -2548 A/G polymorphism of the LEP gene (rs7799039) with the risk of high blood pressure in patients with MS, and the genotype of GG polymorphism + 45 T/G of the ADIPOQ gene (rs2241766) with hyperglycemia as a leading link in the development of MS was established. The association of the allele G of polymorphism +45 T/G (rs2241766) of the ADIPOQ gene with the risk of metabolic syndrome was established (OR (95% CI) =5,6 (2,4-13,0)), as well as the association of the TG and GG genotypes of this genetic variant (OR (95% CI)=3.81 (1.79-8.09) and OR (95% CI)=10.0 (2.25-44.7).
腹部肥胖症与多基因遗传缺陷有关，被认为是新陈代谢综合征(ms)发展的早期事件。这项研究的目的是分析患者adipokine (ADIPOQ)和LEP (LEP)基因多态性(LEP)的频率。dna从患者207个完整的血液中分离出来，100个健康的面孔(对照组)。基因的多态性是通过实时聚合蛋白链式反应来定义的。GG多态性-2548 A/G基因协会(rs779039)成立。从统计学上讲，mds与G多态性+45 T/G基因(或rs22466)的关系与ADIPOQ基因(或(或)(或)的基因(或(95%)与TG基因(或(95%)= 3.81(1.79 - 8.09)和或(95%)的关系与10.0(2.25 - 44.7)有关。Abdominal obesity connecting with polygenic hereditary defects is considered the initial event in metabolic综合症(MS)开发。这门课的主题是让“多刺基因”(ADIPOQ)和“多刺基因”(leptin)中的多刺基因(leptin)变得更好。DNA是由207个病人的血和100个healthy individuals组成的。基因polymorphisms在现实时间序列反应中被发现。(The association of The的genotype of 2548 A / G LEP polymorphism of The gene (rs7799039) with The risk of high blood pressure in这样的MS, and with The genotype of的polymorphism + 45 T / G of The ADIPOQ基因(rs2241766) with hyperglycemia as A leading link MS was established in The development of。G of The association of The allele polymorphism + 45 T / G (rs2241766) of The ADIPOQ基因with The risk of metabolic综合症was established (OR (95% CI) = 5.6 (2,4 - 13.0%), as well as The association of The TG and的genotypes of this genetic variant (OR (95% CI) = 3.81 (79 - 8.09) and OR (95% CI) = 10.0(2.25 - 44.7)。
{"title":"Association of Adiponectin and Leptin Genetic Polymorphisms with Clinical Manifestations of Metabolic Syndrome","authors":"Шрамко, Ю.И., Агеева, Е.С., Малый, К.Д., Репинская, И.Н., Таримов, К.О., Фомочкина, И.И., Кубышкин, А.В., Остапенко, О.В., Гуртовая, А.К., Суман, Шекхар, Настоящий, С.Г.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.09.8-12","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.09.8-12","url":null,"abstract":"Абдоминальное ожирение, связанное с полигенными наследственными дефектами, считается начальным событием в развитии метаболического синдрома (МС). Целью исследования был анализ частоты полиморфизма генов адипонектина (ADIPOQ) и лептина (LEP) у пациентов с МС, а также ассоциации симптомов МС с полиморфизмом названных генов. ДНК была выделена из цельной крови 207 пациентов с МС и 100 здоровых лиц (контрольная группа). Полиморфизмы генов определяли методом полимеразной цепной реакции в реальном времени. Установлена ассоциация генотипа GG полиморфизма -2548 A/G (rs7799039) гена LEP с риском высокого артериального давления у пациентов с МС, а генотипа GG полиморфизма +45 T/G (rs2241766) гена ADIPOQ с гипергликемией как ведущим звеном развития МС. Установлена статистически значимая связь риска развития МС с аллелем G полиморфизма +45 T/G (rs2241766) гена ADIPOQ (OR (95% СI)= 5,6 (2,4-13,0)), а также с генотипами TG и GG данного варианта (OR (95% СI)=3,81 (1,79-8,09) и OR (95% СI)=10,0 (2,25-44,7).\u0000 Abdominal obesity connecting with polygenic hereditary defects is considered the initial event in metabolic syndrome (MS) development. The purpose of study was to analyse the frequency of adiponectin (ADIPOQ) and leptin (LEP) gene polymorphisms in patients with MS, and the association of MS’s symptoms with named genes’ polymorphism. DNA was isolated from the whole blood of 207 patients with MS and 100 healthy individuals (control group). Gene polymorphisms were determined by real-time polymerase chain reaction. The association of the GG genotype of -2548 A/G polymorphism of the LEP gene (rs7799039) with the risk of high blood pressure in patients with MS, and the genotype of GG polymorphism + 45 T/G of the ADIPOQ gene (rs2241766) with hyperglycemia as a leading link in the development of MS was established. The association of the allele G of polymorphism +45 T/G (rs2241766) of the ADIPOQ gene with the risk of metabolic syndrome was established (OR (95% CI) =5,6 (2,4-13,0)), as well as the association of the TG and GG genotypes of this genetic variant (OR (95% CI)=3.81 (1.79-8.09) and OR (95% CI)=10.0 (2.25-44.7).","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"7 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-09-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"125323194","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Дисрегуляция артериального давления вносит значительный вклад в течение и исход сепсиса. Одним из генов, влияющих на состояние сосудистой стенки, эндотелий и тонус артериол, является ген рецептора 1 к ангиотензину II (AGTR1). Поэтому целью нашей работы являлось определение вклада в течение и исход сепсиса генетического полиморфизма AGTR1 rs275651. В исследование были включены пациенты ОРИТ (отделения реанимации и интенсивной терапии), n=286, трех ГКБ (городских клинических больниц) в возрасте 18-92 лет с сепсисом. В общей группе (n=286) септических пациентов наблюдалась разница по частоте развития септического шока в зависимости от генотипа AGTR1 rs275651. У носителей генотипа AGTR1 TT реже развивался септический шок по сравнению с пациентами генотипов AGTR1 AT, AA (60% против 73%, р=0,47, ТМФ (точный метод Фишера), OR=1,8, 95% CI: 1,1-3,3). В подгруппе пациентов с сахарным диабетом второго типа (n=79) были выявлены различия в летальности. Так, носители генотипа TT AGTR1 rs275651 характеризовались меньшим уровнем летальности по сравнению с носителями генотипов ТA, AA (60% против 88%, р=0,018, OR=5,0, 95% CI: 1,34-18,9, ТМФ). Частота развития септического шока у носителей более распространенного генотипа AGTR1 TT также была ниже в подгруппе пациентов с диабетом (57% против 92%; p=0,02, OR=9,2 95% CI: 1,97-42,9, ТМФ). Таким образом, полиморфные варианты промоторной области гена AGTR1 влияют на частоту развития септического шока, а также на течение и исход сепсиса у пациентов с сахарным диабетом. Dysregulation of blood pressure significantly impacts the course and outcome of sepsis. The AGTR1 gene encodes angiotensin II receptor type 1, which affects the vascular tone and contributes to septic shock. Our study aims to define whether the AGTR1 polymorphism contributes to the course and outcome of sepsis. The study included patients (n=286) from three ICU (Intensive Care Unit) aged 18-92 years with sepsis. In all patients (n=286) with sepsis the incidence of septic shock differed depending on AGTR1 genotype: carriers of the AGTR1 TT genotype had a less incidence of septic shock compared with patients with the AGTR1 AT, AA genotypes (60% vs. 73%, P = 0.47, FET (Fisher`s Exact Test), OR=1.8, 95% CI: 1.1-3.3). In group of patients with diabetes mellitus (n=79), we also found differences in sepsis course and outcome based on the AGTR1 rs275651 genotypes. The subgroup of TT AGTR1 rs275651 genotype carriers demonstrated significantly lower mortality compared with TA, AA genotypes carriers (60 % vs. 88 %, Р=0,018, OR=5,0, 95% CI: 1,34 -18,9, FET). The incidence of septic shock was also less in AGTR1 TT genotype-carriers in subgroup patients with diabetes (57% vs 92%, P=0,02, OR=9,2, 95 % CI: 1.97-42.9, FET). We found an association of the functional polymorphism AGTR1 rs275651 with course and outcome of sepsis in ICU patients with diabetes mellitus: carriers of the more common TT genotype had less incidence of septic shock and lower mortality compared to ca
血压失调对败血症的过程和结果都有很大的影响。影响血管壁、内皮和动脉张力的基因之一是1 / angiotenzin II受体基因(AGTR1)。因此，我们的工作目标是确定AGTR1基因多态性败血症的期间和结果。18-92岁的orites患者(icu和icu)、n=286、3个gcb(城市临床医院)都患有败血症。在普通人群(n=286)中，感染性休克的发病率根据AGTR1 rs275651基因类型而异。AGTR1 TT基因载体的感染性休克比AGTR1 AT患者的感染性休克要少，AA(60%对73%，p = 0.47, tmf(准确的费舍尔方法)，或1.8,95%的CI: 1.1 - 3.3)。2型糖尿病患者(n=79)的小组显示了致命差异。因此，TT AGTR1 rs275651基因载体的死亡率较低，AA(60%对88%，p = 0.018，或5.0,95% CI: 1.34 - 18.9, tmf)。更广泛的AGTR1 TT基因类型携带者的感染性休克发病率也较低(57%对92%;p= 0.02，或9.2 95%的CI: 1.97 - 42.9, tmf。因此，AGTR1基因诱导区域的多态性变体影响感染性休克的频率，以及糖尿病患者败血症的传播和结果。《血的力量》和《血的力量的延续》。AGTR1基因encodes angiotensin II型，当vascular tone和连接到性冲击时。我们的研究是关于define whether的，这是关于course和sepsis的。来自三个ICU的学生(n=286)与sepsis一起工作了18-92年。In all患者这样(n = 286) with sepsis incidence of化粪池shock differed depending on AGTR1 genotype少:carriers of the AGTR1 TT genotype had a incidence of化粪池shock谈判with这样with the AGTR1 AT AA genotypes (60% vs . 73%, P =政策分类(Fisher ' s linux Test), OR = 1.8, 95% CI: 1.1 - 3.3)。在一组有diabets mellitus (n=79)的人中，我们在sepsis上发现了差异，在rs275651基因上发现了差异。这是一组TT AGTR1 rs275651, AA genotypes carriers (60% vs 88%， 5.0或5.0,CI: 1.34 - 18.9, FET)。令人震惊的是，阿格特1 TT genoetes (57% vs 92%， P= 0.02，或9.2%，95% CI: 1.97-42.9, FET)。我们发现了一种不同寻常的多肉多肉的组合，其中包括一种不同的颜色和一种不同的颜色。
{"title":"Single-nucleotide promoter polymorphism of angiotensin II type 1 receptor gene AGTR1 affects to sepsis course and outcome in patients with diabetes","authors":"Чумаченко, А.Г., Писарев, В.М., Черпаков, Р.А., Григорьев, Е.К.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.09.4-7","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.09.4-7","url":null,"abstract":"Дисрегуляция артериального давления вносит значительный вклад в течение и исход сепсиса. Одним из генов, влияющих на состояние сосудистой стенки, эндотелий и тонус артериол, является ген рецептора 1 к ангиотензину II (AGTR1). Поэтому целью нашей работы являлось определение вклада в течение и исход сепсиса генетического полиморфизма AGTR1 rs275651. В исследование были включены пациенты ОРИТ (отделения реанимации и интенсивной терапии), n=286, трех ГКБ (городских клинических больниц) в возрасте 18-92 лет с сепсисом. В общей группе (n=286) септических пациентов наблюдалась разница по частоте развития септического шока в зависимости от генотипа AGTR1 rs275651. У носителей генотипа AGTR1 TT реже развивался септический шок по сравнению с пациентами генотипов AGTR1 AT, AA (60% против 73%, р=0,47, ТМФ (точный метод Фишера), OR=1,8, 95% CI: 1,1-3,3). В подгруппе пациентов с сахарным диабетом второго типа (n=79) были выявлены различия в летальности. Так, носители генотипа TT AGTR1 rs275651 характеризовались меньшим уровнем летальности по сравнению с носителями генотипов ТA, AA (60% против 88%, р=0,018, OR=5,0, 95% CI: 1,34-18,9, ТМФ). Частота развития септического шока у носителей более распространенного генотипа AGTR1 TT также была ниже в подгруппе пациентов с диабетом (57% против 92%; p=0,02, OR=9,2 95% CI: 1,97-42,9, ТМФ). Таким образом, полиморфные варианты промоторной области гена AGTR1 влияют на частоту развития септического шока, а также на течение и исход сепсиса у пациентов с сахарным диабетом.\u0000 Dysregulation of blood pressure significantly impacts the course and outcome of sepsis. The AGTR1 gene encodes angiotensin II receptor type 1, which affects the vascular tone and contributes to septic shock. Our study aims to define whether the AGTR1 polymorphism contributes to the course and outcome of sepsis. The study included patients (n=286) from three ICU (Intensive Care Unit) aged 18-92 years with sepsis. In all patients (n=286) with sepsis the incidence of septic shock differed depending on AGTR1 genotype: carriers of the AGTR1 TT genotype had a less incidence of septic shock compared with patients with the AGTR1 AT, AA genotypes (60% vs. 73%, P = 0.47, FET (Fisher`s Exact Test), OR=1.8, 95% CI: 1.1-3.3). In group of patients with diabetes mellitus (n=79), we also found differences in sepsis course and outcome based on the AGTR1 rs275651 genotypes. The subgroup of TT AGTR1 rs275651 genotype carriers demonstrated significantly lower mortality compared with TA, AA genotypes carriers (60 % vs. 88 %, Р=0,018, OR=5,0, 95% CI: 1,34 -18,9, FET). The incidence of septic shock was also less in AGTR1 TT genotype-carriers in subgroup patients with diabetes (57% vs 92%, P=0,02, OR=9,2, 95 % CI: 1.97-42.9, FET). We found an association of the functional polymorphism AGTR1 rs275651 with course and outcome of sepsis in ICU patients with diabetes mellitus: carriers of the more common TT genotype had less incidence of septic shock and lower mortality compared to ca","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"1 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-09-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"129465218","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Гемофилия В - Х-сцепленное рецессивное заболевание, связанное с нарушением свертываемости крови, вызванное мутациями в гене фактора свертывания IX (F9). В гене описаны как точковые изменения последовательности, так и крупные структурные перестройки. Целью данного исследования было определение спектра мутаций гена F9 у российских больных гемофилией B. Проведено исследование 59 неродственных семей с направительным диагнозом «гемофилия B» методами секвенирования по Сэнгеру, массового параллельного секвенирования и количественного MLPA анализа. Мутации обнаружены в 86,4% случаев. Наибольшую долю среди выявленных патогенных вариантов составляют миссенс-мутации - 62,7%, на долю нонсенс-мутаций приходится 19,6%, крупных делеций, включающих один или несколько экзонов - 3,9%, мутаций со сдвигом рамки считывания - 5,9%, мутаций сайта сплайсинга - 2%, мутаций промотора - 5,9%, что в целом соответствует литературным данным. Четырнадцать выявленных нуклеотидных вариантов ранее не были описаны. Большинство из них являются миссенс-мутациями. Таким образом, было проведено изучение спектра мутаций у российских больных гемофилией B. Определение типа мутации, ее локализации в гене и белке позволит предсказать характер течения заболевания и подобрать оптимальное лечение. Hemophilia B is an X-linked recessive disease associated with blood clotting disorder caused by mutations in the coagulation factor IX (F9) gene. Both point sequence changes and large structural rearrangements were described in the gene. The aim of this study was to determine the spectrum of mutations in the F9 gene in Russian patients with hemophilia B. A study of 59 unrelated families with a referral diagnosis of “hemophilia B” was conducted using Sanger sequencing, mass parallel sequencing, and quantitative MLPA analysis. Mutations were detected in 86.4% of cases. The prevalent among the identified pathogenic variants were missense mutations - 62.7%; nonsense mutations account for 19.6%, large deletions involving one or more exons - 3.9%, mutations with a reading frame shift - 5.9%, splice site mutations - 2%, mutations in the promoter- 5.9%, which generally corresponds to the literature data. Fourteen identified nucleotide variants have not been previously described. Most of them were missense mutations. Thus, we studied the spectrum of mutations in Russian patients with hemophilia B. Determining the type of mutation and its localization in the gene and protein will allow to predict the course of the disease and to choose the optimal treatment.
{"title":"The spectrum of the F9 gene mutations in Russian patients with hemophilia B","authors":"Бескоровайная, Т.С., Череватова, Т.Б., Щагина, О.А., Поляков, А.В.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.09.28-33","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.09.28-33","url":null,"abstract":"Гемофилия В - Х-сцепленное рецессивное заболевание, связанное с нарушением свертываемости крови, вызванное мутациями в гене фактора свертывания IX (F9). В гене описаны как точковые изменения последовательности, так и крупные структурные перестройки. Целью данного исследования было определение спектра мутаций гена F9 у российских больных гемофилией B. Проведено исследование 59 неродственных семей с направительным диагнозом «гемофилия B» методами секвенирования по Сэнгеру, массового параллельного секвенирования и количественного MLPA анализа. Мутации обнаружены в 86,4% случаев. Наибольшую долю среди выявленных патогенных вариантов составляют миссенс-мутации - 62,7%, на долю нонсенс-мутаций приходится 19,6%, крупных делеций, включающих один или несколько экзонов - 3,9%, мутаций со сдвигом рамки считывания - 5,9%, мутаций сайта сплайсинга - 2%, мутаций промотора - 5,9%, что в целом соответствует литературным данным. Четырнадцать выявленных нуклеотидных вариантов ранее не были описаны. Большинство из них являются миссенс-мутациями. Таким образом, было проведено изучение спектра мутаций у российских больных гемофилией B. Определение типа мутации, ее локализации в гене и белке позволит предсказать характер течения заболевания и подобрать оптимальное лечение.\u0000 Hemophilia B is an X-linked recessive disease associated with blood clotting disorder caused by mutations in the coagulation factor IX (F9) gene. Both point sequence changes and large structural rearrangements were described in the gene. The aim of this study was to determine the spectrum of mutations in the F9 gene in Russian patients with hemophilia B. A study of 59 unrelated families with a referral diagnosis of “hemophilia B” was conducted using Sanger sequencing, mass parallel sequencing, and quantitative MLPA analysis. Mutations were detected in 86.4% of cases. The prevalent among the identified pathogenic variants were missense mutations - 62.7%; nonsense mutations account for 19.6%, large deletions involving one or more exons - 3.9%, mutations with a reading frame shift - 5.9%, splice site mutations - 2%, mutations in the promoter- 5.9%, which generally corresponds to the literature data. Fourteen identified nucleotide variants have not been previously described. Most of them were missense mutations. Thus, we studied the spectrum of mutations in Russian patients with hemophilia B. Determining the type of mutation and its localization in the gene and protein will allow to predict the course of the disease and to choose the optimal treatment.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"44 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-09-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"127464685","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2022-09-30DOI: 10.25557/2073-7998.2022.09.22-27
Аюпова, Г.Р., Минниахметов, И.Р., Хусаинова, Р.И.
Введение. Муковисцидоз - наследственное аутосомно-рецессивное заболевание. Современные методы ДНК-диагностики открывают возможность для внедрения новых эффективных методов лечения муковисцидоза, в основе которых воздействие на молекулярный патогенез заболевания. Персонализированный подход к оказанию медицинской помощи пациентам с муковисцидозом с учетом генетического профиля с применением новых технологий ДНК-диагностики позволил поднять на новый уровень оказание медико-генетической помощи отягощенным семьям и более эффективно проводить лечебные мероприятия. Цель исследования: реализация программы молекулярно-генетической диагностики для подбора таргетной терапии при муковисцидозе. Методы. Проанализированы данные за всё время проведения неонатального скрининга на муковисцидоз в Республике Башкортостан. В 2021 году в регистре больных муковисцидозом в Республике Башкортостан состояло 94 пациента. Большинству требовалось проведение ДНК диагностики для верификации мутаций в гене CFTR с последующим назначением таргетной терапии. На первом этапе исследований 94 пациентам с муковисцидозом, а также их родственникам проведён анализ с использованием мультиплексной лигазо-зависимой амплификации зондов (SALSA MLPA Probemix P091 CFTR, MRC Holland). На следующем этапе проведено секвенирование всех экзонов гена CFTR методами секвенирования нового поколения (NGS) и Сэнгера. Результаты. Проведен поиск мутаций у 94 пробандов и выявлено 36 патогенных вариантов в гене CFTR. На 2,6% хромосом мутации не обнаружены, на 97,3% хромосомах мутации идентифицированы. У 89 пациентов установлены обе мутации (83,66%), у 5 пробандов обнаружена только одна мутация в гетерозиготном состоянии. У одного пациента диагноз муковисцидоз по итогам исследования снят. Разработка и внедрение новейших технологий секвенирования позволили существенно расширить знания о молекулярных механизмах муковисцидоза, что способствует развитию новых подходов к терапии и проведению новых исследований. Background. Cystic fibrosis is an inherited autosomal recessive disease. Modern methods of DNA diagnosis open up the possibility to develop new effective methods of cystic fibrosis treatment, which are based on the impact on the molecular pathogenesis of the disease. A personalized approach to medical care for patients with cystic fibrosis, taking into account the genetic profile with the use of new DNA diagnostic technologies has raised the provision of medical and genetic counseling for burdened families to a new level and more effective treatment measures. Aim. Implementation of a program of modern molecular genetic diagnosis of inherited diseases using targeted therapy for cystic fibrosis. Methods. The data for the entire period of neonatal screening for cystic fibrosis in the Republic of Bashkortostan were analyzed. In 2021 there were 94 patients on the cystic fibrosis registry in the Republic of Bashkortostan. The majority of patients required DNA diagnosis to verify mutations in the CFTR gene with su
{"title":"Cystic fibrosis: modern possibilities of diagnosis and treatment based on molecular pathogenesis","authors":"Аюпова, Г.Р., Минниахметов, И.Р., Хусаинова, Р.И.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.09.22-27","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.09.22-27","url":null,"abstract":"Введение. Муковисцидоз - наследственное аутосомно-рецессивное заболевание. Современные методы ДНК-диагностики открывают возможность для внедрения новых эффективных методов лечения муковисцидоза, в основе которых воздействие на молекулярный патогенез заболевания. Персонализированный подход к оказанию медицинской помощи пациентам с муковисцидозом с учетом генетического профиля с применением новых технологий ДНК-диагностики позволил поднять на новый уровень оказание медико-генетической помощи отягощенным семьям и более эффективно проводить лечебные мероприятия. Цель исследования: реализация программы молекулярно-генетической диагностики для подбора таргетной терапии при муковисцидозе. Методы. Проанализированы данные за всё время проведения неонатального скрининга на муковисцидоз в Республике Башкортостан. В 2021 году в регистре больных муковисцидозом в Республике Башкортостан состояло 94 пациента. Большинству требовалось проведение ДНК диагностики для верификации мутаций в гене CFTR с последующим назначением таргетной терапии. На первом этапе исследований 94 пациентам с муковисцидозом, а также их родственникам проведён анализ с использованием мультиплексной лигазо-зависимой амплификации зондов (SALSA MLPA Probemix P091 CFTR, MRC Holland). На следующем этапе проведено секвенирование всех экзонов гена CFTR методами секвенирования нового поколения (NGS) и Сэнгера. Результаты. Проведен поиск мутаций у 94 пробандов и выявлено 36 патогенных вариантов в гене CFTR. На 2,6% хромосом мутации не обнаружены, на 97,3% хромосомах мутации идентифицированы. У 89 пациентов установлены обе мутации (83,66%), у 5 пробандов обнаружена только одна мутация в гетерозиготном состоянии. У одного пациента диагноз муковисцидоз по итогам исследования снят. Разработка и внедрение новейших технологий секвенирования позволили существенно расширить знания о молекулярных механизмах муковисцидоза, что способствует развитию новых подходов к терапии и проведению новых исследований.\u0000 Background. Cystic fibrosis is an inherited autosomal recessive disease. Modern methods of DNA diagnosis open up the possibility to develop new effective methods of cystic fibrosis treatment, which are based on the impact on the molecular pathogenesis of the disease. A personalized approach to medical care for patients with cystic fibrosis, taking into account the genetic profile with the use of new DNA diagnostic technologies has raised the provision of medical and genetic counseling for burdened families to a new level and more effective treatment measures. Aim. Implementation of a program of modern molecular genetic diagnosis of inherited diseases using targeted therapy for cystic fibrosis. Methods. The data for the entire period of neonatal screening for cystic fibrosis in the Republic of Bashkortostan were analyzed. In 2021 there were 94 patients on the cystic fibrosis registry in the Republic of Bashkortostan. The majority of patients required DNA diagnosis to verify mutations in the CFTR gene with su","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"11 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-09-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"133900844","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2022-09-30DOI: 10.25557/2073-7998.2022.09.17-21
Ялаев, Б.И., Хусаинова, Р.И.
Проведен поиск генетических и эпигенетических маркеров остеопороза (ОП), ассоциированных с развитием переломов и низким уровнем минеральной плотности костной ткани (МПКТ), а также разработаны клинико-генетические модели ОП в выборках 701 женщины и 476 мужчин, подразделенных на группы в зависимости от наличия и отсутствия остеопоретических переломов и вариации уровня МПКТ в разных отделах скелета. С использованием технологии KASP-генотипирования и непараметрических критериев статистического анализа обнаружено, что маркерами переломов являются полиморфные варианты генов OPG, miR-146, а также сайтов связывания микроРНК генов VDR, ZNF239 и FGF2, маркерами низкого уровня МПКТ - варианты гена OPG, miR-196 и сайтов связывания микроРНК генов FBOX5, SOX9, MMP1 и ZNF239. Проведена полигенная оценка риска 140 ДНК-локусов, выявленных в результате репликации GWAS, и установлены клинико-генетические модели, прогнозирующие риск ОП с эффективностью до 90%. Анализ профиля метилирования 4 генов с использованием пиросеквенирования выявил ассоциацию гипометилирования гена RUNX2 с тяжелой формой первичного ОП в выборке женщин. The authors searched for genetic and epigenetic markers of osteoporosis associated with the development of fractures and low bone mineral density and also developed clinical and genetic models of OP in 701 and 476 male samples divided into comparison groups depending on the presence or absence of osteoporotic fractures and variation in the BMD in different skeletal parts. Using the technology of KASP-genotyping and nonparametric criteria of statistical analysis, polymorphic variants of the OPG gene, miR-146, as well as microRNA binding sites of the VDR, ZNF239 and FGF2 genes, and variants of the OPG gene, miR-196 and microRNA binding sites of FBOX5, SOX9, MMP1 and ZNF239 genes were found to be markers of fractures. We performed a polygenic risk assessment of 140 full genome-wide association replication (GWAS) DNA locus and established clinical and genetic models predicting OP risk with up to 90% efficiency, with a 6,6-fold increased risk of fracture. Analysis of the methylation profile of 4 genes using pyrosequencing revealed an association of RUNX2 gene hypomethylation with severe primary OP in a sample of women.
寻找遗传和表观遗传标记进行骨质疏松骨折(经验)与发展和矿物骨密度低(МПКТ)以及临床遗传模型开发经验抽样701 476人,女性单位分组视остеопоретическ骨折的存在和部门不同МПКТ级别和变奏曲骨架。使用KASP基因测定和非参数统计分析标准，显示骨折标记是OPG、miR-146和FGF2基因的多形态性变体、ZNF239和FGF2、OPG基因的低pkt变体标记、miR-196和FBOX5、SOX9、MMP1和ZNF239。对gis复制所显示的140个dna位点进行了多基因风险评估，并建立了临床基因模型，预测opa风险高达90%。通过热测序分析4个基因的甲基化剖面，显示了RUNX2基因的低标记联想，在女性样本中具有严重的初创形式。The authors searched for genetic and epigenetic markers of osteoporosis (associated with The development of fractures and low bone一家密度and also developed and clinical and genetic models of OP in 701 476男samples divided into comparison groups depending on The奥迪or缺席of osteoporotic fractures and variation in The BMD in different skeletal备件。Using the technology of KASP - genotyping and nonparametric criteria analysis of统计,polymorphic variants of the OPG gene miR - 146, microRNA绑定文化部as well as of the VDR ZNF239 and FGF2 genes and variants of the OPG gene, miR - 196 and microRNA绑定文化部of FBOX5, SOX9 MMP1 and ZNF239 genes were found to be markers of fractures。我们采用了140个多基因再生(gg) DNA和基因改造模型，使用了90%的模板，6.6 - 5个模板模板。四基因分析分析了逃跑基因与severe hypomethylation基因的结合。
{"title":"Study of genetic and epigenetic factors of primary osteoporosis development in men and women from the Volga-Ural region of Russia","authors":"Ялаев, Б.И., Хусаинова, Р.И.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.09.17-21","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.09.17-21","url":null,"abstract":"Проведен поиск генетических и эпигенетических маркеров остеопороза (ОП), ассоциированных с развитием переломов и низким уровнем минеральной плотности костной ткани (МПКТ), а также разработаны клинико-генетические модели ОП в выборках 701 женщины и 476 мужчин, подразделенных на группы в зависимости от наличия и отсутствия остеопоретических переломов и вариации уровня МПКТ в разных отделах скелета. С использованием технологии KASP-генотипирования и непараметрических критериев статистического анализа обнаружено, что маркерами переломов являются полиморфные варианты генов OPG, miR-146, а также сайтов связывания микроРНК генов VDR, ZNF239 и FGF2, маркерами низкого уровня МПКТ - варианты гена OPG, miR-196 и сайтов связывания микроРНК генов FBOX5, SOX9, MMP1 и ZNF239. Проведена полигенная оценка риска 140 ДНК-локусов, выявленных в результате репликации GWAS, и установлены клинико-генетические модели, прогнозирующие риск ОП с эффективностью до 90%. Анализ профиля метилирования 4 генов с использованием пиросеквенирования выявил ассоциацию гипометилирования гена RUNX2 с тяжелой формой первичного ОП в выборке женщин.\u0000 The authors searched for genetic and epigenetic markers of osteoporosis associated with the development of fractures and low bone mineral density and also developed clinical and genetic models of OP in 701 and 476 male samples divided into comparison groups depending on the presence or absence of osteoporotic fractures and variation in the BMD in different skeletal parts. Using the technology of KASP-genotyping and nonparametric criteria of statistical analysis, polymorphic variants of the OPG gene, miR-146, as well as microRNA binding sites of the VDR, ZNF239 and FGF2 genes, and variants of the OPG gene, miR-196 and microRNA binding sites of FBOX5, SOX9, MMP1 and ZNF239 genes were found to be markers of fractures. We performed a polygenic risk assessment of 140 full genome-wide association replication (GWAS) DNA locus and established clinical and genetic models predicting OP risk with up to 90% efficiency, with a 6,6-fold increased risk of fracture. Analysis of the methylation profile of 4 genes using pyrosequencing revealed an association of RUNX2 gene hypomethylation with severe primary OP in a sample of women.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"27 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-09-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"132808151","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2022-09-30DOI: 10.25557/2073-7998.2022.09.41-44
Зарипова, А.Р., Надыршина, Д.Д., Хусаинова, Р.И.
Проведен поиск патогенных изменений в целевых генах у 62 пациентов с несовершенным остеогенезом (НО) из 52 семей из Республики Башкортостан с использованием NGS-технологии. В результате проведенного исследования выявлены 29 мутаций в 4 генах (COL1A1, COL1A2, IFITM5, P3H1), ответственных за развитие НО у 42 пациентов из 32 семей. Дополнительно у 7 пациентов с низкотравматичными переломами были найдены гетерозиготные мутации в генах CLCN7, ALOX12B, PLEKHM1, ERCC4, ARSB, PTH1R, TGFB1, которые не участвуют в патогенезе НО. In our study, we searched for pathogenic changes in target genes in 62 patients with osteogenesis imperfecta from 52 families from the Republic of Bashkortostan using NGS technology. The study revealed 29 mutations in 4 genes (COL1A1, COL1A2, IFITM5, P3H1) responsible for the development of OI in 42 patients from 32 families. Additionally, heterozygous mutations in the CLCN7, ALOX12B, PLEKHM1, ERCC4, ARSB, PTH1R, and TGFB1 genes were found in 7 patients with low-traumatic fractures that are not involved in the pathogenesis of OI.
{"title":"Spectrum and frequency of pathogenic changes in patients with incomplete osteogenesis from the Republic of Bashkortostan","authors":"Зарипова, А.Р., Надыршина, Д.Д., Хусаинова, Р.И.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.09.41-44","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.09.41-44","url":null,"abstract":"Проведен поиск патогенных изменений в целевых генах у 62 пациентов с несовершенным остеогенезом (НО) из 52 семей из Республики Башкортостан с использованием NGS-технологии. В результате проведенного исследования выявлены 29 мутаций в 4 генах (COL1A1, COL1A2, IFITM5, P3H1), ответственных за развитие НО у 42 пациентов из 32 семей. Дополнительно у 7 пациентов с низкотравматичными переломами были найдены гетерозиготные мутации в генах CLCN7, ALOX12B, PLEKHM1, ERCC4, ARSB, PTH1R, TGFB1, которые не участвуют в патогенезе НО.\u0000 In our study, we searched for pathogenic changes in target genes in 62 patients with osteogenesis imperfecta from 52 families from the Republic of Bashkortostan using NGS technology. The study revealed 29 mutations in 4 genes (COL1A1, COL1A2, IFITM5, P3H1) responsible for the development of OI in 42 patients from 32 families. Additionally, heterozygous mutations in the CLCN7, ALOX12B, PLEKHM1, ERCC4, ARSB, PTH1R, and TGFB1 genes were found in 7 patients with low-traumatic fractures that are not involved in the pathogenesis of OI.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"80 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-09-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"130858593","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2022-09-30DOI: 10.25557/2073-7998.2022.09.34-37
Вассерман, Н.Н., Поляков, А.В.
Ахондроплазия - врожденное заболевание, наиболее частая форма карликовости, наследующаяся по аутосомно-доминантному типу. В основе патогенеза лежит нарушение эндохондрального окостенения. Больные имеют низкий рост, укороченные проксимальные отделы конечностей, аномалии черепа. Менее выраженные скелетные аномалии характерны для гипохондроплазии. Оба заболевания обусловлены мутациями в гене FGFR3. К ахондроплазии в 99% случаев приводит мутация c.1138G>A/С (р.Gly380Arg), 60% гипохондроплазии обусловлено вариантом c.1620C>A/G (р.Asn540Lys). Приводящие к ахондроплазии мутации вызывают конститутивную активацию FGFR3. В связи с ортопедическими и неврологическими осложнениями важно своевременное лечение ахондроплазии. Для своевременного начала лечения актуальна молекулярно-генетическая диагностика ахондроплазии. В работе представлены первые результаты программы селективного скрининга на наличие частых патогенных вариантов в гене FGFR3. На материале 270 пациентов информативность программы составила 70%. На долю наиболее частой мутации р.Gly380Arg (c.1138G>A/С) приходится 85,7%. В 13,7% случаев выявлен вариант р.Asn540Lys (c.1620C>A/G). Achondroplasia is a congenital disease, the most common form of short-limb dwarfism, inherited by autosomal dominant type. The pathogenesis is based on a disruption of endochondral ossification. Patients exhibit short stature with shortening of the proximal parts of the limbs, facial abnormalities. Hypochondroplasia is much milder. Both disorders are causes by mutations in the FGFR3 gene. Achondroplasia is caused in 99% of cases by mutation c.1138G>A/C (p.Gly380Arg), 60% of hypochondroplasia is caused by variant c.1620C>A/G (p.Asn540Lys). The mutations leading to achondroplasia cause constitutive activation of FGFR3. Due to orthopedic and neurological complications, it is important to treat achondroplasia. Pharmacological treatment of the disease is being developed. Molecular genetic diagnosis of achondroplasia is relevant for the timely initiation of treatment. The paper presents the first results of selective screening program FSBI «RCMG» for the presence of frequent pathogenic variants in the FGFR3 gene. Based on the material of 270 patients the informativeness of the program was 70%. The share of the most frequent mutation р.Gly380Arg (c.1138G>A/С) account for 85.7%. A variant of р.Asn540Lys (c.1620C>A/G) was detected in 13.7% of cases.
{"title":"Screening for the presence of frequent pathogenic variants in the FGFR3 gene in patients with achondroplasia","authors":"Вассерман, Н.Н., Поляков, А.В.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.09.34-37","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.09.34-37","url":null,"abstract":"Ахондроплазия - врожденное заболевание, наиболее частая форма карликовости, наследующаяся по аутосомно-доминантному типу. В основе патогенеза лежит нарушение эндохондрального окостенения. Больные имеют низкий рост, укороченные проксимальные отделы конечностей, аномалии черепа. Менее выраженные скелетные аномалии характерны для гипохондроплазии. Оба заболевания обусловлены мутациями в гене FGFR3. К ахондроплазии в 99% случаев приводит мутация c.1138G>A/С (р.Gly380Arg), 60% гипохондроплазии обусловлено вариантом c.1620C>A/G (р.Asn540Lys). Приводящие к ахондроплазии мутации вызывают конститутивную активацию FGFR3. В связи с ортопедическими и неврологическими осложнениями важно своевременное лечение ахондроплазии. Для своевременного начала лечения актуальна молекулярно-генетическая диагностика ахондроплазии. В работе представлены первые результаты программы селективного скрининга на наличие частых патогенных вариантов в гене FGFR3. На материале 270 пациентов информативность программы составила 70%. На долю наиболее частой мутации р.Gly380Arg (c.1138G>A/С) приходится 85,7%. В 13,7% случаев выявлен вариант р.Asn540Lys (c.1620C>A/G).\u0000 Achondroplasia is a congenital disease, the most common form of short-limb dwarfism, inherited by autosomal dominant type. The pathogenesis is based on a disruption of endochondral ossification. Patients exhibit short stature with shortening of the proximal parts of the limbs, facial abnormalities. Hypochondroplasia is much milder. Both disorders are causes by mutations in the FGFR3 gene. Achondroplasia is caused in 99% of cases by mutation c.1138G>A/C (p.Gly380Arg), 60% of hypochondroplasia is caused by variant c.1620C>A/G (p.Asn540Lys). The mutations leading to achondroplasia cause constitutive activation of FGFR3. Due to orthopedic and neurological complications, it is important to treat achondroplasia. Pharmacological treatment of the disease is being developed. Molecular genetic diagnosis of achondroplasia is relevant for the timely initiation of treatment. The paper presents the first results of selective screening program FSBI «RCMG» for the presence of frequent pathogenic variants in the FGFR3 gene. Based on the material of 270 patients the informativeness of the program was 70%. The share of the most frequent mutation р.Gly380Arg (c.1138G>A/С) account for 85.7%. A variant of р.Asn540Lys (c.1620C>A/G) was detected in 13.7% of cases.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"98 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-09-30","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"132316426","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
В работе представлены результаты исследования микроРНК miR-221 и miR-223 в микровезикулах плазмы крови у пациентов, перенесших тромбоэмболию легочной артерии, а также их взаимосвязь с показателями клинического анализа крови и тяжестью развившихся осложнений. The results of the study of microRNAs miR-221 and miR-223 in blood plasma microvesicles in patients with pulmonary embolism, as well as their relationship with clinical blood test parameters and the severity of complications, were presented.
{"title":"MicroRNAs miR-221 and miR-223 in blood plasma microvesicles as perspective biomarkers of the severity of post-thromboembolic syndrome","authors":"Сироткина, О.В., Улитина, А.С., Жиленкова, Ю.И., Золотова, Е.А., Симакова, М.А., Моисеева, О.М., Вавилова, Т.В.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.08.47-50","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.08.47-50","url":null,"abstract":"В работе представлены результаты исследования микроРНК miR-221 и miR-223 в микровезикулах плазмы крови у пациентов, перенесших тромбоэмболию легочной артерии, а также их взаимосвязь с показателями клинического анализа крови и тяжестью развившихся осложнений.\u0000 The results of the study of microRNAs miR-221 and miR-223 in blood plasma microvesicles in patients with pulmonary embolism, as well as their relationship with clinical blood test parameters and the severity of complications, were presented.","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"20 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-08-31","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"121266804","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Введение. Шизофрения относится к заболеваниям, отличающимся значительной гетерогенностью симптомов. В полной мере это относится к негативным симптомам (НС), гетерогенность которых, согласно современным представлениям, определяют различные нейробиологические механизмы. В настоящее время распространение получила модель, предусматривающая выделение в структуре НС двух факторов (субдоменов): абулии-апатии (АА) и экспрессивного дефицита (ЭД). Иммунологические исследования показали, что концентрация провоспалительного цитокина ФНО-α дифференцированно связана с субдоменами НС. Цель: исследовать связь между факторами НС и полиморфизмом rs1800629G/A гена ФНО-α. Методы. Выборка для генотипирования составила 541 человек. Выраженность НС определяли по шкале позитивных и негативных синдромов (PANSS). Симптомы шкалы PANSS включали в субдомены в соответствии с ранее предложенным подходом. Генотипы определяли методом ПЦР. Результаты. Выявлены различия в выраженности симптомов ЭД в зависимости от генетического варианта rs1800629 (р=0,035). У пациентов с двумя копиями аллеля А, обладающего более высокой транскрипционной активностью, выраженность симптомов ЭД была выше, чем у носителей аллеля G (22,8±4,7 против 19,2±5,9 балла). Не обнаружено значимого эффекта генотипа на фактор АА. Заключение. Обнаружение дифференцированной связи полиморфизма rs1800629 гена ФНО-α с НС шизофрении находится в соответствии с данными иммунологических исследований, а также подтверждает предположение о различных биологических механизмах, определяющих гетерогенность НС шизофрении. Background. Schizophrenia is characterized by a significant heterogeneity of symptoms. This fully applies to negative symptoms (NS), the heterogeneity of which, according to modern concepts, is determined by various neurobiological mechanisms. A widespread model of NS provides two factors (subdomains) in the structure of NS: abulia-apathy (AA) and expressive deficit (ED). Immunological studies have shown that the concentration of the pro-inflammatory cytokine TNF-α is differentially associated with NS subdomains. Objective. To investigate the relationship between NS factors and the TNF-α polymorphism rs1800629G/A. Methods. The sample for genotyping included 541 people. The severity of NS was determined by the Positive and negative syndromes scale (PANSS). PANSS symptoms were included into subdomains in accordance with the previously proposed approach. Genotypes were determined by PCR. Results. Differences in the severity of symptoms of the ED factor depending on the genetic variant rs1800629 were revealed (p=0.035). In patients with two copies of the A allele, which has a higher transcriptional activity, the severity of ED symptoms was higher than in the G allele carriers (22.8±4.7 versus 19.2±5.9 points). No significant effect of genotype on factor AA was found. Conclusion. The discovery of a differentiated relationship between TNF-α rs1800629 polymorphism and NS is consistent with the data of immunological st
{"title":"The relationship between TNF-α gene polymorphism rs1800629 and negative symptoms factors in schizophrenia","authors":"Михайлова, В.А., Плакунова, В.В., Лежейко, Т.В., Колесина, Н.Ю., Голимбет, В.Е.","doi":"10.25557/2073-7998.2022.08.20-22","DOIUrl":"https://doi.org/10.25557/2073-7998.2022.08.20-22","url":null,"abstract":"Введение. Шизофрения относится к заболеваниям, отличающимся значительной гетерогенностью симптомов. В полной мере это относится к негативным симптомам (НС), гетерогенность которых, согласно современным представлениям, определяют различные нейробиологические механизмы. В настоящее время распространение получила модель, предусматривающая выделение в структуре НС двух факторов (субдоменов): абулии-апатии (АА) и экспрессивного дефицита (ЭД). Иммунологические исследования показали, что концентрация провоспалительного цитокина ФНО-α дифференцированно связана с субдоменами НС. Цель: исследовать связь между факторами НС и полиморфизмом rs1800629G/A гена ФНО-α. Методы. Выборка для генотипирования составила 541 человек. Выраженность НС определяли по шкале позитивных и негативных синдромов (PANSS). Симптомы шкалы PANSS включали в субдомены в соответствии с ранее предложенным подходом. Генотипы определяли методом ПЦР. Результаты. Выявлены различия в выраженности симптомов ЭД в зависимости от генетического варианта rs1800629 (р=0,035). У пациентов с двумя копиями аллеля А, обладающего более высокой транскрипционной активностью, выраженность симптомов ЭД была выше, чем у носителей аллеля G (22,8±4,7 против 19,2±5,9 балла). Не обнаружено значимого эффекта генотипа на фактор АА. Заключение. Обнаружение дифференцированной связи полиморфизма rs1800629 гена ФНО-α с НС шизофрении находится в соответствии с данными иммунологических исследований, а также подтверждает предположение о различных биологических механизмах, определяющих гетерогенность НС шизофрении.\u0000 Background. Schizophrenia is characterized by a significant heterogeneity of symptoms. This fully applies to negative symptoms (NS), the heterogeneity of which, according to modern concepts, is determined by various neurobiological mechanisms. A widespread model of NS provides two factors (subdomains) in the structure of NS: abulia-apathy (AA) and expressive deficit (ED). Immunological studies have shown that the concentration of the pro-inflammatory cytokine TNF-α is differentially associated with NS subdomains. Objective. To investigate the relationship between NS factors and the TNF-α polymorphism rs1800629G/A. Methods. The sample for genotyping included 541 people. The severity of NS was determined by the Positive and negative syndromes scale (PANSS). PANSS symptoms were included into subdomains in accordance with the previously proposed approach. Genotypes were determined by PCR. Results. Differences in the severity of symptoms of the ED factor depending on the genetic variant rs1800629 were revealed (p=0.035). In patients with two copies of the A allele, which has a higher transcriptional activity, the severity of ED symptoms was higher than in the G allele carriers (22.8±4.7 versus 19.2±5.9 points). No significant effect of genotype on factor AA was found. Conclusion. The discovery of a differentiated relationship between TNF-α rs1800629 polymorphism and NS is consistent with the data of immunological st","PeriodicalId":443256,"journal":{"name":"Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika","volume":"102 1","pages":"0"},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-08-31","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"128195171","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
京公网安备 11010802042870号
京ICP备2023020795号-1
扫码关注我们
求助内容：
应助结果提醒方式：