Pub Date : 2017-12-01DOI: 10.1016/j.antinf.2017.10.002
A.-A. Mariaggi, D. Descamps, C. Charpentier
La famille des papillomavirus humains (HPV) regroupe plus de 200 types dont certains sont à haut risque oncogène (HPVhr). Le cycle de réplication virale est conditionné par la différenciation de l’épithélium infecté. Les HPV sont classés en types, sous-types, lignées et sous-lignées selon le degré d’homologie des séquences nucléotidiques. Cette diversité génétique des HPV se reflète dans l’épidémiologie des infections à HPV avec une distribution géographique spécifique des différents variants d’un type d’HPV. La diversité génétique des HPV peut avoir un impact sur la physiopathologie de l’infection à HPV. Tout d’abord, la co-infection par plusieurs types d’HPVhr est un facteur de risque de progression vers le cancer. D’autre part, certains types, sous-types et polymorphismes sont associés à un risque accru d’évolution vers le cancer. Les nouvelles technologies de séquençage haut débit ont permis de mettre en évidence une diversité génétique également au niveau intrapatient. En effet, des travaux ont montré la présence de variants viraux minoritaires et de rares mutations GA induites par la protéine cellulaire APOBEC. Ainsi, la diversité génétique des HPV peut avoir un impact sur la physiopathologie de l’infection. Plus récemment, avec le séquençage haut débit, il a été décrit de la variabilité génétique intrapatient, en faible proportion, dont le rôle dans la physiopathologie de l’infection HPV reste à déterminer.
More than 200 types compose the Human papillomavirus (HPV) family, some of them are high-risk oncogenic viruses and others are low-risk oncogenic viruses. The viral replication cycle is coordinated with cell differentiation. HPV are classified in types, sub-types, lineages and sub-lineages based on nucleotidic sequences. HPV epidemiology showed that HPV types, sub-types and lineages had a specific geographic distribution. Importantly, genetic diversity takes part in HPV infection physiopathology. First, co-infection with multiple HPVhr types increased the risk of cancer progression. Furthermore, some types, some lineages and some polymorphisms are associated with an increased risk of developing cancer. Recently, ultradeep sequencing technologies allowed to evidence genetic intrapatient diversity. Indeed, some studies showed the presence of minority viral variants and some rare GA mutations generated by APOBEC cellular proteins. Thus, HPV genetic diversity can have an impact on the pathophysiology of infection. More recently, with ultradeep sequencing technologies, intrapatient genetic variability has been described, in a minority proportion, the role of which in the pathophysiology of HPV infection remains to be assessed.
{"title":"Diversité génétique des papillomavirus humains","authors":"A.-A. Mariaggi, D. Descamps, C. Charpentier","doi":"10.1016/j.antinf.2017.10.002","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.10.002","url":null,"abstract":"<div><p>La famille des papillomavirus humains (HPV) regroupe plus de 200 types dont certains sont à haut risque oncogène (HPVhr). Le cycle de réplication virale est conditionné par la différenciation de l’épithélium infecté. Les HPV sont classés en types, sous-types, lignées et sous-lignées selon le degré d’homologie des séquences nucléotidiques. Cette diversité génétique des HPV se reflète dans l’épidémiologie des infections à HPV avec une distribution géographique spécifique des différents variants d’un type d’HPV. La diversité génétique des HPV peut avoir un impact sur la physiopathologie de l’infection à HPV. Tout d’abord, la co-infection par plusieurs types d’HPVhr est un facteur de risque de progression vers le cancer. D’autre part, certains types, sous-types et polymorphismes sont associés à un risque accru d’évolution vers le cancer. Les nouvelles technologies de séquençage haut débit ont permis de mettre en évidence une diversité génétique également au niveau intrapatient. En effet, des travaux ont montré la présence de variants viraux minoritaires et de rares mutations G<figure><img></figure>A induites par la protéine cellulaire APOBEC. Ainsi, la diversité génétique des HPV peut avoir un impact sur la physiopathologie de l’infection. Plus récemment, avec le séquençage haut débit, il a été décrit de la variabilité génétique intrapatient, en faible proportion, dont le rôle dans la physiopathologie de l’infection HPV reste à déterminer.</p></div><div><p>More than 200 types compose the Human papillomavirus (HPV) family, some of them are high-risk oncogenic viruses and others are low-risk oncogenic viruses. The viral replication cycle is coordinated with cell differentiation. HPV are classified in types, sub-types, lineages and sub-lineages based on nucleotidic sequences. HPV epidemiology showed that HPV types, sub-types and lineages had a specific geographic distribution. Importantly, genetic diversity takes part in HPV infection physiopathology. First, co-infection with multiple HPVhr types increased the risk of cancer progression. Furthermore, some types, some lineages and some polymorphisms are associated with an increased risk of developing cancer. Recently, ultradeep sequencing technologies allowed to evidence genetic intrapatient diversity. Indeed, some studies showed the presence of minority viral variants and some rare G<figure><img></figure>A mutations generated by APOBEC cellular proteins. Thus, HPV genetic diversity can have an impact on the pathophysiology of infection. More recently, with ultradeep sequencing technologies, intrapatient genetic variability has been described, in a minority proportion, the role of which in the pathophysiology of HPV infection remains to be assessed.</p></div>","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-12-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.10.002","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"45345960","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2017-12-01DOI: 10.1016/j.antinf.2017.07.001
A. Berry, J. Fillaux, X. Iriart
La schistosomose (bilharziose) est une parasitose d’importation assez fréquente, diagnostiquée le plus souvent chez des voyageurs ou migrants. La contamination se fait classiquement en zones tropicales, après exposition à une forme larvaire, la furcocercaire, présente dans certains cours d’eau ou lacs qui hébergent l’hôte intermédiaire, le bulin. En fonction de l’espèce, cette parasitose peut occasionner des atteintes très variées : uro-génitales, coliques ou hépatiques et être responsable de complications sévères après plusieurs années d’évolution : dysurie, insuffisance rénale, stérilité, cirrhose hépatique et hypertension portale. Son diagnostic n’est pas toujours aisé, car moins de 50 % des patients infectés excrètent des œufs dans les selles ou les urines, mais la mise en évidence de ces éléments par examen microscopique permet un diagnostic de certitude. De par leur meilleure sensibilité, les sérodiagnostics ont contribué à améliorer le diagnostic, même si leur interprétation nécessite une bonne expertise. Sur le plan thérapeutique, le praziquantel, lorsqu’il est prescrit précocement, assure une guérison définitive, sans séquelle. L’identification en Corse, à partir de 2014, d’un foyer de transmission de schistosomose uro-génitale avec plus d’une centaine de cas recensés, ne doit plus nous faire percevoir cette parasitose comme un danger lointain mais comme une menace bien réelle en Europe du Sud.
Schistosomiasis (bilharziasis) is a common parasitic disease, most often diagnosed in travelers or migrants. The contamination is usually done in tropical areas, after exposure to the larval stage, the furcocercaria, present in some rivers or lakes, which contains the intermediate host, the bulin. This parasite can cause different types of damage in different organs depending on the species involved: uro-genital, colic or liver. More or less quickly, complications may occur such as dysuria, renal impairment, sterility, liver cirrhosis and portal hypertension. The diagnosis is not always easy as fewer than 50 % of infected patients excrete eggs in the stool or urine, but the evidence of these elements by microscopic examination provides proof of diagnosis. Because of their better sensitivity, immunodiagnosis have contributed to improved diagnosis even if their interpretation requires good expertise. Therapeutically, praziquantel, when prescribed early, ensures a definite cure without sequelae. Identification in Corsica, from 2014, of an outbreak of uro-genital schistosomiasis with more than a hundred cases recorded, should no longer make us perceive this parasitosis as a distant danger but as a real threat in Southern Europe.
血吸虫病(血吸虫病)是一种相当常见的进口寄生虫病，最常在旅行者或移民中诊断出来。这种污染通常发生在热带地区，在接触到一种幼虫形式后，即黄貂鱼，这种幼虫存在于一些河流或湖泊中，这些河流或湖泊中有中间宿主黄貂鱼。根据种类的不同，这种寄生虫病可引起各种各样的疾病:泌尿生殖系统、绞痛或肝脏，并在几年的发展后导致严重的并发症:尿失禁、肾衰竭、不孕症、肝硬化和门脉高压。诊断并不总是容易的，因为只有不到50%的受感染患者从粪便或尿液中排泄鸡蛋，但显微镜检查可以确定诊断。通过提高敏感性，血清诊断有助于改善诊断，即使解释需要良好的专业知识。从治疗的角度来看，吡喹酮在早期使用时，可以保证永久愈合，没有后遗症。从2014年开始，科西嘉岛确认了泌尿生殖血吸虫病的传播中心，记录了100多例病例，这绝不能让我们将这种寄生虫病视为遥远的危险，而是对南欧的真正威胁。血吸虫病(血吸虫病)是一种常见的寄生虫病，最常在旅行者或移民中诊断。The is in tropical通常做的不足的地区,当暴露于污染to The larval实习,此证in The furcocercaria表演一个里弗斯lakes,黄金是否包含中间宿主,The bulin。这种寄生虫可以对不同的器官造成不同类型的损害，这取决于所涉及的物种:尿生殖器官、胆结石或肝脏。随着时间的推移，并发症可能会出现，如尿失禁、肾功能受损、不育、肝硬化和门脉高压。诊断并不总是容易的，因为只有不到50%的受感染患者通过粪便或尿液排出卵子，但显微镜检查这些因素的证据提供了诊断的证据。由于免疫诊断具有较高的敏感性，即使其解释需要良好的专业知识，免疫诊断也有助于改进诊断。在治疗上，吡唑酮，当早期处方时，确保明确的治疗没有后效。鉴定科西嘉,from in 2014 of an 8景uro-genital schistosomiasis with more than a两分栏从事劳动,make us有权势,再加上this as a parasitosis遥远危险目的as a real in Southern威胁欧洲。
{"title":"Schistosomose : une parasitose qui n’est plus uniquement tropicale","authors":"A. Berry, J. Fillaux, X. Iriart","doi":"10.1016/j.antinf.2017.07.001","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.07.001","url":null,"abstract":"<div><p>La schistosomose (bilharziose) est une parasitose d’importation assez fréquente, diagnostiquée le plus souvent chez des voyageurs ou migrants. La contamination se fait classiquement en zones tropicales, après exposition à une forme larvaire, la furcocercaire, présente dans certains cours d’eau ou lacs qui hébergent l’hôte intermédiaire, le bulin. En fonction de l’espèce, cette parasitose peut occasionner des atteintes très variées : uro-génitales, coliques ou hépatiques et être responsable de complications sévères après plusieurs années d’évolution : dysurie, insuffisance rénale, stérilité, cirrhose hépatique et hypertension portale. Son diagnostic n’est pas toujours aisé, car moins de 50 % des patients infectés excrètent des œufs dans les selles ou les urines, mais la mise en évidence de ces éléments par examen microscopique permet un diagnostic de certitude. De par leur meilleure sensibilité, les sérodiagnostics ont contribué à améliorer le diagnostic, même si leur interprétation nécessite une bonne expertise. Sur le plan thérapeutique, le praziquantel, lorsqu’il est prescrit précocement, assure une guérison définitive, sans séquelle. L’identification en Corse, à partir de 2014, d’un foyer de transmission de schistosomose uro-génitale avec plus d’une centaine de cas recensés, ne doit plus nous faire percevoir cette parasitose comme un danger lointain mais comme une menace bien réelle en Europe du Sud.</p></div><div><p>Schistosomiasis (bilharziasis) is a common parasitic disease, most often diagnosed in travelers or migrants. The contamination is usually done in tropical areas, after exposure to the larval stage, the furcocercaria, present in some rivers or lakes, which contains the intermediate host, the bulin. This parasite can cause different types of damage in different organs depending on the species involved: uro-genital, colic or liver. More or less quickly, complications may occur such as dysuria, renal impairment, sterility, liver cirrhosis and portal hypertension. The diagnosis is not always easy as fewer than 50 % of infected patients excrete eggs in the stool or urine, but the evidence of these elements by microscopic examination provides proof of diagnosis. Because of their better sensitivity, immunodiagnosis have contributed to improved diagnosis even if their interpretation requires good expertise. Therapeutically, praziquantel, when prescribed early, ensures a definite cure without sequelae. Identification in Corsica, from 2014, of an outbreak of uro-genital schistosomiasis with more than a hundred cases recorded, should no longer make us perceive this parasitosis as a distant danger but as a real threat in Southern Europe.</p></div>","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-12-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.07.001","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"42348640","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2017-12-01DOI: 10.1016/j.antinf.2017.10.003
G. Durand
Over the past decade, next-generation sequencing (NGS) has made tremendous progress, transforming genomic analysis and opening up for many new opportunities in infectious disease diagnosis. The ability of metagenomics to analyze microbial communities without culturing organisms has even enlarged the application potential in this ever growing field. Whether based on targeted or unbiased (shotgun) sequencing approaches, metagenomics still rely on complex laboratory workflow and computational tools. However, recent advancement in sequencing platforms, turnaround time, nucleic acid extraction, library preparation and bio informatics pipelines are now positioning metagenomics very attractively for routine application in clinical microbiology laboratories. Although the completeness and correctness of the genome reference database along with the ability to rapidly interpret the relevant information remain the key challenges for delivering actionable results. Many examples on how to use metagenomics in clinical laboratories can be found in the medical literature. While a single metagenomics analysis delivers the potential to detect rare and novel pathogens, it is however, still necessary to balance the scientific plausibility against the possibility of identifying a truly novel association pathogen–infection when interpreting results. Additionally, metagenomics has brought a revolution in the field of microbiome analysis by generating new insights into the host-microbe relationship and into the therapeutic potential of microbiota modification. Now, the fast evolution of metagenomics challenges the regulatory framework and mandates cooperation among the medical and research communities, industry and regulatory bodies to foster the development of innovative solutions aimed at integrating metagenomics into the infectious diseases diagnostic arsenal.
Ces dix dernières années, le séquençage nouvelle génération (next-generation sequencing) a réalisé d’énormes progrès, transformant l’analyse génomique et ouvrant de nombreuses opportunités dans le diagnostic des maladies infectieuses. En analysant des communautés microbiennes, sans l’étape de culture, la métagénomique élargit le champ d’applications dans ce domaine en pleine expansion. Utilisant une approche de séquençage ciblée ou totale dite « shotgun », la métagénomique repose sur un flux complexe au laboratoire et des outils bio-informatiques sophistiqués. Toutefois, les progrès concernant les plateformes de séquençage, le temps d’exécution de l’analyse, l’extraction des acides nucléiques, la préparation de la librairie et sur les outils bio-informatiques rendent désormais la métagénomique très attractive pour une utilisation en routine. Cependant, l’exhaustivité et l’exactitude des bases de références ainsi que la capacité de traiter rapidement les informations demeurent de véritables challenges pour fournir des résultats actionnables. La littérature regorge d’exemples sur l’utilisa
在过去的十年中，新一代测序(NGS)取得了巨大的进步，改变了基因组分析，为传染病诊断开辟了许多新的机会。宏基因组学在不培养微生物的情况下分析微生物群落的能力甚至扩大了这一不断发展的领域的应用潜力。无论是基于靶向还是无偏(散弹枪)测序方法，宏基因组学仍然依赖于复杂的实验室工作流程和计算工具。然而，最近在测序平台、周转时间、核酸提取、文库制备和生物信息学管道方面的进步，使得宏基因组学在临床微生物实验室的常规应用非常有吸引力。尽管基因组参考数据库的完整性和正确性以及快速解释相关信息的能力仍然是提供可操作结果的关键挑战。在医学文献中可以找到许多关于如何在临床实验室中使用宏基因组学的例子。虽然单一的宏基因组学分析提供了检测罕见和新型病原体的潜力，但是，在解释结果时，仍然需要平衡科学的合理性与识别真正新的关联病原体感染的可能性。此外，宏基因组学通过对宿主-微生物关系和微生物群修饰的治疗潜力产生了新的见解，在微生物组分析领域带来了一场革命。现在，宏基因组学的快速发展对监管框架提出了挑战，并要求医学界和研究界、工业界和监管机构之间进行合作，以促进制定创新的解决办法，将宏基因组学纳入传染病诊断库。这些项目包括:的)、的(新一代)、的(新一代)、的(新一代)、的(新一代)、的(新一代)、的(新一代)、的(新一代)和(新一代)。En analysant des communautsamas microbiennes, sans l’samtape de culture, la msamtagsamnomique samlarge - le champ d’applications and the domain En pleine expansion。实用的一种方法是将 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -关于交换交换平台的方案、交换交换交换分析的方案、交换交换交换分析的方案、交换交换交换核交换的方案、交换交换交换库的方案、交换交换交换的方案、交换交换交换的方案、交换交换的方案、交换交换的方案、交换交换的方案、交换交换的方案、交换交换的方案、交换交换的方案、交换交换的方案、交换交换的方案、交换交换的方案、交换交换的方案、交换交换的方案、交换交换的方案、交换交换的方案、交换交换的方案、交换交换方案、交换交换方案、交换交换方案、交换交换方案、交换交换方案、交换交换方案、交换交换方案、交换交换方案、交换交换方案、交换交换方案、交换交换方案等。在此之前，“详尽的调查”和“准确的调查”是指，“确定的调查”是指，“确定的调查”是指，“确定的调查”是指，“确定的调查”是指，“确定的调查”是指，“确定的调查”是指，“确定的调查”。La litterature倒流d举例苏尔l 'utilisation de La metagenomique倩碧,那么一个简单的分析可以探测de罕见voire德新病原体,当时德说明结果系数始终necessaire d 'etablir洛杉矶一个新式协会pathogene-infection plausibilite科学化。与此同时，我们还发现了一种新的研究方法，即对微生物组进行分析，以确定它们之间的关系hôte-microbe。以主de la metagenomique这挑战者le干部reglementaire et va性两者之间communautes合作26日任职,les industriels等实例reglementaires倒开发des解决方案innovantes facilitant L 'integration de la metagenomique在L 'arsenal du诊断疾病infectieuses。
{"title":"The inputs of metagenomics in the diagnostic of infectious diseases","authors":"G. Durand","doi":"10.1016/j.antinf.2017.10.003","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.10.003","url":null,"abstract":"<div><p>Over the past decade, next-generation sequencing (NGS) has made tremendous progress, transforming genomic analysis and opening up for many new opportunities in infectious disease diagnosis. The ability of metagenomics to analyze microbial communities without culturing organisms has even enlarged the application potential in this ever growing field. Whether based on targeted or unbiased (shotgun) sequencing approaches, metagenomics still rely on complex laboratory workflow and computational tools. However, recent advancement in sequencing platforms, turnaround time, nucleic acid extraction, library preparation and bio informatics pipelines are now positioning metagenomics very attractively for routine application in clinical microbiology laboratories. Although the completeness and correctness of the genome reference database along with the ability to rapidly interpret the relevant information remain the key challenges for delivering actionable results. Many examples on how to use metagenomics in clinical laboratories can be found in the medical literature. While a single metagenomics analysis delivers the potential to detect rare and novel pathogens, it is however, still necessary to balance the scientific plausibility against the possibility of identifying a truly novel association pathogen–infection when interpreting results. Additionally, metagenomics has brought a revolution in the field of microbiome analysis by generating new insights into the host-microbe relationship and into the therapeutic potential of microbiota modification. Now, the fast evolution of metagenomics challenges the regulatory framework and mandates cooperation among the medical and research communities, industry and regulatory bodies to foster the development of innovative solutions aimed at integrating metagenomics into the infectious diseases diagnostic arsenal.</p></div><div><p>Ces dix dernières années, le séquençage nouvelle génération (next-generation sequencing) a réalisé d’énormes progrès, transformant l’analyse génomique et ouvrant de nombreuses opportunités dans le diagnostic des maladies infectieuses. En analysant des communautés microbiennes, sans l’étape de culture, la métagénomique élargit le champ d’applications dans ce domaine en pleine expansion. Utilisant une approche de séquençage ciblée ou totale dite « shotgun », la métagénomique repose sur un flux complexe au laboratoire et des outils bio-informatiques sophistiqués. Toutefois, les progrès concernant les plateformes de séquençage, le temps d’exécution de l’analyse, l’extraction des acides nucléiques, la préparation de la librairie et sur les outils bio-informatiques rendent désormais la métagénomique très attractive pour une utilisation en routine. Cependant, l’exhaustivité et l’exactitude des bases de références ainsi que la capacité de traiter rapidement les informations demeurent de véritables challenges pour fournir des résultats actionnables. La littérature regorge d’exemples sur l’utilisa","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-12-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.10.003","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"44589822","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2017-12-01DOI: 10.1016/j.antinf.2017.05.001
A. Gagneux-Brunon , F. Lucht , O. Launay , P. Berthelot , E. Botelho-Nevers
Les infections associées aux soins (IAS) constituent un véritable problème de santé publique. Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Clostridium difficile sont les plus souvent à l’origine des IAS. L’antibiorésistance fréquente complique encore la prise en charge et des impasses thérapeutiques existent à présent. Les mesures d’hygiène hospitalière bien qu’essentielles sont insuffisantes pour diminuer drastiquement les IAS. Ainsi, des stratégies alternatives à l’antibiothérapie s’avèrent nécessaires pour prévenir et traiter les IAS. Parmi celles-ci, la vaccination et l’immunisation passive sont probablement les plus prometteuses. Nous avons fait une mise au point sur les vaccins disponibles et en développement clinique pour lutter contre les IAS, chez les patients à risque d’IAS et les soignants. L’intérêt de la vaccination grippale et rotavirus chez les patients pour prévenir ces IAS virales a été examiné. Le développement d’un vaccin anti-S.aureus, déjà émaillé de 2 échecs est complexe. Toutefois, ces échecs ont permis d’améliorer les connaissances sur l’immunité anti-S.aureus. La mise à disposition d’un vaccin préventif anti-C.difficile semble plus proche. Pour les autres bactéries gram négatif responsables d’IAS, le développement est moins avancé. La vaccination des patients à risques d’IAS pose également des problèmes de réponse vaccinale qu’il faudra résoudre pour utiliser cette stratégie. Ainsi, la vaccination des soignants, de par l’effet de groupe permet également de prévenir les IAS. Nous faisons ici le point sur l’intérêt de la vaccination des soignants contre la rougeole, la coqueluche, la grippe, la varicelle, l’hépatite B pour réduire les IAS avec des vaccins déjà disponibles.
The burden of healthcare-associated infections (HAIs) is global and major. Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Clostridium difficile are the most frequent associated pathogens. Infection control measures are crucial but not sufficient to stem the burden of HAIs. Due to antimicrobial resistance, lack of therapeutic options for treatment of totally-drug resistant organism is also observed. Therefore, alternative strategies to antimicrobial drugs are urgently needed to prevent and treat HAI. Among these strategies, vaccines and passive immunization are probably one of the most attractive. In this review, we will discuss licensed and non-licensed vaccines for HAIs at-risk patients and HCWs to prevent HAI. The benefit of Influenza and rotavirus vaccines in patients to prevent these viral IAS is reviewed. The development of an S.aureus vaccine, previously associated to failures, seem to be complicated. These failures allow however a better knowledge of S.aureus immunity. For C.difficile, the goal of obtaining a preventive vaccine seems to be near. Development of vaccines
护理相关感染(IAS)是一个真正的公共卫生问题。大肠杆菌、金黄色葡萄球菌和艰难梭菌是IAS最常见的病因。频繁的抗生素耐药性使治疗复杂化，目前存在治疗僵局。医院卫生措施虽然至关重要，但不足以大幅降低IAS。因此，需要抗生素治疗的替代策略来预防和治疗IAS。其中，疫苗接种和被动免疫可能是最有希望的。我们更新了现有的疫苗，并正在临床开发中，以对抗IAS风险患者和护理人员的IAS。研究了流感和轮状病毒疫苗接种对患者预防这些病毒性ais的重要性。抗s疫苗的研制。aureus，已经被2次失败所覆盖，是复杂的。然而，这些失败提高了抗s免疫的知识。金黄色。提供预防c疫苗。困难似乎更近了。其他导致ias的革兰氏阴性细菌的发育不那么先进。对有ias风险的患者进行疫苗接种也会带来疫苗反应方面的问题，为了使用这一策略，必须解决这些问题。因此，通过群体效应对护理人员进行疫苗接种也可以预防IAS。在这里，我们回顾了为护理人员接种麻疹、百日咳、流感、水痘和乙型肝炎疫苗的价值，以减少现有疫苗的IAS。卫生保健相关感染的负担是全球性和重大的。大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、艰难梭菌是最常见的相关病原体。感染控制措施至关重要，但不足以消除仇恨的负担。由于抗菌素耐药性，也缺乏治疗完全耐药微生物的治疗选择。因此，迫切需要采取抗菌素药物的替代战略来预防和治疗HAI。在这些策略中，疫苗和被动免疫可能是最具吸引力的策略之一。在这篇综述中，我们将讨论针对HAIs高危患者的许可和非许可疫苗以及HCWs预防HAI。回顾了流感和轮状病毒疫苗对患者预防这些病毒的益处。The development of an金黄色葡萄球菌疫苗、10 associated失败、seem to be综合度。野孩a better knowledge of These失败可能得到的金黄色葡萄球菌卷。对于艰难梭菌，获得预防性疫苗的目标似乎即将实现。in Development of疫苗to prevent革兰氏阴性细菌参与(IAS)仍将挑战of Development and in assez早期阶段。然而，由于对通常获得的疫苗免疫反应较差，对有风险的患者进行疫苗接种是具有挑战性的。因此，卫生保健工作者的免疫接种对预防IAS至关重要，因为它与遗传免疫有关。在此，我们还回顾了HCWs免疫预防measles、百日咳、流感、水痘和乙型肝炎预防HAIs的好处。
{"title":"Les vaccins dans la prévention des infections associées aux soins","authors":"A. Gagneux-Brunon , F. Lucht , O. Launay , P. Berthelot , E. Botelho-Nevers","doi":"10.1016/j.antinf.2017.05.001","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.05.001","url":null,"abstract":"<div><p>Les infections associées aux soins (IAS) constituent un véritable problème de santé publique. <em>Escherichia coli</em>, <em>Staphylococcus aureus</em>, <em>Clostridium difficile</em> sont les plus souvent à l’origine des IAS. L’antibiorésistance fréquente complique encore la prise en charge et des impasses thérapeutiques existent à présent. Les mesures d’hygiène hospitalière bien qu’essentielles sont insuffisantes pour diminuer drastiquement les IAS. Ainsi, des stratégies alternatives à l’antibiothérapie s’avèrent nécessaires pour prévenir et traiter les IAS. Parmi celles-ci, la vaccination et l’immunisation passive sont probablement les plus prometteuses. Nous avons fait une mise au point sur les vaccins disponibles et en développement clinique pour lutter contre les IAS, chez les patients à risque d’IAS et les soignants. L’intérêt de la vaccination grippale et rotavirus chez les patients pour prévenir ces IAS virales a été examiné. Le développement d’un vaccin anti-<em>S.</em> <em>aureus</em>, déjà émaillé de 2 échecs est complexe. Toutefois, ces échecs ont permis d’améliorer les connaissances sur l’immunité anti-<em>S.</em> <em>aureus</em>. La mise à disposition d’un vaccin préventif anti-<em>C.</em> <em>difficile</em> semble plus proche. Pour les autres bactéries gram négatif responsables d’IAS, le développement est moins avancé. La vaccination des patients à risques d’IAS pose également des problèmes de réponse vaccinale qu’il faudra résoudre pour utiliser cette stratégie. Ainsi, la vaccination des soignants, de par l’effet de groupe permet également de prévenir les IAS. Nous faisons ici le point sur l’intérêt de la vaccination des soignants contre la rougeole, la coqueluche, la grippe, la varicelle, l’hépatite B pour réduire les IAS avec des vaccins déjà disponibles.</p></div><div><p>The burden of healthcare-associated infections (HAIs) is global and major. <em>Escherichia coli</em>, <em>Staphylococcus aureus</em>, <em>Clostridium difficile</em> are the most frequent associated pathogens. Infection control measures are crucial but not sufficient to stem the burden of HAIs. Due to antimicrobial resistance, lack of therapeutic options for treatment of totally-drug resistant organism is also observed. Therefore, alternative strategies to antimicrobial drugs are urgently needed to prevent and treat HAI. Among these strategies, vaccines and passive immunization are probably one of the most attractive. In this review, we will discuss licensed and non-licensed vaccines for HAIs at-risk patients and HCWs to prevent HAI. The benefit of Influenza and rotavirus vaccines in patients to prevent these viral IAS is reviewed. The development of an <em>S.</em> <em>aureus</em> vaccine, previously associated to failures, seem to be complicated. These failures allow however a better knowledge of <em>S.</em> <em>aureus</em> immunity. For <em>C.</em> <em>difficile</em>, the goal of obtaining a preventive vaccine seems to be near. Development of vaccines","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-12-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.05.001","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"43708322","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"OA","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2017-12-01DOI: 10.1016/j.antinf.2017.08.001
E. Lafont , G. Rossi , B. Rossi , O. Roux , V. de Lastours , V. Zarrouk , S. Dokmak , M. Ronot , V. Leflon , A. Lefort
Le foie est l’organe le plus à même de développer des abcès. L’abcès hépatique (AH) est une maladie rare, touchant principalement les hommes de 60 ans avec plusieurs comorbidités, notamment diabète, transplantation hépatique et néoplasie digestive. Les principales causes de formation des AH sont l’obstacle biliaire (néoplasie, lithiase, cholangite ischémique), ou un foyer infectieux d’origine portale ou systémique. Les AH d’origine biliaire ou portale sont souvent polymicrobiens et les germes retrouvés sont des entérobactéries, des bacilles à Gram négatif anaérobies, Enterococcus sp., Streptococcus sp. Les AH d’origine systémique sont généralement monomicrobiens ; l’AH à Klebsiella pneumoniae hypervirulente, maladie émergente en Asie du Sud Est depuis quelques années, est maintenant rapporté dans le monde entier. Les AH à bacille à Gram négatif non fermentant, et les AH fongiques sont plus rares, et touchent des patients immunodéprimés, dans des contextes d’infections associées aux soins. Le diagnostic d’AH repose sur l’imagerie (échographie ou scanner). Pour rechercher la porte d’entrée de l’AH, il est nécessaire de pratiquer une exploration fine des voies biliaires, et du tube digestif (échographie, scanner ± endoscopie). La documentation microbiologique est essentielle pour optimiser le traitement. Pour ce faire, il faut associer les hémocultures périphériques à la culture du pus de l’AH en respectant les conditions strictes d’anaérobiose. Le traitement repose sur le drainage de l’AH (par ponction simple ou associée à la pose d’un drain), une antibiothérapie prolongée et le traitement de la porte d’entrée. Les AH d’origine biliaire ont des taux de récidive et de mortalité plus élevés que les AH d’origine extrabiliaire.
Liver abscess (HA) is a rare disease affecting mainly 60-year-old men with several comorbidities (diabetes mellitus, liver transplantation, neoplasia). Biliary obstruction is the main cause of HA. Biliary HA and portal HA are often polymicrobial (Enterobacteriaceae, Gram-negative anaerobic bacilli, Enterococcus sp., Streptococcus sp.). Non-fermenting Gram-negative bacillus HA, and fungal HA are health care-associated infections affecting immunosuppressed patients. HA diagnosis is based on imaging (ultrasound or scanner). To find HA origin, both biliary tract and gut tract need to be explored (ultrasound, scan ± endoscopy). Peripheral blood cultures and HA pus culture should be associated to optimize microbiological documentation. HA treatment is based on percutaneous drainage, antibiotherapy, and treatment of the primary source.
肝脏是最容易发生脓肿的器官。肝脓肿(ha)是一种罕见的疾病，主要影响60岁男性，并伴有多种共病，包括糖尿病、肝移植和消化肿瘤。AH形成的主要原因是胆道障碍(肿瘤、结石、缺血性胆管炎)或门或全身起源的感染爆发。胆道或门源ha通常是多微生物的，发现的细菌有肠道细菌、厌氧革兰氏阴性杆菌、肠球菌属、链球菌属。高毒性肺炎克雷伯氏菌ha是东南亚几年来的一种新出现的疾病，现在全世界都有报道。非发酵革兰氏阴性AH和真菌AH更罕见，影响免疫功能低下的患者，在护理相关感染的背景下。ah的诊断是基于图像(超声或扫描仪)。为了找到ha的入口，必须对胆道和消化道进行精细的检查(超声、扫描±内窥镜)。微生物记录对于优化处理至关重要。要做到这一点，必须在严格的厌氧条件下结合外周血液培养和ha脓培养。治疗包括引流ha(通过简单的穿刺或结合引流)，长期抗生素治疗和前门治疗。胆道性ha的复发率和死亡率高于髂外ha。肝脓肿(HA)是一种罕见的疾病，主要影响60岁的男性，并伴有多种合并症(糖尿病、肝移植、肿瘤)。胆道梗阻是HA的主要原因。胆道HA和门HA通常是多微生物的(肠杆菌科，革兰氏阴性厌氧菌，肠球菌属，链球菌属)。非发酵革兰氏阴性芽孢杆菌和真菌芽孢杆菌是影响免疫抑制患者的健康相关感染。= =地理= =根据美国人口普查，这个县的面积为。origin To find公顷,使得biliary传单和gut传单need To be explored (ultrasound,扫描±endoscopy)。外周血培养和HA脓液培养应与优化微生物文献相关。= =地理= =根据美国人口普查，这个县的总面积为，其中土地和(2.641平方公里)水。
{"title":"Abcès du foie","authors":"E. Lafont , G. Rossi , B. Rossi , O. Roux , V. de Lastours , V. Zarrouk , S. Dokmak , M. Ronot , V. Leflon , A. Lefort","doi":"10.1016/j.antinf.2017.08.001","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.08.001","url":null,"abstract":"<div><p>Le foie est l’organe le plus à même de développer des abcès. L’abcès hépatique (AH) est une maladie rare, touchant principalement les hommes de 60 ans avec plusieurs comorbidités, notamment diabète, transplantation hépatique et néoplasie digestive. Les principales causes de formation des AH sont l’obstacle biliaire (néoplasie, lithiase, cholangite ischémique), ou un foyer infectieux d’origine portale ou systémique. Les AH d’origine biliaire ou portale sont souvent polymicrobiens et les germes retrouvés sont des entérobactéries, des bacilles à Gram négatif anaérobies, <em>Enterococcus</em> sp., <em>Streptococcus</em> sp. Les AH d’origine systémique sont généralement monomicrobiens ; l’AH à <em>Klebsiella pneumoniae</em> hypervirulente, maladie émergente en Asie du Sud Est depuis quelques années, est maintenant rapporté dans le monde entier. Les AH à bacille à Gram négatif non fermentant, et les AH fongiques sont plus rares, et touchent des patients immunodéprimés, dans des contextes d’infections associées aux soins. Le diagnostic d’AH repose sur l’imagerie (échographie ou scanner). Pour rechercher la porte d’entrée de l’AH, il est nécessaire de pratiquer une exploration fine des voies biliaires, et du tube digestif (échographie, scanner<!--> <!-->±<!--> <!-->endoscopie). La documentation microbiologique est essentielle pour optimiser le traitement. Pour ce faire, il faut associer les hémocultures périphériques à la culture du pus de l’AH en respectant les conditions strictes d’anaérobiose. Le traitement repose sur le drainage de l’AH (par ponction simple ou associée à la pose d’un drain), une antibiothérapie prolongée et le traitement de la porte d’entrée. Les AH d’origine biliaire ont des taux de récidive et de mortalité plus élevés que les AH d’origine extrabiliaire.</p></div><div><p>Liver abscess (HA) is a rare disease affecting mainly 60-year-old men with several comorbidities (diabetes mellitus, liver transplantation, neoplasia). Biliary obstruction is the main cause of HA. Biliary HA and portal HA are often polymicrobial (<em>Enterobacteriaceae</em>, Gram-negative anaerobic bacilli, <em>Enterococcus</em> sp., <em>Streptococcus</em> sp.). Non-fermenting Gram-negative bacillus HA, and fungal HA are health care-associated infections affecting immunosuppressed patients. HA diagnosis is based on imaging (ultrasound or scanner). To find HA origin, both biliary tract and gut tract need to be explored (ultrasound, scan<!--> <!-->±<!--> <!-->endoscopy). Peripheral blood cultures and HA pus culture should be associated to optimize microbiological documentation. HA treatment is based on percutaneous drainage, antibiotherapy, and treatment of the primary source.</p></div>","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-12-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.08.001","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"43377723","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2017-12-01DOI: 10.1016/j.antinf.2017.10.001
H. Guegan , J.-P. Gangneux
Au sein du genre Aspergillus, l’espèce Aspergillus fumigatus est responsable d’un large spectre de pathologies pulmonaires, allant de formes chroniques et/ou immuno-allergiques chez le patient immunocompétent, à des tableaux invasifs sévères chez le patient immunodéprimé (aspergillose invasive [AI]). Les antifongiques triazolés sont utilisés à la fois en première ligne de traitement de l’AI (voriconazole), ou en prophylaxie. Cependant, depuis le début des années 2000, l’émergence d’isolats cliniques et environnementaux d’A.fumigatus résistants aux azolés est décrite en Europe, remettant en cause la place centrale des azolés dans la prise en charge thérapeutique des aspergilloses. Le principal mécanisme de résistance implique des mutations dans le gène cyp51A, codant l’enzyme cible des azolés (lanostérol 14α-démétylase). La résistance aux azolés a 2 origines possibles : thérapeutique liée à l’utilisation de triazolés au long cours et environnementale associée à l’usage intensif de fongicides azolés en agriculture. Ce phénomène émergent donne toute son importance à la surveillance et la détection rigoureuses des isolats résistants au laboratoire, afin d’améliorer la prise en charge clinique des patients atteints d’AI à souche résistante, particulièrement exposés au risque d’échec thérapeutique. Les aspects épidémiologiques et mécanistiques de la résistance d’Aspergillus aux azolés ainsi que sa prise en charge en pratique seront successivement abordés au cours de cette synthèse.
Among Aspergillus species, Aspergillus fumigatus is responsible for various pulmonary diseases ranging from chronic and/or immuno-allergic forms in immunocompetent host, to severe invasive aspergillosis (IA) in immunocompromised patient. Triazole antifungals are the mainstay of therapy for aspergillosis, as first-line treatment for IA (voriconazole), or for prophylaxis. Over the past decade, the emergence of clinical and environmental azole-resistant A.fumigatus isolates has been reported in Europe, threatening the azole effectiveness for treatment of aspergillosis. The main mechanism of resistance is the occurrence of mutations in cyp51A gene, encoding the azole target enzyme (14 α-demethylase). Two hypothesis for azole resistance emergence are debated: azole resistance following long periods of azole treatment in the clinical setting, and an environmental origin related to the extended use of azole fungicides in agriculture. Thus, a reliable screening of resistant isolates is required in laboratories to improve the clinical management of IA patients with resistant strain, at high risk of treatment failure. Here, we successively review the current epidemiology, molecular mechanisms and clinical implication of Aspergillus azole resistance.
在曲霉属中，烟曲霉负责广泛的肺部疾病，从免疫能力强的患者的慢性和/或免疫过敏，到免疫抑制患者的严重侵袭性疾病(侵袭性曲霉病[AI])。三唑类抗真菌药物既用于ai的一线治疗(伏立康唑)，也用于预防。然而，自21世纪初以来，临床和环境分离物a的出现。在欧洲发现了抗唑类烟曲霉的描述，这对唑类烟曲霉在曲霉病治疗中的中心地位提出了质疑。耐药的主要机制涉及cyp51A基因的突变，该基因编码唑啉靶酶(lanostrol 14α-去甲基酶)。对氮的耐药性有两个可能的来源:与长期使用三唑有关的治疗性和与农业中大量使用氮杀菌剂有关的环境性。这一新兴现象强调了严格监测和检测实验室耐药分离株的重要性，以改善耐药ia患者的临床管理，这些患者特别容易出现治疗失败的风险。本文将依次讨论曲霉对偶氮化合物的抗性的流行病学和机制方面及其在实践中的管理。在曲霉种类中，烟曲霉负责各种肺部疾病，从免疫能力强的宿主的慢性和/或免疫过敏形式，到免疫功能受损患者的严重侵袭性曲霉病(IA)。= =地理= =根据美国人口普查，这个县的面积为，其中土地面积为，其中土地面积为。在过去的几十年里，欧洲出现了临床和环境上耐氮的烟曲霉分离物，威胁到唑对曲霉病的治疗效果。手机制of resistance is The这里target of in The azole cyp51A吉恩,encoding突变酶α(14 -demethylase)。讨论了出现耐唑啉的两个假设:临床环境中长期使用耐唑啉治疗后的耐唑啉，以及与农业中广泛使用耐唑啉杀菌剂有关的环境来源。因此，需要在实验室对耐药菌株进行可靠的筛选，以改善耐药菌株患者的临床管理，因为治疗失败的风险很高。在这里，我们连续回顾了曲霉唑耐药的流行病学、分子机制和临床意义。
{"title":"Résistance aux azolés chez Aspergillus","authors":"H. Guegan , J.-P. Gangneux","doi":"10.1016/j.antinf.2017.10.001","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.10.001","url":null,"abstract":"<div><p>Au sein du genre <em>Aspergillus</em>, l’espèce <em>Aspergillus fumigatus</em> est responsable d’un large spectre de pathologies pulmonaires, allant de formes chroniques et/ou immuno-allergiques chez le patient immunocompétent, à des tableaux invasifs sévères chez le patient immunodéprimé (aspergillose invasive [AI]). Les antifongiques triazolés sont utilisés à la fois en première ligne de traitement de l’AI (voriconazole), ou en prophylaxie. Cependant, depuis le début des années 2000, l’émergence d’isolats cliniques et environnementaux d’<em>A.</em> <em>fumigatus</em> résistants aux azolés est décrite en Europe, remettant en cause la place centrale des azolés dans la prise en charge thérapeutique des aspergilloses. Le principal mécanisme de résistance implique des mutations dans le gène <em>cyp51A</em>, codant l’enzyme cible des azolés (lanostérol 14α-démétylase). La résistance aux azolés a 2 origines possibles : thérapeutique liée à l’utilisation de triazolés au long cours et environnementale associée à l’usage intensif de fongicides azolés en agriculture. Ce phénomène émergent donne toute son importance à la surveillance et la détection rigoureuses des isolats résistants au laboratoire, afin d’améliorer la prise en charge clinique des patients atteints d’AI à souche résistante, particulièrement exposés au risque d’échec thérapeutique. Les aspects épidémiologiques et mécanistiques de la résistance d’<em>Aspergillus</em> aux azolés ainsi que sa prise en charge en pratique seront successivement abordés au cours de cette synthèse.</p></div><div><p>Among <em>Aspergillus</em> species, <em>Aspergillus fumigatus</em> is responsible for various pulmonary diseases ranging from chronic and/or immuno-allergic forms in immunocompetent host, to severe invasive aspergillosis (IA) in immunocompromised patient. Triazole antifungals are the mainstay of therapy for aspergillosis, as first-line treatment for IA (voriconazole), or for prophylaxis. Over the past decade, the emergence of clinical and environmental azole-resistant <em>A.</em> <em>fumigatus</em> isolates has been reported in Europe, threatening the azole effectiveness for treatment of aspergillosis. The main mechanism of resistance is the occurrence of mutations in <em>cyp51A</em> gene, encoding the azole target enzyme (14 α-demethylase). Two hypothesis for azole resistance emergence are debated: azole resistance following long periods of azole treatment in the clinical setting, and an environmental origin related to the extended use of azole fungicides in agriculture. Thus, a reliable screening of resistant isolates is required in laboratories to improve the clinical management of IA patients with resistant strain, at high risk of treatment failure. Here, we successively review the current epidemiology, molecular mechanisms and clinical implication of <em>Aspergillus</em> azole resistance.</p></div>","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-12-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.10.001","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"44842345","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2017-06-01DOI: 10.1016/j.antinf.2017.04.002
C. Andrejak, D. Basille, V. Jounieaux
Les infections à mycobactéries non tuberculeuses (MNT) sont en incidence croissante. Ce sont des pathogènes opportunistes et c’est pourquoi l’isolement d’une MNT n’est pas synonyme d’infection. De ce fait, différentes sociétés savantes ont tenté de déterminer des critères d’infection. Les derniers datent de 2007. Ils associent des critères radio-cliniques, peu spécifiques et des critères microbiologiques. L’un des points importants est l’élimination des diagnostics plus probables que l’infection à MNT. Une fois le diagnostic posé, le traitement n’est pas systématique. Il est important de faire la balance entre les bénéfices du traitement (amélioration des symptômes) et les risques. Sur-traiter expose à la toxicité des antibiotiques. En effet, le traitement est long, au moins 12 mois après négativation des cultures, et lourd, associant au moins 3 antibiotiques. De plus, le traitement optimal de ce type d’infection n’est pas connu. Ainsi, seuls les patients les plus symptomatiques tirent un réel bénéfice du traitement. De plus, les patients, ayant déjà fait une infection à MNT restent à risque d’une nouvelle infection. Enfin, il ne faut pas oublier que l’infection à MNT reste un diagnostic d’élimination. Néanmoins, s’il est choisi de ne pas traiter, il reste important de poursuivre la surveillance de ces patients, puisqu’ils peuvent secondairement nécessiter un traitement. Tous ces éléments doivent donc bien faire réfléchir tout clinicien prenant en charge un patient ayant une infection à MNT. Ainsi, initier un traitement n’est pas anodin pour un patient, ne pas traiter non plus.
Nontuberculous mycobacteria (NTM) infections have an increasing incidence. These NTM are opportunist pathogens. That is why NTM isolation is not a synonym to infection. Scientific societies have tried to determinate some criteria for infection. The current infection criteria have been published in 2007. They are association of radio-clinical criteria and microbiological criteria. The most important criteria are that NTM infection should be an exclusion diagnosis. When diagnosis is established, treatment is not systematic. It is important to do the balance between benefit (symptoms improvement) and risks. Indeed, over treatment exposes to drugs toxicity. Treatment is long (12 months after culture conversion) and difficult (at least 3 antibiotics). Moreover, the optimal treatment is unknown. That is why only very symptomatic patients have a real benefit of treatment. Finally, NTM infection is only an exclusion diagnosis. But, if clinician decides not to treat, he has to follow patient as this patient could secondly need a treatment. All these data should be considered by any clinician who cares for a patient with an NTM infection. Thus, initialing a treatment is not trivial, not to treat either.
非结核分枝杆菌感染(ntm)的发病率正在上升。它们是机会主义病原体，这就是为什么分离非传染性疾病并不等同于感染。因此，不同的学术团体试图确定感染的标准。最近一次是在2007年。它们结合了非特异性放射临床标准和微生物标准。其中一个要点是消除比非传染性疾病感染更有可能的诊断。一旦诊断出来，治疗就不是系统的。平衡治疗的好处(改善症状)和风险是很重要的。过度处理会暴露于抗生素的毒性。事实上，治疗时间很长，至少在培养阴性后12个月，而且很重，涉及至少3种抗生素。此外，这种感染的最佳治疗方法尚不清楚。因此，只有症状最严重的患者才能从治疗中获得真正的好处。此外，已经感染ntm的患者仍然有再次感染的风险。最后，我们不应忘记，非传染性疾病感染仍然是一种消除诊断。然而，如果选择不治疗，继续监测这些患者仍然很重要，因为他们可能随后需要治疗。因此，所有这些因素都应该让任何管理非传染性疾病患者的临床医生深思熟虑。因此，开始治疗对病人来说不是无关紧要的，也不治疗。非结核分枝杆菌(NTM)感染的发病率增加。这些NTM是机会主义病原体。这就是为什么NTM隔离不是感染的同义词。= =地理= =根据美国人口普查，该县的总面积为，其中土地和(3.064平方公里)水。= =地理= =根据美国人口普查，该县的总面积为，其中土地和(3.064平方公里)水。= =地理= =根据美国人口普查局的数据，这个城镇的总面积，其中土地和(1.)水。最重要的标准是NTM感染应是排除诊断。当诊断确定时，治疗是不系统的。重要的是要在益处(症状改善)和风险之间取得平衡。事实上，过度治疗暴露于药物毒性。= =地理根据美国人口普查，这个县的总面积是，其中土地和(1.1%)水。此外，最佳治疗方法尚不清楚。这就是为什么只有非常有症状的病人才能从治疗中得到真正的好处。最后,NTM is only an感染排除用电。然而，如果临床医生决定不治疗，他必须跟踪患者，因为患者可能需要进一步治疗。所有这些数据都应由关心NTM感染患者的临床医生考虑。Thus, initialing治疗了is not not to琐碎,处理不了。
{"title":"Est-il justifié de traiter par antibiotiques les infections pulmonaires à mycobactéries non tuberculeuses ?","authors":"C. Andrejak, D. Basille, V. Jounieaux","doi":"10.1016/j.antinf.2017.04.002","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.04.002","url":null,"abstract":"<div><p>Les infections à mycobactéries non tuberculeuses (MNT) sont en incidence croissante. Ce sont des pathogènes opportunistes et c’est pourquoi l’isolement d’une MNT n’est pas synonyme d’infection. De ce fait, différentes sociétés savantes ont tenté de déterminer des critères d’infection. Les derniers datent de 2007. Ils associent des critères radio-cliniques, peu spécifiques et des critères microbiologiques. L’un des points importants est l’élimination des diagnostics plus probables que l’infection à MNT. Une fois le diagnostic posé, le traitement n’est pas systématique. Il est important de faire la balance entre les bénéfices du traitement (amélioration des symptômes) et les risques. Sur-traiter expose à la toxicité des antibiotiques. En effet, le traitement est long, au moins 12 mois après négativation des cultures, et lourd, associant au moins 3 antibiotiques. De plus, le traitement optimal de ce type d’infection n’est pas connu. Ainsi, seuls les patients les plus symptomatiques tirent un réel bénéfice du traitement. De plus, les patients, ayant déjà fait une infection à MNT restent à risque d’une nouvelle infection. Enfin, il ne faut pas oublier que l’infection à MNT reste un diagnostic d’élimination. Néanmoins, s’il est choisi de ne pas traiter, il reste important de poursuivre la surveillance de ces patients, puisqu’ils peuvent secondairement nécessiter un traitement. Tous ces éléments doivent donc bien faire réfléchir tout clinicien prenant en charge un patient ayant une infection à MNT. Ainsi, initier un traitement n’est pas anodin pour un patient, ne pas traiter non plus.</p></div><div><p>Nontuberculous mycobacteria (NTM) infections have an increasing incidence. These NTM are opportunist pathogens. That is why NTM isolation is not a synonym to infection. Scientific societies have tried to determinate some criteria for infection. The current infection criteria have been published in 2007. They are association of radio-clinical criteria and microbiological criteria. The most important criteria are that NTM infection should be an exclusion diagnosis. When diagnosis is established, treatment is not systematic. It is important to do the balance between benefit (symptoms improvement) and risks. Indeed, over treatment exposes to drugs toxicity. Treatment is long (12 months after culture conversion) and difficult (at least 3 antibiotics). Moreover, the optimal treatment is unknown. That is why only very symptomatic patients have a real benefit of treatment. Finally, NTM infection is only an exclusion diagnosis. But, if clinician decides not to treat, he has to follow patient as this patient could secondly need a treatment. All these data should be considered by any clinician who cares for a patient with an NTM infection. Thus, initialing a treatment is not trivial, not to treat either.</p></div>","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-06-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.04.002","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"43802976","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2017-06-01DOI: 10.1016/j.antinf.2017.01.006
B. Rossi
Les infections bactériennes de la peau et des tissus mous (IBPTM) sont des infections fréquentes de présentation et sévérité variables. Dans cette mise au point, nous nous intéressons plus particulièrement aux infections profondes de la peau que nous avons séparées en infections purulentes et non purulentes comme dans les recommandations de l’IDSA de 2014. L’épidémiologique des bactéries incriminées est détaillée pour la France et rapportée au contexte d’antibiorésistance mondiale. À partir de l’épidémiologie bactérienne actuelle en France et des recommandations de l’IDSA, cette mise au point tend à faire une synthèse des stratégies antibiotiques possibles dans les IBPTM en France en 2017.
Acute bacterial skin infections are very common, with various clinical presentations and severity. This review focuses on deep skin infections, separated into purulent and non-purulent infection as in IDSA recommendation in 2014. Bacterial epidemiology of each infection is detailed for France and included in the context of global antimicrobial resistance. Based on the current bacterial epidemiology in France and IDSA recommendations, this review tends to synthesize the antibiotic strategy in the IBPTM in France in 2017.
{"title":"Mise au point sur l’antibiothérapie des infections bactériennes de la peau et des tissus mous en France","authors":"B. Rossi","doi":"10.1016/j.antinf.2017.01.006","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.01.006","url":null,"abstract":"<div><p>Les infections bactériennes de la peau et des tissus mous (IBPTM) sont des infections fréquentes de présentation et sévérité variables. Dans cette mise au point, nous nous intéressons plus particulièrement aux infections profondes de la peau que nous avons séparées en infections purulentes et non purulentes comme dans les recommandations de l’IDSA de 2014. L’épidémiologique des bactéries incriminées est détaillée pour la France et rapportée au contexte d’antibiorésistance mondiale. À partir de l’épidémiologie bactérienne actuelle en France et des recommandations de l’IDSA, cette mise au point tend à faire une synthèse des stratégies antibiotiques possibles dans les IBPTM en France en 2017.</p></div><div><p>Acute bacterial skin infections are very common, with various clinical presentations and severity. This review focuses on deep skin infections, separated into purulent and non-purulent infection as in IDSA recommendation in 2014. Bacterial epidemiology of each infection is detailed for France and included in the context of global antimicrobial resistance. Based on the current bacterial epidemiology in France and IDSA recommendations, this review tends to synthesize the antibiotic strategy in the IBPTM in France in 2017.</p></div>","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-06-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.01.006","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"45400558","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2017-06-01DOI: 10.1016/j.antinf.2017.05.002
F. Jehl, F. Schramm, E. Talagrand-Reboul, A. Grillon
Les données récentes de pharmacocinétique/pharmacodynamie (PK/PD) des antibiotiques ont considérablement influencé la révision des concentrations critiques cliniques des anciennes molécules et l’établissement de celles des molécules nouvellement disponibles. L’exemple de la vancomycine, dont le paramètre clef de l’efficacité bactérioclinique est le rapport aire sous la courbe (24 h)/concentration minimale inhibitrice (ASC/CMI), est éloquent. La valeur cible de ce paramètre est 400 (prédictive de l’efficacité) et 600 (préventive du passage de staphylocoques hVISA à VISA). Or les concentrations sériques résiduelles, ou le plateau lors de perfusions continues, nécessaires à l’obtention d’une ASC suffisante lorsque les CMI sont supérieures ou égales 1 mg/L sont souvent rapportées comme synonymes de néphrotoxicité avérée ou potentielle. Le problème de l’abaissement de la concentration critique clinique de la vancomycine est donc posé. Les céphalosporines dites de « 5e génération », ceftaroline et ceftobiprole, très souvent actives sur les Staphylococus aureus résistants à la méticilline (SARM), représentent une alternative potentiellement intéressante, pour peu que les posologies soient en adéquation avec les prérequis PK/PD, les probabilités d’atteindre ces prérequis (probabilité d’atteindre la cible) en fonction des CMI et plus particulièrement du break-point clinique. C’est clairement le cas du ceftobiprole, ce devrait l’être avec la ceftaroline à la faveur d’une augmentation prochaine des posologies de 600 mg × 2 en perfusion d’1 heure à 600 mg × 3 en perfusion de 2 heures.
The design or revisions of the break-points for the newly marketed or the older antibiotics have been considerably influenced by the recent development of antibiotics pharmacokinetics/pharmacodynamics (PK/PD). The example of vancomycin, the clinico-bacterial efficacy of which is best described by the area under the serum concentrations curve on minimal inhibitory concentration ratio (AUC/MIC) is demonstrative. It is now well established that a value of 400 (efficacy) or 600 (prevention of emergence of VISA from hVISA) are the targets. Unfortunately, the trough serum concentrations or continuous infusion steady-state concentrations required to reach an AUC consistent with these targets when bacterial MICs are ≥ 1 mg/L are synonymous of confirmed or potential renal toxicity. The question of lowering or not vancomycin clinical break-points is asked. The so-called 5th generation cephalosporins, ceftaroline and ceftobiprole, that are most often active against MRSA, may be considered as an interesting alternative given that their respective dosage regimens are in adequation with the PK/PD pre-requisite and their probabilities of target attainment, as a function of the targeted MICs, particularly the clinical brea
最近抗生素的药代动力学/药代动力学(PK/PD)数据在很大程度上影响了旧分子临床临界浓度的修订和新可用分子临床临界浓度的建立。以万古霉素为例，其细菌临床疗效的关键参数是曲线下面积(24小时)与最小抑制浓度(ASC/ mic)的比值。该参数的目标值为400(预测疗效)和600(预防葡萄球菌从hVISA转移到VISA)。然而，当mic大于或等于1 mg/L时，为获得足够的ASC所必需的残留血清浓度或持续灌注时的稳定，通常被报道为已证实或潜在肾毒性的同义词。这就提出了降低万古霉素临床临界浓度的问题。所谓ceftaroline»,«第5代头孢菌素的活性和头孢比,往往就Staphylococus耐甲氧西林金黄色(mrsa),有趣的是潜在的替代品,以低剂量应符合PK / PD发病的概率,概率达到这些先决条件(目标)根据海事委员会特别是break-point临床。这显然是头孢双酚类药物的情况，它应该与头孢他林一起使用，以便在不久的将来将剂量从1小时输注600mg × 2增加到2小时输注600mg × 3。最近抗生素药效学/药效学(PK/PD)的发展对新上市抗生素或旧抗生素的断点设计或修订产生了重大影响。以万古霉素为例，其临床细菌功效最好由血清浓度曲线下最小抑制浓度比(AUC/MIC)下的面积来描述，这是具有示范意义的。现在已经确定，目标值为400(有效性)或600(防止hVISA出现签证)。不幸的是，当细菌组≥1 mg/L时，达到AUC所需的槽血清浓度或连续稳态输注浓度与这些目标一致，这是确认或潜在肾毒性的同义词。城池or not问题》(vancomycin clinical break-points is ?The generation cephalosporins第五的人致敬,ceftaroline and, that are most头孢比积极的母亲against MRSA, may be as an好有趣的用量来替代that their各自regimens are in adequation PK / PD pre-requisite and their with The probabilities圣母“target of as a功能实现、社会交流部、The clinical break-points尤其高昂。应明确听that When this is the case for头孢比,投入到it also be the case in a near future for ceftaroline圣母搭配了that the复核regimen发数(promenade to an increase of daily从2到3,and to an输液剂量存续期from one to上面两年中。
{"title":"Staphylococcus aureus méticillino-résistants : concentrations critiques et pharmacodynamie de la vancomycine et des nouvelles céphalosporines","authors":"F. Jehl, F. Schramm, E. Talagrand-Reboul, A. Grillon","doi":"10.1016/j.antinf.2017.05.002","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.05.002","url":null,"abstract":"<div><p>Les données récentes de pharmacocinétique/pharmacodynamie (PK/PD) des antibiotiques ont considérablement influencé la révision des concentrations critiques cliniques des anciennes molécules et l’établissement de celles des molécules nouvellement disponibles. L’exemple de la vancomycine, dont le paramètre clef de l’efficacité bactérioclinique est le rapport aire sous la courbe (24<!--> <!-->h)/concentration minimale inhibitrice (ASC/CMI), est éloquent. La valeur cible de ce paramètre est 400 (prédictive de l’efficacité) et 600 (préventive du passage de staphylocoques hVISA à VISA). Or les concentrations sériques résiduelles, ou le plateau lors de perfusions continues, nécessaires à l’obtention d’une ASC suffisante lorsque les CMI sont supérieures ou égales 1<!--> <!-->mg/L sont souvent rapportées comme synonymes de néphrotoxicité avérée ou potentielle. Le problème de l’abaissement de la concentration critique clinique de la vancomycine est donc posé. Les céphalosporines dites de « 5<sup>e</sup> génération », ceftaroline et ceftobiprole, très souvent actives sur les <em>Staphylococus aureus</em> résistants à la méticilline (SARM), représentent une alternative potentiellement intéressante, pour peu que les posologies soient en adéquation avec les prérequis PK/PD, les probabilités d’atteindre ces prérequis (probabilité d’atteindre la cible) en fonction des CMI et plus particulièrement du <em>break-point</em> clinique. C’est clairement le cas du ceftobiprole, ce devrait l’être avec la ceftaroline à la faveur d’une augmentation prochaine des posologies de 600<!--> <!-->mg<!--> <!-->×<!--> <!-->2 en perfusion d’1 heure à 600<!--> <!-->mg<!--> <!-->×<!--> <!-->3 en perfusion de 2<!--> <!-->heures.</p></div><div><p>The design or revisions of the break-points for the newly marketed or the older antibiotics have been considerably influenced by the recent development of antibiotics pharmacokinetics/pharmacodynamics (PK/PD). The example of vancomycin, the clinico-bacterial efficacy of which is best described by the area under the serum concentrations curve on minimal inhibitory concentration ratio (AUC/MIC) is demonstrative. It is now well established that a value of 400 (efficacy) or 600 (prevention of emergence of VISA from hVISA) are the targets. Unfortunately, the trough serum concentrations or continuous infusion steady-state concentrations required to reach an AUC consistent with these targets when bacterial MICs are<!--> <!-->≥<!--> <!-->1<!--> <!-->mg/L are synonymous of confirmed or potential renal toxicity. The question of lowering or not vancomycin clinical break-points is asked. The so-called 5th generation cephalosporins, ceftaroline and ceftobiprole, that are most often active against MRSA, may be considered as an interesting alternative given that their respective dosage regimens are in adequation with the PK/PD pre-requisite and their probabilities of target attainment, as a function of the targeted MICs, particularly the clinical brea","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-06-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.05.002","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"42235384","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
Pub Date : 2017-06-01DOI: 10.1016/j.antinf.2017.05.003
M. Dadashi , F. Fallah , A. Hashemi , B. Hajikhani , P. Owlia , N. Bostanghadiri , N. Farahani , M. Mirpour
Background and aim
NDM-1 gene (blaNDM−1)-producing Klebsiella pneumoniae is allegedly perceived as one of the most dangerous multidrug-resistant bacteria causing infections in hospitals and clinic domains. In numerous Asian countries, sporadic studies have been conducted to investigate the prevalence of blaNDM−1-producing K. pneumoniae. In the present study, we determine the precise prevalence of blaNDM−1-producing K. pneumoniae in different parts of Asia indeed.
Methods
Several international databases including Medline, Embase, and Web of sciences were searched from March 2005 to Jan 2016 to discern studies addressed the prevalence of blaNDM−1-producing K. pneumoniae in Asia. Comprehensive meta-analysis (V2.2, Biostat) software was used to interpret the data.
Results
Of the 595 records identified from the databases, 19 studies fulfilled the eligibility criteria ostensibly. The analyses manifested that the prevalence of blaNDM−-producing K. pneumoniae was 32.5% [95% confidence interval (95% CI) 22.6–44.3] in the analyzed Asian countries. Hence, the further stratified analyses indicated that the prevalence of blaNDM−1-producing K. pneumoniae was higher in the probes, particularly after 2010.
Conclusions
The relatively high prevalence of blaNDM−1-producing K. pneumoniae merits our analysis. Moreover, regular surveillance for hospital-associated infection, monitoring antibiotic sensitivity pattern, and formulation of definite antibiotic policies advocates viable roles for prevention and control of blaNDM−1-producing K. pneumoniae.
Contexte
Les souches de K. pneumoniae produisant le gène blaNDM−1 sont parmi les bactéries multirésistantes pouvant entraîner des infections cliniques, y compris nosocomiales. Des études sporadiques ont étudiées la prévalence de ces souches en Asie.
Méthode
Plusieurs bases de données internationales incluant Medline, Embase, et Rebove Science ont été analysées de mars 2005 à janvier 2016 pour définir la prévalence des souches de K. pneumoniae produisant le gène blaNDM−1en Asie. Une méta-analyse (V2.2, Biostat) a été utilisée pour interpréter les données.
Résultats
À partir de 595 études, 19 remplissaient les caractères d’éligibilités prédéfinies. Les études ont retrouvé une prévalence de K. pneumoniae produisant le gène blaNDM−1 de 32,5 % (intervalle de confiance à 95 % 22,6 à 44,3) dans les pays d’Asie.
Conclusion
La prévalence relativement élevée de souche de K. pneumoniae produisant le gène
产生ndm -1基因(blaNDM -1)的肺炎克雷伯菌被认为是引起医院和诊所感染的最危险的多重耐药细菌之一。在许多亚洲国家，已经进行了零星研究，以调查产生blaNDM−1的肺炎克雷伯菌的流行情况。在目前的研究中，我们确实确定了产blaNDM−1肺炎克雷伯菌在亚洲不同地区的确切流行率。方法检索2005年3月至2016年1月期间Medline、Embase和Web of sciences等多个国际数据库，以识别有关亚洲产blaNDM−1肺炎克雷伯菌流行情况的研究。采用综合meta分析软件(V2.2, Biostat)对数据进行解释。结果从数据库中确定的595条记录中，有19项研究表面上符合资格标准。分析表明，在所分析的亚洲国家中，产白粉菌肺炎克雷伯菌的患病率为32.5%[95%可信区间(95% CI) 22.6-44.3]。因此，进一步的分层分析表明，在探针中产生blaNDM−1的肺炎克雷伯菌的患病率较高，特别是在2010年之后。结论产blaNDM−1肺炎克雷伯菌的较高患病率值得我们分析。此外，定期监测医院相关感染，监测抗生素敏感性模式，并制定明确的抗生素政策，倡导在预防和控制产生blaNDM−1的肺炎克雷伯菌方面发挥切实可行的作用。ContexteLes souches de k .肺炎produisant le基因blaNDM−1是parmi les bacteries抗多种抗菌素的pouvant夹带剂des感染倩碧,y理解院内。在亚洲，只有零星的和零星的，只有零星的和零星的。3 .国际上的 (Medline, Embase, et Rebove Science)和(2016年1月1日)的(2005年1月1日)的(2016年1月1日)的(2016年1月1日)的(2011年1月1日)的(2011年1月1日)。一个msamata - analyze (V2.2, Biostat):一个使用msamata - use - ssamas - use - ssamas - use - ssamas - use - ssamasRésultatsÀ第595部分，19个完整的les caractres d ' samilibilit - samis - pracimdsamis。在亚洲，Les - 32,5 %(区间:95,22,6 %，44,3 %)和Les - 32,5 %(区间:95,22,6 %，44,3 %)的人都是肺炎克雷伯氏菌的携带者。ConclusionLa患病率就elevee de souche de k .肺炎produisant le基因blaNDM−1 justifie诺练习曲。1.对感染、敏感性、抗生素、卫生措施等方面的监测，包括对感染、感染、感染和感染的监测，以及对感染、感染和感染的监测，以及对感染和感染的监测。
{"title":"Prevalence of blaNDM−1-producing Klebsiella pneumoniae in Asia: A systematic review and meta-analysis","authors":"M. Dadashi , F. Fallah , A. Hashemi , B. Hajikhani , P. Owlia , N. Bostanghadiri , N. Farahani , M. Mirpour","doi":"10.1016/j.antinf.2017.05.003","DOIUrl":"10.1016/j.antinf.2017.05.003","url":null,"abstract":"<div><h3>Background and aim</h3><p>NDM-1 gene (<em>bla</em><sub>NDM−1)</sub>-producing <em>Klebsiella pneumoniae</em> is allegedly perceived as one of the most dangerous multidrug-resistant bacteria causing infections in hospitals and clinic domains. In numerous Asian countries, sporadic studies have been conducted to investigate the prevalence of <em>bla</em><sub>NDM−1</sub>-producing <em>K. pneumoniae.</em> In the present study, we determine the precise prevalence of <em>bla</em><sub>NDM−1</sub>-producing <em>K. pneumoniae</em> in different parts of Asia indeed.</p></div><div><h3>Methods</h3><p>Several international databases including Medline, Embase, and Web of sciences were searched from March 2005 to Jan 2016 to discern studies addressed the prevalence of <em>bla</em><sub>NDM−1</sub>-producing <em>K. pneumoniae</em> in Asia. Comprehensive meta-analysis (V2.2, Biostat) software was used to interpret the data.</p></div><div><h3>Results</h3><p>Of the 595 records identified from the databases, 19 studies fulfilled the eligibility criteria ostensibly. The analyses manifested that the prevalence of <em>bla</em><sub>NDM−</sub>-producing <em>K. pneumoniae</em> was 32.5% [95% confidence interval (95% CI) 22.6–44.3] in the analyzed Asian countries. Hence, the further stratified analyses indicated that the prevalence of <em>bla</em><sub>NDM−1</sub>-producing <em>K. pneumoniae</em> was higher in the probes, particularly after 2010.</p></div><div><h3>Conclusions</h3><p>The relatively high prevalence of <em>bla</em><sub><em>NDM−1</em></sub>-producing <em>K. pneumoniae</em> merits our analysis. Moreover, regular surveillance for hospital-associated infection, monitoring antibiotic sensitivity pattern, and formulation of definite antibiotic policies advocates viable roles for prevention and control of <em>bla</em><sub><em>NDM−1</em></sub>-producing <em>K. pneumoniae</em>.</p></div><div><h3>Contexte</h3><p>Les souches de <em>K. pneumoniae</em> produisant le gène <em>bla</em><sub>NDM−1</sub> sont parmi les bactéries multirésistantes pouvant entraîner des infections cliniques, y compris nosocomiales. Des études sporadiques ont étudiées la prévalence de ces souches en Asie.</p></div><div><h3>Méthode</h3><p>Plusieurs bases de données internationales incluant Medline, Embase, et Rebove Science ont été analysées de mars 2005 à janvier 2016 pour définir la prévalence des souches de <em>K. pneumoniae</em> produisant le gène <em>bla</em><sub>NDM−1</sub>en Asie. Une méta-analyse (V2.2, Biostat) a été utilisée pour interpréter les données.</p></div><div><h3>Résultats</h3><p>À partir de 595 études, 19 remplissaient les caractères d’éligibilités prédéfinies. Les études ont retrouvé une prévalence de <em>K. pneumoniae</em> produisant le gène <em>bla</em><sub>NDM−1</sub> de 32,5 % (intervalle de confiance à 95 % 22,6 à 44,3) dans les pays d’Asie.</p></div><div><h3>Conclusion</h3><p>La prévalence relativement élevée de souche de <em>K. pneumoniae</em> produisant le gène <e","PeriodicalId":49043,"journal":{"name":"Journal Des Anti-Infectieux","volume":null,"pages":null},"PeriodicalIF":0.0,"publicationDate":"2017-06-01","publicationTypes":"Journal Article","fieldsOfStudy":null,"isOpenAccess":false,"openAccessPdf":"https://sci-hub-pdf.com/10.1016/j.antinf.2017.05.003","citationCount":null,"resultStr":null,"platform":"Semanticscholar","paperid":"42208895","PeriodicalName":null,"FirstCategoryId":null,"ListUrlMain":null,"RegionNum":0,"RegionCategory":"","ArticlePicture":[],"TitleCN":null,"AbstractTextCN":null,"PMCID":"","EPubDate":null,"PubModel":null,"JCR":null,"JCRName":null,"Score":null,"Total":0}
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