Objectifs
Étudier l’hétérogénéité spatiale de la signature moléculaire du muscle de patients présentant une dermatomyosite juvénile (DMJ) de sévérités différentes et à différents stades de leur évolution.
Méthodes
Une approche par déconvolution sans référence de la transcriptomique spatiale a été réalisée dans 2 biopsies musculaires DMJ avec des sévérités cliniques distincts au moment du diagnostic (forme aiguë ou indolente) et comparée au muscle sain. Dans une seconde étape, les signatures identifiées ont été appliquées à l’analyse aux deux biopsies musculaires d’un même patient avant et après traitement.
Résultats
Nous avons isolé 3 signatures transcriptomiques pathologiques distinctes, de « stress myofibrillaire », de « remodelage musculaire » et de « signalisation d’interféron ». Ces signatures sont distribuées de manière hétérogène spatialement dans les biopsies. La « signature de stress myofibrillaire » était prédominante dans la biopsie la plus sévère tandis que la signature de « remodelage musculaire » était principalement présente dans la biopsie du patient évoluant favorablement. De plus, nous avons montré que les signatures pathologiques transcriptomiques spatialisées sont corrélées à des changements myopathologiques spécifiques (c’est-à-dire des caractéristiques ischémiques avec la signature de « perte myofibrillaire » et une atrophie globale avec la signature de « remodelage musculaire »). De nouveaux gènes et voies ont été identifiés pour chacune de ces signatures. La persistance de signatures spatiales moléculaires anormales a été mise en évidence après la rémission clinique et histologique de la maladie tandis que la signature de signalisation de l’interféron a complètement disparu.
Conclusions
Ces résultats fournissent des indications sur les mécanismes conduisant aux lésions myocytaires et à la rechute de la maladie après la rémission dans la DMJ.
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