E. Karlik, Meltem Değer, Erdal Uzen, N. Gozukirmizi
Colchicum calcedonicum Azn, pek cok endemik bitki turunun goruldugu Turkiye'de yayilis gosteren endemik turlerden biridir. Toprak altinda uzun-oval sekilli sogani ile genellikle 3-4 yapraklidir. Kallus kulturu kullanarak endemik turlerin in vitro uretimi, bu turlerin korunmasinda umut verici bir calisma haline gelmistir. Bu calismanin amaci, in vitro C. chalcedonicum uretimi icin verimli kallus protokolunun olusturulabilmesidir. Explantlarin sterilizasyonunda, 20 dk %0.25 (w/v) civa klorur (HgCl2) kullanilmistir. Civa klorure ilaveten, yuzey sterilizasyonunda 30 dk boyunca Tween 80, %6,5 NaCl ile birlikte kullanilmistir. Bu calismada, 19 farkli besiyeri kullanilmis olup primer kallus olusumu 2,4-D (2 mg L-1), 2IP (0,5 mg L-1), %3 sukroz ve %0,05 aktif karbon iceren Murashige & Skoog bazal besiyerinde elde edilmistir. Calismamiz, aktif karbon kullaniminin primer kallus olusumunda etkili oldugunu gostermistir. Bu calisma, C. chalcedonicum’un primer kallus olusumu icin ilk rapordur. Bununla birlikte, calismamiz endemik tur olan C. chalcedonicum'un in vitro korunmasi ve kallus olusum protokolunun gelistirilmesinde oncu bir calismadir.
{"title":"Pioneering In vitro Studies for Callus Formation of Colchicum chalcedonicum","authors":"E. Karlik, Meltem Değer, Erdal Uzen, N. Gozukirmizi","doi":"10.23902/trkjnat.776974","DOIUrl":"https://doi.org/10.23902/trkjnat.776974","url":null,"abstract":"Colchicum calcedonicum Azn, pek cok endemik bitki turunun goruldugu Turkiye'de yayilis gosteren endemik turlerden biridir. Toprak altinda uzun-oval sekilli sogani ile genellikle 3-4 yapraklidir. Kallus kulturu kullanarak endemik turlerin in vitro uretimi, bu turlerin korunmasinda umut verici bir calisma haline gelmistir. Bu calismanin amaci, in vitro C. chalcedonicum uretimi icin verimli kallus protokolunun olusturulabilmesidir. Explantlarin sterilizasyonunda, 20 dk %0.25 (w/v) civa klorur (HgCl2) kullanilmistir. Civa klorure ilaveten, yuzey sterilizasyonunda 30 dk boyunca Tween 80, %6,5 NaCl ile birlikte kullanilmistir. Bu calismada, 19 farkli besiyeri kullanilmis olup primer kallus olusumu 2,4-D (2 mg L-1), 2IP (0,5 mg L-1), %3 sukroz ve %0,05 aktif karbon iceren Murashige & Skoog bazal besiyerinde elde edilmistir. Calismamiz, aktif karbon kullaniminin primer kallus olusumunda etkili oldugunu gostermistir. Bu calisma, C. chalcedonicum’un primer kallus olusumu icin ilk rapordur. Bununla birlikte, calismamiz endemik tur olan C. chalcedonicum'un in vitro korunmasi ve kallus olusum protokolunun gelistirilmesinde oncu bir calismadir.","PeriodicalId":23163,"journal":{"name":"Trakya University Journal of Natural Sciences","volume":"14 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2020-09-04","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"79169284","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Canli hucrelerin uzun sure boyunca cok dusuk sicakliklarda saklanmasi islemi kriyo-korunma olarak adlandirilir. Kriyo-koruma islemi biyoteknoloji, klinik calismalar ve hayvan veya bitki hucreleriyle ilgili bircok calismada cok onemli bir rol oynadigindan dolayi, kriyo-korumada kullanilan ajanlarin arastirilmasi son derece muhimdir. Kriyo- koruma ajanlari, hucresel metabolizma ve biyofizyoloji uzerindeki etkileri nedeniyle uzun sureli kriyo-korumanin ardindan hucresel canliligin korunmasini saglarlar. Mevcut calismada; hucre canlilik testi, koloni olusturma testi ve gercek zamanli polimeraz zincir reaksiyonu tekniklerinden yararlanilarak, borun kriyo-koruma uzerindeki etkisi, insan akciger kanser hucre hatti, A549 ve fare fibroblast hucre hatti, L929 kullanilarak arastirilmistir. Hucre dondurma ortamini 15 µg/ml bor ile desteklemenin hucre canliligi uzerine olumlu etki ettigi gozlemlenmistir. Ayrica, tekrar eden dondurma - cozme donguleri ve uzun sureli kriyo-koruma sonucunda, gen anlatim profilleri degisen A549 ve L929 hucre hatlarinin, bor takviyesi sonrasinda, programli hucre olumuyle alakali genlerinin anlatiminda azalma, hucre cogalmasi ile ilgili genlerinde de artis gozlemlenmistir. Sonuclarimiz gostermistir ki bor kaynagi olarak sodium pentaborat pentahidrat, kanser veya saglikli hucrelerin canliliklarini kaybetmeksizin dondurulmalarini ve hucrelerin uzun sureli saklanmalari icin son derece onemli bir kriyo-koruyucu ajan olarak kullanilabilir.
{"title":"BORON INCREASES THE VIABILITY OF HUMAN CANCER AND MURINE FIBROBLAST CELLS AFTER LONG TIME OF CRYOPRESERVATION","authors":"T. Hayal","doi":"10.23902/trkjnat.758920","DOIUrl":"https://doi.org/10.23902/trkjnat.758920","url":null,"abstract":"Canli hucrelerin uzun sure boyunca cok dusuk sicakliklarda saklanmasi islemi kriyo-korunma olarak adlandirilir. Kriyo-koruma islemi biyoteknoloji, klinik calismalar ve hayvan veya bitki hucreleriyle ilgili bircok calismada cok onemli bir rol oynadigindan dolayi, kriyo-korumada kullanilan ajanlarin arastirilmasi son derece muhimdir. Kriyo- koruma ajanlari, hucresel metabolizma ve biyofizyoloji uzerindeki etkileri nedeniyle uzun sureli kriyo-korumanin ardindan hucresel canliligin korunmasini saglarlar. Mevcut calismada; hucre canlilik testi, koloni olusturma testi ve gercek zamanli polimeraz zincir reaksiyonu tekniklerinden yararlanilarak, borun kriyo-koruma uzerindeki etkisi, insan akciger kanser hucre hatti, A549 ve fare fibroblast hucre hatti, L929 kullanilarak arastirilmistir. Hucre dondurma ortamini 15 µg/ml bor ile desteklemenin hucre canliligi uzerine olumlu etki ettigi gozlemlenmistir. Ayrica, tekrar eden dondurma - cozme donguleri ve uzun sureli kriyo-koruma sonucunda, gen anlatim profilleri degisen A549 ve L929 hucre hatlarinin, bor takviyesi sonrasinda, programli hucre olumuyle alakali genlerinin anlatiminda azalma, hucre cogalmasi ile ilgili genlerinde de artis gozlemlenmistir. Sonuclarimiz gostermistir ki bor kaynagi olarak sodium pentaborat pentahidrat, kanser veya saglikli hucrelerin canliliklarini kaybetmeksizin dondurulmalarini ve hucrelerin uzun sureli saklanmalari icin son derece onemli bir kriyo-koruyucu ajan olarak kullanilabilir.","PeriodicalId":23163,"journal":{"name":"Trakya University Journal of Natural Sciences","volume":"80 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2020-08-26","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"89636305","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Bu calismada, elektrospin yontemiyle yuksek yuzey alanina sahip, glisin, tirozin ve glutamik asit aminoasitleri ile olusturulmus poliamid 6 polimer yuzeyler uretilmis ve liyofilize Bacillus subtilis E6-5 proteaz ve ticari proteaz enzimleri nanofibriller uzerinde immobilize edilmistir. Enzimlerin yeniden kullanilabilirligi arastirildi. Enzimlerin immobilizasyon verimlilikleri yaklasik olarak % 50-55 arasindaydi. Liyofilize Bacillus proteazi ile yapilan calismalarda glutaraldehitle aktiflestirilmis PA6 nanolifler ve glutaraldehitle aktiflestirilmeyen PA6 nanoliflerde glutamik asit aminoasidi varliginda immobilizasyonun daha basarili oldugu saptanmistir. Glutaraldehit ile aktiflestirilmemis ve aktiflestirilmis yuzeylerde immobilize edilen liyofilize proteaz enziminin 4 kez kullanimi olmasina ragmen, en iyi islevsel stabilite 2 kez kullanim ile elde edilmistir. Saf PA6/glutamik asit nanoliflerinde iki tekrarli kullanim sonucu enzimin immobilizasyon verimi % 38 olarak bulunmustur. Glutaraldehitle aktiflestirilmis PA6 nanoliflerde de PA6/glutamik asit nanolif yuzeyleri iki tekrarli kullanim sonucu enzimin immobilizasyon verimi % 65 olarak bulunmustur. Nanoliflerin glutaraldehitle aktiflestirmesi sonucu enzim immobilizasyon verimi iki kat arttirilmistir. Ticari proteaz ile yapilan calismalarda ise glutaraldehitle aktiflestirilmemis nanolif yuzeylerde enzimin 6 kez kullanimi olmasina ragmen en islevsel stabilite 3 tekrarli kullanimda elde edilmistir. En basarili immobilizasyon verimi PA6 nanoliflerde % 58 olarak bulunmustur. Glutaraldehitle aktiflestirilmis PA6 nanoliflerde de enzim 6 kez kullanim bulmus fakat islevsel stabilite 4 tekrarli kullanima kadar korunmustur.
{"title":"IMMOBILIZATION OF Bacillus subtilis E6-5 PROTEASE AND COMMERCIAL PROTEASE IN NANOFIBRILS CONTAINING DIFFERENT AMINO ACIDS","authors":"Baran Enes Guler, E. Demirkan, Tuba Sevgi̇","doi":"10.23902/trkjnat.633788","DOIUrl":"https://doi.org/10.23902/trkjnat.633788","url":null,"abstract":"Bu calismada, elektrospin yontemiyle yuksek yuzey alanina sahip, glisin, tirozin ve glutamik asit aminoasitleri ile olusturulmus poliamid 6 polimer yuzeyler uretilmis ve liyofilize Bacillus subtilis E6-5 proteaz ve ticari proteaz enzimleri nanofibriller uzerinde immobilize edilmistir. Enzimlerin yeniden kullanilabilirligi arastirildi. Enzimlerin immobilizasyon verimlilikleri yaklasik olarak % 50-55 arasindaydi. Liyofilize Bacillus proteazi ile yapilan calismalarda glutaraldehitle aktiflestirilmis PA6 nanolifler ve glutaraldehitle aktiflestirilmeyen PA6 nanoliflerde glutamik asit aminoasidi varliginda immobilizasyonun daha basarili oldugu saptanmistir. Glutaraldehit ile aktiflestirilmemis ve aktiflestirilmis yuzeylerde immobilize edilen liyofilize proteaz enziminin 4 kez kullanimi olmasina ragmen, en iyi islevsel stabilite 2 kez kullanim ile elde edilmistir. Saf PA6/glutamik asit nanoliflerinde iki tekrarli kullanim sonucu enzimin immobilizasyon verimi % 38 olarak bulunmustur. Glutaraldehitle aktiflestirilmis PA6 nanoliflerde de PA6/glutamik asit nanolif yuzeyleri iki tekrarli kullanim sonucu enzimin immobilizasyon verimi % 65 olarak bulunmustur. Nanoliflerin glutaraldehitle aktiflestirmesi sonucu enzim immobilizasyon verimi iki kat arttirilmistir. Ticari proteaz ile yapilan calismalarda ise glutaraldehitle aktiflestirilmemis nanolif yuzeylerde enzimin 6 kez kullanimi olmasina ragmen en islevsel stabilite 3 tekrarli kullanimda elde edilmistir. En basarili immobilizasyon verimi PA6 nanoliflerde % 58 olarak bulunmustur. Glutaraldehitle aktiflestirilmis PA6 nanoliflerde de enzim 6 kez kullanim bulmus fakat islevsel stabilite 4 tekrarli kullanima kadar korunmustur.","PeriodicalId":23163,"journal":{"name":"Trakya University Journal of Natural Sciences","volume":"11 5","pages":""},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2020-04-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"72581788","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Şiddetli akut solunum yolu sendromu koronavirusu-2 (SARS CoV-2) yuksek virulans etkiye sahip tek zincirli pozitif polariteli RNA virusudur. Spike (S) glikoprotein SARS CoV-2 virionunun en distaki bilesenidir ve anjiyotensin donusturucu enzim 2 (ACE2) reseptoru araciligi ile virusun hucreye girisinde onemlidir. ACE2, vazokonstriktor anjiyotensin 2'yi vazodilator anjiyotensin 1-7'ye donusturerek insanda kan basincinin duzenlenmesinde onemli roller ustlenir. Bu calismada, Asya izolatlarindaki mutasyonlarin S glikoprotein yapisinda neden olabilecegi degisiklikler analiz edilmis ve ilac ve asi hedefleme calismalarina katkida bulunmak uzere modellenmistir. Genom, proteom ve mutasyon analizleri biyoinformatik araclari (MAFFT, MegaX, PSIPRED, MolProbity, PyMoL) kullanilarak yapildi. Protein modellemesi ProMod3 kullanilarak yapildi. S glikoproteinde 26 mutasyon tespit edilmistir. Bu mutasyonlarin S glikoproteininin genel topolojik ve konformasyonel yapisinda ortaya cikardigi degisiklikler, SARS CoV-2’nin virulans ozelliklerini etkileyebilir. Mutasyonlarin reseptor baglanma bolgesini (RBB) kapali formasyondan acik formasyon benzeri bir yapiya donusturdugu belirlenmistir. RBB'de mutasyondan sonra meydana gelen konformasyonel degisimin reseptor afinitesinde bir artisa neden olabilecegi dusunulmektedir. Bu bulgular hastaligin onlenmesi ve SARS CoV-2 ilac ve asi gelistirme calismalari icin faydali olabilir.
{"title":"SARS CoV-2 SPIKE GLYCOPROTEIN MUTATIONS AND CHANGES IN PROTEIN STRUCTURE","authors":"Ekrem Akbulut","doi":"10.23902/trkjnat.774926","DOIUrl":"https://doi.org/10.23902/trkjnat.774926","url":null,"abstract":"Şiddetli akut solunum yolu sendromu koronavirusu-2 (SARS CoV-2) yuksek virulans etkiye sahip tek zincirli pozitif polariteli RNA virusudur. Spike (S) glikoprotein SARS CoV-2 virionunun en distaki bilesenidir ve anjiyotensin donusturucu enzim 2 (ACE2) reseptoru araciligi ile virusun hucreye girisinde onemlidir. ACE2, vazokonstriktor anjiyotensin 2'yi vazodilator anjiyotensin 1-7'ye donusturerek insanda kan basincinin duzenlenmesinde onemli roller ustlenir. Bu calismada, Asya izolatlarindaki mutasyonlarin S glikoprotein yapisinda neden olabilecegi degisiklikler analiz edilmis ve ilac ve asi hedefleme calismalarina katkida bulunmak uzere modellenmistir. Genom, proteom ve mutasyon analizleri biyoinformatik araclari (MAFFT, MegaX, PSIPRED, MolProbity, PyMoL) kullanilarak yapildi. Protein modellemesi ProMod3 kullanilarak yapildi. S glikoproteinde 26 mutasyon tespit edilmistir. Bu mutasyonlarin S glikoproteininin genel topolojik ve konformasyonel yapisinda ortaya cikardigi degisiklikler, SARS CoV-2’nin virulans ozelliklerini etkileyebilir. Mutasyonlarin reseptor baglanma bolgesini (RBB) kapali formasyondan acik formasyon benzeri bir yapiya donusturdugu belirlenmistir. RBB'de mutasyondan sonra meydana gelen konformasyonel degisimin reseptor afinitesinde bir artisa neden olabilecegi dusunulmektedir. Bu bulgular hastaligin onlenmesi ve SARS CoV-2 ilac ve asi gelistirme calismalari icin faydali olabilir.","PeriodicalId":23163,"journal":{"name":"Trakya University Journal of Natural Sciences","volume":"187 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2020-02-16","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"77357118","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Yeasts can accumulate heavy metals and grow in acidic media. In the present study, it was shown that Candida yeasts in an aqueous solution accumulate single Cu(II) and Ni(II) cations. The effect of heavy metal ions on the specific growth rate of biomasses and the uptake of metal ions during the growth phase was investigated in a batch system. Bioaccumulation efficiency decreased with increasing metal ion concentrations at constant sucrose concentrations. Both the specific growth rate and the biomass concentration were more inhibited in the bioaccumulation media containing Ni(II) ions singly as compared with the bioaccumulation media containing Cu(II) ions singly. The maximum specific growth rate and the saturation constant of yeasts were examined with a double-reciprocal form of Monod equation. Metal uptake performance decreased from 81.68% to 46.28% with increasing Ni(II) concentration from 25 mg/L to 250 mg/L for Candida lipolytica. Candida biomasses may be an alternative way of removal of heavy metals from wastewaters and may constitute a sample to produce new biomass. The study showed that Candida yeasts can be used as economical biomass due to their metal resistance and efficient production.
{"title":"PRODUCTION OF Candida BIOMASSES FOR HEAVY METAL REMOVAL FROM WASTEWATERS","authors":"Gülşah Mersin, Ünsal Açıkel","doi":"10.23902/TRKJNAT.817451","DOIUrl":"https://doi.org/10.23902/TRKJNAT.817451","url":null,"abstract":"Yeasts can accumulate heavy metals and grow in acidic media. In the present study, it was shown that Candida yeasts in an aqueous solution accumulate single Cu(II) and Ni(II) cations. The effect of heavy metal ions on the specific growth rate of biomasses and the uptake of metal ions during the growth phase was investigated in a batch system. Bioaccumulation efficiency decreased with increasing metal ion concentrations at constant sucrose concentrations. Both the specific growth rate and the biomass concentration were more inhibited in the bioaccumulation media containing Ni(II) ions singly as compared with the bioaccumulation media containing Cu(II) ions singly. The maximum specific growth rate and the saturation constant of yeasts were examined with a double-reciprocal form of Monod equation. Metal uptake performance decreased from 81.68% to 46.28% with increasing Ni(II) concentration from 25 mg/L to 250 mg/L for Candida lipolytica. Candida biomasses may be an alternative way of removal of heavy metals from wastewaters and may constitute a sample to produce new biomass. The study showed that Candida yeasts can be used as economical biomass due to their metal resistance and efficient production.","PeriodicalId":23163,"journal":{"name":"Trakya University Journal of Natural Sciences","volume":"167 1 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2020-02-16","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"83345674","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Cevreyi ve insan sagligini koruyan antibakteriyel malzemelerle bitim islemi son yillarda onem kazanmaktadir. Bu calismanin amaci da 1) kitosani nano-gumus (Ag) kaplamalar icin baglayici olarak kullanarak yeni nesil antibakteriyel apreler gelistirmek, 2) karides ve kerevitlerden uretilen kitosanin tekstil uretimi icin uygulanabilirligini belirlemek ve 3) cevre dostu tekstil uretimine katkida bulunmaktir. Calismada, karides ve kerevit atiklarindan uretilen kitosan, Ag nanopartikullerinin kumas yuzeylerine baglanmasinda yapiskan olarak kullanilmistir. Nano-Ag partikullerinin kitosan araciligiyla kumas yuzeylerine baglanma ozellikleri Fourier donusumlu kizilotesi spektroskopi (FTIR), Taramali elektron mikroskobu (SEM) ve Enerji dagilimli x isini (EDX) analizleri ile incelenmistir. Kumaslarin Escherichia coli ATCC 8739' ye karsi antibakteriyel aktiviteleri JIS L 1902-2015 standardina gore test edilmistir. Calismanin sonuclari kerevit ve karides kitosanlarinin renksiz bir film olusturdugunu ve Ag nanoparcaciklarini pamuklu kumas uzerine homojen bir sekilde kapladigini gostermistir. Kerevit kitosani ve karides kitosani ile kapli pamuklu kumaslarin antibakteriyel aktivite degerleri sirasiyla, 3,10 ve 5,74 olarak hesaplanirken, kerevit kitosani+nano-Ag ve karides kitosani+nano-Ag ile kaplanmis pamuklu kumaslarin antibakteriyel aktivite degerleri sirasiyla 5,37 ve 5,10 olarak bulundu. E. coli ATCC 8739' ye karsi iyi bir antibakteriyel aktivite sergileyen (% 99,99 azalma) kitosan+nano-Ag kaplamalar, tibbi tekstiller, bebek kiyafetleri ve ic camasirlari gibi giysilerin imalatinda kullanilabilir. Binder olarak kitosanin kullanilmasi, tekstil baskisinda, pigment boyamada, terbiye maddelerinde, kirletici desarjlarinda ve endustriyel kaynakli emisyonlarda kimyasallarin kullanimini azaltabilir. Ayrica, insan ve cevre sagliginin korunmasina yonelik yenilikci cozumler sunar.
{"title":"TEXTILE FINISHING WITH CHITOSAN AND SILVER NANOPARTICLES AGAINST Escherichia coli ATCC 8739","authors":"S. Erdoğan","doi":"10.23902/trkjnat.641367","DOIUrl":"https://doi.org/10.23902/trkjnat.641367","url":null,"abstract":"Cevreyi ve insan sagligini koruyan antibakteriyel malzemelerle bitim islemi son yillarda onem kazanmaktadir. Bu calismanin amaci da 1) kitosani nano-gumus (Ag) kaplamalar icin baglayici olarak kullanarak yeni nesil antibakteriyel apreler gelistirmek, 2) karides ve kerevitlerden uretilen kitosanin tekstil uretimi icin uygulanabilirligini belirlemek ve 3) cevre dostu tekstil uretimine katkida bulunmaktir. Calismada, karides ve kerevit atiklarindan uretilen kitosan, Ag nanopartikullerinin kumas yuzeylerine baglanmasinda yapiskan olarak kullanilmistir. Nano-Ag partikullerinin kitosan araciligiyla kumas yuzeylerine baglanma ozellikleri Fourier donusumlu kizilotesi spektroskopi (FTIR), Taramali elektron mikroskobu (SEM) ve Enerji dagilimli x isini (EDX) analizleri ile incelenmistir. Kumaslarin Escherichia coli ATCC 8739' ye karsi antibakteriyel aktiviteleri JIS L 1902-2015 standardina gore test edilmistir. Calismanin sonuclari kerevit ve karides kitosanlarinin renksiz bir film olusturdugunu ve Ag nanoparcaciklarini pamuklu kumas uzerine homojen bir sekilde kapladigini gostermistir. Kerevit kitosani ve karides kitosani ile kapli pamuklu kumaslarin antibakteriyel aktivite degerleri sirasiyla, 3,10 ve 5,74 olarak hesaplanirken, kerevit kitosani+nano-Ag ve karides kitosani+nano-Ag ile kaplanmis pamuklu kumaslarin antibakteriyel aktivite degerleri sirasiyla 5,37 ve 5,10 olarak bulundu. E. coli ATCC 8739' ye karsi iyi bir antibakteriyel aktivite sergileyen (% 99,99 azalma) kitosan+nano-Ag kaplamalar, tibbi tekstiller, bebek kiyafetleri ve ic camasirlari gibi giysilerin imalatinda kullanilabilir. Binder olarak kitosanin kullanilmasi, tekstil baskisinda, pigment boyamada, terbiye maddelerinde, kirletici desarjlarinda ve endustriyel kaynakli emisyonlarda kimyasallarin kullanimini azaltabilir. Ayrica, insan ve cevre sagliginin korunmasina yonelik yenilikci cozumler sunar.","PeriodicalId":23163,"journal":{"name":"Trakya University Journal of Natural Sciences","volume":"15 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2020-02-16","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"74563064","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
G. Göger, Burcu Akçal Çomoğlu, G. İşcan, F. Demirci
Application of combination studies with essential oils and standard antifungal drugs may reduce adverse effects of synthetic drugs and serve as alternative approach against various pathologies including candidiasis. The aim of the present study was to determine the interaction of two commercial lavender ( Lavandula angustifolia Miller) essential oils in combination with ketoconazole against clinical and standard strains of the human pathogens Candida albicans ATCC 10231, C. krusei NRRL Y-7179 and C. glabrata ATCC 66032. The chemical compositions of the investigated essential oils were confirmed both by gas chromatography/flame ionization detector (GC/FID) and gas chromatography/mass spectrometry (GC/MS) methods. Anticandidal activities of the essential oils were screened in vitro by the microdilution method. The resulting interaction of combining lavender essential oils and ketoconazole was tested using the checkerboard method. The results showed that the interaction between essential oils and ketoconazole revealed additive and indifferent effects against the tested strains. In conclusion, the effects observed by the combination of lavender essential oils and ketoconazole may be encouraging to be used against pathogenic Candida strains.
{"title":"EVALUATION OF ANTICANDIDAL EFFECTS OF ESSENTIAL OILS OF COMMERCIAL LAVENDER (Lavandula angustifolia Miller) IN COMBINATION WITH KETOCONAZOLE AGAINTS SOME Candida Berkhout STRAINS","authors":"G. Göger, Burcu Akçal Çomoğlu, G. İşcan, F. Demirci","doi":"10.23902/trkjnat.590839","DOIUrl":"https://doi.org/10.23902/trkjnat.590839","url":null,"abstract":"Application of combination studies with essential oils and standard antifungal drugs may reduce adverse effects of synthetic drugs and serve as alternative approach against various pathologies including candidiasis. The aim of the present study was to determine the interaction of two commercial lavender ( Lavandula angustifolia Miller) essential oils in combination with ketoconazole against clinical and standard strains of the human pathogens Candida albicans ATCC 10231, C. krusei NRRL Y-7179 and C. glabrata ATCC 66032. The chemical compositions of the investigated essential oils were confirmed both by gas chromatography/flame ionization detector (GC/FID) and gas chromatography/mass spectrometry (GC/MS) methods. Anticandidal activities of the essential oils were screened in vitro by the microdilution method. The resulting interaction of combining lavender essential oils and ketoconazole was tested using the checkerboard method. The results showed that the interaction between essential oils and ketoconazole revealed additive and indifferent effects against the tested strains. In conclusion, the effects observed by the combination of lavender essential oils and ketoconazole may be encouraging to be used against pathogenic Candida strains.","PeriodicalId":23163,"journal":{"name":"Trakya University Journal of Natural Sciences","volume":"311 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2019-12-03","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"84719658","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Deutonymph of Stigmaeus kumalariensis Akyol & Koc (Acari: Stigmaeidae) is herein described and illustrated based on specimens collected from litter and soil from Eksisu marsh, Erzincan (Turkey). This is the first record of deutonymphal stage of S. kumalariensis. In addition, variations in the number of aggenital setae and structure of the median zonal shields in some adult specimens of the species are reported.
{"title":"ON NEWLY DISCOVERED DEUTONYMPHAL STAGE OF Stigmaeus kumalariensis Akyol & Koç (ACARI: STIGMAEIDAE) FROM TURKEY, WITH NUMERICAL AND STRUCTURAL VARIATIONS IN ADULTS","authors":"S. Doğan, S. Doğan, Erhan Zeytun","doi":"10.23902/trkjnat.540747","DOIUrl":"https://doi.org/10.23902/trkjnat.540747","url":null,"abstract":"Deutonymph of Stigmaeus kumalariensis Akyol & Koc (Acari: Stigmaeidae) is herein described and illustrated based on specimens collected from litter and soil from Eksisu marsh, Erzincan (Turkey). This is the first record of deutonymphal stage of S. kumalariensis. In addition, variations in the number of aggenital setae and structure of the median zonal shields in some adult specimens of the species are reported.","PeriodicalId":23163,"journal":{"name":"Trakya University Journal of Natural Sciences","volume":"28 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2019-10-15","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"72765997","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Dogal kaynaklardan yeni ve etkili antiviral etkenler bulmak amaciyla yapilan bu calismada, Ballota glandulosissima Hub.-Mor. & Patzak’dan elde edilen metanol ve su ekstraktlarinin antiviral ozellikleri Respiratuvar Sinsityal Virus (RSV)’una karsi kolorimetrik XTT testi ile degerlendirilmistir. Virusun neden oldugu sitopatik etkilere karsi %50 koruma saglamasi icin gerekli konsantrasyon EC 50 olarak tanimlanmis, CC 50 (%50 Sitotoksik Konsantrasyon)’nin EC 50 ’ye oranindan da secicilik indeksi (SI) belirlenmistir. Arastirma sonucunda, B. glandulosissima ’nin hem metanol (EC 50 = 12.45 µg/mL; SI = 24.84) hem de su ekstraktinin (EC 50 = 19.12 µg/mL; SI = 24.59) RSV’ye karsi; pozitif kontrol olarak kullanilan ribavirin (EC 50 = 3.25 µg/mL, SI = 34.89)’e gore onemli sayilabilecek oranda anti-RSV aktiviteye sahip oldugu tespit edilmistir. Sonuc olarak, B. glandulosissima ekstraktlarinin, RSV’ye karsi klinikte kullanilan ilaclara karsi bir alternatif olarak gelistirilebilmesi icin; daha ileri calismalara layik oldugunu soyleyebiliriz. Bu calisma, B. glandulosissima ’nin anti-RSV aktivitesine yonelik ilk rapordur.
{"title":"EVALUATION OF THE ANTIVIRAL ACTIVITY OF Ballota glandulosissima Hub.-Mor. & Patzak EXTRACTS AGAINST RESPIRATORY SYNCYTIAL VIRUS (RSV)","authors":"H. Doğan, Rüstem Duman","doi":"10.23902/trkjnat.543382","DOIUrl":"https://doi.org/10.23902/trkjnat.543382","url":null,"abstract":"Dogal kaynaklardan yeni ve etkili antiviral etkenler bulmak amaciyla yapilan bu calismada, Ballota glandulosissima Hub.-Mor. & Patzak’dan elde edilen metanol ve su ekstraktlarinin antiviral ozellikleri Respiratuvar Sinsityal Virus (RSV)’una karsi kolorimetrik XTT testi ile degerlendirilmistir. Virusun neden oldugu sitopatik etkilere karsi %50 koruma saglamasi icin gerekli konsantrasyon EC 50 olarak tanimlanmis, CC 50 (%50 Sitotoksik Konsantrasyon)’nin EC 50 ’ye oranindan da secicilik indeksi (SI) belirlenmistir. Arastirma sonucunda, B. glandulosissima ’nin hem metanol (EC 50 = 12.45 µg/mL; SI = 24.84) hem de su ekstraktinin (EC 50 = 19.12 µg/mL; SI = 24.59) RSV’ye karsi; pozitif kontrol olarak kullanilan ribavirin (EC 50 = 3.25 µg/mL, SI = 34.89)’e gore onemli sayilabilecek oranda anti-RSV aktiviteye sahip oldugu tespit edilmistir. Sonuc olarak, B. glandulosissima ekstraktlarinin, RSV’ye karsi klinikte kullanilan ilaclara karsi bir alternatif olarak gelistirilebilmesi icin; daha ileri calismalara layik oldugunu soyleyebiliriz. Bu calisma, B. glandulosissima ’nin anti-RSV aktivitesine yonelik ilk rapordur.","PeriodicalId":23163,"journal":{"name":"Trakya University Journal of Natural Sciences","volume":"86 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2019-10-15","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"75915516","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Bitki mutantlari, bitki islahi ve fonksiyonel gen calismalari icin onemli biyo-kaynaklardir. Mevcut calismada, tuza toleransli aday mutant bugday hatlari elde etmek icin somatik embriyogenez ile konvansiyonel kimyasal mutajenez teknigi birlestirildi. Bu amacla; ekmeklik bugdayda ( Triticum aestivum L. cv. Adana 99) genetik varyasyonlar yaratmak icin embriyonik kalluslara 0-5 mM Sodyum Azid (NaN 3 ), 30 dakika boyunca in vitro ortamda uygulandi. Islem gormus ve gormemis kalluslar, somatik embriyo tesvik ortamina konularak somatik embriyo tesviki icin 3 ve 4 mM NaN 3 uygulamasi optimum mutasyon dozlari olarak tespit edildi. Ardindan bu mutasyon dozlari ile muamele edilen kalluslardan elde edilen somatik embriyolar tuz stresine tolerans gelistirmek icin kullanilacak 125 mM NaCl iceren rejenerasyon ortamlarinda tolerans acisindan tarandi. NaN 3 muamelesinde, orta duzeyde tuza toleransi olan 14 mutant elde edildi. Elde edilen sonuclar; kimyasal mutagenez ile kombine halde in vitro teknik uygulamasinin, populasyonlarda yeterli genetik varyasyon olusturmak ve 1.5 yildan daha az bir surede dorduncu jenerasyon tuz toleransli aday bugday mutant hatlarini islah surecini hizlandirarak elde etmek icin kullanisli bir yontem olabilecegini gostermektedir.
{"title":"OBTAINING CANDIDATE SALT TOLERANT WHEAT MUTANT LINES DERIVED FROM COMBINATION OF SODIUM AZIDE MUTAGENESIS AND SOMATIC EMBRYOGENESIS","authors":"Ayşe Şen, F. Sarsu","doi":"10.23902/trkjnat.571255","DOIUrl":"https://doi.org/10.23902/trkjnat.571255","url":null,"abstract":"Bitki mutantlari, bitki islahi ve fonksiyonel gen calismalari icin onemli biyo-kaynaklardir. Mevcut calismada, tuza toleransli aday mutant bugday hatlari elde etmek icin somatik embriyogenez ile konvansiyonel kimyasal mutajenez teknigi birlestirildi. Bu amacla; ekmeklik bugdayda ( Triticum aestivum L. cv. Adana 99) genetik varyasyonlar yaratmak icin embriyonik kalluslara 0-5 mM Sodyum Azid (NaN 3 ), 30 dakika boyunca in vitro ortamda uygulandi. Islem gormus ve gormemis kalluslar, somatik embriyo tesvik ortamina konularak somatik embriyo tesviki icin 3 ve 4 mM NaN 3 uygulamasi optimum mutasyon dozlari olarak tespit edildi. Ardindan bu mutasyon dozlari ile muamele edilen kalluslardan elde edilen somatik embriyolar tuz stresine tolerans gelistirmek icin kullanilacak 125 mM NaCl iceren rejenerasyon ortamlarinda tolerans acisindan tarandi. NaN 3 muamelesinde, orta duzeyde tuza toleransi olan 14 mutant elde edildi. Elde edilen sonuclar; kimyasal mutagenez ile kombine halde in vitro teknik uygulamasinin, populasyonlarda yeterli genetik varyasyon olusturmak ve 1.5 yildan daha az bir surede dorduncu jenerasyon tuz toleransli aday bugday mutant hatlarini islah surecini hizlandirarak elde etmek icin kullanisli bir yontem olabilecegini gostermektedir.","PeriodicalId":23163,"journal":{"name":"Trakya University Journal of Natural Sciences","volume":"10 1","pages":""},"PeriodicalIF":0.7,"publicationDate":"2019-10-15","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"79342194","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
京公网安备 11010802042870号
京ICP备2023020795号-1
扫码关注我们
求助内容：
应助结果提醒方式：