Bulletin de l'Institut Pasteur最新文献

There is a resurgence of interest in the clinical epidemiology of malaria among African children. This renewed interest follows fifty years of failure to eradicate infection in Africa and redirected efforts toward disease control and prevention. We have a poor understanding of the mechanisms by which clinical immunity is acquired; however, several recent studies have provided new insights into how fast clinical protection is acquired under the varied transmission intensities common to Africa. What is clear is that the frequency with which individuals encounter infection from birth will determine the speed with which they become clinically immune and the patterns of severe pathology they are likely to experience. There remains doubt and concerns over the longterm consequences of reducing natural parasite exposure in several areas of Africa. New field studies are urgently required to tackle these issues so that control may be guided by an improved understanding of malaria as a disease that can lead to death.

On observe un nouvel intérêt de l'épidémiologie clinique palustre chez les enfants africains après 50 ans d'essais d'éradication du paludisme et de lutte, notamment préventive. Les mécanismes d'acquisition de l'immunité clinique sont peu élucidés ; des études récentes ont cependant apporté quelques éclairages nouveaux de la protection acquise en fonction des densités variables de la transmission propre à l'Afrique. Il est maintenant clair que la fréquence des infections individuelles, depuis lu naissance, détermine la rapidité d'apparition de l'immunité clinique et les profils pathologiques pouvant être observés. Un doute subsiste quant aux conséquences à long terme de la réduction des contacts parasitaires dans certaines régions d'Afrique. Il est indispensable et urgent que de nouvelles études sur le terrain induisent une lutte dirigée par une meilleure compréhension du paludisme en tant que maladie potentiellement mortelle.

Distinct strains of transmissible spongiform encephalopathy agents differ with respect to both their biological and physicochemical properties. These strain differences may be due to variability in the conformation of the disease-specific isoform of the prion protein.

Les souches des agents de la TSE (transmissible spongiform encephalopathy) sont distingables par leur aspect particulier sur les plans histologique et clinique. Le grand nombre de souches d'agents de la TSE qui ont été identifiées et caractérisées, en particulier quand ces agents sont passés par des rongeurs comme modèles, corrobore le fait que l'agent étiologique de la TSE doit être capable de variabilité considérable. Sur le plan historique, cette variabilité a été vue comme déterminée par un composant de l'acide nucléique de l'agent pathogène, et a posé une énigme pour l'hypothèse du «tout-protéines qui affirme que l'existence des souches est basée sur des différences de structure des protéines. Ces dernières années cette base protéinique de la variabilité des souches a été soutenue par la démonstration, pour deux souches de TME (trans-missible mink encephalopathy) adaptées au hamster et dans le cas de la maladie de Creutzfeld-Jakob et de l'insomnie fatale familiale, que les formes spécifiques de la PrP résistantes à la protéinase K sont associées à ces désordres. Bien que ces observations soient d'un grand poids pour l'hypothèse du «tout-protéines, ces associations sont loin de prouver que les changements de conformation de la PrP observés soient les seuls déterminants de la variabilité des souches. Les mesures utilisées pour distinguer les différences de structure de la PrP, c'est-à-dire le poids moléculaire du produit résistant à la protéinase K, ne permettent pas une comparaison assez fine. Le développement et/ou l'application de moyens plus sophistiqués pour établir ce type de différences seront nécessaires afin de savoir si les changements de conformation sont un caractère commun aux souches agents de la TSE.

The ability of bacteria to alter their genome sizes and the order of their genes, yet maintain a relatively constant genome, provides a mechanism for diversity and evolution in bacteria. Moreover, bacteria may have evolved by increasing their genome sizes and rearranging gene orders with the assistance of restriction endonucleases cleaving foreign DNA and providing a diverse pool of DNA sequences for genetic recombination. This review examines some of these evolutionary aspects of bacteria including molecular recognition of biomolecules.

Il est admis que les cellules primitives ont évolué et atteint leur optimum. La transition entre un monde sans vie, non organisé, aléatoire, et la situation présente, où la terre est virtuellement couverte par les acides nucléiques et différentes espèces complexes, implique de nombreuses modifications au niveau moléculaire et l'intégration de réactions métaboliques sur des milliards d'années. La capacité des bactéries de modifier la taille de leur génome et l'ordre de leurs gènes, tout en maintenant un génome relativement constant, représente le mécanisme de l'évolution et de la diversité chez les bactéries. De plus, les bactéries ont peut-être évolué en augmentant la taille de leur génome et en réaménageant l'ordre de leurs gènes à l'aide d'endonucléases de restriction clivant l'ADN étranger et produisant un ensemble diversifié de séquences d'ADN pour les recombinaisons génétiques.

Les cellules bactériennes maintiennent leur génome relativement constant alors que parallèlement elles changent par recombinaison génétique, acquièrent et/ou perdent des plasmides et des transposons, et subissent la transduction et la deletion/ insertion d'ADN pouvant produire des mutations. Cela crée une situation qui favorise le surgissement de variants et la diversité des populations bactériennes tout en maintenant le microorganisme d'origine.

Au cours de l'évolution, l'information génétique pour des systèmes métaboliques non utilisés a certainement été perdue. Il est possible que les différences métaboliques majeures entre les bactéries phylogénétiquement apparentées peuvent s'expliquer par une perte des gènes métaboliques afin de maintenir une faible taille génomique et un rapport adéquoit entre la surface et le volume cellulaires.

Cette revue examine quelques-uns des aspects de l'évolution des bactéries.

Human immunodeficiency virus type 1 reverse transcriptase (HIV1 RT) is essential for virus replication. After cell infection, RT catalyses the synthesis of the proviral genome, which is then integrated into the host cell genome. The present understanding of the origin of viral genetic information variations following provirus synthesis is summarized here. During reverse transcription, the structures of the primer-template nucleic acid duplex (A, A-like and B forms), and the local helix bends, modulate RT DNA polymerizing activity by acting on kinetic parameters of nucleotide incorporation and on enzyme processivity. Moreover, the cellular microenvironment, such as dNTP pool imbalance, is involved in mutation fixation by directly influencing RT activity and viral mutation rates. In addition to genome variations linked to RT activity, other parameters, like permanent viral replication and compartmentalization, contribute to HIV1 variability. The implications of these findings on therapy directed against HIV1 infection are discussed.

La transcriptase inverse (RT: reverse transcriptase) du VIH1 (virus de l'immunodéficience humaine de type 1) est une enzyme essentielle pour la replication virale. Après infection de la cellule, la RT catalyse la synthèse du génome proviral, lequel est alors intégré au sein du génome de la cellule hote.

Au cours de la rétrotranscription, les structures des acides nucléiques doubles brins matrice-amorce (sous les formes A, ≪A-like≫ et B) ainsi que les courbures locales des hélices, modulent l'activité ADN polymérase de la RT en agissant sur les paramètres cinétiques d'incorporation nucléotidique ainsi que sur la ≪processivite≫ de l'enzyme. La fluctuation du microenvironnement cellulaire, comme un déséquilibre dans la concentration relative en dNTPs, est impliquée dans la fixation et les taux des mutations en modulant directement l'activité de la RT. En plus des variations du génome liées à l'activité de la RT, d'autres paramètres, comme la replication virale permanente et la compartimentation de l'infection virale contribuent à la variabilité du VIH1. Les implications de ces phénomènes sur la thérapie dirigée contre l'infection par le VIH1 sont discutées.