Bromelain, extracted from the stem of the pineapple, is a complex enzyme used for different purposes. Bromelain supplements are often used to facilitate digestion, improve the circulatory system and relieve arthritis symptoms due to its pain relief. However, in some cases where there is a risk of antibiotic use or bleeding, the use of bromelain or direct consumption of pineapple should be limited. For this purpose, this study was carried out to show the mechanism by which the antibiotic bromelain interaction occurs. Firstly, the bromelain molecule and demeclocycline, minocycline, and tetracycline antibiotics were prepared in the UCSF Chimera visualizing program. The interactions were monitored in the Auto Dock Molecular Modelling Toolkit molecular modeling program. The free binding energies of these interactions were also calculated in Auto Dock. According the molecular modelling results, bromelain and demeclocycline, minocycline, tetracycline antibiotics were interact with hydrogen bonds and hydrophobic interactions. These interactions between bromelain and antibiotics were energetically favorable based on free binding energy calculations.
从菠萝茎中提取的菠萝蛋白酶是一种用于不同用途的复合酶。菠萝蛋白酶补充剂通常用于促进消化、改善循环系统，并因其止痛作用而缓解关节炎症状。不过，在某些有使用抗生素或出血风险的情况下，应限制使用菠萝蛋白酶或直接食用菠萝。为此，我们开展了这项研究，以说明抗生素与菠萝蛋白酶相互作用的机制。首先，在加州大学旧金山分校的Chimera可视化程序中制备了菠萝蛋白酶分子和地美环素、米诺环素和四环素抗生素。在 Auto Dock 分子建模工具包分子建模程序中对相互作用进行了监测。这些相互作用的自由结合能也在 Auto Dock 中进行了计算。分子建模结果显示，菠萝蛋白酶与地美环素、米诺环素、四环素等抗生素之间存在氢键和疏水相互作用。根据自由结合能计算，溴素与抗生素之间的这些相互作用在能量上是有利的。
{"title":"Tetrasiklin Antibiyotikleri ve Bromelain Enzimi Arasındaki Etkileşimlerin Kenetleme Araçları Kullanılarak İncelenmesi","authors":"Gülgün Aylaz","doi":"10.21597/jist.1306563","DOIUrl":"https://doi.org/10.21597/jist.1306563","url":null,"abstract":"Bromelain, extracted from the stem of the pineapple, is a complex enzyme used for different purposes. Bromelain supplements are often used to facilitate digestion, improve the circulatory system and relieve arthritis symptoms due to its pain relief. However, in some cases where there is a risk of antibiotic use or bleeding, the use of bromelain or direct consumption of pineapple should be limited. For this purpose, this study was carried out to show the mechanism by which the antibiotic bromelain interaction occurs. Firstly, the bromelain molecule and demeclocycline, minocycline, and tetracycline antibiotics were prepared in the UCSF Chimera visualizing program. The interactions were monitored in the Auto Dock Molecular Modelling Toolkit molecular modeling program. The free binding energies of these interactions were also calculated in Auto Dock. According the molecular modelling results, bromelain and demeclocycline, minocycline, tetracycline antibiotics were interact with hydrogen bonds and hydrophobic interactions. These interactions between bromelain and antibiotics were energetically favorable based on free binding energy calculations.","PeriodicalId":17353,"journal":{"name":"Journal of the Institute of Science and Technology","volume":"48 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-08-17","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"139350281","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Angiotensin-converting enzyme (ACE, EC 3.4.15.1) is a physiological target for researching new antihypertensive drugs, as it is a substantial enzyme in the regulation of blood pressure. Herein, ACE was purified from human serum with affinity chromatography. Vmax and KM values were found as 60.98 (µmol/min)/mL and 0.34 mM, respectively. The effects of Gly-Arg-Gly-Asp-Ser (GRGDS) and Arg-Gly-Asp (RGD) bioactive peptides on purified ACE were researched. Also, captopril, a specific ACE inhibitory, was used as a reference inhibitor. Bioactive peptides, GRGDS and RGD, demonstrated the inhibitory effect on purified ACE with IC50 values of 46.39 µM and 456.46 µM, respectively. Ki values and kind of inhibition for GRGDS and RGD by the Lineweaver-Burk chart were found. The kind of inhibitory for these bioactive peptides was calculated as reversible-competitive inhibitory. Ki values for GRGDS and RGD were obtained as 93.28 µM and 435.67 µM, respectively. The IC50 value of captopril was designated as 1.57 nM. The inhibitory kind of captopril was designated as reversible non-competitive inhibitory and the Ki value was 0.99 nM. In this study, it was concluded that RGD and GRGDS bioactive peptides have the potential to be utilized as ACE inhibitors.
{"title":"Inhibition effect of Gly-Arg-Gly-Asp-Ser (GRGDS) and Arg-Gly-Asp (RGD) Bioactive Peptides on Angiotensin-Converting Enzyme Activity Purified from Human Serum","authors":"Resul Adanaş, V. Türkoglu, Zehra Bas","doi":"10.21597/jist.1312143","DOIUrl":"https://doi.org/10.21597/jist.1312143","url":null,"abstract":"Angiotensin-converting enzyme (ACE, EC 3.4.15.1) is a physiological target for researching new antihypertensive drugs, as it is a substantial enzyme in the regulation of blood pressure. Herein, ACE was purified from human serum with affinity chromatography. Vmax and KM values were found as 60.98 (µmol/min)/mL and 0.34 mM, respectively. The effects of Gly-Arg-Gly-Asp-Ser (GRGDS) and Arg-Gly-Asp (RGD) bioactive peptides on purified ACE were researched. Also, captopril, a specific ACE inhibitory, was used as a reference inhibitor. Bioactive peptides, GRGDS and RGD, demonstrated the inhibitory effect on purified ACE with IC50 values of 46.39 µM and 456.46 µM, respectively. Ki values and kind of inhibition for GRGDS and RGD by the Lineweaver-Burk chart were found. The kind of inhibitory for these bioactive peptides was calculated as reversible-competitive inhibitory. Ki values for GRGDS and RGD were obtained as 93.28 µM and 435.67 µM, respectively. The IC50 value of captopril was designated as 1.57 nM. The inhibitory kind of captopril was designated as reversible non-competitive inhibitory and the Ki value was 0.99 nM. In this study, it was concluded that RGD and GRGDS bioactive peptides have the potential to be utilized as ACE inhibitors.","PeriodicalId":17353,"journal":{"name":"Journal of the Institute of Science and Technology","volume":"36 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-08-17","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"139350223","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
In this study, for the first time, the antiglaucoma and anticholinergic properties from lanosterol were appraised and researched using different bioanalytical methods and compared with standards. Lanosterol is the compound from which entire fungal and animal steroids are derived. Moreover, is a tetracyclic triterpenoid. Lanosterol is a component in over-the-counter ophthalmic products to prohibit cataracts. The inhibition effects of lanosterol were tested against the butyrylcholinesterase (BChE), carbonic anhydrase I and II (CA I and II) and acetylcholinesterase (AChE), which are associated with some global diseases like Alzheimer’s disease (AD) and glaucoma. Lanosterol were trialed for the inhibition of BChE, AChE, hCA I and II enzymes and indicated efficient inhibition profiles with Ki values in the range of 61.77±22.32 nM against hCA I, 101.11±49.74 nM against hCA II, 2.03±1.21 nM against acetylcholinesterase and 8.39±2.92 nM against butyrylcholinesterase.
本研究首次使用不同的生物分析方法对羊毛甾醇的抗青光眼和抗胆碱能特性进行了评估和研究，并与标准进行了比较。羊毛甾醇是所有真菌和动物甾体化合物的来源。此外，它还是一种四环三萜类化合物。羊毛甾醇是非处方药眼科产品中的一种成分，用于预防白内障。测试了羊毛甾醇对丁酰胆碱酯酶（BChE）、碳酸酐酶 I 和 II（CA I 和 II）以及乙酰胆碱酯酶（AChE）的抑制作用。对羊毛甾醇进行了抑制 BChE、AChE、hCA I 和 II 酶的试验，结果表明其具有高效的抑制作用，对 hCA I 的 Ki 值为 61.77±22.32 nM，对 hCA II 的 Ki 值为 101.11±49.74 nM，对乙酰胆碱酯酶的 Ki 值为 2.03±1.21 nM，对丁酰胆碱酯酶的 Ki 值为 8.39±2.92 nM。
{"title":"Screening of Inhibitory Effects Lanosterol on Butyrylcholinesterase, Acetylcholinesterase and Carbonic Anhydrase Enzymes","authors":"E. Üç","doi":"10.21597/jist.1308662","DOIUrl":"https://doi.org/10.21597/jist.1308662","url":null,"abstract":"In this study, for the first time, the antiglaucoma and anticholinergic properties from lanosterol were appraised and researched using different bioanalytical methods and compared with standards. Lanosterol is the compound from which entire fungal and animal steroids are derived. Moreover, is a tetracyclic triterpenoid. Lanosterol is a component in over-the-counter ophthalmic products to prohibit cataracts. The inhibition effects of lanosterol were tested against the butyrylcholinesterase (BChE), carbonic anhydrase I and II (CA I and II) and acetylcholinesterase (AChE), which are associated with some global diseases like Alzheimer’s disease (AD) and glaucoma. Lanosterol were trialed for the inhibition of BChE, AChE, hCA I and II enzymes and indicated efficient inhibition profiles with Ki values in the range of 61.77±22.32 nM against hCA I, 101.11±49.74 nM against hCA II, 2.03±1.21 nM against acetylcholinesterase and 8.39±2.92 nM against butyrylcholinesterase.","PeriodicalId":17353,"journal":{"name":"Journal of the Institute of Science and Technology","volume":"1 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-08-16","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"139350421","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Bu araştırma Mersin (Türkiye) ili Anamur, Bozyazı ve Aydıncık ilçelerinde bulunan Anamur - Melleç Kaledranı, Dragon Çayı - Pullu Orman Kampı arası ve Mamure Kalesi, Arsinoe Antik Kenti, Bozyazı Melenia ve Tekeli Bozyazı doğal sit alanlarının floristik ve genel vejetasyon yapısını belirlemek amacıyla 2014-2016 yıllarında gerçekleştirilmiştir. Araştırmada toplam 53 familya ve 117 cinse ait 135 takson tespit edilmiş olup toplam 221 lokalitede temsil edildiği görülmüştür. Tespit edilen bitkilerin alanlara göre dağılımı; Anamur - Melleç Kaledran 50, Dragon Çayı - Pullu Orman Kampı arası ve Mamure Kalesi 88, Arsinoe Antik Kenti 41, Bozyazı Melenia 15, Tekeli Bozyazı’da 27 takson tespit edilmiştir. Bu araştırmada 3 adet endemik bitki taksonu tespit edilmiştir. IUCN kriterlerine göre, "nesli tehlike altında" şeklinde değerlendirilen endemik taksonlar: Aristolochia brevilabris Bornm, Muscari babachii Eker & Koyuncu (Kritik- CR), Onopordum boissierianum Raab–Straube & Greuter’dir. Alanda bulunan nadir bitki türleri; Dianthus polycladus Boiss. ve Pancratium maritimum L. türleridir. Endemizm oranı 2.22’dir. Bitkilerin fitocoğrafik bölgelere göre dağılımı: 1 takson Avrupa-Sibirya (%0.70), 4 takson İran-Turan (%2.96), 26 takson Geniş Yayılışlı (%19.25), 54 takson fitocoğrafik bölgesi bilinmeyen (%40.00) ve 50 takson Akdeniz (Doğu Akdeniz dahil) (%37.03) elementi olduğu belirlenmiştir. İlgili alanların sintaksonomik karakter türleri belirtilmiştir. Çalışma alanlarının tamamında Quercetea İlicis, Cisto-Micromerietea ve Quercetea Pubescentis sınıflarının karakter türlerine rastlanılmış olup, sadece Dragon Çayı - Pullu Orman Kampı arası ve Mamure Kalesinde diğerlerinden farklı olarak Querco-Fagetea vejetasyon sınıfına ait karakter türlerin olduğu belirlenmiştir.
{"title":"Anamur, Bozyazı ve Aydıncık (Mersin-Türkiye)’daki Bazı Doğal Sit Alanlarının Flora ve Genel Vejetasyon Yapısının İncelenmesi","authors":"A. Tel, İshak Ortaç, Ergün Özuslu, Ahmet İlçi̇m","doi":"10.21597/jist.1313399","DOIUrl":"https://doi.org/10.21597/jist.1313399","url":null,"abstract":"Bu araştırma Mersin (Türkiye) ili Anamur, Bozyazı ve Aydıncık ilçelerinde bulunan Anamur - Melleç Kaledranı, Dragon Çayı - Pullu Orman Kampı arası ve Mamure Kalesi, Arsinoe Antik Kenti, Bozyazı Melenia ve Tekeli Bozyazı doğal sit alanlarının floristik ve genel vejetasyon yapısını belirlemek amacıyla 2014-2016 yıllarında gerçekleştirilmiştir. Araştırmada toplam 53 familya ve 117 cinse ait 135 takson tespit edilmiş olup toplam 221 lokalitede temsil edildiği görülmüştür. Tespit edilen bitkilerin alanlara göre dağılımı; Anamur - Melleç Kaledran 50, Dragon Çayı - Pullu Orman Kampı arası ve Mamure Kalesi 88, Arsinoe Antik Kenti 41, Bozyazı Melenia 15, Tekeli Bozyazı’da 27 takson tespit edilmiştir. Bu araştırmada 3 adet endemik bitki taksonu tespit edilmiştir. IUCN kriterlerine göre, \"nesli tehlike altında\" şeklinde değerlendirilen endemik taksonlar: Aristolochia brevilabris Bornm, Muscari babachii Eker & Koyuncu (Kritik- CR), Onopordum boissierianum Raab–Straube & Greuter’dir. Alanda bulunan nadir bitki türleri; Dianthus polycladus Boiss. ve Pancratium maritimum L. türleridir. Endemizm oranı 2.22’dir. Bitkilerin fitocoğrafik bölgelere göre dağılımı: 1 takson Avrupa-Sibirya (%0.70), 4 takson İran-Turan (%2.96), 26 takson Geniş Yayılışlı (%19.25), 54 takson fitocoğrafik bölgesi bilinmeyen (%40.00) ve 50 takson Akdeniz (Doğu Akdeniz dahil) (%37.03) elementi olduğu belirlenmiştir. İlgili alanların sintaksonomik karakter türleri belirtilmiştir. Çalışma alanlarının tamamında Quercetea İlicis, Cisto-Micromerietea ve Quercetea Pubescentis sınıflarının karakter türlerine rastlanılmış olup, sadece Dragon Çayı - Pullu Orman Kampı arası ve Mamure Kalesinde diğerlerinden farklı olarak Querco-Fagetea vejetasyon sınıfına ait karakter türlerin olduğu belirlenmiştir.","PeriodicalId":17353,"journal":{"name":"Journal of the Institute of Science and Technology","volume":"141 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-08-16","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"139350439","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
In this paper Gaussian, Mean and total curvature formulae of Rational Bezier Curves with asymptotic frame field are calculated by using its curvatures in 3- dimensional lightlike cone in Minkowski 4- Space. Our main intention is to introduce and investigate some differential geometric properties of the the Rational Bezier Curves with asymptotic frame field in 3- dimensional lightlike cone in Minkowski 4- Space by using its curvatures.
{"title":"Gauss, Mean and Total Curvature Formulae of Rational Bezier Curves in Minkowski 4-Space","authors":"Filiz Ertem Kaya","doi":"10.21597/jist.1243458","DOIUrl":"https://doi.org/10.21597/jist.1243458","url":null,"abstract":"In this paper Gaussian, Mean and total curvature formulae of Rational Bezier Curves with asymptotic frame field are calculated by using its curvatures in 3- dimensional lightlike cone in Minkowski 4- Space. Our main intention is to introduce and investigate some differential geometric properties of the the Rational Bezier Curves with asymptotic frame field in 3- dimensional lightlike cone in Minkowski 4- Space by using its curvatures.","PeriodicalId":17353,"journal":{"name":"Journal of the Institute of Science and Technology","volume":"170 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-08-14","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"139350755","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Bu çalışma, sığırlarda yaygın şekilde kullanılan değerlendirme yöntemini Anadolu mandasına uyarlanmak suretiyle mandalar için kullanılabilir bir değerlendirme sisteminin oluşturulması ve vücut kondisyonu açısından mevcut durumun belirlenmesi amacıyla yürütülmüştür. Çalışmanın materyalini 128 işletme ve bu işletmelerde yetiştirilen 614 baş manda ineği oluşturmuştur. Verilerin hazırlanması amacıyla Microsoft Excel programı, istatistiki değerlendirilme için SPSS 20.0 sürümünden faydalanılmıştır. Vücut kondisyonu değerlendirmesi sonucunda manda ineklerinin omurga (O), kaburga (K), kısa kemikler (KK), leğen kemiği (LK), but bölgesi (BB), oturak yumrusu (OY), kuyruk sokumu (KS), uyluk (U) kondisyonları ve genel vücut kondisyonu sırasıyla, 6.12 puan, 5.73 puan, 5.10 puan, 5.65 puan, 5.69 puan, 5.25 puan, 4.92 puan, 5.10 puan ve 5.51 puan olarak tespit edilmiştir. Genel vücut kondisyonu (GVK) ile O, K, KK, LK, BB, OY, KS ve U özellikleri arasında pozitif yönlü, yüksek ve önemli (p
{"title":"Anadolu Mandalarında Vücut Kondisyonu Değerlendirme Standardının Oluşturulması","authors":"Onur Şahi̇n, Önder Bayram Çoban, M. Soysal","doi":"10.21597/jist.1329192","DOIUrl":"https://doi.org/10.21597/jist.1329192","url":null,"abstract":"Bu çalışma, sığırlarda yaygın şekilde kullanılan değerlendirme yöntemini Anadolu mandasına uyarlanmak suretiyle mandalar için kullanılabilir bir değerlendirme sisteminin oluşturulması ve vücut kondisyonu açısından mevcut durumun belirlenmesi amacıyla yürütülmüştür. Çalışmanın materyalini 128 işletme ve bu işletmelerde yetiştirilen 614 baş manda ineği oluşturmuştur. Verilerin hazırlanması amacıyla Microsoft Excel programı, istatistiki değerlendirilme için SPSS 20.0 sürümünden faydalanılmıştır. Vücut kondisyonu değerlendirmesi sonucunda manda ineklerinin omurga (O), kaburga (K), kısa kemikler (KK), leğen kemiği (LK), but bölgesi (BB), oturak yumrusu (OY), kuyruk sokumu (KS), uyluk (U) kondisyonları ve genel vücut kondisyonu sırasıyla, 6.12 puan, 5.73 puan, 5.10 puan, 5.65 puan, 5.69 puan, 5.25 puan, 4.92 puan, 5.10 puan ve 5.51 puan olarak tespit edilmiştir. Genel vücut kondisyonu (GVK) ile O, K, KK, LK, BB, OY, KS ve U özellikleri arasında pozitif yönlü, yüksek ve önemli (p","PeriodicalId":17353,"journal":{"name":"Journal of the Institute of Science and Technology","volume":"53 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-08-12","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"139350837","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
In this study, it was aimed to determine the structural properties of free radicals formed by gamma irradiation in chlorpropamide and procainamide hydrochloride drug raw materials, which are widely used in medicine, by using electron paramagnetic resonance spectroscopy. As a result of gamma irradiation, it was determined that two different radicals were formed in both chlorpropamide and procainamide hydrochloride samples. It was suggested that –NĊH-, -NCH2ĊH2- and –NĊH-, -NĊHCH2- radicals were formed in chlorpropamide and procainamide hydrochloride samples, respectively. The simulated spectra closest to the experimental spectra recorded at room temperature of the samples studied in powder form were obtained using simulation software. The contributions of the proposed radicals to the experimental spectra were calculated. The g values of the obtained radicals and the hyperfine structure constants of the unpaired electrons were calculated.
本研究的目的是利用电子顺磁共振波谱法，测定广泛用于医药的氯丙酰胺和盐酸普鲁卡因胺药物原料经伽马射线照射后形成的自由基的结构特性。伽马辐照的结果表明，在氯丙酰胺和盐酸普鲁卡因胺样品中形成了两种不同的自由基。结果表明，在氯丙酰胺和盐酸普鲁卡因胺样品中分别形成了-N↪Lu_10AH-, -NCH2ĊH2- 和-N↪Lu_10AH-, -NĊHCH2- 自由基。使用模拟软件获得了与所研究的粉末状样品在室温下记录的实验光谱最接近的模拟光谱。计算了所提出的自由基对实验光谱的贡献。计算了所得自由基的 g 值和未配对电子的超频结构常数。
{"title":"Gama ile Işınlanmış Klorpropamid ve Prokainamid Hidroklorür İlaç Hammaddelerinde Oluşan Serbest Radikallerin EPR Spektroskopisi ile Tanımlanması","authors":"Kerem Sütçü, Yunus Emre Osmanoğlu","doi":"10.21597/jist.1302560","DOIUrl":"https://doi.org/10.21597/jist.1302560","url":null,"abstract":"In this study, it was aimed to determine the structural properties of free radicals formed by gamma irradiation in chlorpropamide and procainamide hydrochloride drug raw materials, which are widely used in medicine, by using electron paramagnetic resonance spectroscopy. As a result of gamma irradiation, it was determined that two different radicals were formed in both chlorpropamide and procainamide hydrochloride samples. It was suggested that –NĊH-, -NCH2ĊH2- and –NĊH-, -NĊHCH2- radicals were formed in chlorpropamide and procainamide hydrochloride samples, respectively. The simulated spectra closest to the experimental spectra recorded at room temperature of the samples studied in powder form were obtained using simulation software. The contributions of the proposed radicals to the experimental spectra were calculated. The g values of the obtained radicals and the hyperfine structure constants of the unpaired electrons were calculated.","PeriodicalId":17353,"journal":{"name":"Journal of the Institute of Science and Technology","volume":"1 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-08-12","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"139350843","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Galaktoz seviyesinin ölçümü, galaktozemi ve galaktoz intoleransı açısından klinik önem taşır. Özellikle yenidoğanlarda hemen tespit edilmemesi ölümcül sonuçlar doğurabilir. Teşhis konduktan sonra da galaktozun diyetten çıkarılması gerekir. Dolayısıyla hem kan hem de diyette özellikle süt ve süt ürünlerinde galaktozun tayini büyük önem taşır. Literatür verilerinde galaktoz tayini için geliştirilen yöntemler spektrofotometre, kromatografi, kütle spektrometresi gibi ön işlem ve pahalı ekipman gerektiren, zaman alıcı ve nispeten yavaş yöntemlerdir. Bu çalışmanın amacını da galaktoz tayini için hızlı, spesifik, ucuz elektrokimyasal bir biyosensör sistemi geliştirilmesi oluşturmaktadır. Biyokomponent olarak Galaktoz Oksidaz (GaOX) enzimi kullanılan bu çalışmada, çalışma elektrodu olarak Rutenyum mediyatör kompleksi içeren karbon pasta elektrot kullanılmıştır. GaOX enzimi pasta yapısı içerisinde immobilize edilmiştir. Çalışmanın özgünlüğünü pasta yapısı içerisinde kullanılan Rutenyum mediyatör sisteminin kullanılması oluşturmaktadır. Elektrot yapım aşamaları döngüsel voltammetri (CV) yöntemiyle karakterize edilirken, optimizasyon ve karakterizasyon çalışmaları 0&0.9 V arası DP, ve 0.5 V’ta amperometrik ölçümler yoluyla gerçekleştirilmiştir. Çalışmalarda ayrıca çalışma tamponu içerisinde 1 mM p-benzokinon mediyatör sistemi kullanılmıştır.Optimizasyon çalışmaları sonu optimum pH 6,5, optimum sıcaklık ise 30 oC olarak bulunmuştur. Geliştirilen biyosensörün doğrusal tayin aralığı 0.05 – 1 mM arası bulunurken, tekrarlanabilirliği 0.25 mM galaktoz için ortalama 0.24 mM, standart sapma ± 0.021 ve varyasyon katsayısı (%VK) %8,3 olarak bulunmuştur. Girişim etkisi denemesinde herhangi bir girişim gözlenmemiştir. Örnek denemesi liyofilize serum ve laktozsuz süt örneklerinde yapılmış ve % geri elde hesaplanmıştır. Bu projede kullanılan Rutenyum mediyatör kompleksinin biyosensör yapımında kullanılmasına literatürde çok az rastlanılmış olmakla birlikte bu çalışmayla ilk defa bir galaktoz biyosensöründe ve ilk defa bir karbon pasta elektrotla kullanımı gerçekleştirilmiştir.
在半乳糖血症和半乳糖不耐受症中，测量半乳糖水平具有重要的临床意义。如果不能及时发现，尤其是新生儿，可能会造成致命后果。一旦确诊，必须从饮食中去除半乳糖。因此，测定血液和膳食中的半乳糖，尤其是牛奶和奶制品中的半乳糖，具有非常重要的意义。文献数据中为测定半乳糖而开发的方法都是耗时且相对缓慢的方法，需要预处理和昂贵的设备，如分光光度计、色谱法、质谱法等。本研究的目的是开发一种快速、特异、廉价的电化学生物传感器系统，用于测定半乳糖。在这项研究中，半乳糖氧化酶（GaOX）酶被用作生物组分，含有钌介质复合物的碳浆电极被用作工作电极。GaOX 酶被固定在浆状结构中。这项研究的独创性在于在浆糊结构中使用了钌介质系统。电极构建步骤通过循环伏安法（CV）进行表征，优化和表征研究则通过 0 至 0.9 V 的 DP 和 0.5 V 的安培测量进行。优化研究结束时，发现最佳 pH 值为 6.5，最佳温度为 30 摄氏度。所开发的生物传感器的线性测定范围为 0.05 - 1 mM，0.25 mM 半乳糖的重现性为 0.24 mM，标准偏差为 ± 0.021，变异系数（%CV）为 8.3%。在干扰效应实验中未观察到干扰。对冻干血清和无乳糖牛奶样品进行了测试，并计算了回收率。虽然本项目中使用的钌媒介复合物在生物传感器构建中的应用在文献中非常罕见，但它首次被用于半乳糖生物传感器，并首次与碳糊电极一起使用。
{"title":"Development of Galactose Biosensor Based on Ruthenium Mediator Complex","authors":"Erhan Canbay, Şevval Kundakçi, Ezginur Yildiz, Zeynep ÇELİK CANBAY, Serçin Doğan, Erol Akyilmaz","doi":"10.21597/jist.1321228","DOIUrl":"https://doi.org/10.21597/jist.1321228","url":null,"abstract":"Galaktoz seviyesinin ölçümü, galaktozemi ve galaktoz intoleransı açısından klinik önem taşır. Özellikle yenidoğanlarda hemen tespit edilmemesi ölümcül sonuçlar doğurabilir. Teşhis konduktan sonra da galaktozun diyetten çıkarılması gerekir. Dolayısıyla hem kan hem de diyette özellikle süt ve süt ürünlerinde galaktozun tayini büyük önem taşır. Literatür verilerinde galaktoz tayini için geliştirilen yöntemler spektrofotometre, kromatografi, kütle spektrometresi gibi ön işlem ve pahalı ekipman gerektiren, zaman alıcı ve nispeten yavaş yöntemlerdir. Bu çalışmanın amacını da galaktoz tayini için hızlı, spesifik, ucuz elektrokimyasal bir biyosensör sistemi geliştirilmesi oluşturmaktadır. Biyokomponent olarak Galaktoz Oksidaz (GaOX) enzimi kullanılan bu çalışmada, çalışma elektrodu olarak Rutenyum mediyatör kompleksi içeren karbon pasta elektrot kullanılmıştır. GaOX enzimi pasta yapısı içerisinde immobilize edilmiştir. Çalışmanın özgünlüğünü pasta yapısı içerisinde kullanılan Rutenyum mediyatör sisteminin kullanılması oluşturmaktadır. Elektrot yapım aşamaları döngüsel voltammetri (CV) yöntemiyle karakterize edilirken, optimizasyon ve karakterizasyon çalışmaları 0&0.9 V arası DP, ve 0.5 V’ta amperometrik ölçümler yoluyla gerçekleştirilmiştir. Çalışmalarda ayrıca çalışma tamponu içerisinde 1 mM p-benzokinon mediyatör sistemi kullanılmıştır.Optimizasyon çalışmaları sonu optimum pH 6,5, optimum sıcaklık ise 30 oC olarak bulunmuştur. Geliştirilen biyosensörün doğrusal tayin aralığı 0.05 – 1 mM arası bulunurken, tekrarlanabilirliği 0.25 mM galaktoz için ortalama 0.24 mM, standart sapma ± 0.021 ve varyasyon katsayısı (%VK) %8,3 olarak bulunmuştur. Girişim etkisi denemesinde herhangi bir girişim gözlenmemiştir. Örnek denemesi liyofilize serum ve laktozsuz süt örneklerinde yapılmış ve % geri elde hesaplanmıştır. Bu projede kullanılan Rutenyum mediyatör kompleksinin biyosensör yapımında kullanılmasına literatürde çok az rastlanılmış olmakla birlikte bu çalışmayla ilk defa bir galaktoz biyosensöründe ve ilk defa bir karbon pasta elektrotla kullanımı gerçekleştirilmiştir.","PeriodicalId":17353,"journal":{"name":"Journal of the Institute of Science and Technology","volume":"19 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-08-11","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"139351029","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Van balığı, Van Gölü havzasına endemik Cyprinidae familyasında yer alan anadrom bir balıktır. Balık beslenme ve büyümesini gerçekleştirdiği Van Gölü’nden nisan-temmuz aylarında göle dökülen akarsulara giriş yapar. Bu sucul ortamlarda balığın beslenme davranışlarında farklılık gözlenir. Bu çalışmada nisan ve temmuz ayları arasında Van Gölünden ve Karasu Çayından örneklenen 30 adet Van balığı sindirim kanalı morfometrik ve histolojik olarak incelendi. Van balığı sindirim kanalı incelendiğinde belirgin bir mide yapısının olmadığı gözlendi. Sindirim kanalı özofagus, mide görevini üstlenen mide benzeri yapı, anterior bağırsak, posterior bağırsak ve anüsten meydana geldiği belirlendi. Van balığının sindirim kanalının en dıştan içe doğru seröz, muskularis, submukoza ve lümene doğru kıvrımlardan oluşan mukoza tabakalarından oluştuğu gözlendi. Bu tabaka kalınlıklarının göl ve akarsudan örneklenen balıklar arasında değiştiği belirlendi. Morfometrik olarak çap, mukoza genişliği, mukoza uzunluğu, mukoza kıvrımları, muskularis kalınlığı, submukoza kalınlığı ve uzunluğu ölçüldü. Bu değerlerin, gölden örneklenen balıklarda akarsulardan örneklenen balıklara göre daha büyük olduğu belirlendi. Van balığı sindirim kanalında ölçümler ilk defa bu çalışma ile belirlendi. Bu ölçülen değerlerin balığın beslenme, stres ve suyun fizikokimyasal yapısı ile ilgili olduğu düşünülmektedir.
{"title":"Van Balığı (Alburnus tarichi (Güldenstädt, 1814))’nın Sindirim Kanalı Üzerinde Histomorfolojik Çalışma","authors":"Burcu Ergöz, A. Oğuz","doi":"10.21597/jist.1297242","DOIUrl":"https://doi.org/10.21597/jist.1297242","url":null,"abstract":"Van balığı, Van Gölü havzasına endemik Cyprinidae familyasında yer alan anadrom bir balıktır. Balık beslenme ve büyümesini gerçekleştirdiği Van Gölü’nden nisan-temmuz aylarında göle dökülen akarsulara giriş yapar. Bu sucul ortamlarda balığın beslenme davranışlarında farklılık gözlenir. Bu çalışmada nisan ve temmuz ayları arasında Van Gölünden ve Karasu Çayından örneklenen 30 adet Van balığı sindirim kanalı morfometrik ve histolojik olarak incelendi. Van balığı sindirim kanalı incelendiğinde belirgin bir mide yapısının olmadığı gözlendi. Sindirim kanalı özofagus, mide görevini üstlenen mide benzeri yapı, anterior bağırsak, posterior bağırsak ve anüsten meydana geldiği belirlendi. Van balığının sindirim kanalının en dıştan içe doğru seröz, muskularis, submukoza ve lümene doğru kıvrımlardan oluşan mukoza tabakalarından oluştuğu gözlendi. Bu tabaka kalınlıklarının göl ve akarsudan örneklenen balıklar arasında değiştiği belirlendi. Morfometrik olarak çap, mukoza genişliği, mukoza uzunluğu, mukoza kıvrımları, muskularis kalınlığı, submukoza kalınlığı ve uzunluğu ölçüldü. Bu değerlerin, gölden örneklenen balıklarda akarsulardan örneklenen balıklara göre daha büyük olduğu belirlendi. Van balığı sindirim kanalında ölçümler ilk defa bu çalışma ile belirlendi. Bu ölçülen değerlerin balığın beslenme, stres ve suyun fizikokimyasal yapısı ile ilgili olduğu düşünülmektedir.","PeriodicalId":17353,"journal":{"name":"Journal of the Institute of Science and Technology","volume":"22 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-08-10","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"139351141","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
The concept of a conformable derivative on time scales is a relatively new development in the field of fractional calculus. Traditional fractional calculus deals with derivatives and integrals of non-integer order on continuous time domains. However, time scale calculus extends these concepts to more general time domains that include both continuous and discrete points. The conformable derivative on time scales has several properties that make it advantageous in certain applications. For example, it satisfies a chain rule and has a simple relationship with the conformable integral, which facilitates the development of differential equations involving fractional order dynamics. It also allows for the analysis of systems with both continuous and discrete data points, making it suitable for modeling and control applications in various fields, including physics, engineering, and finance. In this study, the Sturm-Liouville problem and its properties are examined on an arbitrary time scale using the proportional derivative, a more general form of the fractional derivative. Important spectral properties such as self-adjointness, Green formula, Lagrange identity, Abel formula, and orthogonality of eigenfunctions for this problem are expressed in proportional derivatives on an arbitrary time scale.
{"title":"Self-Adjoint Sturm-Liouville Dynamic Problem via Proportional Derivative","authors":"Tüba Gülşen, Mehmet Acar","doi":"10.21597/jist.1313391","DOIUrl":"https://doi.org/10.21597/jist.1313391","url":null,"abstract":"The concept of a conformable derivative on time scales is a relatively new development in the field of fractional calculus. Traditional fractional calculus deals with derivatives and integrals of non-integer order on continuous time domains. However, time scale calculus extends these concepts to more general time domains that include both continuous and discrete points. The conformable derivative on time scales has several properties that make it advantageous in certain applications. For example, it satisfies a chain rule and has a simple relationship with the conformable integral, which facilitates the development of differential equations involving fractional order dynamics. It also allows for the analysis of systems with both continuous and discrete data points, making it suitable for modeling and control applications in various fields, including physics, engineering, and finance. In this study, the Sturm-Liouville problem and its properties are examined on an arbitrary time scale using the proportional derivative, a more general form of the fractional derivative. Important spectral properties such as self-adjointness, Green formula, Lagrange identity, Abel formula, and orthogonality of eigenfunctions for this problem are expressed in proportional derivatives on an arbitrary time scale.","PeriodicalId":17353,"journal":{"name":"Journal of the Institute of Science and Technology","volume":"24 3 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2023-08-10","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"139351050","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
京公网安备 11010802042870号
京ICP备2023020795号-1
扫码关注我们
求助内容：
应助结果提醒方式：