Pub Date : 2022-04-11DOI: 10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p08
S. Rahma, Ngurah Intan Wiratmini, N. W. Sudatri
Akrilamida merupakan senyawa kontaminan yang ditemukan pada beberapa jenis makanan mengandung karbohidrat dan diolah melalui proses penggorengan atau pemanggangan pada temperatur tinggi. Senyawa akrilamida dapat menyebabkan terjadinya stres oksidatif yang dapat menyebabkan terjadinya neurotoksisitas. Stress oksidatif yang terjadi dapat diatasi dengan pemberian antioksidan salah satunya adalah vitamin C. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui gambaran histologi korteks serebri mencit yang diberikan vitamin C dan diinduksi akrilamida serta dosis yang paling efektif sebagai neuroprotektor pada otak mencit yang diinduksi akrilamida. Penelitian ini menggunakan Rancangan Acak Lengkap (RAL) dengan empat kelompok yaitu diinduksi akrilamida dengan dosis 12,5 mg/kgBB (K+), hanya diberikan larutan normal salin (NaCl 0,9 %) (K-), dan dua perlakuan yang diberikan vitamin C dengan dosis 0,26 mg/ekor/hari (P1) dan 0,52 mg/ekor/hari (P2) serta diinduksi akrilamida dosis 12,5 mg/kgBB. Setiap kelompok dilakukan 6 pengulangan sehingga jumlah sampel yang digunakan berjumlah 24 ekor mencit. Pemberian larutan akrilamida dan vitamin C dilakukan secara oral. Larutan akrilamida diberikan selama 20 hari, sedangkan larutan vitamin C diberikan 3 hari sebelum induksi akrilamida hingga hari ke-20 bersamaan dengan pemberian akrilamida. Mencit akan dibedah pada hari ke-21 untuk diambil organ otaknya kemudian dilakukan preparasi histopatologi dengan metode parafin dan menggunakan pewarnaan Hematoksilin-Eosin. Parameter yang diamati adalah nekrosis pada sel pyramid dan sel glia. Data kualitatif yang didapatkan dinalisis secara statistik dengan One Way ANOVA dan dilanjutkan dengan Duncan. Hasil menunjukkan bahwa vitamin C dosis 0.52 mg/ekor/hari secara nyata memperbaiki kerusakan sel piramid dan sel glia yang diinduksi akrilamida.
{"title":"Uji Efektivitas Vitamin C sebagai Neuroprotektor pada Mencit (Mus musculus) yang Diinduksi Akrilamida","authors":"S. Rahma, Ngurah Intan Wiratmini, N. W. Sudatri","doi":"10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p08","DOIUrl":"https://doi.org/10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p08","url":null,"abstract":"Akrilamida merupakan senyawa kontaminan yang ditemukan pada beberapa jenis makanan mengandung karbohidrat dan diolah melalui proses penggorengan atau pemanggangan pada temperatur tinggi. Senyawa akrilamida dapat menyebabkan terjadinya stres oksidatif yang dapat menyebabkan terjadinya neurotoksisitas. Stress oksidatif yang terjadi dapat diatasi dengan pemberian antioksidan salah satunya adalah vitamin C. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui gambaran histologi korteks serebri mencit yang diberikan vitamin C dan diinduksi akrilamida serta dosis yang paling efektif sebagai neuroprotektor pada otak mencit yang diinduksi akrilamida. Penelitian ini menggunakan Rancangan Acak Lengkap (RAL) dengan empat kelompok yaitu diinduksi akrilamida dengan dosis 12,5 mg/kgBB (K+), hanya diberikan larutan normal salin (NaCl 0,9 %) (K-), dan dua perlakuan yang diberikan vitamin C dengan dosis 0,26 mg/ekor/hari (P1) dan 0,52 mg/ekor/hari (P2) serta diinduksi akrilamida dosis 12,5 mg/kgBB. Setiap kelompok dilakukan 6 pengulangan sehingga jumlah sampel yang digunakan berjumlah 24 ekor mencit. Pemberian larutan akrilamida dan vitamin C dilakukan secara oral. Larutan akrilamida diberikan selama 20 hari, sedangkan larutan vitamin C diberikan 3 hari sebelum induksi akrilamida hingga hari ke-20 bersamaan dengan pemberian akrilamida. Mencit akan dibedah pada hari ke-21 untuk diambil organ otaknya kemudian dilakukan preparasi histopatologi dengan metode parafin dan menggunakan pewarnaan Hematoksilin-Eosin. Parameter yang diamati adalah nekrosis pada sel pyramid dan sel glia. Data kualitatif yang didapatkan dinalisis secara statistik dengan One Way ANOVA dan dilanjutkan dengan Duncan. Hasil menunjukkan bahwa vitamin C dosis 0.52 mg/ekor/hari secara nyata memperbaiki kerusakan sel piramid dan sel glia yang diinduksi akrilamida.","PeriodicalId":30806,"journal":{"name":"Metamorfosa Journal of Biological Sciences","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-04-11","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"45317481","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2022-04-08DOI: 10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p06
R. Astuti, Sri Widodo Agung Suedy, Yulita Nurchayati, Nintya Setiari
Kantong semar (Nepenthes mirabilis (Lour.)) merupakan tanaman unik dengan keberadaan piala pada bagian ujung daun. Jenis ini termasuk kategori langka sehingga perlu dilestarikan. Salah satu upaya konservasi yang dapat dilakukan adalah pemilihan komposisi media tanam untuk budidayanya. Penelitian bertujuan mencari media tanam alternatif yang dapat mendukung pertumbuhan kantong semar selain media sphagnum moss. Penelitian dilaksanakan di green house Desa Ngablak, Kecamatan Ngablak, Kabupaten Magelang pada bulan Agustus hingga November 2020. Penelitian menggunakan Rancangan Acak Lengkap (RAL) dengan 4 perlakuan media tanam yaitu sphagnum moss, sekam bakar, sekam bakar dengan cocopeat (3:1), sphagnum moss dengan cocopeat (3:1) masing-masing diberikan 4 ulangan. Parameter penelitian meliputi jumlah daun, waktu kemunculan daun, panjang daun, lebar daun, dan tinggi tanaman diukur pada 12 Minggu Setelah Tanam (MST). Data penelitian dianalisis dengan Analysist of Varian (ANOVA) dan Duncan Multiple Range Test (DMRT) pada tingkat kepercayaan 95%. Hasil penelitian menunjukkan bahwa semua media perlakuan memberikan pengaruh nyata terhadap jumlah daun, panjang daun, lebar daun, dan tinggi tanaman. Media tanam terbaik adalah sphagnum moss dengan waktu kemunculan daun baru (2,39 minggu), jumlah daun terbanyak (11,25 helai), dan tinggi tanaman (1,6 cm). Media campuran sekam bakar dengan cocopeat (3:1) menghasilkan pertumbuhan yang tidak berbeda dari sphagnum moss, sehingga direkomendasikan menjadi media alternatif yang lebih murah. Kata Kunci: Nepenthes mirabilis, sphagnum moss, sekam bakar, cocopeat
{"title":"Pertumbuhan Kantong Semar (Nepenthes mirabilis (Lour.) Druce) Pada Berbagai Media Tanam","authors":"R. Astuti, Sri Widodo Agung Suedy, Yulita Nurchayati, Nintya Setiari","doi":"10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p06","DOIUrl":"https://doi.org/10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p06","url":null,"abstract":"Kantong semar (Nepenthes mirabilis (Lour.)) merupakan tanaman unik dengan keberadaan piala pada bagian ujung daun. Jenis ini termasuk kategori langka sehingga perlu dilestarikan. Salah satu upaya konservasi yang dapat dilakukan adalah pemilihan komposisi media tanam untuk budidayanya. Penelitian bertujuan mencari media tanam alternatif yang dapat mendukung pertumbuhan kantong semar selain media sphagnum moss. Penelitian dilaksanakan di green house Desa Ngablak, Kecamatan Ngablak, Kabupaten Magelang pada bulan Agustus hingga November 2020. Penelitian menggunakan Rancangan Acak Lengkap (RAL) dengan 4 perlakuan media tanam yaitu sphagnum moss, sekam bakar, sekam bakar dengan cocopeat (3:1), sphagnum moss dengan cocopeat (3:1) masing-masing diberikan 4 ulangan. Parameter penelitian meliputi jumlah daun, waktu kemunculan daun, panjang daun, lebar daun, dan tinggi tanaman diukur pada 12 Minggu Setelah Tanam (MST). Data penelitian dianalisis dengan Analysist of Varian (ANOVA) dan Duncan Multiple Range Test (DMRT) pada tingkat kepercayaan 95%. Hasil penelitian menunjukkan bahwa semua media perlakuan memberikan pengaruh nyata terhadap jumlah daun, panjang daun, lebar daun, dan tinggi tanaman. Media tanam terbaik adalah sphagnum moss dengan waktu kemunculan daun baru (2,39 minggu), jumlah daun terbanyak (11,25 helai), dan tinggi tanaman (1,6 cm). Media campuran sekam bakar dengan cocopeat (3:1) menghasilkan pertumbuhan yang tidak berbeda dari sphagnum moss, sehingga direkomendasikan menjadi media alternatif yang lebih murah. \u0000 \u0000Kata Kunci: Nepenthes mirabilis, sphagnum moss, sekam bakar, cocopeat \u0000 ","PeriodicalId":30806,"journal":{"name":"Metamorfosa Journal of Biological Sciences","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-04-08","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"47961666","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2022-04-05DOI: 10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p04
Nadya Tressna Wulansari, A. I. M. Padmiswari, Ni Wayan Yoshi Antari
Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi pengaruh lama penyimpanan dengan pemberian perasan jeruk nipis terhadap jumlah angka bakteri daging ayam kampung. Eksperimen dengan model rancangan acak lengkap digunakan dalam penelitian ini. Hasil penelitian menunjukan bahwa adanya pengaruh lama penyimpanan dengan pemberian perasan jeruk nipis terhadap jumlah angka bakteri pada daging ayam kampung. Kandungan asam organik, asam sitrat, minyak atsiri dan limonene yang terkandung dalam jeruk nipis mempengaruhi total bakteri yang terdapat pada daging ayam kampung. Daging ayam kampung dengan pemberian perasan air jeruk nipis yang disimpan pada suhu <40C hingga 12 hari cenderung mengalami peningkatan jumlah cemaran bakteri. Namun, jumlah angka lempeng total bakteri pada daging ayam kampung dibawah dari aturan yang dikeluarkan oleh Badan Standarisasi Nasional Indonesia mengenai batas mutu tingkat cemaran mikroba yaitu 1 x 106 CFU/g. Jumlah bakteri pada daging ayam berdasarkan lama penyimpangan cenderung mengalami peningkatan Kata kunci: lama penyimpanan, Citrus aurantifolia, bakteri, daging ayam kampung
这项研究的目的是通过腌制柠檬汁对家禽细菌数量的影响来识别长期贮存的影响。在本研究中使用了一个完全随机设计模型的实验。研究表明，陈腐对家禽家禽数量的细菌产生了长期的储存方式。柠檬汁中的有机、柠檬酸、柠檬酸、atsiri油和柠檬水的含量，对家禽肉中的细菌产生了总影响。在<40C到12天内储存的酸橙汁中的家禽肉馅料更有可能增加细菌杂质。然而，家禽中总细菌的板数低于印度尼西亚国家标准化机构(organization of national standsm)关于微生物污染水平的1×106 CFU/g的规定。根据鸡肉的长期偏差，鸡肉中的细菌数量往往会增加关键字:长期贮存、柑橘、细菌、家禽
{"title":"Pengaruh Lama Penyimpanan Dengan Pemberian Perasan Jeruk Nipis Terhadap Jumlah Angka Bakteri Pada Daging Ayam Kampung","authors":"Nadya Tressna Wulansari, A. I. M. Padmiswari, Ni Wayan Yoshi Antari","doi":"10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p04","DOIUrl":"https://doi.org/10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p04","url":null,"abstract":"Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi pengaruh lama penyimpanan dengan pemberian perasan jeruk nipis terhadap jumlah angka bakteri daging ayam kampung. Eksperimen dengan model rancangan acak lengkap digunakan dalam penelitian ini. Hasil penelitian menunjukan bahwa adanya pengaruh lama penyimpanan dengan pemberian perasan jeruk nipis terhadap jumlah angka bakteri pada daging ayam kampung. Kandungan asam organik, asam sitrat, minyak atsiri dan limonene yang terkandung dalam jeruk nipis mempengaruhi total bakteri yang terdapat pada daging ayam kampung. Daging ayam kampung dengan pemberian perasan air jeruk nipis yang disimpan pada suhu <40C hingga 12 hari cenderung mengalami peningkatan jumlah cemaran bakteri. Namun, jumlah angka lempeng total bakteri pada daging ayam kampung dibawah dari aturan yang dikeluarkan oleh Badan Standarisasi Nasional Indonesia mengenai batas mutu tingkat cemaran mikroba yaitu 1 x 106 CFU/g. Jumlah bakteri pada daging ayam berdasarkan lama penyimpangan cenderung mengalami peningkatan \u0000 \u0000Kata kunci: lama penyimpanan, Citrus aurantifolia, bakteri, daging ayam kampung","PeriodicalId":30806,"journal":{"name":"Metamorfosa Journal of Biological Sciences","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-04-05","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"43230012","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2022-04-05DOI: 10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p03
I. M. S. Wijana, I. Wijaya, A. R. As-syakur, G. Indrawan, Putu Angga Wiradana, Komang Kartika Indi Swari, Dewa Ayu Putu Leliana Sari
Kawasan hilir Daerah Aliran Sungai (DAS) Unda yang terletak di Kabupaten Klungkung telah mengalami suksesi akibat letusan Gunung Agung pada tahun 1963. Ekosistem di kawasan hilir Sungai Unda juga mengalami suksesi antropogenik akibat aktivitas manusia. Proses suksesi tersebut berdampak terhadap spesies tumbuhan penyusun vegetasi di kawasan tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari komposisi floristik vegetasi di kawasan hilir Sungai Unda. Penelitian dilakukan dengan metode jelajah pada tiga tipe ekosistem, yaitu ekosistem hutan dataran rendah, lahan tergenang, dan pantai. Hasil penelitian menunjukkan bahwa komposisi floristik di kawasan hilir Sungai Unda terdiri dari 163 jenis tumbuhan yang terbagi ke dalam 48 suku dan 128 marga. Bentuk hidup spesies tumbuhan didominasi oleh herba kecil (47 spesies), rumput (35 spesies), dan pohon (31 spesies). Fabaceae adalah suku dengan jumlah spesies terbanyak, diikuti oleh suku Poaceae dan Cyperaceae. Berdasarkan zona penelitian, hutan dataran rendah memiliki jumlah spesies terbanyak (120 spesies), sedangkan zona pantai paling sedikit (82 spesies). Stabilitas ekosistem di Kawasan Sungai Unda dapat terganggu oleh beberapa spesies tumbuhan invasif seperti eceng gondok (Eichhornia crassipes), kirinyuh (Chromolaena odorata), tembelekan (Lantana camara), kangkung pagar (Ipomoea carnea), akasia duri (Vachellia farnesiana), dan ekor kucing (Typha angustifolia).
{"title":"Komposisi Floristik Vegetasi di Kawasan Hilir Sungai Unda, Kabupaten Klungkung, Bali","authors":"I. M. S. Wijana, I. Wijaya, A. R. As-syakur, G. Indrawan, Putu Angga Wiradana, Komang Kartika Indi Swari, Dewa Ayu Putu Leliana Sari","doi":"10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p03","DOIUrl":"https://doi.org/10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p03","url":null,"abstract":"Kawasan hilir Daerah Aliran Sungai (DAS) Unda yang terletak di Kabupaten Klungkung telah mengalami suksesi akibat letusan Gunung Agung pada tahun 1963. Ekosistem di kawasan hilir Sungai Unda juga mengalami suksesi antropogenik akibat aktivitas manusia. Proses suksesi tersebut berdampak terhadap spesies tumbuhan penyusun vegetasi di kawasan tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk mempelajari komposisi floristik vegetasi di kawasan hilir Sungai Unda. Penelitian dilakukan dengan metode jelajah pada tiga tipe ekosistem, yaitu ekosistem hutan dataran rendah, lahan tergenang, dan pantai. Hasil penelitian menunjukkan bahwa komposisi floristik di kawasan hilir Sungai Unda terdiri dari 163 jenis tumbuhan yang terbagi ke dalam 48 suku dan 128 marga. Bentuk hidup spesies tumbuhan didominasi oleh herba kecil (47 spesies), rumput (35 spesies), dan pohon (31 spesies). Fabaceae adalah suku dengan jumlah spesies terbanyak, diikuti oleh suku Poaceae dan Cyperaceae. Berdasarkan zona penelitian, hutan dataran rendah memiliki jumlah spesies terbanyak (120 spesies), sedangkan zona pantai paling sedikit (82 spesies). Stabilitas ekosistem di Kawasan Sungai Unda dapat terganggu oleh beberapa spesies tumbuhan invasif seperti eceng gondok (Eichhornia crassipes), kirinyuh (Chromolaena odorata), tembelekan (Lantana camara), kangkung pagar (Ipomoea carnea), akasia duri (Vachellia farnesiana), dan ekor kucing (Typha angustifolia).","PeriodicalId":30806,"journal":{"name":"Metamorfosa Journal of Biological Sciences","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-04-05","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"43330737","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2022-04-05DOI: 10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p02
C. Primiani, P. Pujiati, Mohammad Arfi Setiawan
Genitri (Elaeocarpus sphaericus Schum.) is an endemic plant of Indonesia that has not been widely cultivated and utilized. The use of genitri is usually as road shade, firewood, seeds for jewelry. The results showed that the diversity of chemical compounds genitri had potential for health. The aim of the study was to analyze the potential of genitri to leukocytes and lung tissue structure of wistar rats induced by influenza virus. The study used an experimental approach, with experimental animals in the form of 24 male wistar rats in 4 treatment groups, P0 negative control, P1 influenza virus induction (positive control), P2 influenza virus induction and given genitri leaf, and P3 influenza virus induction and given genitry seeds. Virus induction on day 0 and day 14. Leaves and seeds were given on the 3rd day. Surgery was performed on day 5 and day 33. The number of leukocytes were calculated using microhematocrit, and identified leukocytes and lung tissue structure staining with HE staining. The results showed that genitry seeds could increase the number of leukocytes up to 13,000 cells/µL, the size of the alveoli diameter was 31.48 m, the size of the alveolar septum was 12.02 m. Keywords: Antiviral, Elaeocarpus Sphaericus Schum, Genitri, Leukocytes, Pulmo
{"title":"Potential of Genitri (Elaeocarpus sphaericus Schum.) on Leukocytes and Pulmonary Tissue Structure Influenza Virus Induced Wistar Rat","authors":"C. Primiani, P. Pujiati, Mohammad Arfi Setiawan","doi":"10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p02","DOIUrl":"https://doi.org/10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p02","url":null,"abstract":"Genitri (Elaeocarpus sphaericus Schum.) is an endemic plant of Indonesia that has not been widely cultivated and utilized. The use of genitri is usually as road shade, firewood, seeds for jewelry. The results showed that the diversity of chemical compounds genitri had potential for health. The aim of the study was to analyze the potential of genitri to leukocytes and lung tissue structure of wistar rats induced by influenza virus. The study used an experimental approach, with experimental animals in the form of 24 male wistar rats in 4 treatment groups, P0 negative control, P1 influenza virus induction (positive control), P2 influenza virus induction and given genitri leaf, and P3 influenza virus induction and given genitry seeds. Virus induction on day 0 and day 14. Leaves and seeds were given on the 3rd day. Surgery was performed on day 5 and day 33. The number of leukocytes were calculated using microhematocrit, and identified leukocytes and lung tissue structure staining with HE staining. The results showed that genitry seeds could increase the number of leukocytes up to 13,000 cells/µL, the size of the alveoli diameter was 31.48 m, the size of the alveolar septum was 12.02 m. \u0000Keywords: Antiviral, Elaeocarpus Sphaericus Schum, Genitri, Leukocytes, Pulmo","PeriodicalId":30806,"journal":{"name":"Metamorfosa Journal of Biological Sciences","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-04-05","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"47261652","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2022-03-31DOI: 10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p01
Irma Damayanti, Y. Ramona, Sentot Joko Raharjo
Pneumolysin adalah protein dari bakteri Stretoccous pneumoniae yang berperan penting dalam kematian sel dan kolonisasi bakteri. Ceftriaxone, clarithromycin, dan quercetin terbukti secara in vivo dan in vitro dapat menghambat aktivitas dari pneumolysin. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi interaksi antara ceftriaxone, clarithromycin, dan quercetin dalam menghambat aktivitas pneumolysin secara in silico. Struktur 3D pneumolysin diunduh melalui RCSB PDB (PDB ID:PQQA). Struktur 3D ceftriaxone (ID:5479530), clarithromycin (ID:84029), dan quercetin (ID:5280343) diunduh melalui PubChem. Preparasi protein dengan Discovery Studio dan ligan dengan OpenBabel. Proses docking menggunakan HEX 8.0.0 dan analisis visualisasi dengan Discovery Studio. Interaksi pneumolysin-ceftriaxone menghasilkan 4 ikatan hidrogen, 5 ikatan hidrofobik, 1 ikatan elektrostatik, dan 2 ikatan unfavourable dengan nilai energi ikatan sebesar -329,98kJ/mol. Interaksi pneumolysin-clarithromycin menghasilkan 3 ikatan hidrogen, 1 ikatan elektrostatik, dan 3 ikatan unfavourable dengan nilai energi ikatan sebesar -311,12kJ/mol. Interaksi pneumolysin-quercetin menghasilkan 2 ikatan hidrogen, 4 ikatan hidrofobik, dan 2 ikatan elektrostatik dengan nilai energi ikatan sebesar -246,52kJ/mol. Kata kunci: pneumolysin, ceftriaxone, clarithromycin, quercetin, in silico.
{"title":"Mekanisme Kerja Antibiotik Ceftriaxone, Clarithromycin, dan Senyawa Aktif Quercetin pada Streptococcus pneumoniae dengan Metoda Docking In Silico","authors":"Irma Damayanti, Y. Ramona, Sentot Joko Raharjo","doi":"10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p01","DOIUrl":"https://doi.org/10.24843/metamorfosa.2022.v09.i01.p01","url":null,"abstract":"Pneumolysin adalah protein dari bakteri Stretoccous pneumoniae yang berperan penting dalam kematian sel dan kolonisasi bakteri. Ceftriaxone, clarithromycin, dan quercetin terbukti secara in vivo dan in vitro dapat menghambat aktivitas dari pneumolysin. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi interaksi antara ceftriaxone, clarithromycin, dan quercetin dalam menghambat aktivitas pneumolysin secara in silico. Struktur 3D pneumolysin diunduh melalui RCSB PDB (PDB ID:PQQA). Struktur 3D ceftriaxone (ID:5479530), clarithromycin (ID:84029), dan quercetin (ID:5280343) diunduh melalui PubChem. Preparasi protein dengan Discovery Studio dan ligan dengan OpenBabel. Proses docking menggunakan HEX 8.0.0 dan analisis visualisasi dengan Discovery Studio. Interaksi pneumolysin-ceftriaxone menghasilkan 4 ikatan hidrogen, 5 ikatan hidrofobik, 1 ikatan elektrostatik, dan 2 ikatan unfavourable dengan nilai energi ikatan sebesar -329,98kJ/mol. Interaksi pneumolysin-clarithromycin menghasilkan 3 ikatan hidrogen, 1 ikatan elektrostatik, dan 3 ikatan unfavourable dengan nilai energi ikatan sebesar -311,12kJ/mol. Interaksi pneumolysin-quercetin menghasilkan 2 ikatan hidrogen, 4 ikatan hidrofobik, dan 2 ikatan elektrostatik dengan nilai energi ikatan sebesar -246,52kJ/mol. \u0000Kata kunci: pneumolysin, ceftriaxone, clarithromycin, quercetin, in silico.","PeriodicalId":30806,"journal":{"name":"Metamorfosa Journal of Biological Sciences","volume":" ","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-03-31","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"48748809","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
{"title":"Observations on the Digestive Enzymes in the Giant African Land Snails (Archachatina marginata): Significance and Prospects","authors":"Andrew Ayodeji Aj, Love Abolade Ba","doi":"10.3923/jbs.2022.50.56","DOIUrl":"https://doi.org/10.3923/jbs.2022.50.56","url":null,"abstract":"","PeriodicalId":30806,"journal":{"name":"Metamorfosa Journal of Biological Sciences","volume":"71 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-02-15","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"76709639","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
{"title":"Role of Rotatory Cage Induced Stress on Alteration of Liver Function in Male Wistar Rats","authors":"E. Jeroh, C. Aloamaka, E. Nwangwa","doi":"10.3923/jbs.2022.65.69","DOIUrl":"https://doi.org/10.3923/jbs.2022.65.69","url":null,"abstract":"","PeriodicalId":30806,"journal":{"name":"Metamorfosa Journal of Biological Sciences","volume":"30 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-02-15","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"83378670","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
M.C. Udeh Sylve, O. Nwodo, O. Yakubu, E. Parker, S. Egba, E. Anaduaka, V. Tatah, Ugwu Okechukwu Paul-Chima, E. M. Ale, C. Ude, T. J. Iornenge
{"title":"Effects of Methanol Extract of Gongronema latifolium Leaves on Glycaemic Responses to Carbohydrate Diets in Streptozotocin-induced Diabetic Rats","authors":"M.C. Udeh Sylve, O. Nwodo, O. Yakubu, E. Parker, S. Egba, E. Anaduaka, V. Tatah, Ugwu Okechukwu Paul-Chima, E. M. Ale, C. Ude, T. J. Iornenge","doi":"10.3923/jbs.2022.70.79","DOIUrl":"https://doi.org/10.3923/jbs.2022.70.79","url":null,"abstract":"","PeriodicalId":30806,"journal":{"name":"Metamorfosa Journal of Biological Sciences","volume":"234 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2022-02-15","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"75520368","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
京公网安备 11010802042870号
京ICP备2023020795号-1
扫码关注我们
求助内容：
应助结果提醒方式：